科學家首次證實線粒體堿基編輯器的脫靶效應
脫靶檢測技術工作流程。中國農科院供圖 日前，中國農業科學院深圳農業基因組研究所左二偉團隊與國內其他科研單位合作，首次證實線粒體堿基編輯器（DdCBE）會導致核基因組嚴重的脫靶效應，因而醫學應用存在嚴重的安全風險。該研究對研發高效安全的線粒體堿基編輯器具有指導意義。相關研究成果在線發表在《細胞發現》（Cell Discovery）。 線粒體堿基編輯器是美國博德研究所2020年研發的一項基因編輯技術，它可直接針對雙鏈線粒體DNA，將C·G堿基對編輯為T·A堿基對。與作用于單鏈DNA的胞嘧啶堿基編輯器（CBE）不同，線粒體堿基編輯器可以在雙鏈DNA相應位點發生脫氨基作用，達到堿基編輯的目的。此前研究發現，胞嘧啶堿基編輯器會導致基因組范圍內完全隨機無法預測的脫靶效應，由此引起人們對線粒體堿基編輯器安全性的關注。 該研究利用脫靶檢測技術G......閱讀全文
科學家首次證實線粒體堿基編輯器的脫靶效應
?脫靶檢測技術工作流程。中國農科院供圖 日前，中國農業科學院深圳農業基因組研究所左二偉團隊與國內其他科研單位合作，首次證實線粒體堿基編輯器（DdCBE）會導致核基因組嚴重的脫靶效應，因而醫學應用存在嚴重的安全風險。該研究對研發高效安全的線粒體堿
科學家首次證實線粒體堿基編輯器的脫靶效應
?脫靶檢測技術工作流程。中國農科院供圖? ? 日前，中國農業科學院深圳農業基因組研究所左二偉團隊與國內其他科研單位合作，首次證實線粒體堿基編輯器（DdCBE）會導致核基因組嚴重的脫靶效應，因而醫學應用存在嚴重的安全風險。該研究對研發高效安全的線粒體堿基編輯器具有指導意義。相關研究成果在線發表在《
世界首次證實單堿基基因編輯存在脫靶效應
基因編輯技術越來越火，然而針對基因編輯工具最大的風險——脫靶效應，一直以來缺乏良好的檢測工具。記者從中科院神經科學研究所獲悉，其團隊與多家機構合作完成的研究，建立了一種在精度、廣度和準確性上遠超越之前的基因編輯脫靶檢測技術，這一技術首次證實：近年來興起的單堿基編輯技術有可能導致大量無法預測的脫靶
DNA堿基中產生靶向變化的堿基編輯器－誘導廣泛的脫靶
在一項新的研究中，來自美國麻省總醫院、哈佛醫學院和哈佛大學陳曾熙公共衛生學院的研究人員報道近期開發的幾種在單個DNA堿基中產生靶向變化的堿基編輯器能夠在RNA中誘導廣泛的脫靶效應。他們還描述了對堿基編輯器變體進行基因改造可顯著降低RNA編輯的發生率，這同時也會增加在靶DNA編輯的精確度。相關研究
DNA堿基編輯器或能誘導大量脫靶RNA突變！
DNA堿基編輯方法能夠直接在基因組DNA中進行點突變的校正，同時并不會產生任何雙鏈的斷裂（DSBs，double-strand breaks），但潛在的脫靶效應常常限制了這些方法的應用，腺相關病毒（AAV）是DNA編輯基因療法中最常用的傳遞系統，由于這些病毒能夠在體內持續維持基因表達的功能，因此
單堿基基因編輯研究進展速覽
本文中，小編整理了近年來科學家們在單堿基基因編輯研究領域取得的新進展，分享給大家！ 【1】Nat Commun：科學家首次在豬身上實現多位點單堿基編輯 doi：10.1038/s41467-019-10421-8 近日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院賴良學課題組利用單堿基編輯器首次在豬
中國科學家實現線粒體致病突變體內原位糾正
華東師范大學教授李大力、劉明耀團隊聯合臨港實驗室青年研究員陳亮團隊，開發出高性能線粒體腺嘌呤堿基編輯器（eTd-mtABEs），并利用eTd-mtABEs成功構建了感音神經性耳聾和Leigh綜合癥大鼠疾病模型。此外，團隊使用重新改造的DdCBE變體，首次實現線粒體致病突變的體內原位糾正，成功逆轉了l
遺傳發育所－個體水平發現單堿基編輯系統存在脫靶效應
人類遺傳疾病和農作物農藝性狀很多情況下是由基因組中的單個或少數核苷酸的突變引起的。因此，基因組中關鍵核苷酸變異的鑒定與定向修正是人類遺傳疾病治療及動植物育種的重要方向。基因組編輯工具單堿基編輯器的開發，為定向編輯和修正基因組中的關鍵核苷酸變異提供了重要工具，展現了其在遺傳疾病治療與動植物新品種培
單堿基基因編輯系統，基因治療又一利器
TaC9-ABE單堿基編輯技術原理。黃博純 供圖近日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員賴良學與五邑大學副教授鄒慶劍團隊合作首次將腺苷脫氨酶與轉錄激活因子樣效應子（TALE）融合，開發了一種不會產生Cas9依賴性脫靶的新型堿基編輯系統TaC9-ABE。相關研究3月24日在線發表于《細胞發現》（
基因編輯技術，最后一塊拼圖補齊
韓國基礎科學研究所（IBS）基因組工程中心研究人員開發了一種新的基因編輯平臺，稱為類轉錄激活因子效應相關脫氨酶（TALED）。TALED是能夠在線粒體中進行A到G堿基轉換的堿基編輯器。這一發現是長達數十年治愈人類遺傳疾病之旅的結晶，而TALED，也被認為是基因編輯技術中最后缺失的一塊拼圖。研究成果發
基因編輯技術，最后一塊拼圖補齊
韓國基礎科學研究所（IBS）基因組工程中心研究人員開發了一種新的基因編輯平臺，稱為類轉錄激活因子效應相關脫氨酶（TALED）。TALED是能夠在線粒體中進行A到G堿基轉換的堿基編輯器。這一發現是長達數十年治愈人類遺傳疾病之旅的結晶，而TALED，也被認為是基因編輯技術中最后缺失的一塊拼圖
證實CRISPR/Cpf1基因組編輯幾乎沒有脫靶效應
作為CRISPR基因組編輯的新工具，Cpf1因其不同于Cas9的性質而引起人們的廣泛關注。它只需要單個RNA，即crRNA（CRISPR RNA），因而組裝更加簡單；它的交錯切割模式可能促進利用所需的序列替換現有的DNA序列；它識別富含胸腺嘧啶的DNA序列，而且相對于Cas9識別的富含鳥嘌呤的序
楊輝組/高彩霞組發現單堿基編輯系統存在嚴重脫靶效應
2016年，David Liu團隊在 Nature 期刊上首次報道了基于胞嘧啶脫氨酶APOBEC1（能催化C脫氨基變成U，而U在DNA復制過程中會被識別成T）和尿嘧啶糖基化酶抑制劑UGI（能防止尿嘧啶糖基化酶將U糖基化引起堿基切除修復）的單堿基編輯工具（BE3）首次實現可以在不引入DNA雙鏈斷裂
上海科技大學等團隊構建新型高精準堿基編輯系統
上海科技大學生命科學與技術學院教授陳佳、免疫化學研究所教授楊貝，中科院上海營養與健康研究所研究員楊力與武漢大學醫學研究院教授殷昊合作研究構建了一種高精準堿基編輯系統，并依據其特性命名為變形式堿基編輯系統（簡稱tBEs）。5月10日，該研究成果在線發表于《自然—細胞生物學》。 據悉，研究人員利
Nature子刊：畢昌昊/張學禮團隊開發基于糖基化酶的新型堿基編輯器
中國科學院天津工業生物技術研究所畢昌昊團隊和張學禮團隊合作，在 Nature Biotechnology 期刊發表了題為：Glycosylase-based base editors for efficient T-to-G and C-to-G editing in mammalian cel
Cell重磅：新型基因編輯工具誕生，吹散最后一片烏云
近日，韓國大田的基礎科學研究所（ Institute for Basic Science，IBS）基因組工程中心的研究團隊開發了一種可編程工具，并在Cell發表了“Targeted A-to-G base editing in human mitochondrial DNA with progr
新型腺嘌呤堿基編輯器可讓細胞RNA編輯最小化
在一項新的研究中，來自美國布羅德研究所和哈佛大學的研究人員發現有證據表明使用堿基編輯器會導致細胞中出現意想不到的RNA編輯。相關研究結果發表在2019年5月8日的Science Advances期刊上，論文標題為“Analysis and minimization of cellular RNA
本周Science期刊發布－檢測CRISPR脫靶效應新方法DISCOVERSeq
本周又有一期新的Science期刊（2019年4月19日）發布，它有哪些精彩研究呢？讓小編一一道來。圖片來自Science期刊。 1.Science：開發出一種檢測CRISPR脫靶效應的新方法---DISCOVER-Seq doi:10.1126/science.aav9023； doi:1
科學家提出基因編輯領域發展新方向
4月18日，中國科學院上海營養與健康研究所研究員楊力與上海科技大學生命技術學院教授陳佳、上海科技大學免疫化學研究所副研究員楊貝，應邀在國際學術期刊《自然-生物技術》（Nat Biotechnol）上發表題為To BE or not to BE, that is the question 的新聞與
Nature子刊|堿基編輯器新拓展
作為Cas9核酸酶的進化祖先，IscB蛋白作為緊湊RNA引導的DNA內切酶和缺口酶，使其成為堿基編輯的強有力候選者。然而，目標范圍狹窄限制了IscB系統的應用;因此，有必要找到更多識別不同靶鄰基序(TAMs)的IscB。2024年8月15日，輝大基因張海南、李彤、復旦大學黃錦海、中科院腦科學與智能技
設計基因編輯工具的AI大模型問世
記者27日從中國農業科學院獲悉，該院農業基因組研究所農業基因編輯技術研發與應用創新團隊構建了全球規模最大的實驗驗證數據集，并基于此開發出人工智能（AI）大模型AlphaCD。該模型不僅能高效預測超過2萬余種胞嘧啶脫氨酶的酶活特征，還能設計出新型高性能堿基編輯工具。相關成果日前發表于國際期刊《細胞
多樣化C－to－T植物堿基編輯器被開發
近日，電子科技大學張勇教授、馬里蘭大學YiPing Qi博士、揚州大學張韜教授課題組合作于《Plant Biotechnology Journal》發表了題名《Improved plant cytosine base editors with high editing activity, pur
基因編輯大牛Nature子刊發文：CRISPR單堿基編輯準確！
來自韓國基礎科學研究所IBS的研究人員發表了題為“Genome-wide target specificities of CRISPR RNA-guided programmable deaminases”的文章，證實了最近研發的基因編輯方法的準確性。這一研究成果公布在4月10日的Nature
廣州生物院開發出新型雙堿基編輯器
近日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院賴良學課題組在新型堿基編輯器開發方面取得重要進展，獲得了可同時兼具當前多種單堿基編輯器及CRISPR/Cas9基因編輯功能的多功能堿基編輯器，可廣泛地誘導產生多種模式的突變，對于飽和突變文庫構建、基因突變功能研究等方面具有促進作用。相關研究成果以AGBE: a
新型“堿基編輯器”有助治療遺傳疾病
一個美國團隊２５日在英國《自然》雜志發表報告說，它在基因編輯技術方面取得新進展，可通過一種新型“堿基編輯器”在基因中替換堿基，有助科學家增強對遺傳疾病的理解和開發新療法。 基因是脫氧核糖核酸（ＤＮＡ）上的片段，而ＤＮＡ雙鏈螺旋結構由４種化學堿基組成，即腺嘌呤（Ａ）、鳥嘌呤（Ｇ）、胞嘧啶（Ｃ）和
新進展！構建新型雙堿基編輯器
堿基編輯器是基于CRISPR/Cas9發展的新一代基因組編輯技術，可誘導單個堿基的突變，而鮮有關于特異性介導A-to-G和C-to-G雙突變的堿基編輯工具的研究。此外，關于堿基編輯系統與染色質環境之間的聯系也少見報道。 近日，中國科學院天津工業生物技術研究所研究員畢昌昊帶領的合成生物學技術研究
遺傳發育所利用環狀RNA開發出基于Cas12a的引導編輯器
基于CRISPR-Cas9的引導編輯器（prime editors，PEs）可同時實現任意堿基類型的精準替換，以及小片段的精準插入、替換和刪除。目前，幾乎所有的引導編輯器均是依賴于Cas9蛋白開發而成，但Cas9蛋白存在尺寸較大、脫靶效應高和受限于G/C-rich區域編輯的缺點，限制了引導編輯器
基因測序技術升級檢測CRISPR脫靶效應
政府主導致效率低 2014年末，習近平總書記前往鎮江視察時發表過如下言論：“一些大醫院始終處于‘戰時狀態’的狀況需要改觀。”新醫改啟動至今已是第七年，但因患者在大醫院高度擁堵造成的看病難、看病貴卻絲毫不見緩解，反而有所加劇，習總書記所指出的，正是這一輪醫療衛生體制改革最亟需解決的問題。 相關
恢復動物部分視力——病毒運送傳遞先導編輯器
先導編輯是一種通用的基因編輯形式，可糾正大多數已知的致病基因突變。美國麻省理工學院與哈佛大學布羅德研究所的科學家設計了類似病毒的顆粒，以足夠高的效率將先導編輯器傳遞給小鼠細胞，以治療遺傳疾病。該研究成果8日發表在《自然·生物技術》雜志上。團隊采用了他們之前設計的工程病毒樣顆粒（eVLP），以攜帶堿基
新一代堿基編輯技術開發方面取得重大突破
堿基編輯（BE）作為一種前沿的基因組編輯技術，能夠在基因組水平上實現精確、高效的單堿基編輯。常用的DNA堿基編輯器主要是通過將可編程的DNA結合蛋白（如Cas9）與堿基脫氨酶融合實現的。然而，這些堿基編輯器主要針對C和A堿基的直接編輯，并且它們所包含的脫氨酶可能導致非Cas9依賴的DNA或RNA