表觀遺傳學修飾
組蛋白修飾 表觀遺傳學是指表觀遺傳學改變 (DNA 甲基化、組蛋白修飾和非編碼 RNA 如 miRNA) 對 表觀基因組基因表達的調節，這種調節不依賴基因序列的改變且可遺傳表觀。因素如 DNA 甲基化、組蛋白修飾和 miRNA 是對環境刺激因素變化的反映，這些表觀遺傳學因素相互作用以調節基因表達，控制細胞表型，所有這些表觀遺傳學因素都是維持機體內環境穩定所必需的，有助于正常生理功能的發揮。 組蛋白的翻譯后修飾不僅與染色體的重塑和功能緊密相關，而且在決定細胞命運、細胞生長以及致癌作用的過程中發揮著重要的作用，如組蛋白磷酸化就在有絲分裂、細胞死亡、DNA 損傷修復、DNA 復制和重組過程中發揮著直接的作用。組蛋白翻譯后修飾多發生在組蛋白的 N-端尾部，包括甲基化、乙酰化、磷酸化、ADP-核糖基化、泛素化和小分子泛素化修飾，這些修飾有助于其他蛋白質與 DNA 的結合，從而產生協同或者拮抗作用來調控基因轉錄。例如，乙酰化使組......閱讀全文
基因組DNA甲基化分析方法
早期的基因組DNA甲基化分析技術，如SssI甲基轉移酶分析法、氯乙醛反應法、免疫學抗體技術等，已經不能滿足現代表觀遺傳學研究的需求。今年來常用的基因組甲基化的方法有以下兩種。1. 甲基化敏感擴增多態性實驗甲基化敏感擴增多態性實驗技術被用于檢測雙向型真菌的DNA甲基化，它是在擴增片段長度多態性技術的基
用DNA－芯片技術檢測基因的表達
實驗概要生物芯片是將生命科學研究中所涉及的不連續的分析過程(如樣品制備、化學反應和分析檢測)，利用微電子、微機械、化學、物理技術、計算機技術在固體芯片表面構建的微流體分析單元和系統，使之連續化、集成化、微型化。生物芯片技術主要包括四個基本要點：芯片方陣的構建、樣品的制備、生物分子反應和信號的檢測。1
用DNA芯片技術檢測基因的表達
一、芯片制備基因芯片的制備主要有兩種基本方法，一是在片合成法，另一種方法是點樣法。在片合成法是基于組合化學的合成原理,它通過一組定位模板來決定基片表面上不同化學單體的偶聯位點和次序。在片合成法制備DNA芯片的關鍵是高空間分辨率的模板定位技術和固相合成化學技術的精巧結合。目前，已有多種模板技術用于基因
用DNA芯片技術檢測基因的表達
一、芯片制備基因芯片的制備主要有兩種基本方法，一是在片合成法，另一種方法是點樣法。在片合成法是基于組合化學的合成原理,它通過一組定位模板來決定基片表面上不同化學單體的偶聯位點和次序。在片合成法制備DNA芯片的關鍵是高空間分辨率的模板定位技術和固相合成化學技術的精巧結合。目前，已有多種模板技術用于基因
杰青朱冰團隊發現CSE1L的表達影響DNA甲基化基因沉默機制
2018年4月10日《PNAS》雜志在線發表了朱冰課題組的研究論文“Roles of the CSE1L-mediated nuclear import pathway in epigenetic silencing”。該研究發現CSE1L作為細胞中經典入核轉運途徑中的重要蛋白，是維持部分甲基化
在基因組范圍定位DNA甲基化
DNA甲基化在哺乳動物基因表達中扮演了重要角色。盡管通過線粒體遺傳且隨時間穩定，但是細胞分化、疾病或環境影響都會改變DNA甲基化的模式。近年來，科學家們開發出多種新方法，試圖在基因組范圍定位DNA甲基化。 盡管從理論上來說，全基因組亞硫酸氫鹽測序能讓研究人員全面觀察甲基化組，但它還是面臨技
揭示DNA甲基化與基因沉默的關系
DNA 甲基化與真核基因和轉座子的轉錄抑制有關，但基因沉默的下游機制在很大程度上是未知的。 2021年6月3日，加州大學洛杉磯分校Steven E. Jacobsen團隊在Science 在線發表題為“MBD5 and MBD6 couple DNA methylation to gene s
DNA微陣列檢測基因表達水平及識別基因序列
Schena等1996年用擬南芥光調基因微陣列，以不同器官中的mRNA為探針，檢測其基因表達水平，結果表明葉mRNA的表達水平是根的500倍。Shelon等1996年將釀酒酵母基因組DNA克隆制成微陣列，用6條最大染色體和10條最小染色體DNA探針分別標記上紅，綠熒光標記進行雜交檢測，結果表明9
DNA重組（DNA－recombination）技術：外源基因的蛋白表達2
2.包涵體的分離與純化細胞破碎時提取細胞內產物的關鍵。對于細菌的裂解常用的有酶溶法、超聲破碎法、化學滲透法、玻璃珠研磨等。包涵體可通過超聲波、勻漿等常規的方法是菌體破碎后，離心就可得到。密度梯度離心后可得到高純度的包涵體。包涵體一般不溶于水，為了獲得可溶性的蛋白質可加入強蛋白質變性劑后使其溶解。一般
DNA重組（DNA－recombination）技術：外源基因的蛋白表達1
通過外源DNA的重組、克隆、以及鑒定，可以獲得所需的特異DNA克隆。外源克隆基因在某種表達載體及適宜的宿主細胞中可表達為相應的蛋白質，這就組成了外源基因的蛋白表達系統。表達后的蛋白質必須具有原來的生物學活性，這是基于正確的基因轉錄、轉錄后加工、mRNA翻譯及翻譯后修飾，同時與表達載體的結構和表達體系
DNA重組（DNA－recombination）技術：外源基因的蛋白表達3
（6）遺傳標記： 從成千上萬個哺乳細胞中，檢測出極少數的含DNA重組體的轉染細胞，并鑒定已導入外源DNA是哺乳動物細胞基因表達系統的一個關鍵內容。因此，在真核生物表達載體上必須附有標記基因，才能進行篩選。常用的標記基因有：胸苷激酶基因（thymidine kinase，TK）、二氫葉酸還原酶
DNA重組（DNA－recombination）技術：外源基因的蛋白表達4
（3）CHO細胞穩定表達系統：動物細胞瞬時表達系統中外源基因沒有穩定地整合到宿主細胞染色體中，一染色體外DNA的形式存在。因而只能瞬時表達。要使外源基因在宿主細胞中高效、穩定地表達，必須建立一個穩定表達系統，包括適宜的表達載體、有效的基因轉染、標記基因和目標基因的選擇與共擴增、受體適當的受體細胞和培
DNA與RNA能協同互補調控基因表達
比利時布魯塞爾自由大學主導的一項研究揭示，DNA和RNA的表觀遺傳學協同調控比過去想象的更加緊密。這項發表在最新一期《細胞》雜志上的研究，結合了DNA和RNA研究結果，指出這兩種調控方式共同作用，形成一個互補系統：DNA表觀遺傳學決定了哪些基因可以被激活，而RNA表觀遺傳學則動態調整這些基因的表達水
關于DNA重組的基因表達載體的介紹
將目的基因與運載體結合的過程，實際上是不同來源的DNA重新組合的過程。如果以質粒作為基因表達運載體， 首先要用一定的限制酶切割質粒，使質粒出現一個缺口，露出黏性末端。然后用同一種限制酶切斷目的基因，使其產生相同的黏性末端（部分限制性內切酶可切割出平末端，擁有相同效果）。將切下的目的基因的片段插
DNA分析系統：基因甲基化研究的最佳工具
甲基化研究對于基因的 調控和腫瘤的發生有非常密切的關系。在一般正常的細胞中，基因調控區CpG島處于非甲基化的狀態。而當細胞發生癌變后，這些CG區域往往呈現甲基化狀態。英國醫學刊物《the Lancet》報道奧地利因斯布魯克醫學院的專家們早就可以通過檢測大便中DNA的甲基化變化，把健康人的大便
線蟲基因組中存在DNA甲基化現象
2012年10月18日，吉林大學和華大基因合作完成的旋毛形線蟲不同發育階段DNA甲基化差異分析的相關研究成果在國際著名期刊《基因組生物學》(Genome Biology)上發表。該研究首次證實了線蟲基因組中存在DNA甲基化現象，改寫了長期以來認為線蟲中沒有該表觀遺傳修飾的歷史，同時也使以DN
DNA甲基化分析
The influence of methylation on the promoter activity and gene expression and the involvement of DNA methylation in carcinogenesis caused an extensive
DNA甲基化預測
實驗概要本實驗分別對DNA片段、基因、啟動子和外顯子進行了甲基化的計算預測，并且隨機選擇了1000甲基化的和1000未甲基化的個體進行預測。用于甲基化預測的特征有：GC相關特征、四聯體頻率、轉錄因子結合位點(TFBSs)。所有預測方法均采用Weka提供的軟件進行。實驗步驟1. DNA甲基化數據本研究
DNA－microarray相關的基因表達數據處理攻略
基因表達譜 的發展有助于科研工作人員進一步的理論知識充實及應用到研發等領域中。基因芯片是最近幾年發展起來的基因表達重要工具，本文主要對這種技術的數據分析和管理方法作具體介紹。一、引言DNA微陣列(DNA microarray),也叫基因芯片，是近幾年發展起來的一種能快速、高效檢測DNA片段序列、基因
基因組直接測序法檢測DNA的甲基化
基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法，用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理，并以連接介導的PCR來放大信號強度，然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解，故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解反應
Pyrosequencing－DNA分析系統：基因甲基化研究的最佳工具
甲基化研究對于基因的調控和腫瘤的發生有非常密切的關系。在一般正常的細胞中，基因調控區CpG島處于非甲基化的狀態。而當細胞發生癌變后，這些CG區域往往呈現甲基化狀態。英國醫學刊物《the Lancet》報道奧地利因斯布魯克醫學院的專家們早就可以通過檢測大便中DNA的甲基化變化，把健康人的大便與結腸癌患
北京基因組所揭示半甲基化在基因表達調控中的作用
DNA甲基化是最早發現的表觀遺傳標記之一，在真核細胞基因表達調控中發揮重要作用。隨著DNA甲基化檢測技術的進步，研究發現DNA甲基化具有完全甲基化和半甲基化兩種狀態，以及可以穩定遺傳的半甲基化修飾。關于DNA半甲基化是否具有獨特的生物學功能仍有爭議，因而需要對DNA半甲基化進行研究。此外，傳統的
DNA甲基化的原理
DNA甲基化是最早被發現、也是研究最深入的表觀遺傳調控機制之一。廣義上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的堿基在DNA甲基轉移酶（DNA methyltransferase，DNMT）的催化作用下，以S—腺苷甲硫氨酸（S—adenosyl methionine，SAM）作為甲基供體，通過共價鍵結合的
什么是DNA甲基化？
DNA甲基化（DNA methylation）為DNA化學修飾的一種形式，能夠在不改變DNA序列的前提下，改變遺傳表現。所謂DNA甲基化是指在DNA甲基化轉移酶的作用下，在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5號碳位共價鍵結合一個甲基基團。大量研究表明，DNA甲基化能引起染色質結構、DNA構象、DNA穩定性
什么是DNA甲基化？
DNA甲基化（DNA methylation）為DNA化學修飾的一種形式，能夠在不改變DNA序列的前提下，改變遺傳表現。所謂DNA甲基化是指在DNA甲基化轉移酶的作用下，在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5號碳位共價鍵結合一個甲基基團。大量研究表明，DNA甲基化能引起染色質結構、DNA構象、DNA穩定性
DNA甲基化技術介紹
DNA 甲基化是表觀遺傳學(Epigenetics)的重要組成部分，在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發育以及人類腫瘤發生中起著重要作用，是目前新的研究熱點之一。介紹DNA甲基化是最早被發現、也是研究最深入的表觀遺傳調控機制之一。廣義上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的堿基在DNA甲基轉移酶（DN
dna甲基化與rna甲基化的區別
DNA甲基化和組蛋白修飾的相同點：都有包含甲基化修飾；不同點：修飾對象不同，一個是對DNA修飾，一個是對蛋白：組蛋白修飾。而RNA干擾是對RNA的降解，與前兩者差異較大。
人類基因組DNA甲基化數據分析
近期來自電子科技大學，清華大學等處的研究人員從CpG島等基本定義出發，闡述了高通量DNA甲基化的檢測技術以及針對芯片技術與下一代測序技術的低水平數據處理方法，并重點對比了基于機器學習理論對CpG位點及CpG島甲基化水平的預測算法，以及所利用的特征對預測效果的影響與發展趨勢。 DNA甲基化是表觀
吸煙可以改變－DNA－甲基化
近日，英國 Nature 出版社子刊《Scientific Reports》在線發表了浙江大學醫學院附屬第一醫院李明定教授和他的學生馬云龍博士最新研究成果——首次利用系統生物學的方法探討吸煙如何導致癌癥發生的表觀遺傳學機制，證明了吸煙可以通過改變 DNA 甲基化而導致癌癥的發生，為預防和治療由吸
DNA甲基化的作用原理
DNA甲基化是最早被發現、也是研究最深入的表觀遺傳調控機制之一。廣義上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的堿基在DNA甲基轉移酶（DNA methyltransferase，DNMT）的催化作用下，以S—腺苷甲硫氨酸（S—adenosyl methionine，SAM）作為甲基供體，通過共價鍵結合的