我國科學家首次繪制脊索動物完整單細胞轉錄譜系
解析細胞命運決定過程的轉錄動態是發育生物學的核心問題之一，對了解發育基本規律以及干細胞分化的轉化起到關鍵性的作用。近年來，隨著單細胞基因組學的興起，解決了細胞種類的多樣性和發育過程的不確定性帶來的難題，使得理解胚胎發育細胞譜系變成可能，為研究細胞命運決定提供了技術基礎。 近期，昆明理工大學陳凱教授牽頭的國際合作團隊在國際最著名期刊Nature雜志上，發表了題為“Comprehensive Single-cell Transcriptome Lineages of a Proto-vertebrate”（脊索動物的全面單細胞轉錄細胞譜系）的研究論文。研究團隊以脊椎動物進化關系很近的玻璃海鞘（C. intestinalis）為模型，繪制了首個涵蓋從三胚層分化到孵化全過程的脊索動物胚胎發育單細胞轉錄圖譜，并成功構建了包括神經系統在內全部組織類型的細胞分化譜系。在此基礎上，研究團隊能夠有效地探索細胞命運決定過程中的基因調控網絡，并......閱讀全文
我國科學家首次繪制脊索動物完整單細胞轉錄譜系
解析細胞命運決定過程的轉錄動態是發育生物學的核心問題之一，對了解發育基本規律以及干細胞分化的轉化起到關鍵性的作用。近年來，隨著單細胞基因組學的興起，解決了細胞種類的多樣性和發育過程的不確定性帶來的難題，使得理解胚胎發育細胞譜系變成可能，為研究細胞命運決定提供了技術基礎。 近期，昆明理工大學陳凱
我國科學家首次繪制脊索動物完整單細胞轉錄譜系
解析細胞命運決定過程的轉錄動態是發育生物學的核心問題之一，對了解發育基本規律以及干細胞分化的轉化起到關鍵性的作用。近年來，隨著單細胞基因組學的興起，解決了細胞種類的多樣性和發育過程的不確定性帶來的難題，使得理解胚胎發育細胞譜系變成可能，為研究細胞命運決定提供了技術基礎。 近期，昆明理工大學陳凱
首個海洋生物空間單細胞圖譜獲揭示
記者從深圳華大基因科技有限公司（簡稱“華大”）獲悉，3月29日，中國海洋大學聯合青島華大基因研究院，利用華大自主研發的時空組學技術Stereo-seq，結合單細胞轉錄組測序，以柄海鞘的內柱器官為研究對象，繪制了高質量的空間分辨率單細胞圖譜，全面解析了海洋動物咽部器官的細胞類型和潛在功能特征，為揭示脊
單細胞轉錄組制備儀的功能
fluidigm C1 單細胞自動制備儀用于 mRNA 測序 更完整的流程 ?-首尾相連的流程對單細胞進行全轉錄組分析 最高的通量 ?-每次運行可前所未有的平行處理 96 個單細胞 更容易的操作 ?-直接從單細胞開始，簡化的樣本制備，只需 3 小時手工操作時間，沒有 片段化和純化步驟 更節省的成
空間轉錄組和單細胞轉錄組測序聯合應用的典型案例
單細胞轉錄組測序技術的如火如荼，伴隨著空間轉錄組測序技術的蓬勃發展，可以看到，在現有的高通量檢測技術領域，這兩種技術已為科學研究的發展提供了前所未有的技術支撐。從2019年單細胞多組學被評為《Nature Methods》年度技術進展，到2020年空間轉錄組技術也被評為年度技術進展，相信在接
脊索動物的進化過程
隨后生骨節產生的髓弧片開始愈合，直至完全包裹脊索，漸漸出現椎體（centrum） 等結構，同時向動物體背側延伸，出現包裹神經管的趨勢。脊索被椎體壓迫，逐漸變細小。但是此時的“脊椎骨”細胞只是失去了原生質?的分支，同時細胞間有大量間質 ，即此時是軟骨脊椎。另外每個脊椎骨環是獨立的。由于是軟骨，此段缺少
家蠶絲腺單細胞轉錄組圖譜繪成
中新網重慶6月15日電 (記者 鐘旖)記者15日從家蠶基因組生物學國家重點實驗室(西南大學)獲悉，我國家蠶研究又有新進展。該實驗室徐漢福教授課題組近日在國際知名期刊Nature Communications《自然通訊》上發表相關主題研究論文，以單細胞分辨率揭示了家蠶絲腺的全細胞異質性及其基因轉
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞轉錄組重要研究文獻匯總（二）
4.單細胞轉錄組測序在植物領域嶄露頭角相比動物的單細胞研究，由于植物具有細胞壁的特點，使得植物的單細胞研究相比較難，但是繼2月份的擬南芥根組織單細胞轉錄組學研究[8]，本月在《Developmental Cell》上又發表了一篇基于擬南芥根組織的單細胞轉錄組學研究報道[9]。來自德國圖賓根大學植
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞轉錄組重要研究文獻匯總（一）
1.單細胞測序用于生殖領域研究持續火熱精子生成過程是一個復雜又具有嚴格分化過程的生理過程，繼18年10月份《Cell Research》上的成年人睪丸轉錄組圖譜研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生與成年人睪丸細胞單細胞水平鑒定分類[2]的步伐，本月在《Nature
中國科學家8月參與發表多篇Nature及其子刊文章
8月中國學者參與的多項研究在Nature雜志及其重要子刊上發表，其中包括一種新的鐵死亡分子調控機理、脊索動物的全面單細胞轉錄細胞譜系、植物感應鹽脅迫信號的分子機理等。 鐵死亡（ferroptosis）是一種由鐵依賴的氧化損傷造成膜脂活性氧自由基積累而引起的新型細胞死亡模式，與凋亡、壞死、自噬等
玉米單細胞轉錄組測序，11種細胞類型
近日，廣東省科學院南繁種業研究所生物育種研究室在玉米單細胞轉錄組測序研究方面取得新進展。相關研究在線發表于《作物學報》（The Crop Journal）。廣東省科學院南繁種業研究所李旭輝博士為該論文第一作者，齊永文研究員為通訊作者。玉米是全球重要的糧食和能源作物，而其產量形成的基礎依賴其特殊的根系
3月單細胞轉錄組重要研究文獻匯總
1.單細胞測序用于生殖領域研究持續火熱 精子生成過程是一個復雜又具有嚴格分化過程的生理過程，繼18年10月份《Cell Research》上的成年人睪丸轉錄組圖譜研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生與成年人睪丸細胞單細胞水平鑒定分類[2]的步伐，本月在《Nature
3月單細胞轉錄組重要研究文獻匯總
1.單細胞測序用于生殖領域研究持續火熱 精子生成過程是一個復雜又具有嚴格分化過程的生理過程，繼18年10月份《Cell Research》上的成年人睪丸轉錄組圖譜研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生與成年人睪丸細胞單細胞水平鑒定分類[2]的步伐，本月在《Nature
高通量單細胞轉錄組測序發展與展望
單細胞轉錄組測序技術這幾年的發展之快，運用之廣已眾所周知。為更好的在國內推廣該技術，也為更好的將該技術運用到廣大科研工作者的實際工作中，上海生物芯片有限公司生物信息團隊通過對該技術的整理和歸納，在《生命科學》雜志上發表了名為“高通量單細胞轉錄組測序發展與展望”綜述文章，希望能進一步提升科研工作者對該
單細胞轉錄組制備儀的技術指標
將 C1 應用于單細胞 mRNA 測序，可以從多個細胞個 體平行處理多達 96 個 cDNA 文庫，在任何 Illumina 測序儀上對 mRNA表達進行相對定量。此系統的主要特征包括： 高通量 ?-可對 96 個單細胞進行大規模平行、連貫的制備， 引入條形碼序列標記（Barcode），可將測序
單細胞轉錄組高級分析之細胞譜系分析
基于單細胞轉錄組數據的細胞軌跡分析常見形式有細胞變化軌跡分析和細胞譜系分析，在上一篇中，我們詳細介紹了常規擬時間序列分析的相關內容（具體內容查看鏈接）。在這里，我們主要就細胞譜系分析進行介紹和解讀。細胞譜系分析，最簡明的理解就是細胞領域的進化樹，通常指的是某類祖源細胞，在特定條件下，有多個發育軌跡和
脊索動物的定義和特點
脊索動物（Chordata） 是動物界最高等的一個類群，也是種類相當豐富的一個門（phylum）。它包括從低等的如現代海洋中的文昌魚、海鞘等，到較高等的如魚、蛙、龜、鳥、牛、猿猴、人類等。脊索動物的一個重要共同點就是脊索（chorda dorsalis）。一切脊索動物至少在胚胎時期都具有脊索。
單細胞轉錄組測序研究熱點和發文錦囊
從Top50期刊2000余篇文獻統計： 在剛剛發布的“十四五”規劃中，“基因與生物技術”作為前沿科技攻關領域之一。而在這個領域，近年來最具里程碑的技術突破必然不能忽略“單細胞轉錄組測序”。本文通過對PubMed數據庫中Top50期刊的共計2357篇單細胞轉錄組測序的引文進行數據分析，幫助讀者了
楊樹次生木質部單細胞轉錄組圖譜建立
近日，北京林業大學教授張德強團隊在《植物生物技術雜志》發表研究論文。該研究以楊樹為研究模式，利用單細胞測序技術、基因組分析、RNA原位雜交、愈傷組織遺傳轉化等技術建立了楊樹次生木質部的單細胞轉錄組圖譜，重構了完整的楊樹次生木質部細胞類群，鑒定了調控木質部發育過程的關鍵轉錄因子，系統解答了次生木質
同濟大學發表單細胞轉錄組研究新成果
人類大腦是極為復雜的，數十億神經元形成的龐大網絡控制著我們的行為和情感。正因如此，解析神經回路的分子基礎并不是一件容易的事。過去人們大多是在一塊腦組織上進行遺傳學和表觀遺傳學圖譜分析，但這樣的方法往往無法提供足夠的精確性。 同濟大學醫學院的研究團隊將電生理學技術與單細胞轉錄組分析結合起來，揭示
人類腦細胞的單細胞轉錄組測序研究成果
人腦是由多種不同類別細胞組成的極其復雜的器官。傳統的細胞分類方法只能根據少數已知的細胞的標記分子（marker）對細胞進行分類，對每一類細胞的認識也非常有限。斯坦福大學的著名學者Stephen Quake及其團隊利用單細胞測序技術，對466個人大腦皮層的單細胞進行了轉錄組測序，通過數據分析發
科學家繪制水稻幼苗根葉單細胞轉錄圖譜
水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄組二維UMAP圖與組織解剖圖 圖片來源：錢文峰等 中國科學院遺傳與發育生物學研究所錢文峰研究組應用單細胞轉錄組測序技術，獲得了水稻幼苗葉和根超過20萬個單細胞的轉錄組信息，利用細胞類型標記基因和原位雜交技術，對每個細胞的身份進行了鑒定，構建了水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄
研究人員繪制七鰓鰻單細胞轉錄組圖譜
雷氏七鰓鰻作為現存的無頜脊椎動物代表，是一種由無脊椎動物向脊椎動物進化的過渡類型，被視為研究脊椎動物演化的重要模式生物。近日，華大生命科學研究院聯合遼寧師范大學七鰓鰻研究中心等單位在《自然—通訊》發表最新研究成果，團隊基于華大自主研發的DNBelab C4和 DNBSEQ測序平臺，采用單細胞RNA測
單細胞轉錄組測序構建胸腺器官發生的分子圖譜
2019年10月8日，四川大學胡洪波研究組、解放軍總醫院第五醫學中心劉兵研究組與暨南大學基礎醫學院蘭雨研究組合作在Immunity雜志在線發表了題為“Single-cell RNA Sequencing Resolves Spatiotemporal Development of Pre-thy
科學家繪制水稻幼苗根葉單細胞轉錄圖譜
中國科學院遺傳與發育生物學研究所錢文峰研究組應用單細胞轉錄組測序技術，獲得了水稻幼苗葉和根超過20萬個單細胞的轉錄組信息，利用細胞類型標記基因和原位雜交技術，對每個細胞的身份進行了鑒定，構建了水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄圖譜。相關結果近日發表于《遺傳學和基因組學期刊》。水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄組
脊索動物的來源與研究進展
脊索動物的來源有兩種假說：環節來源說和棘皮來源說。由于棘皮來源說有更多的證據 ，本文按照棘皮來源說（echinoderm theory）論述。脊索動物有一些性狀與棘皮動物相同，如后口 、三胚層、兩側對稱?和分節現象?等，說明脊索動物是由棘皮動物進化而來。按照綜合進化論?可以推測某些棘皮動物胚胎期變異