2021年測序技術培訓班第四屆全國NGS建庫及創新大賽通知
各醫療機構(臨床實驗室): NGS(新一代測序)結合其他分子生物學技術,在生物醫藥領域發揮了越來越重要的作用,各種基于NGS的創新研究及其應用越來越廣。隨著新的《醫療器械監督管理條例》正式實施,為了適應NGS實驗室和實驗室自建方案的實驗人員要求,上海市臨床檢驗中心和上海市遺傳學會共同主辦,長三角罕見病實驗診斷協作中心、上海市實驗醫學研究院和國家衛健委出生缺陷與生殖健康重點實驗室協辦的“2021年新一代測序技術培訓班暨第四屆全國NGS建庫及創新大賽”將分別于2021年9月24-25日對醫療機構實驗室操作人員進行理論培訓,9月26日-29日進行實操培訓。 學員經考試合格后由上海市臨床檢驗中心和上海市遺傳學會聯合頒發《新一代測序NGS技術培訓合格證書》。 NGS技術培訓班 主辦單位: 上海市臨床檢驗中心、上海市遺傳學會 協辦單位: 長三角罕見病實驗診斷協作中心、上海市實驗醫學研究院、國家衛健委出生缺陷與生殖健康重點實......閱讀全文
全新一代測序技術:沒有光的測序
至今,新一代測序技術已經遍布全球上百個基因組測序中心 ――明斯特大學Dag Harmsen 在去年召開的美國微生物學會上,來自明斯特大學的醫學微生物學家Dag Harmsen開始聽到了有關德國大腸桿菌疫情爆發的傳言,這場疫情首先在德國北部地區爆發,感染了至少4000人,奪去了超過
【綜述】2016年新一代測序技術
新一代測序幾乎影響了生物學領域的每一個角落,科學家們用這一技術測序基因組、評估遺傳學變異、定量基因表達、研究表觀遺傳學調控和探索微觀生命。新一代測序市場如今異常繁榮,但開發者們并沒有停下自己的腳步。在最近的基因組生物學技術進展年會(AGBT)上,各大公司紛紛推出了自己的新產品。這些創新旨在推動新
Ion-Torrent新一代測序儀介紹
引言 ?? ? 整個或部分基因組測序的研究問題已解決,研究者的研究重點向著遺傳密碼如何編碼調控細胞功能方向轉移。同樣,在分子水平了解人類健康狀況,基因序列數據則顯得更加重要。大多數的測序都是針對部分基因序列或是一段目標區域,提供必需的數據來解釋給定假說。利用PCR技術很容易從基因組中擴增得
新一代測序技術(下)SOLiD-(ABI)
【摘要】 2005年454公司首推劃時代的新一代測序儀,從而引發了測序市場上454、Illumina、ABI等公司在新一代測序技術上的比拼高潮。也正是這種你追我趕,讓繪制人類全基因組圖譜由過去的耗費4.37億美元和13年時間,驟然縮短到如今SOLiD 3運行一次即獲得50GB可定位測序數據。新一代
我國成功研發新一代基因測序儀
中國自主研發的新一代基因測序儀獲得成功,日前在長春首次展示樣機。它已達到和部分超越國際主流設備技術指標,填補了中國在該領域的空白。 由中國科學院北京基因組研究所與吉林中科紫鑫科技有限公司聯合研制的新一代基因測序儀,與國外第二代高通量測序系統相比,成功解決了“讀長較短”這一關鍵技術難題。
-新一代測序面臨六大挑戰
當年,Solexa品牌還在的時候,MassGenomics的Dan Koboldt就提出了新一代測序(NGS)面臨的一些挑戰,包括生物信息學算法的問題,以及讀長太短,工具太貴,經驗太少。如今,這些問題中的大部分都已解決。不過,別高興得太早。Koboldt認為,我們面臨更新、更難的挑戰。 首先,
新一代高通量測序技術SOLiD簡介
目前市場上有四種高通量測序儀,分別是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根據測序原理,它們可以被分為兩大類:使用合成法測序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用連接法測序(Sequencing by Ligation
Biotechniques:新一代測序中的缺口填補
在完成的基因組的復興時代,科學家使用由第三代測序技術提供的長讀取,來填補基因組裝配中的缺口(gap)。新一代測序能趕得上嗎? 新一代測序,可讓科學家們以比Sanger測序更快的速度和更低的價格,進行基因組測序,為1000美元基因組測序鋪平了道路。但是這種方法犧牲了長讀取速度,將平均讀長減少至大
新一代測序技術的先鋒SOLiD系統
2008年12月 作為上世紀生命科學領域最重要的技術發明之一,測序技術深刻地改變了我們對生命本質的理解和掌控能力。假如沒有測序技術,基因序列就無法確定,酶切、克隆、反轉錄、cDNA、PCR、SNP、RNAi等等研究技術也就根本無從談起,生命科學領域也不會有今日的蓬勃發展。無人不曉的GenBank;
新一代測序離臨床應用還有多遠?
隨著新一代測序變得更快速、更廉價、也更可靠,它有望帶來疾病的重要線索,讓醫生挑選更精準的藥物。然而,面對臨床應用,新一代測序真的準備好了嗎?Wellcome Trust 人類遺傳學中心的Danny Ulahannan給出了否定的答案。他們在《British Journal of Canc
QIAGEN推出新一代測序儀GeneReader
千呼萬喚始出來,在上周舉行的美國分子病理學會年會上,QIAGEN的新一代測序儀GeneReader終于和大家見面了。這臺儀器最初計劃在2014年推出,但后來因故推遲到2015年。 QIAGEN在2012年通過收購Intelligent Biosystems(IBS),躋身新一代測序市場。IBS
2013新一代測序儀將走向何方
盡管今年的摩根大通保健大會沒有出現去年的新品頻發的盛況,但新一代測序儀仍在不斷進步。讀長、準確性、通量、軟件,無一不在變化,讓測序更高、更快、更強。 Illumina公司在2012年第三季度推出了HiSeq 2000的升級版――HiSeq 2500。它是Illumina第一臺特有兩種運
新一代高通量測序技術SOLiD簡介
目前市場上有四種高通量測序儀,分別是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根據測序原理,它們可以被分為兩大類:使用合成法測序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用連接法測序(Sequencing by Ligation
三款熱門新一代測序儀的比較
生物通報道 來自英國Wellcome Trust Sanger研究院的研究人員對市場上三款熱門測序儀(Ion PGM、PacBio RS、MiSeq)的性能進行了比較。該成果發表在7月24日的《BMC Genomics》上。 蓬勃發展的新一代測序(NGS)技術徹底改變了基因組學和遺傳學
新一代測序在癌癥中的臨床應用
一提起癌癥,人們往往談虎色變。的確,癌癥是全球發病和死亡的主要原因。據WHO統計,2012年有820萬例癌癥相關的死亡。所幸,DNA測序技術的快速發展正在改變我們對癌癥的認識,也在轉變癌癥的篩查、診斷和治療。如今,新一代測序主要應用在癌癥預防和治療中的哪些方面?美國罕見病基因組研究所的研究人員不久前
針對單細胞的最全面新一代測序
Bio-Rad Laboratories公司和Illumina公司宣布了一項獨家合作,以開發針對單細胞分析的最全面新一代測序(NGS)流程。這個端對端的商業化方案將實現針對數以千計的單細胞的高通量測序,這在過去是一個充滿挑戰、耗時又昂貴的過程。 大多數科學研究依賴于對大塊組織樣本的分析。這些樣本
新一代測序在農業領域大放光彩
普通農夫的谷倉里肯定沒有最新款的HiSeq測序系統。不過,這并不意味著新一代測序(NGS)在農業領域就不如醫學領域那么重要。 喬治亞大學的特聘教授Andrew Paterson就利用NGS來捕獲群體的多樣性,他將基因型與參考基因組進行比較。他領導的植物基因組作圖實驗室也利用NGS從不同個體中獲
新一代測序在癌癥中的臨床應用
一提起癌癥,人們往往談虎色變。的確,癌癥是全球發病和死亡的主要原因。據WHO統計,2012年有820萬例癌癥相關的死亡。所幸,DNA測序技術的快速發展正在改變我們對癌癥的認識,也在轉變癌癥的篩查、診斷和治療。 如今,新一代測序主要應用在癌癥預防和治療中的哪些方面?美國罕見病基因組研究所的研究人
新一代測序技術連接古今人類關系
新一代測序(NGS)是一種顛覆性的技術,它的出現使得科研工作者能夠以較少的經費,測取數以百萬計的短DNA序列數來進行各方面的研究應用,這其中既包括對古生物的全基因組測序。 7月24日,science雜志上的一篇短評“New life for old bones”揭示了新一代基因測序技術在古生
新一代測序在癌癥中的臨床應用
一提起癌癥,人們往往談虎色變。的確,癌癥是全球發病和死亡的主要原因。據WHO統計,2012年有820萬例癌癥相關的死亡。所幸,DNA測序技術的快速發展正在改變我們對癌癥的認識,也在轉變癌癥的篩查、診斷和治療。 如今,新一代測序主要應用在癌癥預防和治療中的哪些方面?美國罕見病基因組研究所的研究人
用新一代測序尋找罕見變異-需謹慎
新一代測序引入的誤差,使得我們很難檢測到罕見變異,而這些罕見變異在癌癥等疾病中發揮著重要的作用。在Biotechniques最近的一篇新聞中,Janelle Weaver報道了科學家們在描繪這些誤差以及開發策略提高精度方面所取得的進步。 美國國家心臟、肺和血液研究所外顯子組測序項目的研究人員,
SOLiD-5500新一代測序儀性能大盤點
2010年12月16日 生命科技公司(Life Technogy Inc.),宣布推出的SOLiD? 5500和SOLiD? 5500xl新一代測序儀。 上海伯豪生物技術有限公司作為ABI公司服務供商,將在2011年利用SOLiD? 5500xl為廣大科研工作者提供更為全面的新一代測序服務解決
新一代腫瘤基因測序,數據質量是基石
腫瘤細胞的一個明確特點是其復雜的異質性,存在個體不同細胞間,不同個體間,另根據現有的研究基礎,已經發現腫瘤基因層面變異頻率普遍較低,各種因素告訴我們,在復雜的背景中確定腫瘤突變,首先測序堿基的準確率必須過關。原始數據的堿基識別準確性越高,使用的信息分析方法越合理標準,對測序深度的要求就會越低。在
Life-Technologies新一代Ion-Proton測序儀本月上市
LifeTechnologies公司新一代IonProton測序儀將于本月上市。最先推出的是IonProtonI芯片,適合外顯子組測序。而在今年底或明年初,LifeTech將繼續推出IonProtonII芯片,用于全基因組測序。 據LifeTech透露,它已經收到了超過100臺的訂單。一些臨床
通過新一代測序來分析拷貝數變異
對于精準醫療而言,理想的情況是測定每位患者的遺傳變異,并根據結果及其他因素開出適當的藥物。具體到癌癥,遺傳變異包括單核苷酸替換和插入/缺失、基因拷貝數變異、部分或整個基因缺失、大的染色體區域的重復或缺失,以及染色體易位和其他重排。 HER2基因是癌癥精準醫療的首批治療靶點之一,并且已經改變了H
-新一代測序:影響的不只是醫療行業
????? 從Google風投人士參加行業會議的感受看行業變化 過去三十年,JP Morgan(摩根大通公司,美國現代金融業“教父”)的醫療行業峰會都是傳統藥企唱絕對主角,生物科技類公司就是過來看有什么能得幫上忙。 而2014年1月16日的這次會議游戲規則有些不同。臺上活躍
-牛津基因技術公司推出新一代測序panel
上周,牛津基因技術公司(Oxford Gene Technology,OGT)宣布推出卵巢癌檢測試劑盒,這是該公司第一個基于NGS技術的癌癥檢測panel。去年,該公司曾與南安普敦大學、伯明翰大學以及屬于英國分層醫療計劃的CIS健康醫療合作,推出了可檢測60個基因的實體瘤panel。 目前,該
從STR到新一代測序:法醫分析在前進
在很久以前,破案靠的是福爾摩斯。不過,神探畢竟有限,蘇格蘭場還是需要可靠的技術。從80年代開始,法醫實驗室就開始利用DNA檢測來幫助破解刑事案件,具體技術包括STR和SNP分析以及mtDNA測序。近日,《大西洋月刊》(the Atlantic)指出,調查人員目前已開始采用新型的工具和技術。 文
新一代測序十年記:第一臺測序儀的誕生
從454生命科學推出第一臺新一代測序儀以來,一晃十年過去了。這十年,正是基因組學高速發展的十年。我們看到了新儀器接踵而至,也看到了新技術不斷問世,讓人腦洞大開。從當初耗資30億美元的人類基因組計劃,到如今1000美元的人類基因組,測序技術經歷了怎樣的發展?我們在此作一回顧。 454生命科學(4
新一代測序技術為生物制藥開啟新路徑
??????? 新一代測序技術現在越來越多使用在新興生物藥的開發和疫苗生產上。目前藥物研發部門使用的各種高通量技術,例如基因芯片、代謝組學建模、酵母雙雜、蛋白質組學、高通量化學篩選、電子雜交定位,有望被新一代測序技術替代或作為補充。 隨著微生物基因組信息逐漸增多,新一代測序技術在抗細菌和抗病毒藥物