中國科學家主導完成梨基因組研究
由南京農業大學梨工程技術研究中心、深圳華大基因研究院、浙江省農業科學院等多家科研院所合作完成的碭山酥梨基因組研究成果于 2012年11月13日在《基因組研究》(Genome Research)上發表。全球首個梨基因組的成功解析及其基因組層面的功能研究將為培育高產、優質和抗病的新品種梨奠定堅實的遺傳學基礎，同時也為該物種的基礎生物學研究提供寶貴的資源。 中國是梨屬植物的中心發源地之一，也是全球第一產梨大國，年產量約占世界總產量的60%以上。梨在我國分布非常廣泛，遍布大江南北，種植面積僅次于蘋果和柑橘，而且成為眾多梨產區國民經濟收入的重要支柱。但多年來梨的分子層面的研究相對滯后，從而限制了其功能基因的挖掘以及分子育種技術的發展，成為桎梏梨產業發展的瓶頸之一。 具有500多年培育歷史的碭山酥梨(Pyrus bretschneideri)是目前中國、也是全球栽培面積最大的品種。在這項研究中，研究人員對碭山酥梨......閱讀全文
《PLoS生物學》：老鼠全基因組測序圖公布
最新一期的開放存取的《公共科學圖書館·生物學》(PLoS Biology)雜志上，美國、英國和瑞典的研究人員公布了老鼠的全基因組測序圖。老鼠成為繼人類之后第二個完成全基因組測序的哺乳動物。 在對人類和老鼠的基因測序圖進行綜合性比較后，研究人員發現兩者之間的遺傳差異要比人們預想的大得多。老鼠
我科學家主導完成全球首個梨基因組解析
由南京農業大學梨工程技術研究中心、深圳華大基因研究院、浙江省農業科學院等多家科研院所合作完成的碭山酥梨基因組研究成果于 11月 13日在《基因組研究》(Genome Research)上發表。全球首個梨基因組的成功解析及其基因組層面的功能研究將為培育高產、優質和抗病的新品種梨奠定堅實的遺
中國科學家主導完成梨基因組研究
由南京農業大學梨工程技術研究中心、深圳華大基因研究院、浙江省農業科學院等多家科研院所合作完成的碭山酥梨基因組研究成果于 2012年11月13日在《基因組研究》(Genome Research)上發表。全球首個梨基因組的成功解析及其基因組層面的功能研究將為培育高產、優質和抗病的新品種梨奠定
科學家主導完成梨基因組研究，為新品種培育提供寶貴資源
由南京農業大學梨工程技術研究中心、深圳華大基因研究院、浙江省農業科學院等多家科研院所合作完成的碭山酥梨基因組研究成果于2012年 11月13日在《基因組研究》(Genome Research)上發表。全球首個梨基因組的成功解析及其基因組層面的功能研究將為培育高產、優質和抗病的新品種梨奠定
研究人員發布全基因組單核苷酸變異數據庫
10月22日，國際學術期刊Genome Biology 以PGG.SNV： understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse popul
OPGEN全基因組圖譜應用系列——鞭蟲全基因組測序
鞭蟲是一種常見的土壤傳播寄生蟲，地理分布廣，感染率高，寄生于人體盲腸，導致人體慢性感染，對人類危害巨大。鞭蟲的全基因組測序研究由著名的桑格研究院（Wellcome Trust Sanger Institute）完成，發表在世界頂級期刊《Nature Genetics》上。該研究通過對2種不同
全基因組測序的竹亞科及生物學性狀的比較基因組學研究
禾本科（禾草）是被子植物最大科之一，約有12000種，是水稻、小麥、玉米等人類糧食和牲畜飼料的主要來源，也為人類提供了加工淀粉、制糖、釀酒、造紙、編織和建筑等方面的重要原料。同時，禾本科又是植物遺傳學和基因組學研究的模式類群。竹亞科（竹子）是禾本科的12個亞科之一，與早熟禾亞科、稻亞科組成BOP
人類全基因組測序計劃
全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。 1986年， Renato Dulbecco是Z早提出人類基因組測序的科學家之一。他認為如果能夠知道所有人類基因的序列，對癌癥的研究將會很有幫助。美國能源部（DOE）與美國國家衛生研究院（NIH），分別在1986年與1987年加入人類基
虎尾海馬全基因組破譯
中科院南海海洋研究所、德國康斯坦茨大學、華大基因和新加坡A*STAR研究院聯合破譯了虎尾海馬的全基因組。有關研究成果日前以封面文章的形式發表在《自然》雜志上。 海馬隸屬于海龍科。與其他硬骨魚不同，海馬呈現高度特殊的形態，例如頭部前方具有管狀長嘴，無腹鰭和尾鰭，尾端卷曲，全身覆蓋硬骨骼，沒有鱗片
全基因組擴增技術介紹
研究人員通常會在下游分析中遭遇DNA樣本量有限或不足的問題。QIAGEN的全基因組擴增技術通過以包括單細胞在內的小量樣本或珍貴樣本擴增獲得基因組DNA，解決此類難題。REPLI-g?Kit能夠準確地復制原始DNA樣本，不會造成偏差，擴增后的DNA可以直接應用于廣泛的遺傳學分析。什么是全基因組擴增(w
研究人員繪出蘋果基因組草圖
一個國際科研小組8月29日在英國《自然—遺傳學》（Nature Genetics）雜志上報告說，他們繪出了蘋果的基因組草圖，這將有助于從基因水平上分析蘋果性狀，培育更多蘋果新品種。 意大利、美國、新西蘭等國研究人員報告說，他們繪出的是廣受人們喜愛的“金冠蘋果”的基因組草圖。結果
全基因組的比較基因組雜交技術介紹
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
全基因組重測序技術揭示綿羊尾脂形成的分子生物學機制
近日，中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所肉羊遺傳育種科技創新團隊揭示了中國地方綿羊品種在適應性馴化過程中，如何通過基因組層面的選擇和重組來影響綿羊尾型的遺傳進化機制。相關研究成果已發表在《BMC Genomics》上。圖片來源于網絡 綿羊的尾型是一個重要的經濟性狀，可以為綿羊提供能量抵御惡劣環境
多國實施全基因組分析計劃
由于基因測序可以探查與特定疾病相關的基因，該療法正在成為日益受歡迎的診斷方法。 英國計劃到2017年對10萬人進行基因組測序。 美國加州一對龍鳳胎出生后，他們的父母非常憂慮：兩個嬰兒不僅發育緩慢，而且肌肉松軟無力。大腦掃描結果顯示，男嬰或存在大腦性麻痹；然而醫生對造成女嬰震顫和癲癇的原因卻不
全基因組測序各步驟工具
全基因組測序（WGS）是下一代測序技術，用于快速，低成本地確定生物體的完整基因組序列。基因組的深度測序對于臨床研究的意義重大，解讀WGS數據并了解基因組突變在健康和疾病中的重要性是精準醫療的基石。WGS分析流程能分為三大塊，數據處理、檢測變異和綜合分析，具體如下圖所示：由于WGS現在已經非常成熟了，
全血基因組提取操作步驟
操作步驟（（２００ul全血））* 第一次使用前請先在15ml漂洗液WB中加入60ml無水乙醇! 1. 取200ul新鮮、冷凍或加入各種抗凝劑的血液，放入1.5ml離心管。對如果全血起始量小于200μl，則用緩沖液BB補足到200μl。如果起始量介于200μl-300μl之間，則后續操作需要按照比例增
昆蟲全基因組DNA的提取
實驗概要利用改進的CTAB 法提取昆蟲全基因組DNA。主要試劑1. 蛋白酶K[美國Merck公司]2. 三羥甲基氨基甲烷(Tris)[美國Amresco公司]3. Taq DNA聚合酶及dNTP[NEB公司]4. 瓊脂糖及溴化乙錠(EB)[美國Amresco公司生產]5. 乙二胺四乙酸鈉(Na2ED
全基因組研究解碼口吃根源
口吃跨越不同語言和血統，影響著全球約7000萬人。過去，許多人認為口吃能夠通過自主控制來改善。但數十年來的研究表明，口吃實際上是一種高度遺傳的不可控疾病，其原因復雜且模糊。而一項7月28日發表于《自然-遺傳學》上的研究讓口吃的部分原因變得清晰。 研究人員利用基因檢測服務公司23andMe的龐大
全基因組測序的診斷價值
根據《Nature Genetics》上發表的一項新成果，全基因組測序有望用于臨床上的遺傳病診斷。這項研究評估了影響全基因組測序在臨床診斷中取得成功的因素。 這個國際研究小組由英國的研究人員領導，對156個病例或家庭開展了臨床基因組測序。這些病例有著遺傳疾病的特征，但無法通過之前的篩查檢測來解
Science里程碑成果：譜寫真菌基因組百科全書
由包括美國能源部聯合基因組研究所(DOE JGI)在內的20多家機構的研究人員組成的一個國際研究小組近日完成了對數十種真菌(fungi)完整基因組比較的綜合性研究，從而譜寫出了真菌基因組百科全書第一章。相關論文發布在最新一期(6月29日)的《科學》(Science)雜志上。 研究數據表
木質素代謝與黃酮類物質聯系結合構樹基因組
一、木質素（Lignin）是一類復雜的有機聚合物，其在維管植物和一些藻類的支持組織中形成重要的結構材料。木質素在細胞壁的形成中是特別重要的，特別是在木材和樹皮中，因為它們賦予剛性并且不容易腐爛。 木質素作為自然界中含量僅次于纖維素的第二豐富次生代謝物質，對于植物體有重要的生物學功能。由于自然界
木質素代謝與黃酮類物質聯系結合構樹基因組
一、木質素（Lignin）是一類復雜的有機聚合物，其在維管植物和一些藻類的支持組織中形成重要的結構材料。木質素在細胞壁的形成中是特別重要的，特別是在木材和樹皮中，因為它們賦予剛性并且不容易腐爛。 木質素作為自然界中含量僅次于纖維素的第二豐富次生代謝物質，對于植物體有重要的生物學功能。由于自然界
癌癥研究人員聯手匯集腫瘤基因組數據
研究人員希望，數據分享將為利用諸如這些腦部腺癌細胞等腫瘤的基因組信息帶來更好的方法。 這是為大型癌癥研究中心的很多病人提供的最新希望：“讓我們測序你的腫瘤，或許我們能將其同擊敗這種惡性疾病的藥物匹配。”不過，現實是基因組分析仍然僅為癌癥病人提供了一小部分幫助。“我們多半時候不知道如何處理這些
研究人員實現全腦區PET/MR高清成像
腦科學作為生命科學領域的重要前沿分支，代表著人類認知的極限挑戰，其復雜性構成了科學研究中的一項重大難題。特別是在如阿爾茨海默病、抑郁癥、自閉癥、帕金森病等神經退行性疾病和精神疾病領域，腦科學研究對于理解其神經生物學基礎至關重要。因此，期望能加快推進腦疾病的早期診斷和干預治療。一體化PET/MR（醫學
中國種茶樹全基因組密碼破解
記者從安徽農業大學獲悉，該校茶樹生物學與資源利用國家重點實驗室宛曉春教授研究團隊，聯合深圳華大基因等單位，破解了世界上分布最廣的中國種茶樹的全基因組信息，成果日前在線發表于《美國科學院院刊》上。 世界主栽茶樹分屬兩個變種：即中國種和阿薩姆種，前者葉小，分布廣泛，適制綠茶等六大茶類；后者葉大，主
小須鯨全基因組圖譜獲破譯
11月25日，韓國海洋科學技術研究所、深圳華大基因研究院等宣布成功破譯了小須鯨全基因組圖譜，并對鯨類獨特生理習性的遺傳學機制進行了分析。相關成果在線發表于《自然—遺傳學》雜志。 人們一直癡迷于海洋生物是如何演化為陸生生物的。鯨類的進化卻反其道而行之，由陸生向水生演化，和陸生偶蹄動物如牛、豬等
研究發現全新全基因組組裝方法
十年前，Illumina基因組測序技術進入市場時，前所未有的龐大數據量淘汰了較早開發的測序分析工具。 歷史總是重演。如今，第三代測序技術已經達到低成本群體測序規模的臨界點。 英國時間12月9日，《自然—方法學》在線發表了第一個能夠跟上基因組測序產生速度的組裝算法。 這篇論文只有兩位作者，
我國率先完成菊花全基因組測序
中國中醫科學院中藥研究所和安利植物研發中心對外發布消息稱，由他們共同發起的科研團隊，在菊花全基因組計劃獲重大進展的同時，還完成了重要的藥用菊花品種——杭白菊的全長轉錄組遺傳信息發掘。此舉使我國成為世界上首次完成菊屬植物菊花全基因組測序的國家。 據了解，菊屬植物染色體結構復雜，包含從2n=18到
中國樹鼩全基因組解析完成
中科院昆明動物研究所張云研究員課題組與深圳華大基因研究院合作，解析了新型實驗動物中國樹鼩的全基因組，系統評估了樹鼩作為藥物研發實驗動物的特征和優勢。研究近日發表于《公共科學圖書館·綜合》。 研究不僅為中國樹鼩用于新藥研發的藥效學、藥理學和毒理學評價提供了系統的基礎信息數據和科學依據，而且揭示了
“863”腫瘤全基因組研究獲進展
7月14日，“十一五”國家“863”重大專項“食管癌全基因組關聯分析和藥物基因組學研究”和“肺癌全基因組關聯分析和藥物基因組學研究”成果匯報會在京召開。 日前，遺傳學權威期刊《自然—遺傳學》刊登了我國科學家食道癌和肺癌研究的重要進展。由中國醫學科學院腫瘤研究所分子腫瘤學國家重點實驗室教授林東昕