教你巧用IGV輕松實現基因組的可視化
Itegrative Genomics Viewer (IGV)是由Broad研究院的研究人員開發的一款功能強大的綜合性基因組學可視化工具，借助于此工具，從事生物信息的科研工作者就可以輕松的分析查看多種基因組數據。除了直觀的查看序列信息及遺傳密碼中的序列變化或突變外，還可以查看拷貝數變化、染色質沉淀數據和表觀遺傳學修飾等。使用者可以選擇多種顯示模式，以heat map、柱狀圖、散點圖或其他形式查看他們的數據。更為吸引人的是IGV的使用是免費的喲！測序數據reads通過與參考基因組比對可以直觀的查看序列信息及遺傳密碼中的序列變化或突變，還可以查看拷貝數變化、染色質沉淀數據和表觀遺傳學修飾等。前期準備工具：IGV軟件參考基因組：例人參考基因組Homo_sapiens_HG19.sorted.gtf測序數據文件：例bam、bw等一、IGV下載及安裝1.請打開您常用的瀏覽器，在http://www.broadinstiute......閱讀全文
教你巧用IGV輕松實現基因組的可視化
Itegrative Genomics Viewer (IGV)是由Broad研究院的研究人員開發的一款功能強大的綜合性基因組學可視化工具，借助于此工具，從事生物信息的科研工作者就可以輕松的分析查看多種基因組數據。除了直觀的查看序列信息及遺傳密碼中的序列變化或突變外，還可以查看拷貝數變化、染
必備技能！云序生物教你巧用IGV輕松實現基因組的可視化
Itegrative Genomics Viewer (IGV)是由Broad研究院的研究人員開發的一款功能強大的綜合性基因組學可視化工具，借助于此工具，從事生物信息的科研工作者就可以輕松的分析查看多種基因組數據。除了直觀的查看序列信息及遺傳密碼中的序列變化或突變外，還可以查看拷貝數變化、染色質
巧用熒光成像，實現腫瘤干細胞的可視化治療
眾所周知，腫瘤由各種不同類型的細胞構成，目前我們還不清楚光動力檢測是否能夠識別腫瘤內部的所有細胞。 腫瘤干細胞（Cancer stem cells ，CSCs）是一種極其重要的、具有自我更新能力的腫瘤細胞。它們是影響腫瘤進程和放/化療抗性的主要細胞類型，也是導致治療后腫瘤復發的主要原因。評估以
教你輕松搞定血氣分析
目前，血氣分析已被廣泛應用于臨床各科，特別是在危重病人搶救中占重要地位。它有助于了解病情、鑒別診斷、觀察療效和估計預后。通過血氣分析，能對病人的通氣功能，換氣功能主要是缺氧和二氧化炭潴留情況,及機體的酸堿狀態，電解質紊亂的程度有一個較全面的了解。同時，PH值是估計預后的主要特征之一，即pH值愈低，糾
教你輕松看懂凝血常規
一、凝血酶原時間（PT） ?1、正常參考值：12-16秒。 ?2、臨床應用：凝血酶原時間是檢查外源性凝血因子的一種過篩試驗，是用來證實先天性或獲得性纖維蛋白原、凝血酶原、和凝血因子Ⅴ、Ⅶ、Ⅹ的缺陷或抑制物的存在，同時用于監測口服抗凝劑的用量，是監測口服抗凝劑的首選指標。據報道，在口服抗凝劑的過程
新研究實現脊椎動物基因組復制的可視化分析
近日，中山大學海洋科學學院副教授盧建國團隊成功構建脊椎動物基因組復制數據庫DupScan和一站式分析平臺，實現了脊椎動物基因組復制的的可視化分析。相關研究發表于Nucleic Acids Research。盧建國副教授為該論文第一作者和通訊作者，碩士研究生黃沛霖為第二作者，南開大學計算機學院劉健教授
多功能植物小RNA分析工具|一站式小RNA分析及可視化
日，《科學通報》在線發表了華南農業大學園藝學院教授夏瑞團隊最新研究成果，他們研究開發出一款多功能植物小RNA分析工具——sRNAminer，可便于研究人員進行一站式小RNA分析及可視化。 據介紹，植物小RNA是植物生長發育和營養繁殖過程的重要調控分子。目前已有的分析工具多數依賴于命令行環境，
科學家開發一款多功能植物小RNA分析工具
近日，《科學通報》在線發表了華南農業大學園藝學院教授夏瑞團隊最新研究成果，他們研究開發出一款多功能植物小RNA分析工具——sRNAminer，可便于研究人員進行一站式小RNA分析及可視化。 sRNAminer軟件整體功能概覽。課題組供圖 據介紹，植物小RNA是植物生長發育和營養繁殖過程的重要
怎樣巧用離心機呢？小析姐教你幾招。。
目前，實驗室常用的是電動離心機，因其轉動速度快，要注意安全，特別要防止在離心機運轉期間，因不平衡或試管墊老化，而使離心機邊工作邊移動，使其從實驗臺上掉下來，或因蓋子未蓋，離心管因振動而破裂，玻璃碎片旋轉飛出，造成事故。因此，使用離心機時，必須注意如下操作： （1）離心機套管底部要墊棉花或試管墊
教你巧用萬用表測量大值電阻
31/2位和41/2位數字萬用表電阻檔的最大量程一般是20MΩ。對于31/2位數字萬用表而言，使用不同的電阻量程也只能測量0.1Ω～19.99MΩ范圍內的電阻；而對于41/2位數字萬用表，則只能測量0.01Ω～19.999MΩ范圍內的電阻。當被測電阻Rx≥20MΩ時，儀表將顯示溢出符號“
教你輕松玩轉環狀RNA測序加機制研究（一）
從表達譜至海綿機制完美進階，教你輕松玩轉環狀RNA測序加機制研究文章導讀：禽白血病病毒J亞群(ALV-J)屬于逆轉錄病毒屬，慢病毒亞科的家族成員，可引起禽類多種腫瘤性疾病，如骨髓細胞瘤、肉瘤、血管瘤、腎腫瘤和成紅細胞增多癥，以及禽類骨髓白血病，導致受感染雞的高死亡很率。該分散的ALV-J菌株分布廣泛
教你幾招輕松區分糞類圓線蟲和鉤蟲
寄生蟲一直在我們身邊，并沒有那么遙遠。雖然不如解放初期那般泛濫，現如今其實也并不少。本人雖然工作很多年從來沒找到過，但是在丁香園論壇和群里面各位同行發現了不少。地域性也是比較強，廣東、廣西、云南等地寄生蟲發現率還不算低。? ? 其中以蟯蟲檢出率最高，甚至可以在大便中見到成蟲，鏡下也可以見到成
教你輕松玩轉環狀RNA測序加機制研究（二）
3.gga-miR-373 通過與YAP1的3’UTR區結合負調控YAP1的表達，并且過表達gga-miR-375可減弱EMT生信預測揭示YAP1是gga-miR-375的潛在靶基因，進一步的雙熒光素酶報告基因證實了gga-miR-375可通過結合YAP1的3’UTR區抑制YAP1的表達；在體外細胞
光子的量子糾纏實現快速可視化
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/507000.shtm
新年大掃除！化學妹子教你如何輕松搞定
新年將近，又快到了年底“洗舊迎新”大掃除的時候。一個清新、干凈的家庭環境無疑會讓全家人新年過得更放心、更舒心！化學妹子帶來了一些大掃除清洗時的小竅門……大家趕緊get起來吧。 【任務一】：清洗大件窗簾 窗簾，因拆洗不方便，往往年底才洗一次，灰塵與污垢自然積得比較多，成為大家年底洗滌的頭等大事
輕松實現液相色譜的方法轉換（二）
然后將方法轉換到填充1.7μm填料的內徑為2.1mm 的BEH C18 柱上。為了保持兩個柱子上的線速度相同，將流速減小到0.22 ml/min，同時將進樣量從2μl減少到0.8μl，壓力為380bar。為了補償延遲體積的差異，在梯度中引入了0.5min的初始持續時間。這些條件下的結果與用
輕松實現液相色譜的方法轉換（一）
圖1.? 從Agilent 1200系列LC系統到Agilent 1290 Infinity LC系統的方法轉換。 本文對Agilent 1290 Infinity液相色譜系統用于測定鹽酸胃復安藥物制劑中的雜質和有關物質的性能進行了評價。1200系列HPLC系統上的常規LC方法很
人類中心粒組裝實現可視化
沿著縱軸切割并從上方觀察的人類中心粒模型。瑞士日內瓦大學科學家將高分辨率顯微鏡和運動學重建技術相結合，成功實現人類中心粒組裝過程可視化。發表在《細胞》雜志上的這項研究，闡明了中心粒組裝的復雜性，為研究其他細胞器開辟了新途徑。中心粒是細胞內的一種桶狀結構，由多個蛋白質組成。這些蛋白質的突變可引起一系列
增強的金屬檢測軟件輕松實現了產品切換
為使數量不斷增加的食品制造商提高加工生產線的靈活性，梅特勒-托利多金屬檢測開發了 Profile 金屬檢測系統軟件。新軟件提高了對于含水分食品和干燥食品的檢測靈敏度，通過使用 Profile 金屬檢測機現有的“產品聚類”功能，它簡化了產品切換，并使制造商可以在單一頻率設置上加工各種產品。
教你輕松應對全自動凱氏定氮儀的常見故障
在調查飼料營養價值時，檢測飼料中的氮含量是基礎工作之一。只是飼料氮含量怎么檢測，我們經常使用的測氮儀器主要是半自動凱氏定氮儀和全自動凱氏定氮儀，其中全自動凱氏定氮儀應用更多。但是全自動凱氏定氮儀在使用的過程中，常會出現一些問題，如果用戶不懂得處理，將會大大影響我們的使用效果，下面我們就主要來了解一下
比率熒光探針實現可視化檢測農藥殘留
近期，中國科學院合肥物質科學研究院固體物理研究所研究員蔣長龍團隊在氨基甲酸酯農藥和有機磷農藥殘留分析檢測方面取得新進展。研究設計制備了兩種高效的比率熒光納米探針，并結合智能手機的顏色識別器，實現對食品和環境水體中農藥的可視化定量檢測。相關研究成果發表在《化學工程雜志》（Chemical Engi
中藥制丸機出現故障了？本文教你如何輕松分析與應對！
中藥制丸機可生產蜜丸、濃縮丸、水蜜丸、水丸包括丸狀食品。適用于小型藥廠、大中型藥廠試制室、中醫藥研究所、醫院、私人診所、中藥店、名貴滋補品現場加工銷售點、整機采用不銹鋼制作，符合GMP標準。且體積小，耗能低，效率高，噪音小，無污染，操作簡單，安全可靠，本機采用220V照明電，取電極為方便。
活細胞RNA檢測－一步輕松實現
一提到RNA的檢測，大家的腦海中可能會立即浮現出：RT-PCR、FISH、Northern blot等。的確，這些都是檢測RNA的經典方法，但它們需要裂解、固定、RNA抽提等，頗為繁瑣。其實，RNA的檢測完全可以更smart。默克密理博最新推出的SmartFlare? RNA“靈光”技術
單分子測序輕松升級參考基因組
現代基因組學的最大需求之一，就是得到人類和模式生物的高質量完成基因組。目前，人們利用二代測序技術對越來越多的物種(從原核生物到真核生物)進行了基因組測序，取得了許多重要的研究成果。 不過大部分物種的基因組還中存在有大量的缺口gap，就目前的數據來說，各種已測序物種的基因組中缺口gap所占的
凈化器性能環境測試艙教你如何輕松選擇合適的空氣凈...
凈化器性能環境測試艙教你如何輕松選擇合適的空氣凈化器空氣是每一個人賴以生存的氣體，自誕生之日開始，就與我們的生存息息相關。近年來，社會進步，時代發展，空氣質量日益下降，高效凈化空氣中的霧霾污染物,攔截空氣中顆粒物的產品已經逐漸進入了人們的視野，空氣凈化器應運而生。? 然而，目前空氣凈化器市場品牌
巧用掃描電鏡實現襯底支撐石墨烯的高質量成像
常見的襯底支撐石墨烯體系，有SiC熱解生長石墨烯、Cu等金屬襯底上CVD法生長石墨烯、Si上轉移石墨烯等。石墨烯的常用結構表征技術包括透射電鏡、拉曼（Raman）、原子力顯微鏡（AFM）、光學顯微鏡以及掃描電鏡（SEM）。其中，SEM具有分辨率達納米級、觀測范圍大、速度快、無損等優點，在石墨烯的生長
新型納米探針可實現農藥可視化定量檢測
近期，中國科學院合肥物質院固體所蔣長龍研究員團隊在氨基甲酸酯農藥和有機磷農藥殘留分析檢測方面取得新進展，設計制備了兩種高效的比率熒光納米探針，并結合智能手機的顏色識別器，實現對食品和環境水體中農藥的可視化定量檢測。相關研究成果發表在Chemical Engineering Journal和ACS
新型納米探針可實現農藥可視化定量檢測
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505204.shtm 近期，中國科學院合肥物質院固體所蔣長龍研究員團隊在氨基甲酸酯農藥和有機磷農藥殘留分析檢測方面取得新進展，設計制備了兩種高效的比率熒光納米探針，并結合智能手機的顏色識別器，實現對食
全基因組測序各步驟工具
全基因組測序（WGS）是下一代測序技術，用于快速，低成本地確定生物體的完整基因組序列。基因組的深度測序對于臨床研究的意義重大，解讀WGS數據并了解基因組突變在健康和疾病中的重要性是精準醫療的基石。WGS分析流程能分為三大塊，數據處理、檢測變異和綜合分析，具體如下圖所示：由于WGS現在已經非常成熟了，
巧用低壓驗電筆
低壓驗電筆是常用一種輔助安全用具。用于檢查500V以下導體或各種用電設備外殼是否帶電。一支普通低壓驗電筆，可隨身攜帶，掌握驗電筆原理，結合熟知電工原理，靈活運用技巧很多。 （1）判斷交流電與直流電口訣 電筆判斷交直流，交流明亮直流暗， 交流氖管通身亮，直流氖管亮一端。 說