菌落PCR(ColonyPCR)方法
菌落PCR(Colony PCR)可不必提取基因組DNA,不必酶切鑒定,而是直接以菌體熱解后暴露的DNA為模板進行PCR擴增,省時少力。建議使用載體上的通用引物。通常利用此方法進行重組體的篩選或者DNA測序分析。最后的PCR產物大小是載體通用引物之間的插入片斷大小。具體方法:1、PCR混合物的制備Taq buffer(10×) 20 uldNTP(2.5 mM) 5 ulPrimer Forward(50 mM) 10 ulPrimer Reverse(50 mM) 10 ulddH 2 O 147 ulTaq(2U/ul) 8 ultotal 200 ul 將上述溶液混勻,10 ul每管分裝于200 ul PCR管中。2、常溫下隨機挑選轉化板上的轉化子,用滅菌的牙簽或槍頭挑取少量菌體,在LB瓊脂糖平板上輕點,做一拷貝;然后將沾有菌體的牙簽或槍頭置于相應的裝有PCR混合物的PCR管中洗滌數下(管子做好記號,如平板上點的......閱讀全文
PCR檢測方法
PCR反應的zui大特點是具有較大擴增能力與極高的靈敏性,但令人頭痛的問題是易污染,極其微量的污染即可造成假陽性的產生。污染原因一、標本間交叉污染:標本污染主要有收集標本的容器被污染,或標本放置時,由于密封不嚴溢于容器外,或容器外粘有標本而造成相互間交叉污染;標本核酸模板在提取過程中,由于吸樣槍污染
其它PCR方法
·?????????Standard PCR Protocol?(Molecular Biology Techniques Manual)The followings are described in detailRecommended Reagent ConcentrationsRecommend
直接原位PCR(In-situ-PCR)操作方法
原位PCR是原位雜交細胞定位和PCR的高靈敏度相結合的技術,使得靶基因檢測有了極大的改進。此技術是在細胞(爬片、甩片或涂片)或組織(石蠟、冰凍切片)上直接對靶基因片段進行擴增,通過摻入標記基團直接顯色或結合原位雜交進行檢測的方法。1.組織切片和細胞樣品的制備【試劑與配置】10%福爾馬林二甲苯PBS【
知曉PCR,定量PCR與數字PCR的實驗方法與選擇
從1985年至今的30多年時間里,PCR分析經歷了三代技術的發展。一代傳統PCR技術,采用瓊脂糖凝膠電泳的方法對PCR產物進行定性分析。第二代熒光定量PCR技術,通過在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號的積累實時監控PCR進程,最后用Cq值對基因進行定量分析。第三代數字PCR技術,通過將PC
cDNA文庫組標準流程七:快速鑒定、菌落PCR
1.質粒快速鑒定??試劑:Protoplasting buffer:30mM Tris-HCl, pH8.0 ??????????????????0.33ml/1.0M????? 5mM EDTA ??????????????????????????????0.1ml/0.5M????? 50mM
PCR(RTPCR)反轉錄-定性檢測方法
1、試劑 (1)10倍 RT 緩沖液:500mmol/L Tris·Cl(pH8.0),0.60 mmol/L MgCl2,400mmol/L KCl,10mmol/L DTT。 (2)10倍 PCR 緩沖液:100mmol/L Tris·Cl(pH8.3),500mmol/L kCl,15
新型PCR分析方法毛細管PCR技術
新型PCR分析方法毛細管PCR技術?常規PCR反應采用導熱性較差的塑料管作為反應容器,對于100~1樣品,樣品溫度要比槽板溫度滯后2030s,加上槽板升降溫度較慢(1C/s),因此30個循環反應通常需要2~6h,循環時間多浪費在常規PCR反應采用導熱性較差的塑料管作為反應容器,對于100~1樣品,樣
新型PCR分析方法毛細管PCR技術
常規PCR反應采用導熱性較差的塑料管作為反應容器,對于100~1樣品,樣品溫度要比槽板溫度滯后20—30s,加上槽板升降溫度較慢(1’C/s),因此30個循環反應通常需要2~6h,循環時間多浪費在加熱和冷卻樣品過程中,不能滿足臨床快速診斷的需要。毛細管PCR由于采用導熱性遠強于塑料管的毛細管作為反應
PCR產物克隆方法
平端連接 通常情況下,PCR產物可直接與平端載體DNA進行連接,但其連接效率效低。因為TaqDNA聚合酶具有非模板依賴性末端轉移酶活性,能在兩6條 DNA鏈的3'末端加上一個多余的堿基,使合成的PCR產物成為3'突出一個堿基的DNA分子。這種DNA分子的連接效率很低。由
PCR檢測方法(二)
3.實驗操作注意事項:盡管擴增序列的殘留污染大部分是假陽性反應的原因,樣品間的交叉污染也是原因之一。因此,不僅要在進行擴增反應是謹慎認真,在樣品的收集、抽提和擴增的所有環節都應該注意:(1)戴一次性手套,若不小心濺上反應液,立即更換手套。(2)使用一次性吸頭,嚴禁與PCR產物分析室的吸頭混用,吸頭不
PCR產物純化方法
Purification of PCR Products in Preparation for CloningJoseph SambrookPeter Maccallum Cancer Institute and The University of Melbourne, AustraliaDavid
PCR檢測方法(一)
PCR反應的最大特點是具有較大擴增能力與極高的靈敏性,但令人頭痛的問題是易污染,極其微量的污染即可造成假陽性的產生。污染原因一、標本間交叉污染:標本污染主要有收集標本的容器被污染,或標本放置時,由于密封不嚴溢于容器外,或容器外粘有標本而造成相互間交叉污染;標本核酸模板在提取過程中,由于吸樣槍污染導致
pcr儀測溫方法
?PCR測溫服務PCR是分子生物學領域的關鍵技術。不管是在基礎研究還是臨床診斷領域,PCR 的應用越來越廣泛。一個穩定的溫度循環是成功實現PCR所必須的,在PCR反應過程中對溫度控制的要求很高,良好的溫度控制是PCR儀質量好壞的關鍵。?為什么要對PCR儀進行測溫1、PCR儀的溫度條件和狀態對于PCR
多重PCR(Multiplex-PCR)
一般PCR僅應用一對引物,通過PCR擴增產生一個核酸片段,主要用于單一致病因子等的鑒定.多重PCR(multiplex PCR),又稱多重引物PCR或復合PCR,它是在同一PCR反應體系里加上二對以上引物,同時擴增出多個核酸片段的PCR反應,其反應原理,反應試劑和操作過程與一般PCR相同.??? 多
重疊PCR—overlap-PCR
1、簡介?重疊PCR也是基本的PCR原理:變性-退火-延伸。不同的是在重疊PCR過程是兩個或者幾個片段重疊延伸之后,再進行指數擴增的PCR過程。 ?2、基本原理*步:PCR產生兩個或者幾個片段,這幾個片段之間必須有重疊區。?第二步:以兩個片段為例,見上圖,*步產生的兩個片段,A D鏈之間有互補,B
多重PCR(Multiplex-PCR)
一般PCR僅應用一對引物,通過PCR擴增產生一個核酸片段,主要用于單一致病因子等的鑒定.多重PCR(multiplex PCR),又稱多重引物PCR或復合PCR,它是在同一PCR反應體系里加上二對以上引物,同時擴增出多個核酸片段的PCR反應,其反應原理,反應試劑和操作過程與一般PCR相同.??? 多
PCR簡介/PCR儀
PCR的要素基本的PCR須具備PCR儀圖冊1.要被復制的DNA模板 Template2.界定復制范圍兩端的引物Primers.3.DNA聚合酶Taq. Polymearse4.合成的原料(四種脫氧核苷酸)及水。 PCR儀工作原理利用升溫使DNA變性,在聚合酶的作用下使單鏈復制成雙鏈,進而達到基因復制
Troubleshooting-for-PCR-and-multiplex-PCR
Troubleshooting discussion is based on the PCR protocol as described in the table below. All reactions are run for 30 cycles.COMPONENTVOLUMEFINALCONCE
熒光定量PCR技術的熒光定量PCR的方法
接下來我們就來了解一下熒光定量的主要方法,我們如何選擇合適的方法?熒光定量PCR所使用的熒光化學可分為兩種:熒光探針和熒光染料。而熒光定量 PCR 的方法相應的可分為特異類和非特異類兩類,特異性檢測方法是在PCR反應中利用標記熒光染料的基因特異寡核苷酸探針來檢測產物;而非特異性檢測方法是在在PCR反
普通PCR梯度PCR-原位PCR-熒光定量PCR儀的區別
普通PCR儀: 一般把一次PCR擴增只能運行一個特定退火溫度的PCR儀,稱之為普通PCR儀,也就是傳統的PCR儀。如果要用它做不同的退火溫度則需要多次運行。如;(ABI 2720) 梯度PCR儀: 一次性PCR擴增可以設置一系列不同的退火溫度條件(通常12種溫度梯度)的稱
反轉錄PCR(RTPCR,-Reversed-Transcript-PCR)
1 原理 RT—PCR是一種將cDNA合成與PCR技術結合分析基因表達的快速靈敏的方法,主要用于對表達信息進行檢測或定量分析,還可以用來檢測基因表達差異而不必構建cDNA文庫克隆cDNA。RT-PCR的模板可以為總RNA或poly(A)+選擇性RNA。逆轉錄反應可以使用逆轉錄酶,以隨機引物、ol
PCR技術(十一):PCR片段拼接的SOE和SDL方法
PCR技術(多聚酶鏈式反應)是現代分子生物學的一個巨大突破,它能在體外迅速、 大量、靈敏地擴增基因片段。可是,經PCR技術擴增的大量相關基因片段如何能有效 拼接,卻是一個很值行探討的問題。傳統的方法是引入限制性內切酶位點,這不但操 作繁雜,而有時為了構建限性位點還會影響解讀三聯密碼的正確性。本介紹兩
PCR技術(八):擴增較大片段DNA的PCR方法
一般PCR方法在擴增大片段DNA時的局限性: 通常所用的PCR方法都在兩個方面有局限,即目標產物精確程度和合成片段的大小。Pfu(Pyrococcus furiosus)DNA聚合酶,具有完整的3'外切酶校讀活性(3'-editing-exonuclease),可以將每個循環中堿基
反向PCR-(inversePCR)
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 反向PCR可用于研究與已知DNA區段相連接的未知染色體序列,因此又可稱為染色體緩移或染色體步移。這時選擇的引物雖然與核心DNA區兩末端序列互補,但兩引物3’端是相互反向的。擴增前先用限制性內切酶酶切樣品DNA,然后用DNA連接
PCR技術(十四):反向PCR
描述一種大聚合酶鏈反應(PCR)應用的方法,使在已知序列的核心區邊側的未知 DNA成幾何級數擴增。用適當的限制性內切裂解含核心區的DNA,以產生適合于PCR擴 增大小的片段,然后片段的末端再連接形成環狀分子。PCR的引物同源于環上核心區 的末端序列,但其方向性,使鏈的延長經過環上的未知區而不是分開引
反向PCR(inverse-PCR)簡介
反向PCR是一種多聚合酶鏈式反應(PCR)應用的方法,可使已知序列的核心區邊側的未知DNA成幾何級數擴增。用適當的限制性內切裂解含核心區的DNA,以產生適合于PCR擴增大小的片段,然后片段的末端再連接形成環狀分子。PCR的引物同源于環上核心區的末端序列,但其方向可使鏈的延長經過環上的未知區而不是分開
反向PCR-(inversePCR)
利用反向PCR可對未知序列擴增后進行分析,探索鄰接已知DNA片段的序列,并可將僅知部分序列的全長cDNA進行分子克隆,建立全長的DNA探針。可用于:(1)基因游走研究;(2)轉位因子研究;(3)已知序列DNA旁側病毒整合位點分析等研究。實驗方法原理反向PCR可用于研究與已知DNA區段相連接的未知染色
直接原位PCR(In-situ-PCR)
原位PCR是原位雜交細胞定位和PCR的高靈敏度相結合的技術,使得靶基因檢測有了極大的改進。此技術是在細胞(爬片、甩片或涂片)或組織(石蠟、冰凍切片)上直接對靶基因片段進行擴增,通過摻入標記基團直接顯色或結合原位雜交進行檢測的方法。一、組織切片和細胞樣品的制備試劑與配置10%福爾馬林;二甲苯;PBS操
直接原位PCR(In-situ-PCR)
原位PCR是原位雜交細胞定位和PCR的高靈敏度相結合的技術,使得靶基因檢測有了極大的改進。此技術是在細胞(爬片、甩片或涂片)或組織(石蠟、冰凍切片)上直接對靶基因片段進行擴增,通過摻入標記基團直接顯色或結合原位雜交進行檢測的方法。一、組織切片和細胞樣品的制備試劑與配置10%福爾馬林;二甲苯;PBS操
反向PCR-(inversePCR)
實驗方法原理 反向PCR是克隆T-DNA插入位點側翼DNA序列非常有效的方法。?1. ?選擇合適的限制性內切酶位點。并在T-DNA的邊界(左邊界、右邊界均可)和酶切位點附近設計引物P1、P2;2. ?回收DNA,T4連接酶連接,使酶切后的DNA片段環化;3. ?回收連接后的DNA,用引物P1、P2做