我國科學家對桃進行全基因組重測序繪制進化路線
我們平時吃的桃是如何進化而來的?近日,一項針對桃的全基因組重測序研究揭開了這一謎底。該研究對84份桃種質進行重測序,在全基因組水平上繪制了從光核桃到普通桃的進化路線,并鑒定了與人工選擇相關的候選基因,揭示了桃的進化歷史及人類活動對果樹的影響。 這項研究由中國農業科學院鄭州果樹研究所王力榮研究團隊與深圳華大基因聯合開展。據王力榮介紹,普通桃起源于我國西藏的光核桃,然而在這兩個種之間其他近緣種的進化關系,一直以來在科學界存在爭議。通過此次重測序,可以確定普通桃的進化始于光核桃,之后為山桃,再次為甘肅桃,最終形成普通桃,而新疆桃只能認為是普通桃的一個地理類群。 另外,與其他果樹相比,桃有個有趣的現象,即桃由于自花授粉可以結果(“自交親和”),一直被認為遺傳多樣性較低。然而,事實上,桃的性狀卻多種多樣,如有毛的毛桃、無毛的油桃、扁平的蟠桃和油蟠桃,還有重瓣的花形、不同的花藥顏色等。這些多樣性在其他果樹如杏樹、櫻桃樹和蘋果樹上是看......閱讀全文
我國科學家對桃進行全基因組重測序-繪制進化路線
我們平時吃的桃是如何進化而來的?近日,一項針對桃的全基因組重測序研究揭開了這一謎底。該研究對84份桃種質進行重測序,在全基因組水平上繪制了從光核桃到普通桃的進化路線,并鑒定了與人工選擇相關的候選基因,揭示了桃的進化歷史及人類活動對果樹的影響。 這項研究由中國農業科學院鄭州果樹研究所王力榮研究團
基因測序技術進化史
DNA上承載了關于我們的太多信息:發展史、祖先、特征、疾病易感性、甚至性格和命運。因此很多人迫不及待地想將DNA看得一清二楚。解碼人類基因組的第一次鄭重嘗試是始于1990年的人類基因組計劃。盡管合作和艱苦工作無疑扮演了重要角色,但一系列工程上的突破推動了這個項目,以前所未有的速率收集并核對數據。
桃分子進化遺傳機制獲破解
日前,中國農業科學院鄭州果樹研究所研究員王力榮團隊與華中農業大學教授郭文武、美國康奈爾大學Boyce Thompson研究所教授費章君合作完成基于480份桃全基因組重測序解析桃育種歷史的研究成果,在線發表于《基因組生物學》。該研究采用目前最大規模的桃重測序,揭示了桃馴化和改良的基因組印記,闡明桃
NEJM:利用基因測序譜寫“腫瘤進化樹”
近幾年來,腫瘤產生耐藥突變以逃逸靶向治療的假說已被業內科學家所默認。最近一段時間,幾項重要的研究對這一假說進行了充分的證實,腫瘤學家Charles Swanton領導的肺癌癌癥進化阻斷計劃(TRACERx)讓耐藥逃逸的假說逐漸為更多人所認可。 為了使TRACERx計劃能夠充分證實部分腫瘤細胞耐
武漢植物園發現桃基因組轉座元件的進化機制
桃原產于我國,馴化和栽培歷史超過三千年,桃花形態和顏色多樣,集中在早春時節開放,成為春季主要的觀賞景觀之一,自2千多年前成書的《詩經》開始,一直是歷代詩人反復歌詠的對象。而桃的果實風味鮮美、營養豐富,深受人們喜愛。桃自交親和且基因組很小(230Mb左右),但品種間的表型差異相當豐富。 中國科學
最新果蠅基因組測序,展現奇妙的進化
對真核生物進行全基因組測序在二十世紀還是一項了不起的大工程,直到2000年末人們還只完成了四項這樣的研究。不過自那以后,測序技術的飛速進步使全基因組測序對于許多研究團隊來說觸手可及,現在每隔不久就會涌現出一項新的測序成果。日前,維也納獸醫大學Christian Schl?tterer研究組的
基因組測序揭示須鯨的罕見進化模式
單一物種如何演化成兩個新物種?進化學家給出的答案通常是地理隔離。不過,有時沒有地理隔離也能產生新的物種,這種罕見的情況被稱為同地物種形成(sympatric speciation)。根據瑞典和德國的最新研究成果,須鯨正是經歷了這種同地物種形成。 文章的共同第一作者、德國法蘭克福大學的Fritj
基因組測序揭示多細胞生物進化之謎
最近,研究人員通過對各種綠藻進行基因組測序,已經接近于解開了“引起多細胞生物的遺傳變化”的謎團。 從單細胞生物到多細胞生物的過渡,是地球上生命進化的關鍵進步;在不同的系統發育譜系中,這種改變已經獨立地發生了多次。了解“有多少基因以及有哪些基因,對單細胞祖先成為多細胞來說是必要的”,是一個有趣的
基因組測序揭示龜鱉軀體發育及進化機制
龜鱉類有著漫長且成功的演化歷史,是形態學上最為特化的爬行動物之一。全球共有龜鱉類動物13科、89屬、270余種,被分為兩個特征明確的支系 ——側頸龜亞目和曲頸龜亞目。中華鱉和綠海龜分別是曲頸龜中鱉類和海龜類的典型代表,對其進行基因組學研究,有助于理清龜鱉類系統發育及其軀體進化機制。 日
基因組測序挑戰由來已久的進化理論
在Lewis Carroll寫的《愛麗絲魔鏡之旅》(Through the Looking-Glass)這本書中,紅皇后向愛麗絲解釋說:“你必須盡力地不停奔跑,才能使你保持在原地。”用中國話說就是“逆水行舟,不進則退”。 在逆水中要保持在原來的地方,也要不停地盡力地劃。或者更形象地比喻為魚兒在急
454測序參與棉花基因組進化研究工作
棉花是全球重要的經濟作物之一。它的纖維,俗稱皮棉,是紡織工業主要的天然原料。全世界棉花種植面積約5億畝,我國常年種植面積近8千萬畝。棉花不但是重要的纖維和油料植物,而且是重要的植物蛋白來源。在食用油中,棉籽油的亞油酸含量最高,達到55.6%。除此以外,棉花種子中還含有極為豐富的蛋白質和脂肪等物質
鄭果所解析桃高質量基因組及果實香氣遺傳進化機制
桃汁多、味美,受到全世界廣大消費者的喜愛。然而,隨著長期以來育種家培育出大果、高糖和耐貯藏品種,消費者反映果實香氣變淡、桃沒桃味。利用基因組是研究果實重要農藝性狀的有力工具。7月26日,Plant Journal在線發表了中國農科院鄭州果樹所王力榮和曹珂研究員為通訊作者的題為“New high-
我國領銜完成木薯基因組測序并揭示其進化特征
記者從9月13日在海南海口召開的973項目“重要熱帶作物木薯品種改良的基礎研究”課題驗收會上獲悉,我國科學家同步完成了木薯野生祖先種和栽培種兩個全基因組測序,首次揭示了栽培木薯高光效、光合產物運輸及淀粉高效積累途徑基因的進化特征,這為今后通過分子定向設計育種培育出“超級木薯”奠定了良好的基礎。
全基因組測序揭示喀斯特植物適應性進化機制
中國南方喀斯特起源古老、分布廣泛,被認為是生態與進化研究的“天然實驗室”。中國科學院華南植物園研究員康明團隊等完成了首個喀斯特植物懷集報春苣苔的全基因組測序。相關研究近日在線發表于《新植物學家》。 喀斯特植物是我國植物多樣性和特有性的重要組成部分,但迄今為止對喀斯特植物的多樣性起源和適應性進
獼猴桃網狀進化與雜交物種形成機制研究獲進展
獼猴桃是原產我國的重要經濟果樹植物。除了現代農業生產中廣泛馴化育種利用的中華獼猴桃(Actinidiachinensis var. chinensis)和美味獼猴桃(A. chinensis var. deliciosa)兩個類群外,獼猴桃屬植物還包括其他50多個物種共計約76個分類單元。該屬植
武漢植物園在獼猴桃葉綠體基因組研究中獲得新進展
獼猴桃(Actinidia chinensis)是一種富含Vc的經濟水果,目前在全世界越來越受到消費者歡迎。盡管我國學者對中華獼猴桃的全基因組進行了測序,然而對獼猴桃葉綠體基因組并未進行組裝和注釋。 中國科學院武漢植物園獼猴桃資源與育種學科組副研究員姚小洪在研究員黃宏文的指導下,完成了不同倍性
猿類基因組測序為人類進化研究提供“里程碑”視角
經過20多年的努力,科研人員成功地對6種現存猿類的基因組進行了完整測序,為研究人類進化提供了近距離視角,這被英國《自然》雜志稱為“遺傳學的一個里程碑”。 123名來自多個國家和地區的科研人員組成的團隊9日在《自然》發表了這項研究結果,預計將有助猿類保護,并增進科學家對人類進化的理解。 基因組
中科院遺傳所等揭開桃之為桃的基因揭秘
中國科學院遺傳與發育生物學研究所田志喜、中國農業科學院鄭州果樹研究所王力榮及同事,報告了與桃子12種重要性狀相關的基因區域,這些性狀影響桃子的口味和外形。他們的研究為未來育種提供了寶貴的基因數據。相關成果11月9日在線發表于《自然—通訊》。 什么樣的桃子才稱得上完美?毛桃還是油桃,甜桃還是酸
863計劃“特色果樹功能基因組學研究與應用”通過中期檢查
我國是世界桃起源中心,保存有世界上份數最多的桃種質,桃在我國的栽培面積和產量遠高于其他國家,在果品生產中具有重要地位。為進一步發掘優異桃種質資源,建立桃分子育種平臺,十二五期間,國家863計劃啟動了“特色果樹功能基因組學研究與應用”課題。6月5日863計劃領域辦組織相關專家對課題進行了中期檢查
再探獼猴桃基因奧秘
毛花獼猴桃 劉永勝供圖 這項研究不僅證實了獼猴桃進化過程中兩次近代基因組倍增歷史事件對物種分化和物種形成的影響,而且進一步揭示獼猴桃富營養成分諸如維生素C、類胡蘿卜素、葉綠素和類黃酮等的基因組學機制,為獼猴桃品質改良和遺傳育種奠定了堅實基礎。 獼猴桃起源于中國,大約100年前引入新西蘭開始馴化和
“兩件事”讓獼猴桃變成“維C大王”
中國科學家發現,獼猴桃在進化過程中發生過兩次同源四倍體事件,這讓獼猴桃的一些關鍵功能基因得以大幅擴張拷貝數,其中就包括合成維生素C的基因。這或許揭示了“維C大王”背后的秘密。相關研究結果近日發表在細胞出版社最新創建的綜合性學術期刊iScience上。 “了解獼猴桃的基因家族和產生維生素C的通路
基因測序
基因測序是一種新型基因檢測技術,能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,預測罹患多種疾病的可能性,個體的行為特征及行為合理。基因測序技術能鎖定個人病變基因,提前預防和治療。基因測序相關產品和技術已由實驗室研究演變到臨床使用,可以說基因測序技術,是下一個改變世界的技術
基因測序
第1代測序技術——熒光標記的Sanger法 在第一臺全自動測序儀出現之前,使用最為廣泛的測序方法就是 Sanger 在 20 世紀 70 年代中期發明的末端終止法測序技術。 Sanger 也因此獲得 1980年的諾貝爾化學獎。 他的發明第一次為科研人員開啟了深入研究生命遺傳密碼的大門。G1.1? ?
中國科學家Nature子刊公布新基因組草圖
來自合肥工業大學、四川大學、四川省自然資源科學研究院、北京百邁客生物科技有限公司等10多家機構的研究人員組成的一個研究小組成功繪制出了獼猴桃(Actinidia chinensis)的全基因組序列草圖。相關成果發表在10月18日的《自然通訊》(Nature Communications)雜志
“兩件事”,讓獼猴桃變成“維C大王”
彌猴桃經歷兩次同源四倍體事件,每個細胞中的染色體組和所有基因加倍。(論文作者供圖) 中國科學家發現,獼猴桃在進化過程中發生過兩次同源四倍體事件,這讓獼猴桃的一些關鍵功能基因得以大幅擴張拷貝數,其中就包括合成維生素C的基因。這或許揭示了“維C大王”背后的秘密。相關研究結果于9月20日發表在細胞出
研究發現桃果實糖含量關鍵基因
桃果實甜度是決定品質的關鍵因素,而糖分的積累與轉運蛋白的調控密切相關。近日,中國農業科學院鄭州果樹研究所桃資源與育種團隊在《植物生理學》(Plant Physiology)上發表了研究論文,系統揭示了MFS轉運蛋白家族調控桃果實糖代謝的分子機制。 該研究創新性地利用空間代謝組學(MALDI-M
《科學》:基因調節驅動進化
耶魯大學的研究人員發表在8月10日的《科學》雜志上的文章顯示,他們通過采用新方法分析基因啟動子序列變異,而且對基因調節推動進化分歧有了新的了解。 之前完成的基因組測序工作顯示,人類和黑猩猩的蛋白質編碼基因有99%是相同的。目前生物學家面臨的挑戰是解釋導致人和猩猩之間明顯差異的原因。通常認為,如果
基因測序儀
原理編輯abi prism 310型基因分析儀采用毛細管電泳技術取代傳統的聚丙烯酰胺平板電泳,應用該公司ZL的四色熒光染料標記的ddntp(標記終止物法),因此通過單引物pcr測序反應,DNA測序儀生成的pcr產物則是相差1個堿基的3''''末端為4種不同熒光染料
基因測序定義
基因測序是一種新型基因檢測技術,能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,預測罹患多種疾病的可能性,個體的行為特征及行為合理。基因測序技術能鎖定個人病變基因,提前預防和治療。 基因測序相關產品和技術已由實驗室研究演變到臨床使用,可以說基因測序技術是下一個改變世界的技術
基因測序簡介
測序技術迄今為止已發展了三代,測序技術有4個指標:讀長、成本、準確度、通量。 成本、準確度這兩項指標都很好理解,成本下降使得單個人類基因組的花費已經從2001年的1億美元下降到了1000美元以下。準確度則是測序結果的準確程度,例如二代測序的solid可以達到99.9%,而唯一投入實用的三代測序