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  • 為什么檢測2019nCov用ORF1ab/S/N基因

    為什么當前nCov的核酸檢測試劑盒以ORF1ab、S和N作為目標基因?為什么單用ORF1b做進化就能推測nCov來源于蝙蝠?為什么用如此短的時間就能比較分析那么多種coronaviruses基因組從而否定重組陰謀論?我睡前思考著這些問題,索性搜搜文獻看。精神食糧讓我意識到自己是個無知的人類。 我檢索了有關nCov基因組可視化的文獻,截取了Paraskevis等人文章的組裝注釋圖[1](按道理講我更希望貼我國科學家發表在nature上的,無奈尺寸和配色不適用于手機屏幕),如下: 所以看看吧,這么小的基因組,就這么幾個主要的基因,你還想用哪個做qPCR?!哈哈哈,我真的是如此愚鈍。 此外,如此小的基因組,加上病毒基因組屬于單正義鏈RNA(所以也不會出現高等植物多倍體、雜合等問題),對下游計算分析的硬件要求及耗時也將相應降低,分析個重組不重組的當然會更快。 Zumla等人對冠狀病毒的生活史做了比較全面的綜述[2]。病......閱讀全文

    病毒介導基因轉移

    病毒介導基因轉移:前述的化學和物理方法都是通過傳染方式基因轉移。病毒介導基因轉移(viral mediatedgene transfer)是通過轉換方式完成基因轉移,即以病毒為載體(vector),將外源目的基因通過基因重組技術,將其組裝于病毒上,讓這種重組病毒去感染受體宿主細胞,這種病毒稱為病毒運

    關于漢坦病毒的病毒基因分析

      J.W.Song等從韓國絨鼠(Eothenomys regulus)分離了兩株PUU相關病毒,命名為Muju(MUJ)病毒。兩株病毒G2基因241bp片段序列存在1.2%差異,G2基因241bp片段和S基因208bp片段與PUU病毒相應片段序列的同源性分別為79.5%~83.4%和80.3%~8

    什么是病毒癌基因?

    它不編碼病毒結構成分,對病毒無復制作用,但是當受到外界的條件激活時可產生誘導腫瘤發生的作用。

    病毒癌基因的定義

    病毒癌基因(viral oncogene):是存在于致癌DNA病毒和一部分逆轉錄病毒基因組中能使靶細胞發生惡性轉化的基因。它不編碼病毒結構成分,對病毒無復制作用,但是當受到外界的條件激活時可產生誘導腫瘤發生的作用。

    重要病毒測序完成:基因交換病毒很棘手

    生物通報道:研究人員已經對來自大猩猩和黑猩猩的埃博拉病毒進行了首次測序,并且發現這種病毒比之前想象的更加易變。令人意外的是,他們還發現這種病毒的不同病毒株能夠交換基因——這意味著開發一種成功疫苗將變得更難。 埃博拉病毒(Ebola virus)能導致發燒和出血,并且90%的感染者會死亡。自1976

    基因療法:改良病毒為患者導入健康基因

      所謂基因療法,就是利用正常基因填補或替代基因疾病中某些病變或缺失的基因的治療方法。近年來,英國牛津和美國費城的一些研究人員宣布,他們對因患有罕見基因疾病而影響視力的病人們進行了治療,成功使他們的視力獲得改善。意大利的科學家們也宣布,他們使患有另外兩種基因疾病的病人病情得到了減輕。這些研究結果,以

    細胞化學詞匯病毒癌基因

    中文名稱:病毒癌基因外文名稱:viral oncogene類????型:癌基因位????置:存在于病毒(基因組屬????于:RNA病毒定? ? 義:病毒癌基因(viral oncogene):是存在于致癌DNA病毒和一部分逆轉錄病毒基因組中能使靶細胞發生惡性轉化的基因。它不編碼病毒結構成分,對病毒無

    丙型肝炎病毒的基因結構

      HCV-RNA約有9500-10000bp組成,5′和3′非編碼區(NCR)分別有319-341 bp,和27-55 bp,含有幾個順向和反向重復序列,可能與基因復制有關。在5′非編碼區下游緊接一可讀框(ORF),其中基因組排列順序為5'-C-E1-E2-p7-NS2-NS3-NS4-N

    痘苗病毒系統基因表達實驗

    重組痘苗病毒(VTF7-3)感染后的脂質體轉染 兩種重組痘苗病毒共感染細胞 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 本方案從構建外源基因位于 PT7 和 T7 終止子之間的質

    簡述病毒癌基因的作用

      逆轉錄病毒為RNA病毒中的一類,其RNA不會自我復制,而是在逆轉錄酶的作用下合成DNA,其DNA會整合到細胞DNA上,再源源不斷轉錄出RNA。這個整合過程使逆轉錄病毒可以獲取宿主細胞的遺傳信息。推測逆轉錄病毒的癌基因即為逆轉錄病毒從宿主細胞中獲得的細胞癌基因。  逆轉錄病毒基因組兩端為LTR,具

    基因編輯摧毀皰疹病毒

      幾乎所有人都會攜帶不同形式的皰疹病毒,而后果可能比偶發的唇皰疹嚴重得多。皰疹病毒還會引發帶狀皰疹,并且與失明、出生缺陷,甚至是癌癥存在關聯。然而,人們至今仍未擺脫它們。  對抗皰疹病毒的最好方法之一是阻斷它們復制DNA時所需的酶。不過,盡管這會使人體內的病毒水平下降,但它無法清除感染。更糟糕的是

    痘苗病毒系統基因表達實驗

    實驗方法原理 本方案從構建外源基因位于 PT7 和 T7 終止子之間的質粒載體開始,然后用重組質粒通過脂質體介導轉染已經被vTF7-3(可以持續表達T7 RNA聚合酶的痘苗病毒)感染的細胞。收獲后,基因產物在細胞內的表達可以用脈沖標記的方法或用「重組痘苗病毒及其產物的鑒定實驗」中敘述的方法分

    病毒介導基因轉移技術介紹

    病毒介導基因轉移:前述的化學和物理方法都是通過傳染方式基因轉移。病毒介導基因轉移(viral mediatedgene transfer)是通過轉換方式完成基因轉移,即以病毒為載體(vector),將外源目的基因通過基因重組技術,將其組裝于病毒上,讓這種重組病毒去感染受體宿主細胞,這種病毒稱為病毒運

    新“基因剪刀”可切除免疫缺陷病毒基因

    ??據在線發表于《自然·通信》上的一項最新研究,美國科學家已成功從非人類靈長類動物的基因組中編輯了SIV(猴免疫缺陷病毒,與人類免疫缺陷病毒HIV密切相關,即艾滋病的病因)。這一突破是在艾滋病病毒研究方面邁出的重要一步,將使研究人員比以往任何時候都更接近于開發出治療人類HIV感染的方法。 主持研

    -人造病毒突破基因治療瓶頸

      最近,西班牙巴塞羅那自治大學(UAB)生物技術和生物醫學研究所納米生物學部門的研究人員,在Antonio Villaverde的指導下,成功地制備了一種人造病毒——能夠自組裝并形成納米顆粒的蛋白質,能夠包圍DNA片段,穿透細胞,以一種非常不同的方式到達細胞核,然后在那里釋放治療性DNA片段。這一

    關于漢坦病毒的宿主基因分析

      多采用細胞色素B基因分析方法。W.C.Black IV等采用微衛星DNA分析確定鹿鼠之間的基因關系,并研究了鼠類窩內漢坦病毒傳播的方式。俄羅斯遠東地區南部的7種宿主動物中存在4種漢坦病毒(HTN、PUU、SEO、KBR)。  L.Minskaya等的研究表明,從非主要宿主動物分離的病毒與標準株抗

    人造病毒突破基因治療瓶頸

    最近,西班牙巴塞羅那自治大學(UAB)生物技術和生物醫學研究所納米生物學部門的研究人員,在Antonio Villaverde的指導下,成功地制備了一種人造病毒——能夠自組裝并形成納米顆粒的蛋白質,能夠包圍DNA片段,穿透細胞,以一種非常不同的方式到達細胞核,然后在那里釋放治療性DNA片段。這一成果

    丙型肝炎病毒的基因分型

      HCV基因分型還無統一標準,因用于基因分型的部位和采用的技術方法不同,出現了各種基因分型結果,但各種基因型分類方法之間有一定的對應關系,茲舉幾種基因型分類法供參考。  HCV基因型各種分型之間的對應關系  現知歐美國家多數HCV-Ⅰ型感染,而亞洲國家以Ⅱ型為主,Ⅲ型次之。Okomoto報告日本慢

    關于病毒癌基因的基本介紹

      病毒癌基因(viral oncogene):是存在于致癌DNA病毒和一部分逆轉錄病毒基因組中能使靶細胞發生惡性轉化的基因。它不編碼病毒結構成分,對病毒無復制作用,但是當受到外界的條件激活時可產生誘導腫瘤發生的作用。

    簡述皰疹病毒的基因結構

      HSV基因組為一線性DNA分子,由共價連接的長片段(L)和短片段(S)組成。每片段均含有單一序列和反轉重復序列。基因組中有72個基因,共編碼70各異的蛋白質,其中除24種蛋白的特性還不清楚外,有18種編碼蛋白組成病毒DNA結合蛋白及各種酶類,參予病毒DNA合成,包裝及核苷酸的代謝等。30多種不同

    概述基因沉寂的病毒的影響

      早在20世紀70年代初人們就發現,病毒或類病毒侵入植物后,RNA依賴性的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRP)的活性明顯提高。RdRP是生物體內普遍存在的一種RNA聚合酶,在體外能以單鏈RNA或單鏈DNA甚至以雙鏈RNA為模板,合成與模板互補RNA,合

    PNAS:讓病毒“吐出”基因組

      病毒感染導致的手足口病,會使兒童出現可能致命的腦腫脹和麻痹,現在科學家們找到了治療這種疾病的潛在途徑,這一發現也為對抗其他相關病毒提供了寶貴線索。   在中國和東南亞國家,每年都會出現手足口病的爆發,這種疾病是由腸道病毒71型(EV71)引起的。在一些受到感染的兒童中,病毒會引發腦炎造成永久性

    免疫缺陷病毒基因結構功能

      HIV基因組長約9.2~9.7kb,含gag、Pol、env、3個結構基因,及至少6個調控基因(TaT Rev、Nef、Vif、VPU、Vpr)并在基因組的5′端和3′端各含長末端序列。HIV LTR含順式調控序列,它們控制前病毒基因的表達。已證明在LTR有啟動子和增強子并含負調控區。  1.g

    痘苗病毒系統基因表達實驗(一)

    本節介紹依賴于在哺乳動物細胞質合成噬菌體 T7 RNA 聚合酶的瞬時細胞質表達系統。首先,將感興趣的基因插入質粒中,使其位于 T7 RNA 聚合酶啟動子(PT7)的控制下。應用脂質體轉染,重組質粒進入感染了 vTF7-3 的細胞質中,而 vTF7-3 是一種能編碼噬菌體T7 RNA聚合酶的重組痘苗病

    痘苗病毒系統基因表達實驗(二)

    實驗方法原理含有 pT7 控制的外源基因(本實驗「重組痘苗病毒(VTF7-3)感染后的脂質體轉染」)的重組質粒,通過同源重組可整合到痘苗病毒中,并制備重組病毒儲液。將此病毒儲液與 vTF7-3 共同感染貼壁或懸浮細胞,在培養過程中,外源基因被高效的 T7 RNA 聚合酶轉錄,并在感染細胞的細胞質完成

    人工病毒載體可用于基因編輯

    《自然·通訊》30日報告了一種制作人工病毒樣載體的方法,所制載體能進入人類細胞執行特定任務,如基因編輯。這種大容量、可定制化的納米材料為未來基因療法和定制化醫療帶來新希望。病毒是一種高效的生物“機器”,能夠快速復制和組裝后代。自然的人類病毒,如慢病毒屬,此前曾經過改造在動物中遞送治療性的DNA或RN

    深圳禽流感死亡病例病毒與野鳥病毒基因接近

      記者1月2日從深圳疾控中心了解到,深圳一感染高致病性禽流感患者2011年12月31日因醫治無效死亡。深圳疾控中心對死亡病例樣本進行病毒測序,結果顯示,此例病毒與香港2011年禽流感死亡的野鳥病毒基因接近,與家禽較遠。但目前仍不能確定這名患者感染上高致病性禽流感是否與候鳥有關。   深圳疾控中心

    Science:人巨細胞病毒病毒基因組測序

      人巨細胞病毒是一種很常見的皰疹病毒,感染約50-100%的成人,但通常沒有不良影響,并且它可以保持潛伏多年。人巨細胞病毒感染是比較常見的,發展中國家感染人數比發達國家人數多。   該病毒可導致出新生兒生缺陷和免疫系統受損,可能會導致致命疾病。該病毒也與癌癥發展有關聯。這項新的研究分析了病毒的蛋

    樹懶基因組中發現“化石”病毒

      ????? 二趾樹懶(Choloepus hoffmanni,如上圖)的基因組中隱藏著一個“化石”病毒。   據美國《科學》雜志在線新聞報道,就像恐龍在焦油中留下的腳印一樣,逆轉錄酶病毒會將其DNA中的一些片段插入到一種動物的基因組中。研究人員在樹懶的基因組中發現了泡沫病毒的古老片段。研究人

    基因轉染技術的病毒方法轉染介紹

      病毒作為基因轉染是基因遞送良好的工具,病毒載體的優點有:  (1)在轉化的細胞中傳播重組的DNA分子作為穩定的遺傳成分;  (2)可能將有缺陷的或突變的基因置于病毒調節信號的控制下以進行研究;  (3)能將克隆的基因作為病毒微染色體的一部分 ,并能進行分離;  (4)轉移效率較高。其主要缺點是病

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