研究更接近了對脆性X綜合征的破解
研究脆性X綜合征——這是對某些自閉癥及智力遲鈍病例的一種基因觸發因子——的研究人員發現,信使RNA(mRNA)對該病的起病起著某種關鍵性的作用。以往的研究顯示,某種被稱作CGG三核苷酸重復序列的特別的核苷酸三聯體的異常擴增可令脆性X智力遲鈍-1基因或FMR1沉寂并導致脆性X綜合癥。但是,在此之前,這一串遭到損壞的CGG三核苷酸重復序列會令這一重要的基因沉寂的機制卻是一直未知的。 應用人類胚胎干細胞來追蹤發育過程,Dilek Colak 及其同事發現,當過多的核苷酸重復序列出現時,它們會被轉錄至mRNA,而后者轉而會與FMR1基因的相應的CGG-重復序列部分相融合。他們說,正是這一RNA/DNA雙鏈形成了一個基因路障并中斷了FMR1的活性。然而,當研究人員阻斷了mRNA與FMR1的CGG-重復序列部分之間的相互作用時,該基因就不會沉寂。......閱讀全文
低度重復序列的概念
低度重復序列在單倍體基因組中只出現一次或數次,因而復性速度很慢。單拷貝順序在基因組中占50-80%,如人基因組中,大約有60-65%的順序屬于這一類。單拷貝順序中儲存了巨大的遺傳信息,編碼各種不同功能的蛋白質。尚不清楚單拷貝基因的確切數字,但是是有其在單拷貝順序中只有一小部份用來編碼各種蛋白質,其他
中度重復序列的概念
中度重復序列(moderately repetitive sequence )一般是非編碼序列,有十個到幾百個拷貝,如?rRNA基因和?tRNA?基因等。這類重復序列的平均長度大約為 300bp ,往往構成序列家族,常以回文序列形式出現在基因組的許多位置上,有些同單一序列間隔排列。大部分中度重復序列
反向重復[序列]的定義
存在于雙鏈核酸分子中排列順序方向相反的一段核苷酸序列。
串聯重復[序列]的定義
中文名稱串聯重復[序列]英文名稱tandem repeat定 義首尾相連的重復序列。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
重復[DNA]序列的概念
中文名稱重復[DNA]序列英文名稱repetitive [DNA] sequence定 義DNA分子中重復出現的核苷酸序列。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
高度重復序列的概念
高度重復序列是一組基因序列,在基因組中重復頻率高,可達百萬(10^6)以上,因此復性速度很快。在基因組中所占比例隨種屬而異,約占10-60%,在人基因組中約占20%。
Alu重復序列的概念
中文名稱Alu重復序列英文名稱Alu repetitive sequence;Alu family定 義哺乳動物和人基因組中的一種中等重復序列,因該序列中有限制性內切酶Alu的切點而得名。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
簡單重復序列的概念
簡單重復序列(Simple Sequence Repeat,簡稱SSR),是指重復單位長度和堿基組成基本一致,只 有少數基因出現微小的差異的一類短串聯重復序列。
散在重復序列的概念
散在重復序列是與串聯重復序列的組織形式不同的另一類重復序列,是散在方式分布于基因組內的散在重復序列。
散在重復序列的定義
散在重復序列是與串聯重復序列的組織形式不同的另一類重復序列,是散在方式分布于基因組內的散在重復序列。
同向重復[序列]的概念
中文名稱同向重復[序列]英文名稱direct repeat定 義核苷酸排列次序一致的重復序列。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
簡單重復序列的功能特點
SSR 標記具有高度重復性、豐富的多態性、共顯性、高度可靠性等優點,但由于其需要對所研究物種的一系列微衛星位點進行克隆和測序分析,以便設計相應的引物,這是非常費時、費力和代價昂貴的工作,沒有足夠的投資、人力和時間,是不可能實現的,因而給它的利用帶來了一定困難。
長末端重復序列的定義
長末端重復序列(long terminal repeats,LTRs)是相同的DNA序列,重復數百或數千次發現在兩端retrotransposons或前病毒的DNA由反轉錄的RNA逆轉錄病毒。
高度重復序列的結構特點
倒位(反向)重復序列這種重復順序復性速度極快,即使在極稀的DNA濃度下,也能很快復性,因此又稱零時復性部分,約占人基因組的5%。反向重復序列由兩個相同順序的互補拷貝在同一DNA鏈上反向排列而成。變性后再復性時,同一條鏈內的互補的拷貝可以形成鏈內堿基配對,形成發夾式或“+”字形結構。倒位重復(即兩個互
末端反向重復[序列]的定義
中文名稱末端反向重復[序列]英文名稱inverted terminal repeat;ITR定 義排列順序相反的、等同的或密切相關的核苷酸序列。常出現于某些轉座子的末端。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
核苷酸序列的概念
核苷酸序列,就是指DNA或RNA中堿基的排列順序。這意味著DNA中A,T,G,C的排列順序,或者mRNA中A,U,G,C的排列順序,也包括rRNA,tRNA中堿基的排列順序。
核苷酸序列的結構
核苷酸序列,就是指DNA或RNA中堿基的排列順序。這意味著DNA中A,T,G,C的排列順序,或者mRNA中A,U,G,C的排列順序,也包括rRNA,tRNA中堿基的排列順序。
長散在重復序列的概念
中文名稱長散在重復序列英文名稱long interspersed repeated sequences定 義以散在方式分布于基因組中的較長的重復序列。重復序列的單元長度在1000bp以上。常具有轉座活性。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
細胞化學詞匯末端反向重復[序列]
中文名稱:末端反向重復[序列]英文名稱:inverted terminal repeat;ITR定 義:排列順序相反的、等同的或密切相關的核苷酸序列。常出現于某些轉座子的末端。應用學科:生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
短散在重復序列的概念
中文名稱短散在重復序列英文名稱SHORT INTERSPERSED REPEATED SEQUENCE定 義以散在方式分布于基因組中的較短的重復序列。重復序列單元長度在50BP以下。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
核苷酸序列的分析方法
根據核苷酸序列頻率分布的特點和離散傅立葉變換所固有的“柵欄效應”,提出采用調頻Z變換的分析方法,定義了相應的表達式,同時構造了短時調頻Z變換用于識別基因區域中的外顯子部分和內含子部分。與已有的基因區域識別算法相比,該方法不需要依賴于訓練樣本序列。測試結果表明了該方法的有效性。
核苷酸序列的分析方法
根據核苷酸序列頻率分布的特點和離散傅立葉變換所固有的“柵欄效應”,提出采用調頻Z變換的分析方法,定義了相應的表達式,同時構造了短時調頻Z變換用于識別基因區域中的外顯子部分和內含子部分。與已有的基因區域識別算法相比,該方法不需要依賴于訓練樣本序列。測試結果表明了該方法的有效性。
簡單重復序列多態性的概念
中文名稱簡單重復序列多態性英文名稱simple sequence repeat polymorphism;SSRP定 義由組成比較簡單的(如二、三核苷酸或四核苷酸序列)串聯重復所具有的拷貝數不同而造成的多態現象。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),方法與技術(二級學科)
重復序列長度多態性的定義
中文名稱重復序列長度多態性英文名稱repeat sequence length polymorphism定 義亞種、品系或個體間相同或相似重復單元的重復拷貝數不同而造成的多態現象。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
高度重復序列的主要功能
a.參與復制水平的調節反向序列常存在于DNA復制起點區的附近。另外,許多反向重復序列是一些蛋白質(包括酶)和DNA的結合位點。b.參與基因表達的調控DNA的重復順序可以轉錄到核內不均一RNA分子中,而有些反向重復順序可以形成發夾結構,這對穩定RNA分子,免遭分解有重要作用.c.參與轉位作用幾乎所有轉
核苷酸序列的基本概念
由A、T、C、G四種字符組成的核苷酸序列本質上是生物分子的一種符號表示。在計算生物學中,常采用離散傅立葉變換進行頻譜分析。
核苷酸序列的分析方法介紹
核苷酸序列,就是指DNA或RNA中堿基的排列順序。這意味著DNA中A,T,G,C的排列順序,或者mRNA中A,U,G,C的排列順序,也包括rRNA,tRNA中堿基的排列順序。 根據核苷酸序列頻率分布的特點和離散傅立葉變換所固有的“柵欄效應”,提出采用調頻Z變換的分析方法,定義了相應的表達式,同
散在重復序列的結構分布特點
散在重復序列是與串聯重復序列的組織形式不同的另一類重復序列,是散在方式分布于基因組內的散在重復序列。
DNA核苷酸序列岡崎片段的介紹
岡崎片段是相對較短的DNA核苷酸序列(真核生物中大約有150到200個堿基對長),它們的合成是不連續的,并隨后通過DNA連接酶連接在一起,形成DNA復制過程中的滯后鏈。岡崎片段是20世紀60年代兩位日本分子生物學家、名古屋大學的一對校友夫婦岡崎令治和岡崎恒子共同發現的。
Nature:DNA重復序列是否致病取決于什么?
DNA重復序列在人類基因組中是很常見的。重復序列已經被提出作為一種進化機制,但是它們可能與人類疾病相關。現在,馬克斯-普朗克分子遺傳學研究所和Charité – Universit?tsmedizin Berlin的科學家已經證明,DNA重復序列是否與人類疾病相關,取決于它們在基因組中的位置,序