北大生科院PNAS發布單細胞測序新技術
來自北京大學生命科學學院等處的研究人員發表了題為“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章,開發出了一種新型微流控單細胞全轉錄測序新方法,這種方法有效地消除轉錄組高度動態特性所帶來的測量差異,提高單細胞全轉錄組分析的準確性和可靠性。 這一研究成果公布在《美國國家科學院院刊》(PNAS)雜志上,文章的通訊作者分別是北京大學生物動態光學成像中心的趙亮博士,黃巖誼教授和湯富酬 教授。生物動態光學成像中心(Biodynamic Optical Imaging Center, BIOPIC)是北京大學于2010年成立的一個跨學科合作實體研究中心。中心的目標是發展和利用最先進的生物成像與基因測序手段,在分子和細胞水平上進 行生命科學與醫學基礎研究。 近年來不斷發展的實驗技術,提供了更加定量與客觀的證據,表明在許多關鍵生命過程例如胚胎發育、細胞分化、疾病發生......閱讀全文
單細胞研究指南:測序方法大比拼
??多細胞生物的每個細胞都攜帶著相同的遺傳學信息。不過,近年來蓬勃發展的單細胞研究告訴我們,每一個細胞都是獨一無二的。不同類型的細胞激活特定組合的機制,即使是同類型細胞,基因表達也會出現差異。??那么,細胞之間的哪些差異有生物學意義,哪些差異來自于技術偏好呢?要獲得可靠的結果又需要研究多少細胞呢?這
單細胞研究指南:測序方法大比拼
多細胞生物的每個細胞都攜帶著相同的遺傳學信息。不過,近年來蓬勃發展的單細胞研究告訴我們,每一個細胞都是獨一無二的。The Scientist雜志最近聯系了單細胞研究領域的一些專家,請他們分享了在單細胞中進行轉錄研究的秘訣。希望幫助研究者們更好地構建文庫,處理和分析結果數據。 那么,細胞之間的哪
單細胞研究指南:測序方法大比拼
多細胞生物的每個細胞都攜帶著相同的遺傳學信息。不過,近年來蓬勃發展的單細胞研究告訴我們,每一個細胞都是獨一無二的。不同類型的細胞激活特定組合的機制,即使是同類型細胞,基因表達也會出現差異。 那么,細胞之間的哪些差異有生物學意義,哪些差異來自于技術偏好呢?要獲得可靠的結果又需要研究多少細胞呢?這
單細胞RNA測序,眾多研究都pick它
多細胞測序和單細胞測序,你pick誰?如今,大多數研究人員也許會選擇后者,因為不一樣的角度,會帶來不一樣的見解。 多細胞測序和單細胞測序,你pick誰?如今,大多數研究人員也許會選擇后者,因為不一樣的角度,會帶來不一樣的見解。單細胞測序的最初動力來自癌癥研究,可幫助人們了解腫瘤異質性和腫瘤微環
單細胞測序技術的研究進展如何?
單細胞測序技術在近年來取得了顯著的研究進展,主要體現在以下幾個方面:??1. 技術改進: ? ?- 提高了測序的通量和準確性,能夠同時對更多的單細胞進行測序,并且降低了測序錯誤率。 ? ?- 開發了新的單細胞分離和捕獲方法,如微流控技術的不斷優化,提高了細胞捕獲的效率和純度。??2. 多組學
單細胞測序技術在細胞呼吸研究進展
單細胞測序技術在細胞呼吸研究中面臨以下一些挑戰:數據復雜性和分析難度:單細胞測序會產生大量復雜的數據,需要復雜的生物信息學分析方法和專業知識來解讀,從海量數據中準確識別與細胞呼吸相關的有意義信息并非易事。技術誤差和噪聲:包括樣本制備、細胞捕獲、核酸擴增等過程中可能引入技術偏差和噪聲,影響數據的準確性
【盤點】單細胞測序研究進展一覽
細胞是生物學的基本單位,近年來研究人員正努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。而應用而生的就是單細胞測序技術,該技術是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。而隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并對逐個細胞進行序列比較已經開始
單細胞測序技術應用和發展現狀研究
一背景概況單細胞測序技術是指能夠在單個細胞的水平上,對基因組或轉錄組進行高通量測序分析的一項新技術。與傳統高通量測序相比,單細胞測序不僅能夠分析相同表型細胞的異質性,還能獲取難以培養微生物的遺傳信息以及珍貴的臨床樣本的信息,具有廣闊的應用前景。細胞是生命的單位,目前大部分的基因檢測均是從組織中抽提D
【盤點】單細胞測序研究進展一覽
細胞是生物學的基本單位,近年來研究人員正努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。而應用而生的就是單細胞測序技術,該技術是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。而隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并對逐個細胞進行序列
單細胞測序技術在腫瘤研究中的應用
單細胞測序技術在腫瘤研究中有以下多方面的應用:腫瘤細胞異質性研究鑒定腫瘤內不同的細胞亞群,包括具有不同基因突變、轉錄組特征和表型的細胞。揭示腫瘤細胞之間的差異對腫瘤進展、轉移和治療反應的影響。腫瘤微環境分析解析腫瘤微環境中免疫細胞、基質細胞等的組成和功能狀態。研究腫瘤細胞與微環境中其他細胞的相互作用
單細胞測序需要準備什么再去測序
DNA測序的測序原理: DNA測序是指分析特定DNA片段的堿基序列,也就是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)與鳥嘌呤的(G)排列方式。快速的DNA測序方法的出現極大地推動了生物學和醫學的研究和發現。
如何-解讀-單細胞-測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。
Nature:單細胞測序(下)
隨著技術的飛速發展,成本大大降低,使得基因組測序成為常規技術。然而,大多數的人類基因組、癌癥或其他仍然是通過從多個細胞中抽提DNA來進行測序,它所忽略的細胞間的差異對于控制基因表達、細胞行為和藥物反應卻有可能是至關重要的。 該研究小組也觀測了其他類型的乳腺癌。將腫瘤作為一個整體測序,研究小
Nature:單細胞測序(上)
Nicholas Navin所需要的就只是一個細胞――問題是如何得到它。這是在2010年,冷泉港實驗室的博士后研究員正在探究驅動乳腺癌的遺傳改變。此前的大部分癌癥基因組研究都是碾碎少量的腫瘤組織,一并將這些DNA進行測序,生成的是一張癌癥基因組的一致圖像。但Navin想要解析來自單個細胞的序
如何-解讀-單細胞-測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位,研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。
單細胞測序方法匯總
單細胞生物學研究一直是當今的熱門話題,而且-前沿的領域就是單細胞RNA測序了(scRNA-seq)。常規RNA測序方法一次性能夠對成千上萬個細胞進行加工測序,并給出平均差異,但并沒有兩個細胞是完全一樣的,而新型的scRNA-seq方法就能夠揭示出制造每一種特異性的微小改變,甚至這種技術還能夠闡明完整
如何-解讀-單細胞-測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位,研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。
如何-解讀-單細胞-測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位,研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。
單細胞測序方法介紹
單細胞RNA測序(scRNA-seq)作為一種全基因組測序的方式,在單細胞層面廣泛用于確定細胞類型和細胞變異的鑒定。Namocell單細胞分離儀可以通過細胞標記CD27以及一種細胞活性的染料,來分選出單個活的B細胞。通過分析分離后的單細胞基因表達情況,對比靜息記憶B細胞,可以從單細胞層面研究基因表達
什么是單細胞測序?
單細胞測序是一種能夠在單個細胞水平上對基因組、轉錄組、表觀遺傳組等進行分析的技術。通過單細胞測序,可以:揭示細胞的異質性:了解即使是看似相同的細胞群體中,每個細胞在基因表達、染色質可及性等方面的獨特特征。發現新的細胞類型和狀態:識別出傳統方法難以區分的稀有細胞類型以及細胞在不同生理或病理條件下的特殊
Namocell單細胞分離儀應用——單細胞測序
2018年11月,Namocell與CZ-Biohub(Chan Zuckerburg Biohub)合作,在單細胞測序領域做出了新的嘗試。CZ-Biohub利用Namocell單細胞分離儀分選出目的B細胞,并且將其進行單細胞測序,為抗體新藥的發現邁出了重要一步。單細胞RNA測序(scRNA-s
時空分辨單細胞測序技術和傳統單細胞測序技術的區別
時空分辨單細胞測序技術和傳統單細胞測序技術主要有以下區別:空間信息獲取傳統單細胞測序:通常無法獲取細胞在組織中的空間位置信息,只是對分離出的單細胞進行獨立分析。時空分辨單細胞測序:能夠在測定單細胞基因表達等信息的同時,明確細胞在原始組織中的具體空間位置。細胞互作研究傳統單細胞測序:難以直觀地揭示基于
時空分辨單細胞測序技術與其他單細胞測序技術的差異
時空分辨單細胞測序技術與其他單細胞測序技術主要在以下方面存在區別:空間信息獲取普通單細胞測序技術:通常不提供細胞在原始組織中的空間位置信息。時空分辨單細胞測序技術:能夠同時獲取細胞的基因表達等信息以及它們在組織內的空間位置。細胞間相互作用分析普通單細胞測序技術:難以直接推斷細胞間基于空間位置的相互作
時空分辨單細胞測序技術的研究熱點有哪些?
時空分辨單細胞測序技術的研究熱點包括以下幾個方面:技術改進與創新提高時空分辨率,實現更精細的細胞定位和更短時間間隔的動態監測。開發新的標記和成像方法,以提高檢測的準確性和靈敏度。多組學整合結合轉錄組、表觀基因組、蛋白質組等多組學數據,全面揭示細胞的時空特性。疾病機制研究深入探究腫瘤發生、發展和轉移過
小個頭大內涵的單細胞測序研究盤點
近幾年來,基于單細胞測序技術的科學研究取得了突飛猛進的發展,其成果有望為一些重要的生物學問題提供新的解決方案。測序君盤點了2015年的單細胞測序研究成果,供大家查閱。《Science》:瑞典卡羅林斯卡學院的科學家們的單細胞測序研究。該研究生成了有關皮質細胞類型以及細胞內活化基因的詳細圖譜。研究小組利
謝曉亮:從單細胞研究到高通量測序
2011年7月第八期《自然—方法學》刊登了Monya Baker撰寫的一篇人物特寫,詳細介紹了在當期發表的論文 “Fluorogenic DNA sequencing in PDMS microreactors”的主要作者哈佛大學謝曉亮教授的高通量測序技術。全文翻譯如下: 在科學界,
單細胞轉錄組測序研究熱點和發文錦囊
從Top50期刊2000余篇文獻統計: 在剛剛發布的“十四五”規劃中,“基因與生物技術”作為前沿科技攻關領域之一。而在這個領域,近年來最具里程碑的技術突破必然不能忽略“單細胞轉錄組測序”。本文通過對PubMed數據庫中Top50期刊的共計2357篇單細胞轉錄組測序的引文進行數據分析,幫助讀者了
單細胞測序技術在腫瘤研究中的應用案例
以下是一些單細胞測序技術在腫瘤研究中的應用案例:??**案例一:乳腺癌** 研究人員利用單細胞測序技術對乳腺癌腫瘤組織進行分析,發現了不同亞型乳腺癌細胞之間的基因表達差異和腫瘤細胞的異質性。他們鑒定出了具有干細胞特性的腫瘤細胞亞群,這些細胞可能與腫瘤的復發和耐藥性有關。這為開發更有針對性的治療
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。