測序與芯片揭示miRNA調控海參夏眠機制
海參(Apostichopus japonicus),是生活在海邊至海底8000米的海洋棘皮動物,以海底藻類和浮游生物為食。當夏季來臨,上層海水由于太陽光強烈照射,溫度上升。此時,海底的小生物都浮到海面,進行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海參,迫于夏季食物中斷,進入夏眠,此時,其基礎代謝率明顯減退,耗氧和氨氮排泄率下降,甚至嚴重退化為一個很細小的腸纖維。MiRNAs在低代謝基因調控中的作用研究,是一個新興的熱點。為了確定miRNAs是否對海參夏眠過程具有調控作用,近日,中國海洋大學的陳慕雁博士后領銜的團隊和聯川生物公司科研團隊攜手,對海參夏眠過程中的miRNAs進行了深入研究,研究成果發表在10月刊的PLoS ONE上。研究人員對深度夏眠至少連續15天狀態的海參采集樣本,并使用經過夏眠后又恢復活動狀態的非夏眠海參為對照樣本。之后,研究人員采用Solexa深度測序技術分析了海參腸miRNA的表達譜,結果一共鑒定出了308個......閱讀全文
測序與芯片揭示miRNA調控海參夏眠機制
海參(Apostichopus japonicus),是生活在海邊至海底8000米的海洋棘皮動物,以海底藻類和浮游生物為食。當夏季來臨,上層海水由于太陽光強烈照射,溫度上升。此時,海底的小生物都浮到海面,進行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海參,迫于夏季食物中斷,進入夏眠,此時,其基礎代謝率明
中海大:測序與芯片揭示miRNA調控海參夏眠機制
海參(Apostichopus japonicus),是生活在海邊至海底8000米的海洋棘皮動物,以海底藻類和浮游生物為食。當夏季來臨,上層海水由于太陽光強烈照射,溫度上升。此時,海底的小生物都浮到海面,進行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海參,迫于夏季食物中斷,進入夏眠,此時,其基礎代謝
測序解析miRNA調控害蟲發育機制
小菜蛾(Plutella xylostella)是全球范圍內嚴重危害十字花科作物生長的鱗翅目害蟲,據估計每年造成的損失和防治成本達到40-50億美元。最近的轉錄組分析和基因組測序為了解小菜蛾適應環境脅迫的分子機制提供了一個極好的機會。盡管Etebari等1發現了在寄生脅迫下二齡幼蟲中的一組miRNA
Cell揭示miRNA調控新機制
來自波士頓大學兒童醫院及哈佛醫學院的研究人員發現,微處理器上游的一個生物合成步驟控制了miR-17~92表達。這一重要的研究發現發布在8月6日的《細胞》(Cell)雜志上。 MicroRNAs (miRNAs)是一個調控RNA大家族,其主要通過與靶mRNA 3′端非翻譯區(3′ UTR)互補配
中國農大:測序解析miRNA調控害蟲發育機制
小菜蛾(Plutella xylostella)是全球范圍內嚴重危害十字花科作物生長的鱗翅目害蟲,據估計每年造成的損失和防治成本達到40-50億美元。最近的轉錄組分析和基因組測序為了解小菜蛾適應環境脅迫的分子機制提供了一個極好的機會。盡管Etebari等1發現了在寄生脅迫下二齡幼
海洋所首次完成仿刺參基因組測序和組裝
日前,我國科學家在國際上首次完成仿刺參基因組測序和組裝,對刺參生物學和遺傳育種研究具有重要科學意義,將對我國刺參產業發展產生重要推動作用。 該成果由中國科學院海洋研究所研究員楊紅生團隊和相建海團隊共同完成,在天津生物芯片技術公司的技術支撐下,突破了刺參復雜基因組測序和組裝技術瓶頸,采用新一代測
中國科學家國際上首次完成仿刺參基因組測序組裝
近日,記者從中國科學院海洋研究所獲悉,我國科學家正式完成仿刺參基因組測序和組裝,這在國際上尚屬首次。該研究成果對刺參生物學和遺傳育種研究具有重要科學意義,對我國刺參產業發展將產生重要推動作用。 據了解,該項研究得到了國家科技部973 、863計劃,國家基金委,中國科學院和山東省科技廳、青島市
四川農大:揭示miRNA調控玉米穗發育機制
microRNA(miRNAs)是一類內源性的非編碼小RNA,在植物的多種生理過程中發揮重要調控作用,包括代謝,激素反應,轉座子的表觀遺傳控制,脅迫應答。在模式植物如水稻和擬南芥中已進行了廣泛的miRNA研究。在玉米中,脅迫應答相關miRNA和其靶基因的研究也已開展過很多。然而,關于miRNA參
研究揭示miRNA參與狼瘡低甲基化調控機制
中國科學院上海生命科學研究院健康科學研究所沈南教授領導的研究組整合上海交通大學附屬仁濟醫院風濕科的臨床優勢和健康所的基礎研究力量,繼2009年在風濕病學領域最有影響力的雜志ARTHRITIS & RHEUMATISM上報道了miRNA作為負反饋調節分子在狼瘡關鍵致病通路中起了重要作
非編碼RNA調控仿刺參腸道再生和皂苷合成研究獲進展
非編碼RNA中的miRNA和tRNA在基因表達調控中扮演重要角色,然而在棘皮動物中相關研究較缺乏。中國科學院海洋研究所研究員李富花課題組通過多組學數據整合分析,揭示了棘皮動物miRNA和tRNA基因的組織結構特點、進化歷史和表達調控機制,以及它們在海參腸道再生和皂苷合成等生物學過程中的重要作用。
非編碼RNA調控仿刺參腸道再生和皂苷合成研究獲進展
非編碼RNA中的miRNA和tRNA在基因表達調控中扮演重要角色,然而在棘皮動物中相關研究較缺乏。中國科學院海洋研究所研究員李富花課題組通過多組學數據整合分析,揭示了棘皮動物miRNA和tRNA基因的組織結構特點、進化歷史和表達調控機制,以及它們在海參腸道再生和皂苷合成等生物學過程中的重要作用。相關
非編碼RNA調控仿刺參腸道再生和皂苷合成研究新進展
非編碼RNA中的miRNA和tRNA在基因表達調控中扮演重要角色,然而在棘皮動物中相關研究較缺乏。中國科學院海洋研究所研究員李富花課題組通過多組學數據整合分析,揭示了棘皮動物miRNA和tRNA基因的組織結構特點、進化歷史和表達調控機制,以及它們在海參腸道再生和皂苷合成等生物學過程中的重要作用。
揭示miRNA在腫瘤細胞糖代謝中的功能及調控機制
5月17日,國際學術期刊Journal of Biological Chemistry在線發表了中科院上海生命科學研究院生化與細胞所季紅斌研究組與劉新垣研究組合作的研究論文miR-143 regulates cancer glycolysis via targeting hexok
miRNA調控乳脂合成新機制
乳汁是年幼哺乳動物包括人類的主要營養來源。乳汁的營養價值主要來自脂肪和蛋白質組分。相比于牛奶,山羊奶含有更多的總脂肪,包括更高豐度的有益不飽和脂肪酸。MicroRNAs(miRNAs)是一類含有約22個核苷酸的小RNA,參與各種代謝過程。然而,目前有關miRNA在調控山羊奶成分中的作用知之甚少。西北
仿刺參腸道再生和皂苷合成研究取得重要進展
非編碼RNA中的miRNA和tRNA在基因表達調控中扮演重要角色,然而在棘皮動物中相關研究非常缺乏。 近日,記者從中科院海洋所了解到,該所實驗海洋生物學重點實驗室研究員李富花課題組通過多組學數據整合分析,揭示了棘皮動物miRNA和tRNA基因的組織結構特點、進化歷史和表達調控機制,以及它們在海
仿刺參腸道再生和皂苷合成研究取得重要進展
非編碼RNA中的miRNA和tRNA在基因表達調控中扮演重要角色,然而在棘皮動物中相關研究非常缺乏。 近日,記者從中科院海洋所了解到,該所實驗海洋生物學重點實驗室研究員李富花課題組通過多組學數據整合分析,揭示了棘皮動物miRNA和tRNA基因的組織結構特點、進化歷史和表達調控機制,以及它們在
JVI:首次報道病毒miRNA調控對蝦抗病毒
病毒,尤其是DNA病毒,會產生自身的microRNA(miRNA)來調控宿主和病毒基因的表達。由于其在病毒—宿主相互作用中的重要作用,近年來病毒miRNA已引起了廣泛的關注與研究,然而人們對無脊椎動物病毒 miRNA的了解卻十分有限。至今,大多數對病毒miRNA的研究是在細胞系中進行的,但是
天津生物芯片參與繪制海參基因組
海參屬于棘皮動物,是其中體型與形態最為特殊的種類,且處于從無脊椎向脊椎動物分化的獨特進化地位,也是國內外重要的海產經濟物種,具有極高的營養與醫用價值。 10月12號,國際學術期刊PLoS Biology在線刊發了天津生物芯片參與的海參全基因組精細參考圖譜項目文章-“The sea cucumb
芯片與測序(一)
在高通量檢測這個領域里,基因芯片和二代測序這對相愛相殺的cp,原本均是了解基因組結構和功能的絕佳高手,如今為了一爭高下,又是鬧的不開交。這不,基因芯片仗著自己老大哥的身份,手持一個二維的DNA探針陣列所形成的三維地圖,以數以萬計的探針做方向標,能按圖索驥的找到基因組的特定位置,且結合完整成熟的指控分
芯片與測序(二)
另外,欲尋找疾病診斷標記物的小伙伴可要記住了,無論是mRNA或者lncRNA,HTA平臺有更多的基因可作為biomarker。 可變剪切分析是識別基因不同轉錄本特異性表達的有效手段。其中,RNA-seq可鑒定到23,934個差異exons,HTA鑒定到26,999個差異exons(3698個共
上海生科院揭示軸突富集的miRNA調控軸突發育的分子機制
國際學術期刊Cell Reports 于12月17日在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所鮑嵐研究組的最新研究進展:FMRP-Mediated Axonal Delivery of miR-181d Regulates Axon Elongation by Locall
微生物所揭示miRNA調控植物生長素信號途徑的機制
microRNA(miRNA)是一類廣泛存在于生物體的21nt到24nt的短的非編碼RNA,通過堿基互補配對的方式介導其靶標mRNA的剪切或者抑制其翻譯。在植物中,miRNA主要通過剪切靶標mRNA調控生長發育以及抗病抗逆作用。植物生長素(auxin)信號途徑在植物生長發育過程中具有重要的調控作
全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制(二)
3. 環狀RNA的差異表達與前列腺癌的進展有關研究者對144個前列腺癌進行了聚類分析,與線性RNA相比,環狀RNA最強模式與它們在每個樣本中的總體豐度相一致。另外,極端circRNA分布的患者的預后明顯較circRNA分布穩定的患者差,同時極端circRNA index組也與更高的轉移發生率
全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制(一)
2月7日,加拿大多倫多大學的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授團隊對144例前列腺癌樣本進行全轉錄組測序,結合后續的功能機制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的調控機制!該研究成果以題為“Widespread and Functional RNA Circ
《Cell》重磅!全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制
2月7日,加拿大多倫多大學的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授團隊對144例前列腺癌樣本進行全轉錄組測序,結合后續的功能機制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的調控機制!該研究成果以題為“Widespread and Functional RNA Ci
Cell》重磅!全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制!
2月7日,加拿大多倫多大學的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授團隊對144例前列腺癌樣本進行全轉錄組測序,結合后續的功能機制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的調控機制!該研究成果以題為“Widespread and Functional RNA Ci
西北農林:發現miRNA調控乳脂合成新機制
乳汁是年幼哺乳動物包括人類的主要營養來源。乳汁的營養價值主要來自脂肪和蛋白質組分。相比于牛奶,山羊奶含有更多的總脂肪,包括更高豐度的有益不飽和脂肪酸。MicroRNAs(miRNAs)是一類含有約22個核苷酸的小RNA,參與各種代謝過程。然而,目前有關miRNA在調控山羊奶成分中的作用知之甚少
西北農林:發現miRNA調控乳脂合成新機制
乳汁是年幼哺乳動物包括人類的主要營養來源。乳汁的營養價值主要來自脂肪和蛋白質組分。相比于牛奶,山羊(Capra hircus)奶含有更多的總脂肪,包括更高豐度的有益不飽和脂肪酸。MicroRNAs(miRNAs)是一類含有約22個核苷酸的小RNA,參與各種代謝過程。然而,目前有關miRNA在
Cell:miRNA,調控子的調控
MicroRNAs是多細胞生物體遺傳程序的重要調控者。由于它們具有強大的作用,其自身的生成也受到嚴密地控制。來自德國馬克思?普朗克發育生物學研究所的科學家們在新研究中獲得了關鍵的研究發現。他們在擬南芥(阿拉伯芥,thale cress)中發現了一個調節micro RNAs生成的新元件,通過去
miRNA與剪接因子相互作用調控胚胎干細胞的分子機制
該項研究發現在胚胎干細胞中miRNA介導調控了近六百個可變剪接事件,其中大部分是由miR-294所調控,包括Foxp1的可變剪接。結合RNA干擾和高通量測序發現,miR-294主要通過抑制剪接調控因子Muscle blind-like蛋白(Mbnl1/2)的表達來起作用的。有趣的是,分化過程