新一代測序:影響的不只是醫療行業
從Google風投人士參加行業會議的感受看行業變化 過去三十年,JP Morgan(摩根大通公司,美國現代金融業“教父”)的醫療行業峰會都是傳統藥企唱絕對主角,生物科技類公司就是過來看有什么能得幫上忙。 而2014年1月16日的這次會議游戲規則有些不同。臺上活躍,臺下達成合作意向的都是些醫療保險公司,軟件開發商,數據分析商,以及各種IT類企業。 “我來過5次了,以前全部是傳統藥企,談的都是怎么治療某種病。但隨著新醫改法案(Affordable Care Act)的頒布,出現了一些幾年前完全沒有的商業模式。現在大家談的都是數據分析,數字醫療,怎樣更好地服務患者。我們投的一家IT類公司之前問我,‘你覺得我應該去JP Morgan的會么’,5年前我會跟他說沒必要,但現在我跟他說,‘你真的應該去’。” 醫改的方向之一是把醫院報銷額......閱讀全文
基因測序:數據深度挖掘和解讀難題待解
作為一種新型基因檢測技術,基因測序能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,預測罹患多種疾病的可能性,個體的行為特征及行為合理。基因測序技術能鎖定個人病變基因,提前預防和治療。正因如此,今年華大基因的上市,就引發了資本市場的熱烈追捧。 在日前在京召開的第四屆全國功能基因組學高峰論壇上,與會的眾多
-英公開埃博拉病毒基因測序數據
一個英國科研團隊成功完成了對埃博拉病毒的基因測序,并已將數據在網上公開發布,免費提供給全球科研人員使用。這有助于各國研發更高效的治療藥物和疫苗。 劍橋大學3日發布公告稱,2014年埃博拉疫情在西非暴發后,來自該校及英國多個科研機構的研究人員開始在塞拉利昂采集病毒樣本,并利用美國一家公司開發的新
基因測序:數據深度挖掘和解讀難題待解
作為一種新型基因檢測技術,基因測序能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,預測罹患多種疾病的可能性,個體的行為特征及行為合理。基因測序技術能鎖定個人病變基因,提前預防和治療。正因如此,今年華大基因的上市,就引發了資本市場的熱烈追捧。 在日前在京召開的第四屆全國功能基因組學高峰論壇上,與會的眾多專
基因測序:數據處理與標準問題仍待解
圖片來源:百度圖片 目前我國在數據行業標準方面概念還很模糊,這就導致科研機構、醫療機構、企業在利用基因數據的時候,沒有統一的規則,也造成基因測序行業良莠不齊。這種情況,亟須得到改變。 基因測序,一直被視為生命科學和生物技術發展的重大革命。在經歷過前些年的積累之后,今年的基因測序行
科學家提出基因測序數據分類新標準
有助于開發出更有效的疫苗;更迅速應對潛在公共衛生突發事件 最近,美國洛斯阿拉莫斯國家實驗室(LANL)的一個遺傳學小組和一國際財團聯合提出了一套旨在闡明可公開獲取的基因測序數據信息的質量標準。新標準最終可使遺傳研究人員開發出更有效的疫苗,或有助于公共健康部門或安全人員更迅速地應對潛在的公共衛生
基因測序:數據處理與標準問題仍待解
【導讀】目前我國在數據行業標準方面概念還很模糊,這就導致科研機構、醫療機構、企業在利用基因數據的時候,沒有統一的規則,也造成基因測序行業良莠不齊。這種情況,亟須得到改變。 目前我國在數據行業標準方面概念還很模糊,這就導致科研機構、醫療機構、企業在利用基因數據的時候,沒有統一的規則,也造成基因測
新一代腫瘤基因測序,數據質量是基石
腫瘤細胞的一個明確特點是其復雜的異質性,存在個體不同細胞間,不同個體間,另根據現有的研究基礎,已經發現腫瘤基因層面變異頻率普遍較低,各種因素告訴我們,在復雜的背景中確定腫瘤突變,首先測序堿基的準確率必須過關。原始數據的堿基識別準確性越高,使用的信息分析方法越合理標準,對測序深度的要求就會越低。在
ctdna測序數據測序深度多少可用
ctdna測序數據測序深度多少可用2-氨基嘌呤等其他堿基結構類似物同樣具有誘變作用。②藥物或射線引起的化學變化 亞硝酸能夠作用于腺嘌呤(A)的氨基而使它變為次黃嘌呤(HX);可以作用于胞嘧啶(c)而使它變為尿嘧啶(U)。這兩種氨基到酮基的變化帶來堿基配對關系的改變,從而通過 DNA復制而造成A∶T→
基因測序
第1代測序技術——熒光標記的Sanger法 在第一臺全自動測序儀出現之前,使用最為廣泛的測序方法就是 Sanger 在 20 世紀 70 年代中期發明的末端終止法測序技術。 Sanger 也因此獲得 1980年的諾貝爾化學獎。 他的發明第一次為科研人員開啟了深入研究生命遺傳密碼的大門。G1.1? ?
基因測序
基因測序是一種新型基因檢測技術,能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,預測罹患多種疾病的可能性,個體的行為特征及行為合理。基因測序技術能鎖定個人病變基因,提前預防和治療。基因測序相關產品和技術已由實驗室研究演變到臨床使用,可以說基因測序技術,是下一個改變世界的技術
測序“垃圾”數據變身寶藏
基因組測序中曾經被視為是垃圾的數據,現在能夠用來為人們提供重要的疾病線索。St. Jude兒童研究醫院——華盛頓大學兒童癌癥基因組項目的研究人員獨辟蹊徑,在染色體末端DNA重復片段的測序數據中,挖掘到了寶貴的癌癥信息。 染色體末端的DNA重復片段被稱為端粒,此前這種重復片段往往在二代測
首個中國地區古人全基因組數據被測序
近日,《當代生物學》發表了首次針對中國地區古人類的全基因組研究成果。該項目由中國科學院古脊椎動物與古人類研究所和德國馬普進化人類研究所等團隊合作完成,研究分析了距今4萬年前出土于北京房山田園洞的一具男性個體基因組,發現東亞早期人群組成十分復雜。 雖然歐洲和西伯利亞地區都有古人類樣本基因組被測序
乳腺癌的8年數據,基因測序受患者青睞
隨著基因測序技術的發展,成本不斷降低,活躍在市場上的乳腺癌基因測序產品也越來越多。然而,患者對乳腺癌BRCA測序持何態度?BRCA基因測序是否對患者的治療決策有影響?2016年2月11日,《JAMA Oncology》雜志報道了年輕乳腺癌患者BRCA基因檢測的調查報告,經調查發現,近年來乳腺癌年
精準醫療時代已至-基因測序數據分析成為關鍵
隨著醫學技術提升、就醫環境改善,困擾人們的復雜疾病是否能夠得到更加有效的治療?相關統計顯示,針對城市居民死亡率較高的癌癥(惡性腫瘤)、心臟病、冠心病等復雜疾病,傳統醫療方案的治療效果并不佳。據WINSymposium公布的數據顯示,傳統醫療在腫瘤治療上用藥無效率高達75%。人們仍然談“癌”色變。
平價基因測序公司如何賺錢?高價賣數據才是生財之道
可能一天前你還在為已經降到“冰點”的基因測序市場價格而竊喜,卻不知后一天,基因測序公司已經將你的“基因秘密”高價轉手賣給了那些需要基因大數據的研究機構或者制藥公司,而后者據此研發的靶向治療生物藥物,一個療程就可能售價十幾萬美元。 平價基因測序時代來臨,基因測序業務門檻低、不賺錢已是行業內公開的
Nature:測序研究引發的思考,誰該擁有個人基因數據?
大樣本數據庫是影響基因數據分析解讀的重要因素,也是影響測序產業鏈發展的瓶頸之一。如今,越來越多的志愿者將自己的基因數據貢獻給科研,但是對于后續的數據反饋,卻是一個值得深思的問題。近日,一位遺傳學研究者在Nature網站上披露了如今遺傳學研究中存在的問題:是否有必要將原始數據反饋給參與者?以下為她
基因測序儀
原理編輯abi prism 310型基因分析儀采用毛細管電泳技術取代傳統的聚丙烯酰胺平板電泳,應用該公司ZL的四色熒光染料標記的ddntp(標記終止物法),因此通過單引物pcr測序反應,DNA測序儀生成的pcr產物則是相差1個堿基的3''''末端為4種不同熒光染料
蠶豆基因測序!
蠶豆的基因組終于被測序了,它擁有130億個堿基,超過了人類基因組的4倍。這項研究最近發表在《自然》雜志上。這一非凡的技術壯舉對于培育具有最佳營養成分和可持續生產的豆子的目標具有重要意義。由英國雷丁大學、丹麥奧胡斯大學和芬蘭赫爾辛基大學領導的一個來自歐洲和澳大利亞的研究小組合作進行了這項廣泛的測序工作
基因測序定義
基因測序是一種新型基因檢測技術,能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,預測罹患多種疾病的可能性,個體的行為特征及行為合理。基因測序技術能鎖定個人病變基因,提前預防和治療。 基因測序相關產品和技術已由實驗室研究演變到臨床使用,可以說基因測序技術是下一個改變世界的技術
基因測序原理
基因是位于DNA上的,其測序的原理是一樣的DNA測序的方法有很多種.目前最常見的是雙脫氧終止法了.在測序用的緩沖液中含有四種dNTP及聚合酶.測序時分成四個反應,每個反應除上述成分外分別加入2,3-雙脫氧的A,C,G,T核苷三磷酸(稱為ddATP,ddCTP,ddGTP,ddTTP),然后進行聚合反
基因測序簡介
測序技術迄今為止已發展了三代,測序技術有4個指標:讀長、成本、準確度、通量。 成本、準確度這兩項指標都很好理解,成本下降使得單個人類基因組的花費已經從2001年的1億美元下降到了1000美元以下。準確度則是測序結果的準確程度,例如二代測序的solid可以達到99.9%,而唯一投入實用的三代測序
從“基因測序儀”觀“測序行業”!
基因測序儀:基因測序“皇冠上的明珠” 基因測序儀是測序產業鏈的起點也是關鍵環節,它為整個中下游測序服務提供最基本的測序支撐,同時也是壁壘最高的部分,處于基因測序產業價值鏈頂端。基因測序儀對于基因產業的重要性,如同發動機之于汽車行業,芯片之于電子通信行業,可謂是基因測序“皇冠上的明珠”。 到目前為
高通量測序數據分析
1. 是不是一定要用大型計算機? 除了序列拼接組裝以外,其它分析不是一定要大型計算機,在普通的PC上也可以進行一些處理,當然,買一臺或幾臺高性能的工作站電腦,能顯著加快數據處理的速度。 2. 是不是一定要用Linux系統? 也不一定非用Linux不可,在Window下可以完成部分數據處理。
三代測序數據漫談
三代明星:PacBio及其序列數據再來看看江湖呼聲漸漲的三代測序技術。目前三代測序市場上,表現最為搶眼的莫過于以PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore Technologies為代表的納米孔單分子測序技術。與前兩代相比,三代測序最為核心的特點就是單分子測序,測序過程無需進
單細胞測序基準數據的特點
單細胞測序基準數據集是用于評估和比較不同單細胞測序數據分析方法和工具的標準化數據集。這些數據集通常具有以下特點:高質量和準確性:經過嚴格的質量控制和驗證,以確保數據的可靠性。多樣性:涵蓋不同的細胞類型、組織、物種和實驗條件,以全面測試分析方法的通用性。詳細的注釋:包括細胞類型、狀態、疾病信息等,以便
基因測序操作設備
過長的測序周期以及上萬美元的儀器成本,成了阻礙基因測序進入尋常百姓家的障礙。而運用新技術的基因測序儀大大降低了基因組測序的門檻,使得更多研究人員能夠使用這項技術開發多種應用。 總部位于美國加州的生命技術公司(Life Technologies),最近正在中國推出臺式基因測序儀Ion Proto
基因測序操作設備
過長的測序周期以及上萬美元的儀器成本,成了阻礙基因測序進入尋常百姓家的障礙。而運用新技術的基因測序儀大大降低了基因組測序的門檻,使得更多研究人員能夠使用這項技術開發多種應用。[2]?總部位于美國加州的生命技術公司(Life Technologies),最近正在中國推出臺式基因測序儀Ion P
基因測序首次獲準
2014年7月3日,中國首次批準第二代基因測序診斷產品作為醫療器械注冊,用于為孕產婦檢測唐氏綜合征等染色體疾病風險,以避免新生兒出生缺陷。 國家食藥總局表示,經審查,批準的BGISEQ-1000基因測序儀、BGISEQ-100基因測序儀和胎兒染色體非整倍體(T21、T18、T13)檢測試劑盒(
基因測序的發展
DNA測序技術正以驚人的速度向前發展。在過去十年中,高通量測序技術使數據生成呈指數級增長態勢。 由此產生的大量數據在基礎生物學領域的應用已經產生了變革性的影響,從考古學、刑事調查到產前診斷、癌癥預后,DNA測序與數據分析已經滲透到了生物相關的多個行業。 測序技術的瓶頸是分析和解釋所有的DNA序
什么是基因測序
基因測序是一種新型基因檢測技術,能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,預測罹患多種疾病的可能性,個體的行為特征及行為合理。基因測序技術能鎖定個人病變基因,提前預防和治療。 基因測序相關產品和技術已由實驗室研究演變到臨床使用,可以說基因測序技術,是下一個改變世界的技術[1]。