NAR：人類基因組中或含有超過20％的非編碼基因
近日，一項刊登在國際雜志Nucleic Acids Research上的研究報告中，來自美國國家癌癥研究中心的科學家們通過研究發現，高達20%的編碼基因可能根本就無法進行編碼，因為這些基因具有非編碼或偽基因（即過時的編碼基因）的特征，由此導致的人類基因組的縮小或許會對生物醫學領域產生重要的影響，因為產生蛋白質的基因數量以及其身份對于科學家們研究包括癌癥和心血管疾病在內的多種疾病都至關重要。圖片來源：k_e_n / Fotolia 2003年科學家們完成了人類全基因組測序工作，研究人員發現，人類基因中實際上攜帶有2萬個彼此分離的編碼基因。研究人員對編碼相關人類蛋白質組的基因進行了分析，對來自數據庫GENCODE/Ensembl， RefSeq和UniProtKB中參考蛋白質組的詳細對比分析后他們發現了22210個編碼基因，但這些基因中僅有19446個基因出現在數據庫中；而剩下的2764個基因似乎僅存在于一個或兩個數據庫的注釋......閱讀全文
迄今最全面的非編碼基因組圖譜問世
生命科學 非編碼 DNA 延伸段在發育和基因調控中發揮著關鍵作用。2 月 3 日發表在《自然》（Nature）上的一項新研究稱，來自美國麻省理工學院（MIT）的研究團隊發表了迄今為止最全面的非編碼基因組圖譜，EpiMap（Epigenome Integration across Multi
基因組所發表長非編碼RNA分類問題綜述文章
近日，中國科學院北京基因組研究所基因組科學與信息重點實驗室的“百人計劃”研究員章張及其團隊，與沙特阿卜杜拉國王科技大學(King Abdullah University of Science and Technology)開展科研合作，對長非編碼RNA的分類問題進行了系統綜述，相關論文在RN
NAR：人類基因組中或含有超過20％的非編碼基因
近日，一項刊登在國際雜志Nucleic Acids Research上的研究報告中，來自美國國家癌癥研究中心的科學家們通過研究發現，高達20%的編碼基因可能根本就無法進行編碼，因為這些基因具有非編碼或偽基因（即過時的編碼基因）的特征，由此導致的人類基因組的縮小或許會對生物醫學領域產生重要的影響，
基因組密碼被解鎖：深度學習模型破解非編碼區奧秘
人類基因組中超98%的遺傳變異位于非編碼區，這些變異通過調控染色質可及性、三維構象、剪接加工等多種分子機制影響基因表達，最終導致疾病發生。由于調控機制的復雜性和細胞類型特異性，目前解讀非編碼變異的分子效應仍是重大挑戰。現有深度學習模型在預測功能基因組特征時，往往在輸入序列長度與預測分辨率之間難以兼顧
Nature子刊：非編碼RNA癌癥藥物基因組圖譜新突破
近日，匹茲堡大學藥物遺傳研究中心的楊達和張敏課題組借力于一種名為彈性網絡回歸（Elastic Net regression）的機器學習模型，從1,001個腫瘤細胞系的高通量長非編碼RNA表達譜（long noncoding RNAs, lncRNAs）與265種抗癌藥物敏感性數據中，挖掘出了27
人類癌癥基因組非編碼區域中鑒別出關鍵的致癌突變
近日，一項刊登在國際雜志Nature上的研究報告中，來自加拿大安大略省癌癥研究所的科學家們通過研究在人類癌癥基因組中的大量非編碼區域（也被稱之為人類癌癥DNA的“暗物質”）中發現了一種新型的致癌突變；這種突變或能作為一種新型潛在的治療靶點，幫助科學家們開發治療多種類型癌癥的新型療法，包括腦癌、肝
北京基因組所合作開發完成長非編碼RNA數據庫
長非編碼RNA（Long non-coding RNA, lncRNA）是近年來國際研究的新熱點,與人類癌癥、神經系統等疾病發生密切相關，在疾病診療方面表現出了潛在的重大應用價值。雖然長非編碼RNA表達量相對較低，但由于其在轉錄、基因組印記、翻譯、可變剪切、轉錄后表達調控、蛋白運輸與定位等過程的
在非結核分枝桿菌的基因組中，糖分解途徑相關酶編碼基因有哪些？
非結核分枝桿菌（Non-tuberculous mycobacteria，簡稱NTM）是一類廣泛存在于環境中的細菌，其中一些種類可以引起人類和動物的感染。在非結核分枝桿菌的基因組中，糖分解途徑相關酶編碼基因主要包括以下幾種： 糖酵解途徑（Glycolysis）：這是細胞獲取能量的主要途徑。非結
我國發現一類新型長非編碼RNA－基因組“暗物質”不斷“正名”
國際著名學術期刊Molecular Cell近日在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲研究組關于長非編碼RNA的最新進展。該研究發現，一類新型長非編碼RNA，或與小胖威利綜合征的發生發展密切相關。 人類基因組中存在大量被稱為基因組“暗物質”的非編碼序列，包括基因
Science首次證實全新基因的非編碼來源
在過去的幾年里，科學家們已逐漸認識到基因組中本來是非編碼的區域，確實有可能形成新基因。事實上，相關物種基因組的比較也甚至指出，這種從頭形成基因的方式也許是一種普遍模式。 來自加州大學戴維斯分校的研究人員近期發現了在6種果蠅株系中全部或部分表達的142個轉錄子，對應于果蠅參考基因組(refe
智力障礙相關非編碼基因突變發現
科技日報北京6月6日電?（記者張夢然）新一期《自然·醫學》發表的一項大規模遺傳學研究結果顯示，相比目前已知的其他任何非性別相關基因，RNU4-2基因的罕見突變，可能是更多臨床診斷智力障礙病例的一個促進因素。新發現有望促進對特定神經發育疾病的診斷和治療。智力障礙是一種神經發育疾病，其特征為智力功能以及
非結核分枝桿菌的基因組中可能含有哪些與糖代謝途徑相關的酶編碼基因？
糖酵解途徑相關酶編碼基因：NTM的基因組中可能含有許多糖酵解途徑相關酶編碼基因，如葡萄糖激酶（GK）、磷酸果糖激酶（PFK）、丙酮酸激酶（PK）等。這些酶催化葡萄糖或其他糖類物質的初步分解，生成丙酮酸等中間產物。 糖異生途徑相關酶編碼基因：NTM的基因組中可能含有許多糖異生途徑相關酶編碼基因，
基因組重編碼生物體“赭石”誕生
美國耶魯大學合成生物學家創建了一種新型基因組重新編碼生物體（GRO），并命名為“赭石”（Ochre），實現了對生物體遺傳密碼的重寫。這一成果發表在最新一期《自然》雜志上，不僅促進了人類對遺傳密碼可塑性的理解，也為未來合成生物學的應用提供了更多可能。在這項研究中，科學家成功將DNA或RNA中的冗余密碼
Science：宏基因組研究挑戰DNA編碼規則
人們一直認為DNA編碼的指令是所有生命通用的，例外情況極少。但本期Science雜志上的一項新研究顯示，自然界中的生物又一次打破了既定的規則。 美國能源部聯合基因組研究所的Edward Rubin領導研究團隊，獲得來自1776種環境（包括17個人體區域）的微生物宏基因組數據，以便在其中尋找重編
黃病毒屬長鏈非編碼亞基因組RNA的溶液結構研究中新進展
9月10日，生命學院方顯楊課題組和軍事科學院軍事醫學研究院微生物流行病研究所秦成峰課題組合作，在《歐洲分子生物學報道》（EMBO Reports）上發表了題為“黃病毒屬長鏈非編碼亞基因組RNA在溶液中具有伸展的三維結構并具有柔性”(Long non-coding subgenomic flavi
非編碼RNA調控的新的胃癌促癌基因
近日，重慶醫科大學藥學院肖斌教授團隊與陸軍軍醫大學（原第三軍醫大學）國家免疫生物制品工程技術研究中心鄒全明教授團隊在腫瘤學領域權威雜志《Oncogene》（JCR 1區）在線發表了題為“The miR-29c-KIAA1199 axis regulates gastric cancer mig
非編碼區的定義
基因是由成千上萬個核苷酸對組成。組成基因的核苷酸序列可以分為不同區段。在基因表達的過程中,不同區段所起的作用不同。能夠轉錄為相應信使RNA,進而指導蛋白質合成(也就是能編碼蛋白質)的區段叫做編碼區。不能編碼蛋白質的區段叫做非編碼區。非編碼區位于編碼區前后,同屬于一個基因,控制基因的表達和強弱 。
非編碼區的作用
非編碼區雖然不能編碼蛋白質,但對于遺傳信息表達是不可缺少的。在它上面有調控遺傳信息表達的核苷酸序列,是有遺傳效應的。比如RNA聚合酶結合位點。非編碼區對目的基因是不可缺少的。非編碼區上有與RNA聚合酶的結合位點,具有調控作用。基因非編碼區的堿基的插入、缺失和替代也屬于基因突變事件,盡管大多數的研究是
關于基因表達的機制非編碼RNA的成熟的介紹
多數生物體中的非編碼基因（ncRNA）被轉錄為需要進一步加工的前體。核糖體RNA（rRNA）通常被轉錄為含有一個或多個rRNA的前體rRNA，前體rRNA后來在特定位點被大約150種不同的snoRNA切割和修飾。轉移RNA（tRNA）的5'和3'端序列分別被RNase P和tRN
長非編碼RNA調控癌基因MYC表達的綜述文章
8月7日，中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所研究員陳玲玲受邀在國際學術期刊Current Opinion in Genetics & Development 發表題為The long noncoding RNA regulation at the MYC locus 的綜述論
Cell驚人發現：誰說非編碼RNA不編碼？
來自德克薩斯大學西南醫學中心的Eric Olson和同事們在分析梳理肌肉特異性的長鏈非編碼RNAs(lncRNAs)以了解它們的功能時，發現了一種在骨骼肌中特異性表達的lncRNA。盡管這一RNA以往被歸類為是非編碼RNA，它的序列中包含的一小段卻看上去好像一個編碼區域。這一研究發現發布在《細胞
連接非編碼突變和腫瘤基因表達的轉錄組全網絡
腫瘤基因組中充滿了非編碼突變，這些突變對腫瘤的影響研究還不是很清晰。加州大學圣地亞戈分校的科學家Wei Zhang and Ana Bojorquez-Gomez，Trey Ideker，在最近國際頂級期刊Nature Genetics發表文章 A global transcriptiona
非編碼序列的概念
中文名稱非編碼序列英文名稱non-coding sequence定 義基因中不具有編碼功能的序列。如真核生物基因的內含子、啟動子等。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），基因表達與調控（二級學科）
簡述非編碼RNA的成熟
多數生物體中的非編碼基因（ncRNA）被轉錄為需要進一步加工的前體。核糖體RNA（rRNA）通常被轉錄為含有一個或多個rRNA的前體rRNA,前體rRNA后來在特定位點被大約150種不同的snoRNA切割和修飾。轉移RNA（tRNA）的5'和3'端序列分別被RNase P和tRN
非編碼序列的定義
中文名稱非編碼序列英文名稱non-coding sequence定 ?義基因中不具有編碼功能的序列。如真核生物基因的內含子、啟動子等。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控(二級學科)
人血細胞中的所有蛋白編碼基因進行全基因組轉錄組分析
在臨床和研究環境中，血液都是對人類進行分子分析的主要來源，并且是許多治療策略的目標，這突顯了需要對構成人類血液的細胞進行全面的分子圖譜構建。人類蛋白質圖譜計劃（www.proteinatlas.org）是一個開放式數據庫，旨在通過整合各種組學技術（包括基于抗體的成像）來繪制所有人類蛋白的圖譜。在
科研人員開發內源基因非編碼區定向進化新技術
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517501.shtm近日，中國農業科學院植物保護研究所作物病原生物功能基因組研究創新團隊開發了核酸酶LbCas12a介導的內源基因非編碼區定向進化技術。相關研究成果發表在《植物通訊 (Plant Comm
上海生科院總結多種基因內部來源的非編碼RNA生成機制
10月1日，中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所研究員楊力受邀在WIREs RNA 發表了題為Splicing noncoding RNAs from the inside out 的綜述論文，系統總結了多種來自于前體RNA內部序列的非編碼RNA分子及其產生機制和潛在功能作用。 真核基
Cell：神秘的非編碼RNA在基因表達中起重要作用
在細胞中，DNA被轉錄成RNA，提供給細胞制造蛋白質的分子配方。大多數的基因組被轉錄成RNA，但實際上只有一小部分的RNA是來自于基因組中的蛋白質編碼區域。 賓夕法尼亞大學Perelman醫學院Penn表觀遺傳學研究所主任Shelley Berger博士說：“為什么非編碼區能轉錄？它們的功能一
挑戰傳統假設，研究揭示細胞有非基因組信息系統
美國莫菲特癌癥中心科學家一項新研究提出，細胞擁有一個此前未知的、獨立于基因組的信息處理系統，使它們能夠對環境變化迅速作出反應。相關論文發表于最近的《交叉科學》（iScience）雜志。圖片來源：《交叉科學》雜志幾十年來，科學家們一直將DNA視為細胞信息的唯一來源。這個DNA藍圖指導細胞構建蛋白質并控