HPV分型基因檢測的簡介
HPV分型基因檢測指的是檢測多種基因型HPV的同時可以對HPV陽性結果進行基因分型的檢測技術。其利用包括PCR-熒光探針法或其他分子生物學方法在內的核酸檢測技術,以特定高危型HPV核酸(包括DNA和RNA)序列為檢測目的,對人宮頸樣本(如人宮頸脫落上皮細胞或分泌物等)進行體外定性檢測的試劑,以確定受試樣本中是否存在高于陽性判斷值水平的高危型HPV病毒,同時鑒定感染HPV的基因型別。 此類試劑在臨床上用于:1)篩查宮頸細胞學檢查為ASC-US(意義未確定的非典型鱗狀上皮細胞)結果的患者,以確定是否需要進行陰道鏡檢查(以下簡稱ASC-US人群分流用途);2)對于30歲及以上的女性,通過檢測是否有高危型HPV感染,與宮頸細胞學檢查聯合進行宮頸癌篩查,此檢測結合細胞學病史和其他風險因素的評估、以及臨床診療和篩查指南的要求,用于指導患者的管理(以下簡稱宮頸癌聯合篩查用途);3)對于某年齡段(根據臨床試驗結果而定)女性,通過檢測是否有......閱讀全文
外生殖器部位表皮增生性疾病中HPV-DNA的檢測和分型
??? 低危型人乳頭狀瘤病毒(HPV)6和HPV-11等感染主要導致局部鱗狀上皮良性增生,而高危型HPV-16及HPV-18等感染多引起鱗狀上皮惡性增殖。???? 我們對外生殖器的幾種主要腫瘤及瘤樣病變進行HPV檢測與分型,探討了HPV感染與外生殖器表皮增生性疾病的發生及惡變的關系。研究納入
HLA細胞法分型試驗簡介
HLA-D和DP位點的抗原須用細胞法分型進行鑒定,所以又稱LD抗原(lymphocytedefinedantigen),其鑒定方法普遍采用混合淋巴細胞培養(mixedlymphocyteculture,MLC),也稱混合淋巴細胞反應(mixedlymphocytereaction,MLR)。1.試驗
HLA細胞法分型試驗簡介
HLA-D和DP位點的抗原須用細胞法分型進行鑒定,所以又稱LD抗原(lymphocytedefinedantigen),其鑒定方法普遍采用混合淋巴細胞培養(mixedlymphocyteculture,MLC),也稱混合淋巴細胞反應(mixedlymphocytereaction,MLR)。
乙肝病毒的基因分型
HBV根據抗原決定簇的差異可劃分為4個不同的血清型和9個血清亞型, 通過對HBV全基因序列比較后發現,血清亞型的區分并不能反應HBV基因組的差異。根據HBV全基因核苷酸序列異源性≥ 8.0% 或者S基因區核苷酸序列異源性≥4.0% , 將不同病毒株分為A-H 8個基因型。?? ?HBV基
關于單基因病的分型介紹
1.常染色體疾病(顯性和隱形) 致病基因為顯性并且位于常染色體上。如軟骨發育不全、多指(趾)癥、基因位于X染色體上:抗維生素D佝僂癥等。親代有一患者,后帶發病率一般為50%(如親代為純合體、則后帶發病率為100%,但這種情況較少)。 2.常染色體隱形遺傳病 致病基因為隱性并且位于常染色體上
STR分型檢測技術介紹
STR(short tandem repeat,短片段重復序列)廣泛存在于人類及哺乳動物的基因組中,具有高度多態性,它們一般由2-6個堿基構成一個核心序列,核心序列串聯重復排列,由核心序列重復數目的變化產生長度多態性。對于一個特定的個體,染色體上某個特定位置的重復序列的重復次數是固定的,而對于不同的
什么是STR分型檢測?
STR分型檢測(short tandem repeat)是一種檢測技術。主要用于檢測人類及哺乳動物的基因組。
用PCR進行基因分型1
與許多一次做數百塊Southern blots的研究人員一樣,我第一次用PCR做基因分型(genotyping)時覺得見效很快,不再需要等幾天才能看到結果,不再需要DNA顯微圖像或者操作紫外線了。隨著技術的不斷進步,RCR使基因組學和轉錄組學發生了翻天覆地的變化,甚至隨著免疫PCR的普及開始進軍蛋白
用PCR進行基因分型2
質譜法原則上,添加到引物末端的核苷能夠直接依據質量,利用通過基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectroscopy,MALDI-TOFMS)直接檢測出來,這是一種不需標
HLA基因分型方法:RFLP法
RFLP法1)常規制備DNA鹽析法1.用淋巴細胞分離液從抗凝血中分離出白細胞。2.每3ml細胞懸液加10ml紅細胞裂解液溶解紅細胞兩次,再加2ml白細胞裂解液溶解白細胞。3.加50μl 10%?SDS和70μl蛋白酶K消化蛋白質,37℃過夜或55℃?3h。4.加0.25體積飽和醋酸鈉溶液,劇烈搖動1
高危型HPV感染的表現
1、皮膚表現有資料表明皮膚的鮑溫病、基底細胞癌、帕哲病、鱗狀細胞癌等上皮腫瘤也與此類病毒感染有關。2、粘膜表現宮頸癌、肛門肛管癌、扁桃體癌、口腔癌、喉癌、鼻腔內癌、食道癌等
載脂蛋白e基因分型HBV多位點耐藥基因檢測結果分析
目的 分析乙型肝炎患者HBV核苷(酸)類似物耐藥相關的10個位點的突變情況及其臨床意義。 方法 采用焦磷酸測序法對658例各型乙型肝炎患者行核苷類似物抗乙肝病毒多位點耐藥基因檢測并分析不同核苷(酸)類似物耐藥的突變形式,對常見突變模式者ALT和HBV-DNA水平進行比較。 結果 300
篩查高危型HPV
?2018年,WHO呼吁所有國家采取行動:2030年全球消除宮頸癌。宮頸癌之所以能成為人類即將戰勝的第一種惡性腫瘤,是因為在2008年,豪森教授發現人乳頭瘤病毒(HPV)與宮頸癌發生密切相關并獲得諾貝爾醫學獎。隨著HPV疫苗的問世以及宮頸癌篩查的普及,未來宮頸癌的發生率和死亡率將顯著下降。?目前,建
單倍體基因型的簡介
單倍型,是單倍體基因型的簡稱,在遺傳學上是指在同一染色體上進行共同遺傳的多個基因座上等位基因的組合;通俗的說法就是若干個決定同一性狀的緊密連鎖的基因構成的基因型。按照某一指定基因座上基因重組發生的數量,單倍型可以指至少兩個基因座甚至整個染色體。
基因分型的新方法被研發
廉價的基因分型方法對現代基因組學至關重要。在最新這篇論文中,研究人員報道了QUILT,它使用低覆蓋率的全基因組序列數據執行二倍體基因型填充。QUILT采用吉布斯采樣將讀數劃分為母本和父本集,并使用大型參考面板促進快速單倍體填充。 研究人員證明了這種劃分在許多兆堿基上是準確的,能夠實現接近理
高危型HPV在頭頸部鱗癌檢測中的意義
人乳頭瘤病毒(human papilloma virus,HPV)是一種乳多空病毒科的乳頭瘤空泡病毒A屬,為球形DNA病毒,能引起人體皮膚黏膜的鱗狀上皮增殖。HPV作為宮頸癌發病的明確病因已受到醫學界的廣泛關注,現證實其也可引起頭頸部鱗狀細胞癌( head and necks quamous cel
Affymetrix推出AxiommiRNA靶基因分型芯片
2012年11月6日,來自加利福尼亞州圣克拉拉的消息――Affymetrix公司(納斯達克代碼:AFFX)推出了 Axiom? miRNA靶基因分型芯片,唯一一款可在全基因組范圍評估microRNA(miRNA)靶基因位點的高密度基因分型工具。這些新的芯片將實現全面研究,以闡明miRNA調控
PYRO測序用于SNP基因分型原理
其實是一種段片段焦磷酸測序技術,在測序引物的引導下,完成段片段(含snp)的測序,從而實現基因分型。缺點:不能檢測長片段,對于重復序列沒有辦法。原理簡介1.測序引物與單鏈,PCR擴增的DNA模板相結合。然后將其與DNA聚合酶、ATP硫酸化酶、熒光素酶和三磷酸腺苷雙磷酸酶,以及底物APS和熒光素一起孵
免提取DNA,輕松搞定基因分型
基因分型是通過使用生物學試驗檢查個體的DNA序列的過程,也是將目標序列與另一個體的序列或參考序列進行比較來確定個體的遺傳構成(基因型)差異的過程。PCR 是一種常見的基因分型方法,用于對樣本的基因型進行擴增和鑒定。但由于基因分型通常需要檢測成百上千份樣品,樣品處理、提取基因組DNA、PCR擴增目的基
小片段法進行基因分型(一)
摘要:????? 背景:用于基因分型的高分辨率熔解曲線技術既簡單又有效。在以熔解為基礎的方法中,探針法是基因分型的黃金標準,可以將等位基因與目標的匹配完全區分開。小片段基因分型法是代替探針的基因分型法。異源雙鏈核酸分子的存在使得檢測純合子變得容易,其熔解峰的形狀有明顯的改變。純合子G/C或A/T的基
小片段法進行基因分型(二)
結果:??????? 圖1顯示的是校正之前的完整的熔解峰顯示。 從低溫和高溫內標及擴增子熔解的中部區分熔解信號。圖1:派生熔解曲線顯示校準和擴增子的熔解峰。左邊和右邊的峰是校準內標的峰。94的熔解剖面圖,接近76℃,從獨立的PCR反應中生成。校準分子沒有對其,純合子的擴增峰沒有清楚的分開。中部最窄且
HPVlgG抗體的簡介
HPV是一組病毒的總稱,組成一個科,其病毒形態類似,但DNA限制性內切酶圖譜各異,核殼體蛋白質的抗原性不同,其電鏡下的結果如圖1所示。目前已經確定的HPV型別大約有80余種,依其感染的上皮所在部位分為皮膚型HPV和生殖道上皮HPV,大約35種型別可感染婦女生殖道,約20種與腫瘤相關(下文提到的H
葡萄球菌屬的分類與分型簡介
根據生化反應和產生色素不同,可分為金黃色葡萄球菌(Staph.aureus)、表皮葡萄球菌(Staph. epidermidis)和腐生葡萄球菌(Staph.saparophytics)三種。其中金黃色葡萄球菌多為致病菌,表皮葡萄球菌偶爾致病,腐生葡萄球菌一般不致病。60%-70%的金黃色葡萄球
2bRAD基因分型樣品的制備
實驗概要RAD的高通量測序是目前同布發現和分析遺傳多態性廣泛使用的方法。本文描述了進行RAD基因分型的一個可選的方法,被稱為2b-RAD,用IIB型限制性內切酶(ALFI,BsaXI)作為基因分型的替代方法。主要試劑1. ALFI (Fermentas, cat no. ER1801)2. T4連接
2bRAD基因分型樣品的制備
實驗概要本實驗介紹了2b-RAD基因分型樣品的制備流程。主要試劑ALFI((Fermentas, cat no. ER1801)T4連接酶(NEB, cat no. M0202)ATP(NEB, cat no. P0756)DNA聚合酶((NEB, cat no. M0530)dNTP(NEB, c
磷酸二酯酶的基因分型
分子克隆技術揭示磷酸二酯酶(phosphodiesterases,PDEs)是一個多基因大家族,開發選擇性的磷酸二酯酶抑制劑將為多種疾病的治療開辟新的思路。PDEs是一個多基因的大家族,它包括11型共30余種具有不同底物專一性、酶動力學特征、調控特點以及細胞與亞細胞分布區域不同的磷酸二酯酶同功酶 P
關于HLA分型的DNA分型方法介紹
DNA分型主要分為兩種方法:基于核酸序列識別的方法和基于序列分子構型的方法,常用的方法大致可分為大類: ①限制性片段長度多態性分析(restriction fragment length polymorphism,RFP)。其原理是不同的DNA膜板山于序列的差異在限制性內切酶作用下將被切成大小
肺癌的基因分型:新的機會,新的挑戰
我們當前治療肺癌患者的方法是實施前期基因分型,預先發現可以使用特異療法治療的畸變或者可以指導患者針對這些畸變進行特殊藥物的臨床試驗。 這是一個快速發展的領域。美國國立綜合癌癥網絡(NCCN)指南建議測試多種畸變,特別是表皮生長因子受體(EGFR)的基因突變和間變性淋巴瘤激酶(ALK)基因的重組
Affymetrix推出AxiomBiobank芯片,用于基因分型研究
2012年11月1日,來自加利福尼亞州圣克拉拉的消息――Affymetrix公司(納斯達克代碼:AFFX)今日宣布推出 Axiom? Biobank 芯片,一種內容靈活且性價比很高的功能生物學方案,能夠經濟地對大樣品集合進行基因分型,如生物樣本庫、基因組中心及核心實驗室篩查的樣品。 A
HLA基因分型方法:PCR-SSCP法
PCR-SSCP法1)提取DNA同前RFLP法?2)PCR擴增同前PCR-RFLP,也可加入1μCi32P-dCTP標記產物。?3)非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳1.取PCR的擴增產物,加凝膠加樣液3μl,95℃加熱變性2min,冰浴驟冷。同位素摻入的DNA取1μl稀釋10倍,加樣3μl。2.取樣品用微量