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  • 表觀基因組學研究指南(一)

    今年九月,對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份,因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在Nature,Genome Biology,Genome Research等雜志上公布了三十多份論文,還有在Science,Cell,以及the Journal of Biological Chemist上的一些功能性介紹論文。這一項目的研究人員對147細胞系進行了將近1,650次實驗,分子轉錄,轉錄因子結合,染色體拓撲結構,組蛋白修飾,DNA甲基化等多方面內容。 包含這些種種功能元件的就是表觀遺傳學,近年來科學家們越來越意識到這些元件特征在發育和疾病中的重要性,因此早在2008年,也就是NHGRI啟動ENCODE計劃的五年后,NIH又開始了第二項大規模圖譜繪制工程:表觀基因組學路線圖項目(Roadmap Epigenomics Program),這一項目整理了61個“完整”的表觀基因組,......閱讀全文

    胚胎干細胞轉錄因子NANOG的新發現

      在胚胎干細胞的自我更新中,轉錄因子Nanog 具有關鍵性的作用,這一因子也一直是近年來研究的熱點。最近,西班牙國家癌癥研究中心(CNIO)的科學家們發現,NANOG也調控成體生物分層上皮細胞的細胞分裂,分層上皮細胞是皮膚表皮的組成部分,或者覆蓋在食管和陰道表面。相關研究結果發表在最近的《自然通訊

    CCAAT轉錄因子

    中文名稱CCAAT轉錄因子英文名稱CCAAT transcription factor定  義可與啟動子中的CCAAT元件發生特異性相互作用的轉錄因子。應用學科細胞生物學(一級學科),細胞遺傳(二級學科)

    轉錄因子組成

    真核生物在轉錄時往往需要多種蛋白質因子的協助。一種蛋白質是不是轉錄結構的一部分往往是通過體外系統看它是否是轉錄起始所需要的。一般這些促成轉錄起始所需的轉錄結構包括三個重要的組成部分:亞基RNA聚合酶的亞基,它們是轉錄必須的,但并不對某一啟動子有特異性。復合物某些轉錄因子能與RNA聚合酶結合形成起始復

    輔助轉錄因子

    中文名稱輔助轉錄因子英文名稱ancillary transcription factor定  義協助RNA聚合酶同啟動子結合,并促進已結合的RNA聚合酶啟動轉錄速率的轉錄因子。應用學科細胞生物學(一級學科),細胞遺傳(二級學科)

    關于基因轉錄的轉錄因子介紹

      轉錄因子(transcription factor)是起調控作用的反式作用因子。轉錄因子是轉錄起始過程中RNA聚合酶所需的輔助因子。真核生物基因在無轉錄因子時處于不表達狀態,RNA聚合酶自身無法啟動基因轉錄,只有當轉錄因子(蛋白質)結合在其識別的DNA序列上后,基因才開始表達。轉錄因子的結合位點

    Nat-Commun:揭秘轉錄因子“勘察”細胞基因組的分子機制

      轉錄因子(TFs)是一種能調節基因表達的特殊蛋白,其能在完整的基因組中搜索并結合特殊區域來調節基因的表達;我們都知道,轉錄因子不僅能結合特殊的DNA序列,還能非特異性結合任何DNA鏈。這些非特異性的關聯就能夠明顯增加轉錄因子尋找特殊靶點的能力,然而目前研究人員并不清楚在掃描大量基因組、定位以及結

    轉錄因子活性ELISA

    轉錄因子活性ELISA是建立在ELISA基礎上的高靈敏度的檢測方法,比EMSA的靈敏度高l0倍,在5h內就能完成。不涉及放射性和凝膠電泳,安全簡便,而且這種微孔板的形式能同時檢測1—96個樣品。ArrayStarTM轉錄因子活性ELISA試劑盒可以快速、靈敏地檢測細胞核提取物中轉錄因子的DNA結合活

    轉錄因子和轉錄因子之間可以有相互作用嗎

    可以轉錄因子真核生物轉錄起始十分復雜,往往需要多種蛋白因子的協助,轉錄因子與RNA聚合酶Ⅱ形成轉錄起始復合體,共同參與轉錄起始的過程。根據轉錄因子的作用特點可分為二類;第一類為普遍轉錄因子,它們與RNA聚合酶Ⅱ共同組成轉錄起始復合體時,轉錄才能在正確的位置開始。除TFⅡD以外,還發現TFⅡA,TFⅡ

    轉錄因子的轉錄調控區的介紹

      同一家族的轉錄因子之間的區別主要在轉錄調控區。  轉錄調控區包括轉錄激活區(transcription activation domain)和轉錄抑制區(transcription repression domain)二種。近年來,轉錄的激活區被深入研究。它們一般包含DNA結合區之外的30-10

    利用人工組合轉錄因子對人類基因組掃描

    Scanning the human genome with combinatorial transcription factor librariesPublished online: 18 February 2003, doi:10.1038/nbt794March 2003 Volume 21

    多名學者推薦全基因組分析轉錄因子功能新技術

      來自北卡羅來納大學教堂山分校,NIH等處的研究人員利用一種新型方法,分析了酵母轉錄因子Rap1在整個基因組中的結合動態,從而可以更好研究這一轉錄因子的功能,這一方法將有助于科學家們實時分析轉錄情況,相關成果公布在Nature雜志上。   對于這一成果,來自法國國家科學研究中心的Fran?ois

    關于轉錄因子的轉錄抑制區的介紹

      也是轉錄因子調控表達的重要位點,但是對其作用機理研究尚不深入。可能的作用方式有三種:1)與啟動子的調控位點結合,阻止其它轉錄因子的結合;2)作用于其它轉錄因子,抑制其它因子的作用;3)通過改變DNA的高級結構阻止轉錄的發生。  轉錄因子必須在核內作用,才能起到調控表達的目的。因此,轉錄因子上的核

    依賴ρ因子的轉錄終止

    ρ因子是一種分子量為46kDa的蛋白質,以六聚體為活性形式。

    轉錄終止因子的定義

    中文名稱轉錄終止因子英文名稱transcription termination factor定  義輔助具有RNA聚合酶活性的轉錄復合體特異性地識別轉錄終止信號的蛋白質因子(如ρ因子等),其作用導致轉錄終止。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控(二級學科)

    簡述轉錄因子的作用

      是通過和順式因子的互作來實現的。這段序列可以和轉錄因子的DNA結合域實現共價結合,從而對基因的表達起抑制或增強的作用。  目前,人工轉錄因子(Artificial Transcription Factor,ATF)的構建已用于轉錄因子的生物學功能研究中起到重要作用。ATF是指將不同的DNA結合結

    概述轉錄因子的組成

      真核生物在轉錄時往往需要多種蛋白質因子的協助。一種蛋白質是不是轉錄結構的一部分往往是通過體外系統看它是否是轉錄起始所需要的。一般這些促成轉錄起始所需的轉錄結構包括三個重要的組成部分:  1、亞基  RNA聚合酶的亞基,它們是轉錄必須的,但并不對某一啟動子有特異性。  2、復合物  某些轉錄因子能

    通用轉錄因子的定義

    通用轉錄因子(general transcription factors, GTFs) 。真核生物中有效的和啟動子特異性的起始過程中需要幾個起始因子,這些起始因子稱為通用轉錄因子

    通用轉錄因子的定義

    通用轉錄因子(general transcription factors, GTFs)?? 。真核生物中有效的和啟動子特異性的起始過程中需要幾個起始因子,這些起始因子稱為通用轉錄因子。

    利用人工組合轉錄因子對人類基因組掃描2

    Figure 5: Regulation of?CDH5?by TFZFs in several human cancer cell lines.Blue, cells infected with a pMX construct containing the DNA binding domain o

    北京基因組所轉錄因子TALE和DNA相互作用研究獲進展

      近日,中國科學院北京基因組研究所基因組科學與信息重點實驗室雷紅星研究組,在其開展的轉錄因子TALE(transcription activator-like effector)和DNA相互作用研究方面取得階段性進展,該研究對TALE蛋白的構象可塑性以及特異性識別DNA的機制進行了深入的計

    基因轉錄因子的相關介紹

      轉錄因子(transcription factor)是起調控作用的反式作用因子。轉錄因子是轉錄起始過程中RNA聚合酶所需的輔助因子。真核生物基因在無轉錄因子時處于不表達狀態,RNA聚合酶自身無法啟動基因轉錄,只有當轉錄因子(蛋白質)結合在其識別的DNA序列上后,基因才開始表達。轉錄因子的結合位點

    轉錄終止因子的概念介紹

    中文名稱轉錄終止因子英文名稱transcription termination factor定  義輔助具有RNA聚合酶活性的轉錄復合體特異性地識別轉錄終止信號的蛋白質因子(如ρ因子等),其作用導致轉錄終止。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控(二級學科)

    通用轉錄因子的相關介紹

      在真核生物中有效的和啟動子特異性的起始需要幾個起始因子,這些起始因子稱為通用轉錄因子。通用轉錄因子共同執行

    轉錄激活因子的定義

    定義1:一個轉錄因子家族,通過識別和結合環腺苷酸應答元件而激活基因表達。環腺苷酸應答元件存在于很多病毒和細胞的基因啟動子中。 所屬學科:生物化學與分子生物學(一級學科);基因表達與調控(二級學科)定義2:與特定DNA序列結合以促進基因轉錄的因子。 所屬學科:遺傳學(一級學科);分子遺傳學(二級學科)

    轉錄起始因子的定義

    中文名稱轉錄起始因子英文名稱transcription initiation factor定 ?義參與轉錄起始作用的因子。應用學科遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)

    轉錄激活因子的定義

    定義1:一個轉錄因子家族,通過識別和結合環腺苷酸應答元件而激活基因表達。環腺苷酸應答元件存在于很多病毒和細胞的基因啟動子中。 所屬學科:生物化學與分子生物學(一級學科);基因表達與調控(二級學科)定義2:與特定DNA序列結合以促進基因轉錄的因子。 所屬學科:遺傳學(一級學科);分子遺傳學(二級學科)

    PNAS:“打了就跑”的轉錄因子

      細胞核中的調控蛋白,在活化基因時采取了一種“打了就跑”(hit-and-run)的策略。美國國家科學院院刊PNAS雜志上發表的一項最新研究,深入解析了這種高效的轉錄模式。  “就像馬克吐溫筆下闖了禍就跑的湯姆·索亞一樣,轉錄因子結合啟動子并激活轉錄之后就會立即離開,讓小伙伴們去繼續自己未完成的工

    胚胎干細胞發育研究取得新進展

      清華大學陳燁光研究組和中科院遺傳與發育研究所韓敬東研究組合作在胚胎干細胞發育研究方面取得新的進展,相關成果文章“Genome-wide mapping of SMAD target genes reveals the role of BMP signaling in embryonic stem

    玉米轉錄因子和籽粒重要轉錄因子互作協同調控醇溶蛋白

    玉米(Zea mays)原產于墨西哥和中美洲地區,是一種由古印第安人(Indians)在數千年前利用野生墨西哥類蜀黍(Euchlaenamexicana)(現存在于墨西哥和尼加拉瓜)雜交而來的品種。但是,作為一類重要的糧食作物,天然玉米籽粒在其營養價值上卻有著重要的缺陷。根據已有的文獻報道,玉米籽粒

    玉米轉錄因子ZmMADS47和籽粒轉錄因子Opaque2-調控醇溶蛋白

      玉米(Zea mays)原產于墨西哥和中美洲地區,是一種由古印第安人(Indians)在數千年前利用野生墨西哥類蜀黍(Euchlaenamexicana)(現存在于墨西哥和尼加拉瓜)雜交而來的品種。但是,作為一類重要的糧食作物,天然玉米籽粒在其營養價值上卻有著重要的缺陷。根據已有

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