我國發現一類新型長非編碼RNA基因組“暗物質”不斷“正名”
國際著名學術期刊Molecular Cell近日在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲研究組關于長非編碼RNA的最新進展。該研究發現,一類新型長非編碼RNA,或與小胖威利綜合征的發生發展密切相關。 人類基因組中存在大量被稱為基因組“暗物質”的非編碼序列,包括基因間非編碼序列等。隨著研究的深入,這些曾因用處不明而一度被視為人體“垃圾基因”的序列正逐漸“正名”,越來越多的非編碼序列功能被科學家發掘。 陳玲玲研究組本次發現的是基因內非編碼序列轉錄產生的一類新型線形長非編碼RNA,并將其命名為SPA。研究人員注意到,其中兩條SPAs來源的區域僅在父系來源的染色體表達,且該區域在幾乎所有的小胖威利綜合征患者中完全缺失或不被轉錄。值得一提的是,2012年,陳玲玲研究組曾發現另一被命名為sno-lncRNAs的長非編碼RNA,同樣位于該區域。 小胖威利綜合征是一類基因疾病,病理機制至今不詳。臨床表現主......閱讀全文
長非編碼RNA與肺癌轉移
我們體內的大多數DNA(約80%)并沒有編碼蛋白,不過它們會轉錄為RNA。這些非編碼的RNA分子負責在細胞中實現多種功能。microRNA等小RNA已經被研究得很多了,近年來人們又發現了一類長非編碼RNA,這些RNA擁有兩百個以上的核苷酸。 長非編碼RNA對細胞周期、細胞生長和細胞死亡等細
基因組所發表長非編碼RNA分類問題綜述文章
近日,中國科學院北京基因組研究所基因組科學與信息重點實驗室的“百人計劃”研究員章張及其團隊,與沙特阿卜杜拉國王科技大學(King Abdullah University of Science and Technology)開展科研合作,對長非編碼RNA的分類問題進行了系統綜述,相關論文在RN
長鏈非編碼-RNA-測序案例分析
背景:人類壽命的延長伴隨著神經退行性疾病的發病幾率的增加,因而價格不貴的血液診斷的發展迫在眉睫。通過 RNA-seq 分析血液細胞的轉錄本是發現新的生物標志物的非常高效的途徑。 目的:利用 Illumina 測序平臺對帕金森病人白血球中 lncRNAs 進行分析,探討其對 mRNA 選擇性剪接的
長鏈非編碼RNA調控腫瘤生長
人類基因組能夠產生10000多種長鏈非編碼RNA(lncRNA),但是至今為止,人們只知道幾十種lncRNA分子的功能。 加州大學圣地亞哥分校的Liuqing Yang等人發表在Nature上的一項研究成果表明,兩種lncRNAs可以與雄激素受體結合并控制其功能。雄激素受體是一種轉錄因
長鏈非編碼-RNA(lncRNA)研究策略
長鏈非編碼 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)指的是轉錄本長度在 200-100000 nt 之間的 RNA 分子,它們不編碼蛋白,位于細胞核或胞質內,具有保守的二級結構。研究顯示,lncRNA 并非以前所認識的那樣沒有功能,它可與蛋白質、DNA 和 RNA 相互作
如何揭開長非編碼RNA的神秘面紗
長非編碼RNA(lncRNA)長達兩百個核苷酸以上的轉錄本,但并不編碼任何蛋白質。盡管如此,長非編碼RNA在不同組織和發育階段的表達依然具有特異性,說明lncRNA的調控具有重要的生物學意義。細胞中絕大多數lncRNA(也稱lincRNA)位于細胞核,它們對應的DNA區域有的與蛋白編碼基因重疊,
帶你走進神秘的長鏈非編碼RNA
長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類轉錄本長度超過200nt的RNA分子,它們并不編碼蛋白,而是以RNA的形式在多種層面上(表觀遺傳調控、轉錄調控以及轉錄后調控等)調控基因的表達水平。lncRNA起初被認為是基因組轉錄的“噪音”,是RNA聚合酶II轉錄的副產物,不具有生物學功能。然而,近年來的研究
長鏈非編碼RNA與淋巴瘤
類基因組中僅有1.5%~2.0%編碼蛋白的基因得以穩定轉錄,而剩余的絕大多數RNA無編碼蛋白的功能。長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類異質性的非編碼RNA,根據lncRNA的功能,可將其分為信號分子、誘餌分子、引導分子和骨架分子4類。人們以往僅將這些不具編碼功能的RNA視為進化過程中產生的廢
長鏈非編碼RNA:-從科研到臨床
長鏈非編碼RNA (LncRNA)是一類真核生物中長度大于200 nt的非編碼RNA分子;根據其與鄰近基因的位置可以分為反義lncRNA、增強子lncRNA、基因間lncRNA、雙向lncRNA、和內含子lncRNA;它具有多種作用機制,比如在細胞核中作為分子支架、協助可變剪接、調節染色體結構
長鏈非編碼RNA:-從科研到臨床(一)
概述長鏈非編碼RNA?(LncRNA)是一類真核生物中長度大于200 nt的非編碼RNA分子;根據其與鄰近基因的位置可以分為反義lncRNA、增強子lncRNA、基因間lncRNA、雙向lncRNA、和內含子lncRNA;它具有多種作用機制,比如在細胞核中作為分子支架、協助可變剪接、調節染色體結
【盤點】長鏈非編碼RNA的研究進展
非編碼RNA在生命調控過程中扮演著重要角色,近年來的研究成果常入選CNS年度十大科學突破。人類基因組轉錄區高達76%,但轉錄產物中只有不到2%是編碼蛋白質的mRNA,其他均為非編碼RNA,其中microRNA (miRNA)、長鏈非編碼RNA(lncRNA)、環狀RNA(circRNA)等調控
長鏈非編碼RNA:-從科研到臨床(二)
脂類代謝和脂肪生成最新的研究表明,lncRNA控制肝臟中的脂類代謝,調控脂肪生成,從而維持機體的脂質穩態[9]。APOA1編碼蛋白是高密度脂蛋白的重要組分。其反義轉錄本APOA1-AS可以在體內和體外抑制APOA1的表達。LncRNA NEAT1在脂肪生成過程中調節PPARγ2的可變剪接,它還介
長鏈非編碼RNA:-從科研到臨床(三)
腎臟疾病與糖尿病?糖尿病經常伴隨著腎病的發生[5].?比如基因間lncRNA PVT1與二類疾病都緊密關聯。研究人員在II型糖尿病人的晚期腎病進程中發現了PVT1的基因變異。高糖處理可以誘導人的腎間質細胞中PVT1和纖連蛋白1、IV型膠原蛋白、TGFβ1、PAI1等因子的高表達。相反,敲除P
調節免疫應答的新途徑——長鏈非編碼RNA
“我們需要知道細菌感染引發的炎癥反應是由什么來調節該過程的。”該研究的領導者,UTA大學化學副教授Subhrangsu Mandal說。 “如果我們能做到這一點,我們就可以控制中樞神經系統炎癥性疾病,迄今為止這些疾病一直難以治療,如敗血癥和腦膜炎,以及癌癥和肌肉營養不良,它們也可以看作一種炎癥
2017年不能錯過的長非編碼RNA研究推薦
2017年即將過去,這一年的非編碼RNA研究取得了很多重磅級成果。與早先的主要是在不同類型的疾病(癌癥)中大規模鑒定非編碼RNA,今年的研究是對非編碼RNA機制的更深入探索,給我們展現了作用方式更豐富多彩的非編碼RNA世界。圖片來源于網絡 一 長非編碼RNA(lncRNA) 長非編碼RNA是
我國發現一類新型長非編碼RNA-基因組“暗物質”不斷“正名”
國際著名學術期刊Molecular Cell近日在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲研究組關于長非編碼RNA的最新進展。該研究發現,一類新型長非編碼RNA,或與小胖威利綜合征的發生發展密切相關。 人類基因組中存在大量被稱為基因組“暗物質”的非編碼序列,包括基因
科學家發現長鏈非編碼RNA作用新模式
中國工程院院士、中國醫學科學院院長曹雪濤帶領課題組發現,長鏈非編碼RNA(lncRNA)可通過直接結合細胞漿中的信號轉導蛋白分子并影響其磷酸化的新方式而調控免疫細胞的分化發育與功能。該成果為研究lncRNA發揮生物學效應的作用機制提出了新觀點,并為免疫細胞分化發育與功能調控研究提出了新方向。相關
Nature子刊:長非編碼RNA可模擬DNA起作用
長期以來,人們一直認為基因組的大部分區域屬于“禁飛區”。這些區域不編碼任何蛋白,因此細胞的基因讀取機器很少接近。然而近年來科學家們發現,許多非編碼序列其實能夠轉錄成RNA,Gas5就是其中之一。 GAS5是一段基因間的長非編碼RNA(lincRNA),它來自于非編碼的“垃圾DNA”或“基因組的
研究發現長非編碼RNA調控學習記憶新機制
4月30日,《自然-通訊》(Nature Communications)雜志以研究論文形式發表了中國科學技術大學劉強研究組題為Activity dependent LoNA Regulates Translation by Coordinating rRNA Transcription and
長鏈非編碼RNA測序服務助力揭開lncRNA神秘面紗
2012年12月18日,華大基因科技服務有限公司(簡稱“華大科技”)在國內推出長鏈非編碼RNA測序(lncRNA-Seq)服務。該技術突破了常規研究方法效率低、研究范圍受限的瓶頸,可一次性獲得樣本中幾乎全部的lncRNA序列,不僅可以對已知lncRNA進行定量分析,還可對 novel lnc
長非編碼RNA調控癌基因MYC表達的綜述文章
8月7日,中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所研究員陳玲玲受邀在國際學術期刊Current Opinion in Genetics & Development 發表題為The long noncoding RNA regulation at the MYC locus 的綜述論
長鏈非編碼RNA編碼多肽的系統挖掘和鑒定研究新進展
6月13日,Molecular & Cellular Proteomics在線發表了中國科學院生物物理研究所研究員楊福全團隊和中科院院士陳潤生團隊,關于長鏈非編碼RNA(lncRNA)編碼多肽的系統挖掘和鑒定的研究論文Deeply Mining a Universe of Peptides En
長鏈非編碼RNA對腦生長起重要作用
“長非編碼RNA通常被描述為‘基因組的暗物質’。在這里,我們系統地研究了它們對大腦發育、長期記憶儲存、衰老和癡呆導致的記憶力下降的分子機制,”Puthanveettil說。 RNA是細胞的主要調節因子,是讀取、轉錄和調節DNA表達以及構建蛋白質的小型核苷酸鏈,雖然科學家們已經掌握了腦細胞之間如
研究發現空氣污染誘發肺癌關鍵長鏈非編碼RNA
中科院動物所周光飚研究組通過深入研究,發現了空氣污染誘發肺癌的關鍵長鏈非編碼RNA。相關成果日前發表于腫瘤學雜志Oncotarge。 據了解,肺癌已成為全球發病率最高、致死人數最多的癌癥,其中90%的肺癌由吸煙、空氣污染等環境因素引起。然而,空氣污染誘發肺癌的分子機制目前尚不清楚。 此前研究
長非編碼RNA調控炎癥小體組裝激活研究中取得進展
4月3日,中國科學技術大學教授吳緬研究組在國際學術期刊《自然-通訊》(Nature Communications)上在線發表題為The lncRNA Neat1 promotes activation of inflammasomes in macrophages 的研究論文。 在固有免疫反
我科學家發現一類新型長非編碼RNA
國際著名學術期刊《分子細胞》近日以封面故事發表了中科院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲研究組的最新研究論文,揭示了一類全新內含子來源的長非編碼RNA的產生機制,及其參與剪接調控的重要功能。這將為進一步了解PWS綜合征的病理機制提供新的研究思路。 幾乎所有哺乳動物細胞的基因
中國科大在動物長鏈非編碼RNA研究中取得進展
中國科學技術大學生命科學學院非編碼RNA功能及功能機理研究團隊近日在國際期刊《基因組生物學》(Genome Biology)發表了題為Systematic evaluation of C. elegans lincRNAs with CRISPR knockout mutants 的文章,報道了
僅需1個長非編碼RNA變化足以逆轉細胞衰老
隨著時間推移,細胞慢慢老化,許多疾病發病都跟細胞衰老有關。誘導細胞再生是對抗細胞衰老相關疾病的核心策略之一。然而,老化細胞往往高度抵抗任何旨在誘導再生的操作。(老年成纖維細胞重編程效果低下) 雖然眾所周知RNA負責細胞內蛋白質合成,但是一類被稱為非編碼RNA的特殊分子從來不會被轉化為蛋白質,事
黃病毒屬長鏈非編碼亞基因組RNA的溶液結構研究中新進展
9月10日,生命學院方顯楊課題組和軍事科學院軍事醫學研究院微生物流行病研究所秦成峰課題組合作,在《歐洲分子生物學報道》(EMBO Reports)上發表了題為“黃病毒屬長鏈非編碼亞基因組RNA在溶液中具有伸展的三維結構并具有柔性”(Long non-coding subgenomic flavi
從心臟病到癌癥——長非編碼RNA到底發揮了什么作用?
直到近幾年才發現人類基因的70%是非編碼RNA,非編碼RNA不能翻譯為蛋白質,但仍在人體中發揮重要作用。Stefanie Dimmeler是首批發現一個microRNA亞群在血管再生中發揮重要作用的研究人員之一,她最近獲得了歐洲研究委員會(ERC)的ERC高級研究員資助,這使她能夠對另一群非編碼