關于新建自動化生物樣本庫的流程思考(四)
四、 明確配套要求 正如開篇我們提到的,樣本庫系統化建設會牽一發而動全身,所以我們在確定了核心產品方案之后需要審視配套要素,以使得之后發生的裝機、使用流程較為順暢。核心產品必須能夠運入目標場地并順利裝機,這就產生了基建對接要求;核心產品的正常使用會同時涉及到凍存耗材和樣本信息管理軟件的使用,這就產生了耗材和軟件的對接要求,這一點對自動化產品尤為重要。a. 基建要求基建與裝修考慮的出發點主要包含以下幾點:通過性(所有必經的通道、電梯、房間門的寬度與高度)、安裝可行性(層高、面積、承重、強弱電、通風與氧氣濃度監控、空調、上下水等)、使用便利性(樓層、場地周邊是否適合建設液氮貯槽、是否方便液氮槽車運輸等)。成熟的供應商會針對每一款設備提供完整的基建需求方案,也可要求供應商進行現場勘測。b. 耗材要求自動化的耗材包容性低于人工,所以耗材的標準化是自動化應用的前提。選擇自動化適配的耗材一般建議考慮以下內容:可批量識別(使用帶有底......閱讀全文
關于新建自動化生物樣本庫的流程思考(四)
四、 明確配套要求?正如開篇我們提到的,樣本庫系統化建設會牽一發而動全身,所以我們在確定了核心產品方案之后需要審視配套要素,以使得之后發生的裝機、使用流程較為順暢。核心產品必須能夠運入目標場地并順利裝機,這就產生了基建對接要求;核心產品的正常使用會同時涉及到凍存耗材和樣本信息管理軟件的使用,這就產生
關于新建自動化生物樣本庫的流程思考(二)
c. 規模及溫區目標規模和溫區選擇同樣是需要定義的核心目標。規模的決策邏輯主要考慮以下幾點:年度樣本提供者的數量預期、涉及樣本的種類、單個樣本可用于下游檢測的最小體積、每種樣本的復份數量、規劃使用年限等;溫區的選擇則具有相對更加復雜的決策邏輯:需要綜合考量下游應用目標、微環境純凈度、分子在微環境中的
關于新建自動化生物樣本庫的流程思考(一)
生物樣本庫的規劃與籌建工作一般多由醫學、生物學背景的專家承擔,然而由于在建庫過程中往往會涉及到多專業的知識和復雜的決策流程,一旦某個環節出現疏漏就會造成更廣泛的影響。自動化樣本庫的建設所涉及的信息和界面則更是紛繁復雜。在此背景下,我們將基于以往經驗,梳理整個建設流程的邏輯思路,拋磚引玉,供有建庫需求
關于新建自動化生物樣本庫的流程思考(三)
三、 核心產品選型與方案打造?當理想目標被納入現實框架,實際需求就產生了,根據實際需求我們可以進行核心產品的選型和項目方案的打造。?a. 確定準入門檻確定準入門檻本質上是明確項目核心利益所在,每個項目皆可不同:例如涉及生產級細胞樣本的保藏可能會要求樣本存取時溫度波動應小于某個固定值;又如涉及生物安全
組織庫冷凍樣本管理流程(四)
四. 超低溫冰箱的考慮因素1. 冰箱類型。??? 超低溫冰箱有立式和臥式之分,溫度有-80 度和-150 度。目前市面上-150 度冰箱都是臥式。臥式冰箱優點是開門冷氣散發較小,缺點是占地面積大,立式冰箱正好相反。所以大規模建庫的情況下,推薦使用立式冰箱做大規模存儲,而臥式冰箱做經常開關門的
生物樣本庫類型
生物樣本庫(Biobank)有多種類型,常見的組織、器官庫(Tissue bank),如血液庫、眼角膜庫、骨髓庫,到擁有正常細胞、遺傳突變細胞、腫瘤細胞和雜交瘤細胞株(系)的細胞株(系)庫,近年來出現了臍血干細胞庫、胚胎干細胞庫等各種干細胞庫以及各種人種和疾病的基因組庫(Genome bank)
生物樣本庫的現狀
早在1994年中國科學院就建立了中華民族永生細胞庫,而后,山東省臍帶血造血干細胞庫、北京臍帶血造血干細胞庫、泰州(復旦)健康科學研究院、SBC芯超生物銀行等專項生物標本資源庫也相繼建立,所以我國生物樣本資源庫與歐美相比,起步時間并不算晚。 2003年我國啟動了國家自然科技資源共享平臺建設項目,
生物樣本庫的定義
生物樣本庫 根據經濟合作與發展組織(OECD)的定義,”生物樣本庫(Biobank)是一種集中保存各種人類生物材料(Human biological material),用于疾病的臨床治療和生命科學研究的生物應用系統”。 類型 生物樣本庫(Biobank)有多種類型,常見的組織、器官庫(T
生物樣本庫的價值
在和大量客戶接觸和交流的過程中,發現越來越多的臨床科研工作者意識到樣本資源對于科研工作的重要性,開始重視臨床生物樣本的大量收集和規范化管理工作,一個優秀的生物樣本庫信息化管理體系的建立,將帶來以下價值: 整體科研 即從短期、中期和長期三個階段來規劃本單位的科研目標,明確各個階段可以采用的科研
組織庫冷凍樣本管理流程(六)
附件C.生物樣本庫編號規則建議標本庫編號命名規則:總原則:唯一性,共享性輔原則:在滿足總原則基礎上,盡量精簡。編號長度盡量保持統一。一.組織生物樣本采集和常規采集的編號規則組織編號規則。組織編號規則標簽類型:BRADY THT-163-499-3-IP 長方形為25.4mm*9.525mm, 圓直徑
組織庫冷凍樣本管理流程(一)
一. 取材和編號/標簽部分在本環節進行組織和血液的取材,并制作條形碼標簽,將樣本進行分裝。1. 取材單:手術醫生根據臨床病例情況在術前一日通知樣本庫次日取樣本,同時在醫囑中注明需要抽取血樣數量、種類。樣本庫根據次日樣本情況預先準備樣本提取單,并預先定義好流水編號。樣本提取單上的信息可包含并不僅限于以
組織庫冷凍樣本管理流程(二)
10. 樣本庫標識建議在冰箱外門上貼上磁性凍存架模擬標識,并在對應的空格位置上填寫凍存盒的信息。例如凍存盒內樣本名稱,凍存盒編號,凍存盒內樣本編號起止等。這樣,在打開冰箱門之前,對內部的樣本基本情況也能一目了然。注:【根據某些樣本最終的實驗要求,可能需要設計不同的存儲流程,比如有些需要做蛋白實驗的樣
組織庫冷凍樣本管理流程(五)
2.臥式冰箱臥式冰箱的標本位置信息也采用類似于立式冰箱的方式,區別是臥式冰箱里的凍存架的高度是用方框內的格子表達的。請參考如下:3. 液氮灌一個標本的位置信息會用AA-BB-CC-DD 表達,AA 是液氮灌在整個冰箱/液氮灌的主界面排列中的編號。BB 是凍存架的編號,可以選擇A…..Z 的編號,也可
組織庫冷凍樣本管理流程(三)
一. 組織庫冷凍保存管的常見形態與保存溫度。組織:凍存管保存(以內旋凍存管為多),常保存于-80 度/-150 度冰箱或液氮,也有很多單位將部分組織以RNAlater 浸潤后保存于-30 度或-80 度條件,此外也有OCT 包埋,蠟塊等組織保存形態。在條件允許的情況下,盡量保留T/P/N 三
生物樣本庫主要形式
1、醫院或研究機構下單個研究人員或者單個科室因其研究需要將其搜集的生物樣本單獨保存而建立的生物樣本庫(Biobank); 2、醫院或研究機構建立的生物樣本庫(Biobank),進行醫院或研究機構內部搜集的生物樣本資源統一保存和分配使用; 3、多個醫院或研究機構聯合組成的生物樣本庫(Bioba
什么是生物樣本庫?
生物樣本庫又稱生物銀行(Biobank),主要是指標準化收集、處理、儲存和應用健康和疾病生物體的生物大分子、細胞、組織和器官等樣本(包括人體器官組織、全血、血漿、血清、生物體液或經處理過的生物樣本(DNA、RNA、蛋白等)以及與這些生物樣本相關的臨床、病理、治療、隨訪、知情同意等資料及其質量控制
生物樣本庫主要形式
1、醫院或研究機構下單個研究人員或者單個科室因其研究需要將其搜集的生物樣本單獨保存而建立的生物樣本庫(Biobank); 2、醫院或研究機構建立的生物樣本庫(Biobank),進行醫院或研究機構內部搜集的生物樣本資源統一保存和分配使用; 3、多個醫院或研究機構聯合組成的生物樣本庫(Bioba
生物樣本庫的識別跟蹤
a) 提取、分裝后的樣本應能通過信息系統追溯到原始樣本并與其信息相關聯; b) 每份樣本在信息系統中應有且僅有唯一一個或者一組識別符號(數字或條形碼); c)樣本從采集到處理、儲存、配送運輸、使用后剩余返回重新儲存等的全過程都應被有效記錄; d) 生物樣本的轉移應被及時記錄,信息系統能追溯
生物樣本庫發展現狀
生物樣本庫是標準化搜集處理、儲存和分發健康和疾病生物體的生物大分子、細胞、組織和器官等樣本,以及相關的個體生理及病理信息的系統。目前主要是人體樣本的搜集儲存,包括核酸、蛋白、細胞、血液及其分離成分、尿液、唾液、毛發、精液、卵子、受精卵、卵巢組織、睪丸組織、胎盤、臍帶、胸腺、脂肪、皮膚、骨髓、角膜、血
生物樣本庫認可依據
CNAS-R01《認可標識使用和認可狀態聲明規則》 CNAS-R02《公正性和保密規則》 CNAS-R03《申訴、投訴和爭議處理規則》 CNAS-RL01:2019《實驗室認可規則》 CNAS-RL02:2018《能力驗證規則》 CNAS-RL10:2020《生物樣本庫認可規則》 C
生物樣本庫與轉化醫學
隨著后基因組時代的來臨,對基因的研究引發了新的方法和研究手段的誕生,密切了基礎醫學與藥物研發、臨床醫學之間的聯系。使人們可以更準確地理解環境和人類遺傳分子之間的相互作用,以期精確地描繪疾病發生的本質,從而改進對于疾病的診查和治療。由此誕生了從實驗室到病床,把基礎研究所獲得的知識、成果快速轉化為臨
生物樣本庫的發展現狀
生物樣本庫(Biobank)是眾多重要科研成果快速產業化、應用到臨床,實現“轉化醫學”的重要保證,美國、歐洲以及國際衛生組織都投入了幾億到幾百億美元建立大型生物樣本庫。 進入二十一世紀以來,隨著現代生物技術的快速發展,分子遺傳學取得了巨大的發展,國外對于人類遺傳資源的保護與開發研究勢頭強勁,主
生物樣本庫的信息系統
生物樣本庫(Biobank)資源管理信息系統是為了便利于有效的管理生物樣本和相關信息所建立的具有搜集、保存、檢索和分析功能的信息系統。其易用性、安全性、可靠性是其重要考核內容。為此: 生物樣本庫(Biobank)資源管理信息系統的功能包括但不限于:追蹤捐贈者的問卷和知情同意,管理生物樣本采集、
關于舉辦生物樣本庫認可宣貫培訓的通知
原文地址:https://www.cnas.org.cn/zxtz/912820.shtml 關于舉辦生物樣本庫認可宣貫培訓的通知
生物樣本庫的推廣勢在必行如何安全存儲和管理生物樣本
1. 標準化樣本處理 生物樣本種類繁多(主要分為5大類:組織樣本、血液樣本、核酸和蛋白質樣本、凍存的細胞樣本、組織切片和組織芯片),對樣本進行標準化處理是構建樣本庫最重要也是最核心的一樣工作。 1) 樣本處理是對樣本進行必要的分割、分裝和處理,以使樣本滿足儲存和將來使用的質量要求。樣本的處理
活體腫瘤樣本庫與常規腫瘤生物樣本庫有什么區別?
一、常規生物樣本庫 腫瘤在臨床上有實體瘤和非實體瘤之分。來源于臨床活檢或外科手術的固體腫瘤組織,由病理醫生決定切割組織的關鍵部份用于常規病理診斷,且在不影響常規病理診斷的情況下,組織的剩余部份被生物樣本庫切割收集,將腫瘤蠟塊存儲到樣本庫中。但是這種方式保存的樣本,不能夠保證保存下來的腫瘤塊是否
愛沙尼亞基因組中心生物樣本庫的自動化解決方案
概述愛沙尼亞生物樣本庫是收集能夠代表整個愛沙尼亞人口的以民族委基礎的生物樣本庫。因為整體工作量、反應時間、樣本的完整性和過程的安全性等因素,為研究伙伴人工發放樣本變得越來越困難,因此愛沙尼亞生物樣本庫采用了由一套自動化存儲系統,一臺自動化液體處理系統和多個小設備(如離心機和開蓋機)組成的Hamilt
盛元廣通實驗室自動化生物樣本庫質量控制管理系統
隨著我國生物醫學研究的不斷深入和精準醫療的快速發展,對高質量生物樣本的需求日益增長。近年來,我國生物樣本庫建設取得了顯著進展。各級政府、高校和醫院紛紛投入資源建設生物樣本庫,推動了生物樣本資源的有效整合和利用。生物樣本庫的質量控制管理體系正在逐步完善。相關機構和部門已經制定了一系列質量控制標準和操作
中國生物樣本庫:不能僅“存起來再說”
101篇1980年前后發表于《細胞》《自然》等雜志的重大發現,20年后僅1項有臨床價值。”中國科學院院士、復旦大學附屬中山醫院院長樊嘉在近日召開的中國整合生物樣本學大會上說,美國的這組統計數字顯示從實驗室到臨床的傳統轉化模式效率低、時間長。 高質量論文僅有不足百分之一臨床轉化,這樣的窘境有
中國生物樣本庫向標準化邁進
1 癌癥研究現狀與精準醫學 過去一百多年,各國對腫瘤浩浩蕩蕩的研究并沒有取得突破性進展,就如 Clifton Leaf 在 2004年 Fortune 所提到:“Why We’re Losing the War on Cancer —— and How to Win it?”。近 10 多年來