PNAS最新介紹測序組裝染色體技術
你有沒有試過在不知道最終圖案的情況下玩拼圖游戲?這正是一些基因組研究人員在嘗試通過新一代DNA測序數據，拼接成染色體時所面臨的同樣問題。這些染色體能提供基因組組織和結構變異方面的信息，有助于解析進化歷史。為了能拼湊出這些染色體來，科學家們可以通過物理或者遺傳圖譜完成，但是對于許多物種而言，這種指導性的圖譜并不存在。 不過現在，一組來自美國伊利諾伊大學的研究人員開發出了一種新方法，能在沒有任何已有物理或遺傳圖譜的情況下，預測出物種染色體的相應組裝。這種方法被稱為輔助染色體組裝(reference-assisted chromosome assembly，RACA，生物通譯)，其工作原理就是比較基因組信息和雙末端序列信息。 “我們設計的這種方法靶向基因組，或者說是基因組保守性，嘗試將其進一步融入到進化背景中去，”文章的通訊作者，伊利諾斯大學生物工程系助理教授馬健(Jian Ma，音譯)解釋道，“這樣就能分析出......閱讀全文
PNAS最新介紹測序組裝染色體技術
你有沒有試過在不知道最終圖案的情況下玩拼圖游戲?這正是一些基因組研究人員在嘗試通過新一代DNA測序數據，拼接成染色體時所面臨的同樣問題。這些染色體能提供基因組組織和結構變異方面的信息，有助于解析進化歷史。為了能拼湊出這些染色體來，科學家們可以通過物理或者遺傳圖譜完成，但是對于許多物種而言，這種指
四種測序技術實現了胡椒染色體級別的組裝
胡椒為什么辣？胡椒堿含量的高低決定了胡椒的辛辣程度。10月16日，中國科學家宣布找到胡椒堿的來源，以及哪些基因對胡椒“辣”味機制至關重要。 《自然-通訊》雜志發表的這項最新成果由中國熱帶農業科學院香飲所聯合華中農業大學、馬來西亞科學院等7家單位完成。他們繪制了我國胡椒栽培種“熱引1號”染色體級
人類基因全測序完成！最后的Y染色體的組裝和分析完成
《自然》23日發表的兩篇論文公布了人類Y染色體的組裝和分析，Y染色體也是最后完成全測序的人類染色體。這項全球100多名科學家參與的研究填補了當前Y染色體參考的諸多空白，帶來了對不同人群演化和變異的見解。人類Y染色體由于結構復雜一直很難測序和組裝。超過一半的Y染色體在當前的人類參考基因組組裝中缺失，導
染色體的運動依賴紡錘體微管的組裝和去組裝
當細胞從間期進入有絲分裂期，間期細胞微管網絡解聚為游離的αβ-微管蛋白二聚體，再重組成紡錘體，介導染色體的運動；分裂末期紡錘體微管解聚，又重組形成細胞質微管網絡。 可分為：動粒微管：連接染色體動粒于兩極的微管。 極間微管：從兩極發出，在紡錘體中部赤道區相互交錯的微管。 星體微管：中心體周圍
Y染色體的測序工作
美國科學家完成了人類Y染色體的基因測序，發現這個一向被認為脆弱的性染色體，自我保護能力比人們想象的更強。 這一成果有助于增進人們對男性不育癥的了解，以及研究更好的診斷和治療方法。它還將重新激起有關性別的進化歷程的爭論。 Y染色體內部存在一種獨特的結構，使它在一定程度上能夠自我修復有害的基因變
概述x染色體的測序工作
2003年6月，美國的研究人員在Nature雜志上發表了已完成的對人類Y染色體的詳細分析。 2005年3月17日，在Nature雜志上發表的一篇文章宣告基本完成對人類X染色體的全面分析。對X染色體的詳細測序是在英國Wellcome Trust Sanger研究中心領導下，世界各地多所著名學院超
Y染色體的測序工作介紹
美國科學家完成了人類Y染色體的基因測序，發現這個一向被認為脆弱的性染色體，自我保護能力比人們想象的更強。 這一成果有助于增進人們對男性不育癥的了解，以及研究更好的診斷和治療方法。它還將重新激起有關性別的進化歷程的爭論。 Y染色體內部存在一種獨特的結構，使它在一定程度上能夠自我修復有害的基因變
X染色體的測序及研究
2003年6月，美國的研究人員在Nature雜志上發表了已完成的對人類Y染色體的詳細分析。2005年3月17日，在Nature雜志上發表的一篇文章宣告基本完成對人類X染色體的全面分析。對X染色體的詳細測序是在英國Wellcome Trust Sanger研究中心領導下，世界各地多所著名學院超過250
大麥6號染色體基因測序研究
2013年11月15日，成立于1875年的嘉士伯實驗室和華大基因旗下子公司――深圳華大科技服務有限公司（簡稱“華大科技”）宣布，雙方將聯合開展大麥6號染色體基因組破譯工作，旨在為培育大麥新品種提供具有價值的資源。 基因序列信息是開展快速及現代育種的核心，有助于挖掘有利遺傳突變，加速農作物育種改
單分子測序改善微生物基因組組裝
美國國家生物防衛分析和反制中心的研究人員近日在《Genome Biology》上發表文章，介紹了SMRT技術在微生物基因組組裝上的應用。他們認為，單分子測序數據能降低測序費用，并帶來更多完整的基因組，改善微生物基因組數據庫的質量。 隨著測序費用的不斷下降，測序項目的數量也在不斷上升。G
長讀長測序技術：拯救基因組組裝項目
隨著高精度長讀長測序技術的出現，基因組難以組裝的狀態正在改變。《Nature Methods》雜志上近日發表了一篇文章，介紹了基因組組裝項目如何受益于這種技術。 自測序技術問世以來，利用DNA序列的片段來組裝人類、動植物或微生物的基因組就一直是難題。許多參考基因組都存在缺陷，如組裝錯誤或存在缺
龍井茶樹染色體級別基因組組裝成功
? ?龍井43 ?? 中國農科院供圖 近日，《自然—通訊》在線發表了我國科學家在茶樹全基因組組裝和茶樹起源演化研究上取得的重要突破。該項研究由中國農業科學院茶葉研究所（以下簡稱茶葉所）和中國農業科學院深圳農業基因組研究所（以下簡稱基因組所）主導并攜手中國科學院昆明動物研究所（以下簡稱昆
三代基因測序組裝算法和軟件研發獲突破
DNA基因測序技術從上世紀70年代起，歷經三代技術后，目前已發展成為一項相對成熟的生物產業。測序技術的應用也擴展到了生物、醫學、制藥、健康、農林、園藝、花卉、環保、法醫等許多領域，并成為一項與我們衣食住行密切相關的高技術產業。據最新統計，2012年全球基因測序市場的產值已超過百億，按最近幾年增長
象腿蕉染色體級別基因組組裝研究獲進展
中國科學院華南植物園海外知名學者John Seymour Heslop Harrison教授領導的研究團隊，在象腿蕉染色體級別基因組組裝研究方面取得新進展。相關研究發表于Gigascience。王梓維為該文第一作者，John Seymour Heslop Harrison和劉青副研究員為通訊作者，華
象腿蕉染色體級別基因組組裝研究獲進展
象腿蕉（Ensete glaucum）是芭蕉科中耐寒的蕉類植物，原產于中國云南和東南亞地區，具有觀賞、飼用和藥用價值。中國科學院華南植物園教授John Seymour Heslop Harrison帶領的研究團隊，采用單分子納米孔、Illumina測序策略，結合染色體構像捕獲技術，發表了首個象腿蕉染
Nature：新研究詳細揭示染色體的自我重新組裝機制
在一項新的研究中，美國費城兒童醫院兒科血液學主任Gerd A. Blobel博士及其同事們發現了一種基本生物學過程---細胞核及其染色體物質在細胞分裂后如何自我重新組裝---的關鍵機制和結構細節。這些新的發現為人類健康和疾病提供了重要的新見解。相關研究結果近期發表在Nature期刊上，論文標題為
“六谷”豐登？——首個染色體水平基因組組裝完成
中國菰? ? 中國農科院供圖? ? ? ??中國菰 （Zizania latifolia） 原產于中國，屬于禾本科稻族菰屬，主要分布于中國、韓國、日本和印度等國家。中國菰的穎果為菰米，在我國古代是重要的“六谷”之一。? ? 近日，中國農業科學院煙草研究所煙草功能成分與綜合利用創新團隊與中國水稻研
染色體在細胞分裂后的自我重新組裝機制
在一項新的研究中，美國費城兒童醫院兒科血液學主任Gerd A. Blobel博士及其同事們發現了一種基本生物學過程---細胞核及其染色體物質在細胞分裂后如何自我重新組裝---的關鍵機制和結構細節。這些新的發現為人類健康和疾病提供了重要的新見解。相關研究結果近期發表在Nature期刊上，論文標題為
《自然—方法學》發表媲美基因組測序速度的組裝算法。
10年前，Illumina基因組測序技術進入市場時，前所未有的龐大數據量淘汰了較早開發的測序分析工具。 歷史總是重演。如今，第三代測序技術已經達到低成本群體測序規模的臨界點。 12月10日，《自然—方法學》在線發表了第一個能夠跟上基因組測序產生速度的組裝算法。 論文作者、中國農業科學院農業
海洋所首次完成仿刺參基因組測序和組裝
日前，我國科學家在國際上首次完成仿刺參基因組測序和組裝，對刺參生物學和遺傳育種研究具有重要科學意義，將對我國刺參產業發展產生重要推動作用。 該成果由中國科學院海洋研究所研究員楊紅生團隊和相建海團隊共同完成，在天津生物芯片技術公司的技術支撐下，突破了刺參復雜基因組測序和組裝技術瓶頸，采用新一代測
我國科學家完成大蒜基因組測序和組裝
近日，中國農業科學院麻類研究所南方蛋白飼料植物資源開發與利用團隊聯合有關高校和企業，歷時4年完成了大蒜基因組的測序和組裝工作。相關研究成果在線發表在《分子植物》上。 據課題組成員劉頭明研究員介紹，大蒜是重要的蔬菜作物之一，我國大蒜的年播種面積達到1000萬畝以上。大蒜具有膨大的鱗莖，富含大
中丹將聯合開展大麥染色體測序研究
丹麥嘉士伯實驗室和中國深圳華大基因科技服務有限公司(簡稱華大科技)11月15日宣布，雙方將聯合開展大麥6號染色體測序研究，旨在為培育大麥新品種提供有價值的資源。 基因組測序是當今世界快速育種科技的核心工作，有助于挖掘有利的遺傳突變，加速農作物育種改良。但大麥基因組非常復雜，測序工作挑戰不小
Y染色體完整測序或改善細菌DNA研究
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507607.shtm
揭示染色體在細胞分裂后的自我重新組裝機制
在一項新的研究中，美國費城兒童醫院兒科血液學主任Gerd A. Blobel博士及其同事們發現了一種基本生物學過程---細胞核及其染色體物質在細胞分裂后如何自我重新組裝---的關鍵機制和結構細節。這些新的發現為人類健康和疾病提供了重要的新見解。相關研究結果近期發表在Nature期刊上，論文標題為
首個豆科綠肥作物染色體水平基因組組裝完成
?紫云英? ? ? ?中國農科院供圖近日，中國農業科學院農業資源與農業區劃研究所肥料及施肥技術團隊完成了首個豆科綠肥作物——紫云英的染色體水平參考基因組組裝，并利用比較基因組學解析了紫云英共生結瘤的遺傳基礎。該研究填補了豆科綠肥作物基因組學研究的空白，為豆科植物與根瘤菌共生提供了新的見解。相關研究成
希望組自主三代組裝軟件NextDenovo最新版本全球學術開源
希望組面向全球釋放三代測序數據高效糾錯、組裝軟件NextDenovo最新版本V2.0-beta.1 （https://github.com/Nextomics/NextDenovo），并免費開放用于學術和其他非商業用途。據悉，本次希望組發布的最新版本NextDenovo是專為三代測序數據開發的糾
研究揭示海灣扇貝兩個亞種基因組測序和組裝
日前，青島農業大學在扇貝育種研究方面再次取得重要進展，海洋科學與工程學院教授王春德課題組與合作單位成功完成海灣扇貝北部亞種和南部亞種基因組測序和分析，相關研究成果在線發表于《自然》旗下開源期刊Scientific Data。 此前，王春德課題組已完成紫扇貝基因組測序和組裝，紫扇貝和海灣扇貝兩個
Y染色體完整測序揭開，有望破解遺傳、疾病難題
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507590.shtm 圖片來源：N.哈納切克/美國國家標準與技術研究院8月23日，兩篇發表在《自然》雜志的論文宣告：科學家組裝了人類Y染色體的第一個完整序列，補齊了人類基因組這部“生命天書”。多年
“六谷”之一菰米首個染色體水平基因組組裝完成
中國菰? ? 中國農科院供圖? ? ??? ? 中國菰 （Zizania latifolia） 原產于中國，屬于禾本科稻族菰屬，主要分布于中國、韓國、日本和印度等國家。中國菰的穎果為菰米，在我國古代是重要的“六谷”之一。? ? 近日，中國農業科學院煙草研究所煙草功能成分與綜合利用創新團隊與中國水
動物性染色體起源新假說，首個魚類Y染色體整圖譜出爐
2021年7月12日，福建省淡水水產研究所薛凌展團隊聯合福建師范大學、華中農業大學和維也納大學等單位，在Genome Biology 在線發表題為“ Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin o