古老DNA追溯黑死病起源
一項對古代基因組的研究顯示，14世紀在現在的吉爾吉斯斯坦暴發的一場瘟疫中，許多人死于引起鼠疫的耶爾森氏菌菌株，該菌株產生的病原體在幾年后又導致了黑死病。 “這就像找到了所有菌株聚集的地方。”該研究的共同負責人、德國萊比錫馬克斯·普朗克進化人類學研究所的古遺傳學家Johannes Krause說，該研究6月15日發表于《自然》。 1346年至1353年間，黑死病肆虐歐亞大陸西部，一些地區的死亡人數高達60%。歷史記錄表明，黑死病起源于東部：克里米亞半島的卡法在1346年被蒙古帝國軍隊圍攻期間暴發了最早的瘟疫，高加索和中亞其他地區則被認為是潛在的震中。 中國擁有世界上最具遺傳多樣性的現代鼠疫桿菌菌株，這暗示黑死病起源于東亞。“文獻中有各種各樣的假設。我們確實知道它的確切來源。”Krause說。 幾年前，英國斯特林大學的經濟和環境歷史學家、該研究的共同主要作者Philip Slavin在吉爾吉斯斯坦的一對14世紀......閱讀全文
古老DNA追溯黑死病起源
一項對古代基因組的研究顯示，14世紀在現在的吉爾吉斯斯坦暴發的一場瘟疫中，許多人死于引起鼠疫的耶爾森氏菌菌株，該菌株產生的病原體在幾年后又導致了黑死病。 “這就像找到了所有菌株聚集的地方。”該研究的共同負責人、德國萊比錫馬克斯·普朗克進化人類學研究所的古遺傳學家Johannes Kraus
古DNA分析：黑死病大流行或源于歐亞大陸中部
中新網北京6月16日電 (記者 孫自法)國際著名學術期刊《自然》最新發表一篇微生物學論文稱，研究人員對7名死于14世紀個體開展的DNA分析顯示，14世紀曾席卷歐亞大陸的黑死病可能源于歐亞大陸中部。 該論文介紹，黑死病是由鼠疫耶爾森菌(Yersinia pestis)引起，在公元1346年至
失去的基因或能解釋黑死病的起源
大約六千年前，一種細菌經歷了基因變化，它的生存環境因此從老鼠的內臟擴大到了跳蚤。此類的基因變化一直發生著，但這次的特別之處是它最終導致了黑死病，在14世紀殺死了三分之一的歐洲人口。導致黑死病的鼠疫耶爾森菌（Yersinia pestis）是從另一種叫假結核耶爾森菌的細菌演變而來。演變發生在中國的
大數據預知下一次“黑死病”？
用電腦預測傳染病爆發聽起來特別科幻，但科學家們就要做到了。在這項新研究中，科學家利用機器學習，用大數據擬合動物的生存模式，對哪種動物可能攜帶危險病毒、細菌或真菌做出準確預測。 新型傳染病的爆發常常是病原微生物由動物突然傳到人類的情況，這種傳染病被稱為人畜共患病。如果可以對人畜共患病的跨物種傳染
關于鼠疫桿菌的研究過程介紹
黑死病14世紀在歐洲奪去上千萬人生命，占當時歐洲總人口將近三分之一。一個國際研究小組利用脫氧核糖核酸(DNA)和蛋白質分析方法確認，鼠疫桿菌是這場瘟疫以及之后400年間多場瘟疫的罪魁禍首。 黑死病死者樣本中發現鼠疫桿菌特有基團 麻風病等傳染病致人死亡后，即使過去多年，研究人員仍可從死者遺骸中
古老的黑死病至今仍影響人的免疫系統！基因有陰暗面？
傳染病是推動人類進化最強大的選擇壓力之一，包括歷史上有記錄以來的一次最大死亡事件——第二次瘟疫大流行的爆發，通常稱為黑死病，其由鼠疫耶爾森菌引起。這場瘟疫對非洲-亞歐大陸甚至產生了毀滅性的影響，造成多達30-50%的人口死亡，盡管已經過去幾個世紀，但其影響似乎至今仍然在蔓延。黑死病在人類遺傳學上留下
關于鼠疫桿菌的最新進展介紹
黑死病曾是人類歷史上最嚴重的瘟疫之一。而黑死病的罪魁禍首是鼠疫桿菌。最近，研究者從倫敦公墓四具死于黑死病的中世紀古尸牙齒中，提取出鼠疫桿菌，重建了病菌的DNA，從而對這個歷史上可怕的疾病的真實面貌有了更深入的理解。 [10] 2014年7月，在倫敦的一處專門埋葬瘟疫病人的公墓里，研究者們找到了
讓人聞風喪膽的黑死病－肆虐人間竟已長達4000年
在俄羅斯薩馬拉地區，科學家們發現了兩具死于黑死病的遺體，距今已有3800年。該發現表明黑死病危害人類已經長達4000年。圖片來源于網絡 一項于6月8日發表在雜志《自然?通訊》的研究表明，這是兩具感染了鼠疫桿菌的遺體。這個發現使得黑死病的源頭又提早了1000年，也就是說黑死病肆虐人間已經長達40
死神的無聲低語:英國在人類遺址中發現四千年前鼠疫DNA
在一項重大發現中，來自弗朗西斯-克里克研究所的研究人員與牛津大學、萊文斯地方歷史小組以及韋爾斯和門迪普博物館合作，發現了迄今為止英國最古老的鼠疫證據。該小組在薩默塞特和坎布里亞的人類遺骸中發現了三個4000年前的鼠疫耶爾森氏菌（導致鼠疫的細菌）病例。弗朗西斯-克里克研究所的研究人員在今天（5月30日
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA序列測定3
2．利用末端轉移酶和α-32P-ddNTP標記DNA的3ˊ-末端 在二價陽離子存在下，末端轉移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羥基末端，如果作為底物的核苷酸經過修飾（如ddNTP），則可以在DNA的3ˊ-OH上僅加入一個核苷酸。對于雙鏈DNA片段，亦存在DNA的兩側均被標記問題，可通過上述同
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA序列測定1
㈣ DNA聚合酶 如前所述，選用合適的DNA聚合酶進行測序反應也是保證測序質量的重要因素之一。常用于雙脫氧末端終止法測序的有幾種不同的酶： 1．大腸桿菌DNA聚合酶Ⅰ大片段（Klenow片段） 此酶是最早用于建立Sanger測序的酶。但通常會有兩個問題：①Klenow片段的持續合成能力較
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA序列測定2
目前應用的兩種快速序列測定技術是Sanger等（1977）提出的酶法（雙脫氧鏈終止法）和Maxam（1977）提出的化學降解法。雖然其原理大相徑庭，但這兩種方法都同樣生成相互獨立的若干組帶放射性標記的寡核苷酸，每組核苷酸都有共同的起點，卻隨機終止于一種（或多種）特定的殘基，形成一系列以某一特定核苷酸
DNA重組技術(DNA－Recombination)
一、DNA 的酶切與連接（1）酶切反應：同質粒DNA 的鑒定，只不過是質粒DNA 換為載體DNA 。若大量酶切，則成比例增加。（2）加2倍體積的預冷無水乙醇和1/10體積的3mol/l NaAc混勻，-20℃2h以上。（3）15000rpm離心15min，棄上清。（4）加入75%乙醇洗滌2次，離心棄
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組與鑒定1
重組DNA是在體外用限制性內切酶，將不同來源的DNA分子進行特異地切割，獲得的目的基因或DNA片段與載體重新連接，從而組成一個新的DNA雜合分子。重組的DNA分子能夠通過一定的方式進入相應的宿主細胞，在宿主細胞中進行無性增殖，獲得大量的目的基因或DNA片段，此過程稱基因克隆。重組的DNA分子也能夠在
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組與鑒定2
（1）CaCl2處理以后的轉化: 當細菌處于0℃、二價陽離子（如Ca2+、Mg2+等）低滲溶液中時，細菌細胞膨脹成球形，處于感受態；此時轉化混合物中的DNA形成抗DNA酶的羥基-鈣磷酸復合物粘附于細胞表面，重組DNA在42℃短時間熱沖擊后吸附在細胞表面，在豐富培養基中生長數小時后，球狀細胞恢復原
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組與鑒定3
當多克隆位點有外源DNA片段插入時，破壞此酶的N端閱讀框架，產生無α互補功能的N端片段，因此在帶有外源DNA片段的細菌在含有IPTG/X-gal的培養基上呈白色，見圖7-11 。如果外源DNA插入片段相當短，不破壞β-半乳糖苷酶的氨基端氨基酸序列的閱讀框，有時產生的重組體菌落不呈白色而是呈淺藍色。4
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組的載體3
在作為載體時，這些噬菌體有一個很大的優點，即克隆到M13mp載體的外源DNA片段（雙鏈），在子代噬菌體便成為了單鏈形式。故應用M13mp進行克隆，可方便地分離到大量含有外源DNA某一單鏈的DNA分子。這種單鏈DNA可在下列工作中作模板：①主要用作雙脫氧鏈終止法進行DNA序列測定的模板；②制備僅有一條
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組的載體2
二、噬菌體載體作為細菌寄生物的噬菌體，大多數具有編碼多種蛋白質的基因，能利用宿主細胞的蛋白質合成體系，進行生長和增殖。構建的噬菌體載體，以λ噬菌體、M13和粘粒最為常用。㈠ λ噬菌體載體野生型λDNA是一種基因組為4.8 kb的線性雙鏈DNA，全部序列已知，共編碼50多個基因。其中約一半基因參與
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組的載體1
載體（vector）是攜帶靶DNA（目的DNA）片段進入宿主細胞進行擴增和表達的運載工具。常用的載體是通過改造天然的細菌質粒、噬菌體和病毒等構建而成。目前已構建成的載體主要有質粒載體、噬菌體載體、病毒載體和人工染色體等多種類型，亦可根據其用途不同分為克隆載體和表達載體二類。載體的構建和選擇應考慮以下
DNA合成（DNA－synthesis－）技術介紹
蛋白質概念提出：DNA多肽合成（DNA synthesis ）：按照預定核苷酸的順序，將脫氧核苷酸逐個進行人工連接合成DNA鏈的方法。目前多是采用固相合成法，即是在多聚體支持物上從3′端延伸核苷酸，可自動化操作。)目前，oligo DNA合成一般都采用固相亞磷酰胺三酯法合成DNA片段，此方法具有高效
DNA－指紋的概念高變區DNA與DNA指紋
人的衛星DNA?或稱隨體DNA?是由一些短的DNA 片段（10bp 左右）多次重復所構成的。重復片段的組成和拷貝數在不同的個體及基因組的不同位置上不一樣。提取不同個體的基因組DNA 后，用其切點能識別序列為4 個堿基而又不切割該重復片段的限制性內切酶在重復片段的兩側切割基因組DNA ，然后將樣品進行
《科學》評選2022年十大突破
仰望星空、俯耕大地、探微解密... ...近日，《科學》公布了2022年十大科學突破，用科學視角帶領人們上天入地、溯古追今。? 窺視深空的“黃金之眼” 2021年12月25日發射升空的詹姆斯·韋布空間望遠鏡（JWST），在遭受了小型太空巖石撞擊的波折下，依然在2022年產出了諸多令人驚嘆的成
“垃圾DNA”或是編碼DNA的“保鏢”
"垃圾DNA"的概念源自上世紀70年代，用來形容基因組中不是編碼蛋白質的DNA序列，在學術上被稱為非編碼DNA序列。 非編碼DNA"開關說"究竟是個啥？ 科學家們發現，人類基因組中包含多達400萬個基因開關和功能調節因子，它們的載體便是"垃圾DNA"。這強烈地沖擊了"DNA序列=生物性
DNA－Fingerprinting,－DNA－Barcoding,－and－Next－Generation－Sequencing－...
DNA fingerprinting of plants has become an invaluable tool in forensic, scientific, and industrial laboratories all over the world. PCR has become
“垃圾DNA”或是編碼DNA的“衛士”
“垃圾DNA”的概念是在上世紀70年代提出來的，用來形容那些基因組中不是編碼蛋白質的DNA序列，而在學術上被稱為非編碼DNA序列。 由于當時的科學家普遍認為有生物學意義的蛋白質才是決定生物性狀的關鍵，而且也沒有一種好的理論和技術手段來解釋這些“垃圾”存在的原因，于是“垃圾DNA”這一觀念便形
DNA重組（DNA－recombination）技術：工具酶
一、限制性內切酶限制性內切酶（restriction endonucleases，RE）是其中最重要的工具酶之一。它是一類核酸水解酶，能識別和切割雙鏈DNA分子中的特定核苷酸序列。（一）命名原則限制性內切酶大多從細菌中發現，根據來源進行命名，限制酶的第一個字母（大寫，斜體）為宿主菌的屬名，第二、第三
DNA提取方法洗滌－DNA（或－RNA）
當裂解物通過硅膠膜進行離心分離,現在所提取的 DNA 或 RNA 應該與柱子結合,雜質、細胞蛋白和多糖應該已經通過了。?但是,膜仍然被殘留的細胞蛋白質和鹽弄臟。如果樣品來自植物,仍然會有多糖,也許一些色素留在膜上,或者如果樣品是血液,膜可能會被染成棕色或黃色。洗滌步驟用于去除這些雜質。通常有兩次洗滌
DNA連接酶(DNA－ligase)介紹
DNA連接酶是1967年在三個實驗室同時發現的。它是一種封閉DNA鏈上缺口酶，借助ATP或NAD水解提供的能量催化DNA鏈的5'-PO4與另一DNA鏈的3'-OH生成磷酸二酯鍵。但這兩條鏈必須是與同一條互補鏈配對結合的(T4DNA連接酶除外)，而且必須是兩條緊鄰DNA鏈才能被DNA
DNA－Immunoprecipitation－for－the－Determination－of－DNABinding－Specificity
Andrea J. Gossett?and?Jason D. Lieb1Department of Biology, University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill, NC 27599, USA1Corresponding autho