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  • 學者開發出基因結構注釋“拋光”工具

    華南農業大學園藝學院教授夏瑞團隊在國家自然科學基金等項目的資助下,開發了一種基于基因共線性進行物種基因組基因結構注釋矯正的工具——SynGAP(Synteny-based Gene structure Annotation Polisher)。相關成果近日在線發表于《基因組生物學》(Genome Biology)。 演化過程中,在具有共同祖先的近緣物種之間,染色體上同源基因存在保守排列的現象,被稱為基因共線性。近緣物種的基因共線性區塊中,部分基因丟失了與其對應的共線性基因,進而在區塊內形成共線性對的間隔。共線性基因的缺失,可能由基因組序列的變化引起的,同時還有可能是錯誤注釋或缺失的基因模型導致的。 基于后一種可能性,夏瑞團隊通過兩物種的共線性分析,檢測出共線性區塊中共線性對的空缺位置。隨后進行雙向的同源比對以實現對間隔內潛在注釋錯漏的初步鑒定與矯正。再通過去冗余、可靠性指標計算篩選、參考注釋質量分級等步驟對初步矯正結果進......閱讀全文

    ras基因的基因結構

    ras基因在進化中相當保守,廣泛存在于各種真核生物如哺乳類,果蠅,真菌,線蟲及酵母中,提示它有重要的生理功能.哺乳動物的ras基因家族有三個成員,分別是H-ras,K-ras,N-ras,其中K-ras的第四個外顯子有A,B兩種變異體.各種ras基因具有相似的結構,均由四個外顯子組成,分布于全長約3

    結構基因的結構

    ? 人類結構基因4個區域:①編碼區,包括外顯子與內含子;②前導區,位于編碼區上游,相當于RNA5’末端非編碼區(非翻譯區);③尾部區,位于RNA3’編碼區下游,相當于末端非編碼區(非翻譯區);④調控區,包括啟動子和增強子等。基因編碼區的兩側也稱為側翼順序(圖3-1)。  1.外顯子和內含子 大多

    簡述ras基因的基因結構

      ras基因在進化中相當保守,廣泛存在于各種真核生物如哺乳類,果蠅,真菌,線蟲及酵母中,提示它有重要的生理功能.哺乳動物的ras基因家族有三個成員,分別是H-ras,K-ras,N-ras,其中K-ras的第四個外顯子有A,B兩種變異體.各種ras基因具有相似的結構,均由四個外顯子組成,分布于全長

    bcr/abl融合基因的基因結構

    人abl基因位于9號染色體長臂,有1b、1a和2~11共12個外顯子[1]。轉錄始自1b或1a,形成的兩種mRNA長度分別為7kb和6kb,合成的兩種蛋白質分子量均約為145,前者定位于細胞膜,而后者主要在細胞核內。abl主要結構有N端的肉瘤同源2(srchomology,SH2)、SH1。SH2結

    結構基因、調節基因、操縱基因的功能對比

    結構基因:是決定合成某一種蛋白質或RNA分子結構相應的一段DNA。結構基因的功能是把攜帶的遺傳信息轉錄給mRNA(信使核糖核酸),再以mRNA為模板合成具有特定氨基酸序列的蛋白質或RNA。調節基因:是調節蛋白質合成的基因?。它能使結構基因在需要某種酶時就合成某種酶,不需要時,則停止合成,它對不同染色

    Rictor基因的結構

    Rictor和Mtor(frap1;mim 601231)是一種蛋白質復合物的組成部分,該復合物整合了營養和生長因子衍生的信號來調節細胞生長(Sarbassov等人,2004[PubMed 15268862])。

    結構基因的概念

    結構基因是編碼蛋白質或RNA的基因。細菌的結構基因一般成簇排列,多個結構基因受單一啟動子共同控制,使整套基因或都表達或者都不表達。結構基因編碼大量功能各異的蛋白質,其中有組成細胞和組織器官基本成分的結構蛋白、有催化活性的酶和各種調節蛋白等。

    結構基因的特征

    1.它們彼此緊密連鎖。按Z,Y,A順序排列,而且在一起轉錄形成一個多順反子的mRNA;2.只有當乳糖存在時,這些基因才迅速轉錄,形成多順反子的mRNA,并翻譯成相應的酶。所以這些酶,就是由乳糖誘導產生的誘導酶,其活性的產生和活性的提高不是已有的酶被激活所致,而是在誘導物的誘導下酶的重新合成,并隨著合

    MHC基因結構分析

    ?? 一、小鼠H-2基因復合體  (一)H-2復合體的結構  本世紀30年代,Gorer在鑒定近交系小鼠血型抗原時曾發現4組紅細胞抗原,命名為抗原Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ。其中抗原Ⅱ只存在于某些品系而不存在于另一些品系小鼠中。其后,Snell等用近交系小鼠中生長的腫瘤分別移植于其雜交子代,腫瘤只能在抗原Ⅱ陽性

    結構基因的功能

    結構基因在理論上有如下兩種功能:其核苷酸順序決定一條多肽鏈(蛋白質鏈)一級結構上的氨基酸序列,即一個順反子(cistron)(帶著足以決定一個蛋白質分子的全部組成需要信息的最短DNA片段);其核苷酸順序也決定一條多核苷酸鏈(如mRNA)的核苷酸順序。一種結構基因對應于一種蛋白質分子。結構基因在調節基

    關于bcr/abl融合基因的基因結構介紹

      人abl基因位于9號染色體長臂,有1b、1a和2~11共12個外顯子。轉錄始自1b或1a,形成的兩種mRNA長度分別為7kb和6kb,合成的兩種蛋白質分子量均約為145,前者定位于細胞膜,而后者主要在細胞核內。abl主要結構有N端的肉瘤同源2(srchomology,SH2)、SH1。SH2結合

    學者開發出基因結構注釋“拋光”工具

    華南農業大學園藝學院教授夏瑞團隊在國家自然科學基金等項目的資助下,開發了一種基于基因共線性進行物種基因組基因結構注釋矯正的工具——SynGAP(Synteny-based Gene structure Annotation Polisher)。相關成果近日在線發表于《基因組生物學》(Genome B

    學者開發出基因結構注釋“拋光”工具

      華南農業大學園藝學院教授夏瑞團隊在國家自然科學基金等項目的資助下,開發了一種基于基因共線性進行物種基因組基因結構注釋矯正的工具——SynGAP(Synteny-based Gene structure Annotation Polisher)。相關成果近日在線發表于《基因組生物學》(Genome

    基因導入儀的結構

      基因導入儀主要功能是產生一個高電壓、大電流RC尖脈沖。因此它的主要組成部分包括高壓脈沖產生、單片機和電極(形狀由需要而定)。該儀器整機一體化設計,操作簡單,顯示直觀,微處理器控制的脈沖放電采用人機對話界面,細化了電容、電阻的設定范圍,使細胞的電穿孔實驗在相關條件下有了更廣泛的選擇。

    載脂蛋白基因結構

      載脂蛋白基因的分離是通過用相應的cDNA作為探針篩選基因文庫而完成的。比較基因的核苷酸序列與cDNA的核苷酸序列得以鑒定基因的內含子與外顯子數目以及它們的分界線。大部分真核細胞的基因含有內含子,內含子不編碼氨基酸,但有些內含子參與基因表達的調控。外顯子通常占據基因內的三個區域:第一個區域不編碼氨

    關于結構基因的簡介

      結構基因是指決定某一種蛋白質分子結構的相應的一段DNA或染色體。在正常情況下,在需要某種或其有關的酶時,在調節基因和操縱基因的控制下等候在啟動子(Promotor)位置上的RNA聚合酶開始轉錄,從而產生了與這些酶有關的結構基因的信使RNA,并由后者合成所需的酶。若其發生突變,便會產生失去活性的蛋

    BCR/ABL的基因結構

    人abl基因位于9號染色體長臂,有1b、1a和2~11共12個外顯子。轉錄始自1b或1a,形成的兩種mRNA長度分別為7kb和6kb,合成的兩種蛋白質分子量均約為145,前者定位于細胞膜,而后者主要在細胞核內。abl主要結構有N端的肉瘤同源2(srchomology,SH2)、SH1。SH2結合磷酸

    結構基因的功能特點

    結構基因在理論上有如下兩種功能:其核苷酸順序決定一條多肽鏈(蛋白質鏈)一級結構上的氨基酸序列,即一個順反子(cistron)(帶著足以決定一個蛋白質分子的全部組成需要信息的最短DNA片段);其核苷酸順序也決定一條多核苷酸鏈(如mRNA)的核苷酸順序。一種結構基因對應于一種蛋白質分子。結構基因在調節基

    骨橋蛋白的基因結構

      OPN人的OPN基因定位在染色體4q13,是單一編碼基因,8kb大小,具有7個外顯子和6個內含子組成。小鼠位于5號染色體上,基因長約7Kb,包括7個外顯子,其5’端有啟動子序列,該啟動子中IKb長度也被測序并用GCG程序分析了轉錄因子的可能識別部位,這些轉錄因子包括API-5、PEA-3、PEA

    原核細胞的基因結構

      原核生物的基因結構多數以操縱子形式存在,即完成同類功能的多個基因聚集在一起,處于同一個啟動子的調控之下,下游同時具有一個終止子。兩個基因之間存在長度不等的間隔序列,如與乳糖代謝有關酶的基因。在距轉錄起始點-35和-10(轉錄起始點上游的核苷酸序列為“-”,下游的核苷酸序列為“+”)附近的序列都有

    控制結構基因的種類

    控制結構基因的轉錄速度,位于結構基因的附近,本身不能轉錄成mRNA。大腸桿菌乳糖操縱子包括4類基因:①結構基因,能通過轉錄、翻譯使細胞產生一定的酶系統和結構蛋白,這是與生物性狀的發育和表型直接相關的基因。乳糖操縱子包含3個結構基因:lacZ、lacY、lacA。lacZ合成β—半乳糖苷酶,lacY合

    簡述結構基因的功能

      結構基因在理論上有如下兩種功能:其核苷酸順序決定一條多肽鏈(蛋白質鏈)一級結構上的氨基酸序列,即一個順反子(cistron)(帶著足以決定一個蛋白質分子的全部組成需要信息的最短DNA片段);其核苷酸順序也決定一條多核苷酸鏈(如mRNA)的核苷酸順序。一種結構基因對應于一種蛋白質分子。結構基因在調

    人類基因結構特點

    雙螺旋結構,結構基因是編碼蛋白質或RNA 的基因。細菌的結構基因一般成簇排列,多個結構基因受單一啟動子共同控制,使整套基因或都表達或者都不表達。基因具有兩方面的特征:1、它們彼此緊密連鎖。按Z,Y,A順序排列,而且在一起轉錄形成一個多順反子的mRNA;2、只有當乳糖存在時,這些基因才迅速轉錄,形成多

    什么是結構基因、調節基因,區別是什么?

    凡是編碼酶蛋白、血紅蛋白、膠原蛋白或晶體蛋白等蛋白質的基因都稱為結構基因;凡是編碼阻遏或激活結構基因轉錄的蛋白質的基因都稱為調節基因。但是從基因的原初功能這一角度來看,它們都是編碼蛋白質。

    基因組系統解析工具開發研究取得重要進展

    近日,中國工程院院士、南方海洋科學與工程廣東省實驗室(廣州)教授包振民團隊開發國際首個整合宏觀/微觀進化基因組和功能基因組的綜合分析工具(PanSyn,https://github.com/yhw320/PanSyn)。相關成果發表于《自然-實驗手冊》。該成果是包振民團隊長期積累的豐富基因組學分析方

    關于基因類型—抗癌基因的組成結構介紹

      抗癌基因亦稱腫瘤抑制基因(tumor suppressor gene)或隱性致癌基因(recessive onco-gene)。該類基因之存在可抑制細胞惡變,其丟失或失活(二倍體細胞中二個等位基因都失活)情況下促進細胞癌變。首次被鑒定出的是抗癌基因 Rb(Retinoblas-toma),它是從

    操縱基因的基本結構

    有許多種操縱基因用足跡法定位并進行了DNA序列分析,將影響阻遏物結合的操縱基因突變的特性加以描述,它們最重要的特征是反向重復(inverted repeat)或毗鄰重復(near repeat)。例如,用核酸酶消化DNA與lac阻遏物的復合體,分離得到一個乳糖操縱基因片段,由24bp組成,其中約有1

    ASNS基因的結構及作用

    這個基因編碼的蛋白質參與天冬酰胺的合成。這個基因補充了溫度敏感型倉鼠突變體TS11的突變,該突變體在非耐受溫度下阻止細胞周期G1期的進展。另外,還描述了該基因的剪接轉錄變體。

    操縱基因的結構特點

    操縱基因是操縱子中的控制基因,在操縱子上一般與啟動子相鄰,通常處于開放狀態,使RNA?聚合酶通過并作用于啟動子啟動轉錄。但當它與調節基因所編碼阻遏蛋白結合時,就從開放狀態逐漸轉變為關閉狀態,使轉錄過程不能發生。

    操縱基因的基本結構

    有許多種操縱基因用足跡法定位并進行了DNA序列分析,將影響阻遏物結合的操縱基因突變的特性加以描述,它們最重要的特征是反向重復(inverted repeat)或毗鄰重復(near repeat)。例如,用核酸酶消化DNA與lac阻遏物的復合體,分離得到一個乳糖操縱基因片段,由24bp組成,其中約有1

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