SSR標記實驗步驟
一、簡介:SSR簡單序列重復標記(Simple sequence repeat, 簡稱SSR標記),也叫微衛星序列重復,是由一類由幾個核苷酸(1-5個)為重復單位組成的長達幾十個核苷酸的重復序列,長度較短,廣泛分布在染色體上。由于重復單位的次數的不同或重復程度的不完全相同,造成了SSR長度的高度變異性,由此而產生SSR標記或SSLP標記。雖然SSR在基因組上的位置不盡相同,但是其兩端序列多是保守的單拷貝序列,因此可以用微衛星區域特定順序設計成對引物,通過PCR技術,經聚丙烯酰胺凝膠電泳,即可顯示SSR位點在不同個體間的多態性。優點:(1)標記數量豐富,具有較多的等位變異,廣泛分布于各條染色體上;(2)是共顯性標記,呈孟德爾遺傳;(3)技術重復性好,易于操作,結果可靠。缺點:開發此類標記需要預先得知標記兩端的序列信息,而且引物合成費用較高。二、操作程序:取葉片→磨樣→提取DNA→PCR擴增→電泳檢測→染色→讀帶標記。1、DNA提取......閱讀全文
SSR標記實驗步驟
一、簡介:SSR簡單序列重復標記(Simple sequence repeat, 簡稱SSR標記),也叫微衛星序列重復,是由一類由幾個核苷酸(1-5個)為重復單位組成的長達幾十個核苷酸的重復序列,長度較短,廣泛分布在染色體上。由于重復單位的次數的不同或重復程度的不完全相同,造成了SSR長度的高度變異
SSR標記實驗步驟
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 與其它分子標記相比,SSR標記具有以下優點:(1)數量豐富,覆蓋整個基因組,揭示的多態性高;(2)具有多等位基因的特性,提供的信息量高;(3)以 孟德爾方式遺傳,呈共顯性;(4)每個位點由設計的引物順序決定,便于不同的實
SSR標記實驗步驟
SSR簡單序列重復標記可以用于:用微衛星區域特定順序設計成對引物,通過PCR技術,經聚丙烯酰胺凝膠電泳,即可顯示SSR位點在不同個體間的多態性。實驗方法原理與其它分子標記相比,SSR標記具有以下優點:(1)數量豐富,覆蓋整個基因組,揭示的多態性高;(2)具有多等位基因的特性,提供的信息量高;(3)以
中科院西雙版納課題組開發出柬埔寨龍血樹SSR分子標記
柬埔寨龍血樹SSR分子標記的開發為其保護遺傳學研究奠定基礎 柬埔寨龍血樹(Dracaenacambodiana)為百合科龍血樹屬植物,單子葉喬木狀,分布于云南南部及西南部、廣西西南部、海南南部,生于海拔950-1700m的石灰巖上,為耐寒、喜鈣樹種,在柬埔寨、泰國、越南和老撾也
SSR銀染方法
SSR銀染方法(輕輕震蕩)1、固定10%乙醇+0.5%冰乙酸 6min×2次2、染色0.2% AgNO3 12min3、漂洗(1)蒸餾水 1-2min(2)0.002% Na2S2O3 1-2min(3)顯色1.5%NaOH + 0.4%甲醛(4)保存0.75%Na2CO3
SSR分析技術介紹
微衛星標記(microsatellite),又稱為短串聯重復序列(short tandem repeats,STR)或簡單重復序列(simple sequence repeats,SSR),是均勻分布于真核生物基因組中的簡單重復序列,由2~6個核苷酸的串聯重復片段構成。由于重復單位的重復次數
SSR分子標記技術及其在構建玉米DNA指紋庫上的應用1
SSR分子標記技術及其在構建玉米DNA指紋庫上的應用 康麗麗 周鴻飛(沈陽農業大學農學院) 玉 米是一種重要的飼用、糧用和工業加工作物,在國民經濟中占有重要的地位。玉米育種方法的改進對農業發展具有重要意義。長期以來,育種家們大多數是借用易于 鑒別的形態學和同工酶等遺傳標記來輔助育種,并取得了很大成功
SSR分子標記技術及其在構建玉米DNA指紋庫上的應用2
2玉米DNA指紋庫的構建2. 1利用SSR分子標記構建玉米DNA指紋庫目 前,國內外對玉米種質鑒定采用的遺傳標記仍以形態標記為主,參考同工酶和種子貯藏蛋白標記。但形態標記的表現受環境影響較大,鑒定工作量大,周期長,受季 節限制。同工酶和種子貯藏蛋白標記多態性不夠豐富,同工酶還存在組織和器官特異性,取
SSR及PAGE電泳2
2、反應混合液配制在0.5mL Eppendorf管中加入下列試劑: 稀釋DNA 2 μL primer 各0.5 μL 10×PCR Buffer 2.5 μL dNTP 2 μL MgCl2 1.5 μL Taq酶 0.2 μL
SSR-GEL-and-Silver-Staining-Protocol
I.?EQUIPMENT:DNA sequencing unit (35 x 45 cm) & 2000V power supplyClampsLg. plastic trays (4), about 43 x 50 x 8 cm, and one lidTwo rocking platformsH
SSR及PAGE電泳1
相關知識SSR簡介所有真核生物基因組中都有一類叫微衛星(microsatellite)或簡單序列重復(simple sequence repeats)的序列,它是由2-5個核苷酸首尾相連重復多次構成的一段DNA序列,具有很強的保守性。可以根據這段序列兩邊的序列設計引物,用PCR方法擴增出中間的S
SSR(simple-sequence-repeat)技術
SSR(simple sequence repeat )技術是另一種非常有用的分子標記技術,在生物體基因組內存在許多重復的簡單序列小片斷,在不同種內小片斷的重復數不同,這種不同的重復數,是由其遺傳基因所決定,有種屬特異性,這種差異經PCR擴增后,被放大到可檢測程度。因此SSR構成了另一種標記系統
不容錯過的SSR分析技術
微衛星標記(microsatellite),又稱為短串聯重復序列(short tandem repeats,STR)或簡單重復序列(simple sequence repeats,SSR),是均勻分布于真核生物基因組中的簡單重復序列,由2~6個核苷酸的串聯重復片段構成。由于重復單位的重復次數在個
簡介固態繼電器的負載與SSR的選擇
SSR對一般的負載應是沒有問題的,但也必須考慮一些特殊的負載條件,以避免過大的沖擊電流和過電壓,對器件性能造成不必要的損壞。白熾燈、電爐等類的“冷阻”特性,造成開通瞬間的浪涌電流,超過額定工作電流值數倍。一般普通型SSR,可按電流值的2/3選用。增強型SSR,可按廠商提供的參數選用。在惡劣條件下
str測序原理
微衛星DNA又稱短串聯重復序列(short tandem repeats, STR) 、簡單重復序列(simple sequence repeat, SSR),指DNA基因組中小于10個核苷酸的簡單重復序列,廣泛存在于真核基因組中,多數以2~6個堿基為核心單位、串聯重復排列的序列。 1974年,S
微衛星技術(micro-satellite,-MS)
微衛星DNA又稱短串聯重復序列(short tandem repeats, STR) 、簡單重復序列(simple sequence repeat, SSR),指DNA基因組中小于10個核苷酸的簡單重復序列,廣泛存在于真核基因組中,多數以2~6個堿基為核心單位、串聯重復排列的序列。 1974年,S
幾種標記實驗的特點
RAPD利用 10 個堿基的一個或幾個隨機引物非定點地擴增 DNA 片段,一般一個引物可擴增 6-12 條 DNA 片段,利用凝膠電泳分開擴增的片段,從而進行基因多態性研究。 RAPD 是一種能快速進行基因多態性研究的技術,并且由于不涉及印跡雜交、放射性自顯影等技術,因此簡便易行。SSR 真核生物的
常用的幾種分子標記
RAPD利用 10 個堿基的一個或幾個隨機引物非定點地擴增 DNA 片段,一般一個引物可擴增 6-12 條 DNA 片段,利用凝膠電泳分開擴增的片段,從而進行基因多態性研究。 RAPD 是一種能快速進行基因多態性研究的技術,并且由于不涉及印跡雜交、放射性自顯影等技術,因此簡便易行。?SSR 真核生物
種子的SSR檢測——高通量前處理解決方案
美國SPEX SamplePrep公司擁有60余年的專業樣品前處理儀器生產經驗和專業背景。SPEX GENO高通量組織研磨儀,開始是專門為杜邦旗下先鋒良種農業(PIONEER)植物樣品而研發。SSR(又稱微衛星DNA)標記,由于其共顯性遺傳特點,可以鑒定雜合子和純合子。該標記法需要DNA量少,實驗重
武漢植物園蓮遺傳連鎖圖譜研究取得進展
遺傳連鎖圖譜是研究植物基因組結構、進化的有力工具,是基因定位、克隆和分子標記輔助育種的重要基礎。但作為被子植物中起源最早的植物之一,且素有“活化石”之稱的蓮,其基因組學研究卻明顯滯后。因此,構建蓮遺傳連鎖圖譜有助于蓮基因組學研究的快速發展,為蓮重要經濟性狀的分離和克隆提供依據,從
蓮遺傳連鎖圖譜研究取得進展
遺傳連鎖圖譜是研究植物基因組結構、進化的有力工具,是基因定位、克隆和分子標記輔助育種的重要基礎。但作為被子植物中起源最早的植物之一,且素有“活化石”之稱的蓮,其基因組學研究卻明顯滯后。因此,構建蓮遺傳連鎖圖譜有助于蓮基因組學研究的快速發展,為蓮重要經濟性狀的分離和克隆提供依據,從而有利于進一步探
PCR擴增標記法探針標記
PCR擴增標記法探針標記???? PCR擴增標記法的原理與普通的核酸PCR相同。即Taq?DNA多聚酶以DNA為模板,在特異引物引導下,在PCR儀中合成cDNA探針。由于在反應體系中加入一定量的標記dNTP,因此擴增的同時又是一個標記過程。cDNA探針PCR擴增法標記原理
高通量組織研磨儀分析南瓜雜交種純度
在水稻、玉米、大豆、油菜等重要農作物上,SSR標記技術已成為一種普遍采用的純度鑒 定方法。SSR標記由于具有數量豐富,多態性高,共顯性遺傳,操作簡便,結果穩定可靠等優點,已成為當今作物品種純度鑒定的理想標記類型。且快速簡便 SSR檢測方法也被研究建立起來,"南瓜SSR標記開發較遲,目前主要用于遺傳連
SSR固態繼電器對于特殊的負載要慎重考慮
SSR固態繼電器對一般的負載應是沒有問題的,但也必須考慮一些特殊的負載條件,以避免過大的沖擊電流和過電壓,對器件性能造成不必要的損壞。? 白熾燈、電爐等類的“冷阻”特性,造成開通瞬間的浪涌電流,超過額定工作電流值數倍。一般普通型SSR,可按電流值的2/3選用。增強型SSR,可按廠商提供的參數選
農作物種子純度鑒定方法綜述4
4.2 SSR(Simple sequence repeat,簡單序列重復標記)由Moore等于1991年創立。SSR即微衛星DNA,是一類由幾個(多為1~5個)堿基組成的基序(motif)串聯重復而成的DNA串聯重復序列,其長度一般較短,廣泛分布于基因組的不同位置,如(cA)n、(AT)n、(GG
花粉活力分析儀在茄子和辣椒育種中的應用
傳統育種技術結合新型的細胞及分子育種技術能夠大大提高育種效率,有效的提高茄科植物的產量和品質,法國Vegenov技術資源中心利用阻抗流式細胞儀Ampha Z32對不同品種的辣椒和茄子的花粉數量及活性進行了測定,快速篩選出用于DH生產的最佳的品種,并利用分子檢測技術建立了辣椒和茄子的遺傳指紋圖譜。
單克隆抗體的標記(酶標記、熒光素標記、同位素標記和...1
目前動物用單抗,在動物疫病診斷和檢疫、妊娠檢測、性別鑒定等方面有廣泛的應用,大多以診斷試劑(盒)的形式提供,其中核心試劑為標記的單抗。下面將介紹最常用的幾種標記技術。?一、酶標記?1、辣根過氧化物酶(HRP)標記?辣根過氧化物酶(HRP)標記單抗和多克隆抗體的常用方法是過碘酸鈉法。其原理是HRP的糖
單克隆抗體的標記(酶標記、熒光素標記、同位素標記和...2
單克隆抗體的標記(酶標記、熒光素標記、同位素標記和生物素標記)(3)移入透析袋中,在1000ml 0.01mol/L PH9.5碳酸鹽緩沖液中,4℃透析過夜,更換三次緩沖液,注意避光。?(4)吸取上述醛化好的HRP溶液3ml,加入5mg IgG的碳酸鹽緩沖液1ml,室溫輕攪2-3小時,避光;加入5m
特異引物的PCR標記的相關介紹
特異引物的PCR標記所用引物是針對已知序列的 DNA 區段而設計的,具有特定核苷酸序列(通常為 18—24 bp),可在常規PCR復性溫度下進行擴增,對基因組 DNA 的特定區域進行多態性分析。 ①序列標志位點 (Sequence Tagged Sites,STS) STS是對以特定對引物
RNA標記
RNA labeling?(Amersham Pharmacia)For the generation of radiolabelled, single stranded RNA for use as hybridization probes??32P-pCp 3' End-labeling