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  • 如何設計嵌套PCR引物以及注意事項

    嵌套 PCR 又稱巢式 PCR(nested PCR,nPCR),是指以第一次 PCR 產物為模板直接進行第二次 PCR 擴增,以增加 PCR 的靈敏度,第二次 PCR 設計的引物在第一次所用引物對的內部,這種引物被稱為「內部」或 「嵌套」引物。 以第一次 PCR 產物為模板進行第二次 PCR 擴增,可明顯提高敏感度而對特異性無損(Albert and Fenyo 1990)。 由于嵌套 PCR 使用兩套引物對,在補充反應組分如 Tag DNA 聚合酶后就可能提髙總循環數。如果不能進行完整的嵌套 PCR (使用兩個內部引物),為提髙靈敏度和特異性,可設計半嵌套 PCR,即只用一個內部引物,與來自第一次反應的外部引物結合使用。 嵌套 PCR 的最大問題是它易受污染。必須將第一次 PCR 的反應管打開,將初級產物轉移 到新管,以進行第二次反應。其缺點也包括進行兩輪 PCR 需要額外成本和額外進行引物合成。 為了降低污染風險,可......閱讀全文

    Troubleshooting-for-PCR-and-multiplex-PCR

    Troubleshooting discussion is based on the PCR protocol as described in the table below. All reactions are run for 30 cycles.COMPONENTVOLUMEFINALCONCE

    多重PCR(Multiplex-PCR)

    一般PCR僅應用一對引物,通過PCR擴增產生一個核酸片段,主要用于單一致病因子等的鑒定.多重PCR(multiplex PCR),又稱多重引物PCR或復合PCR,它是在同一PCR反應體系里加上二對以上引物,同時擴增出多個核酸片段的PCR反應,其反應原理,反應試劑和操作過程與一般PCR相同.??? 多

    多重PCR(Multiplex-PCR)

    一般PCR僅應用一對引物,通過PCR擴增產生一個核酸片段,主要用于單一致病因子等的鑒定.多重PCR(multiplex PCR),又稱多重引物PCR或復合PCR,它是在同一PCR反應體系里加上二對以上引物,同時擴增出多個核酸片段的PCR反應,其反應原理,反應試劑和操作過程與一般PCR相同.??? 多

    PCR簡介/PCR儀

    PCR的要素基本的PCR須具備PCR儀圖冊1.要被復制的DNA模板 Template2.界定復制范圍兩端的引物Primers.3.DNA聚合酶Taq. Polymearse4.合成的原料(四種脫氧核苷酸)及水。 PCR儀工作原理利用升溫使DNA變性,在聚合酶的作用下使單鏈復制成雙鏈,進而達到基因復制

    重疊PCR—overlap-PCR

    1、簡介?重疊PCR也是基本的PCR原理:變性-退火-延伸。不同的是在重疊PCR過程是兩個或者幾個片段重疊延伸之后,再進行指數擴增的PCR過程。 ?2、基本原理*步:PCR產生兩個或者幾個片段,這幾個片段之間必須有重疊區。?第二步:以兩個片段為例,見上圖,*步產生的兩個片段,A D鏈之間有互補,B

    普通PCR梯度PCR-原位PCR-熒光定量PCR儀的區別

      普通PCR儀:   一般把一次PCR擴增只能運行一個特定退火溫度的PCR儀,稱之為普通PCR儀,也就是傳統的PCR儀。如果要用它做不同的退火溫度則需要多次運行。如;(ABI 2720)   梯度PCR儀:   一次性PCR擴增可以設置一系列不同的退火溫度條件(通常12種溫度梯度)的稱

    反轉錄PCR(RTPCR,-Reversed-Transcript-PCR)

    1 原理   RT—PCR是一種將cDNA合成與PCR技術結合分析基因表達的快速靈敏的方法,主要用于對表達信息進行檢測或定量分析,還可以用來檢測基因表達差異而不必構建cDNA文庫克隆cDNA。RT-PCR的模板可以為總RNA或poly(A)+選擇性RNA。逆轉錄反應可以使用逆轉錄酶,以隨機引物、ol

    直接原位PCR(In-situ-PCR)

    原位PCR是原位雜交細胞定位和PCR的高靈敏度相結合的技術,使得靶基因檢測有了極大的改進。此技術是在細胞(爬片、甩片或涂片)或組織(石蠟、冰凍切片)上直接對靶基因片段進行擴增,通過摻入標記基團直接顯色或結合原位雜交進行檢測的方法。一、組織切片和細胞樣品的制備試劑與配置10%福爾馬林;二甲苯;PBS操

    直接原位PCR(In-situ-PCR)

    原位PCR是原位雜交細胞定位和PCR的高靈敏度相結合的技術,使得靶基因檢測有了極大的改進。此技術是在細胞(爬片、甩片或涂片)或組織(石蠟、冰凍切片)上直接對靶基因片段進行擴增,通過摻入標記基團直接顯色或結合原位雜交進行檢測的方法。一、組織切片和細胞樣品的制備試劑與配置10%福爾馬林;二甲苯;PBS操

    反向PCR-(inversePCR)

    實驗方法原理 反向PCR是克隆T-DNA插入位點側翼DNA序列非常有效的方法。?1. ?選擇合適的限制性內切酶位點。并在T-DNA的邊界(左邊界、右邊界均可)和酶切位點附近設計引物P1、P2;2. ?回收DNA,T4連接酶連接,使酶切后的DNA片段環化;3. ?回收連接后的DNA,用引物P1、P2做

    反向PCR(inverse-PCR)簡介

    反向PCR是一種多聚合酶鏈式反應(PCR)應用的方法,可使已知序列的核心區邊側的未知DNA成幾何級數擴增。用適當的限制性內切裂解含核心區的DNA,以產生適合于PCR擴增大小的片段,然后片段的末端再連接形成環狀分子。PCR的引物同源于環上核心區的末端序列,但其方向可使鏈的延長經過環上的未知區而不是分開

    反向PCR-(inversePCR)

    ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 反向PCR可用于研究與已知DNA區段相連接的未知染色體序列,因此又可稱為染色體緩移或染色體步移。這時選擇的引物雖然與核心DNA區兩末端序列互補,但兩引物3’端是相互反向的。擴增前先用限制性內切酶酶切樣品DNA,然后用DNA連接

    反向PCR-(inversePCR)

    利用反向PCR可對未知序列擴增后進行分析,探索鄰接已知DNA片段的序列,并可將僅知部分序列的全長cDNA進行分子克隆,建立全長的DNA探針。可用于:(1)基因游走研究;(2)轉位因子研究;(3)已知序列DNA旁側病毒整合位點分析等研究。實驗方法原理反向PCR可用于研究與已知DNA區段相連接的未知染色

    菌落PCR(Colony-PCR)方法

    菌落PCR(Colony PCR)可不必提取基因組DNA,不必酶切鑒定,而是直接以菌體熱解后暴露的DNA為模板進行PCR擴增,省時少力。建議使用載體上的通用引物。通常利用此方法進行重組體的篩選或者DNA測序分析。最后的PCR產物大小是載體通用引物之間的插入片斷大小。具體方法:1、PCR混合物的制備T

    PCR技術(十四):反向PCR

    描述一種大聚合酶鏈反應(PCR)應用的方法,使在已知序列的核心區邊側的未知 DNA成幾何級數擴增。用適當的限制性內切裂解含核心區的DNA,以產生適合于PCR擴 增大小的片段,然后片段的末端再連接形成環狀分子。PCR的引物同源于環上核心區 的末端序列,但其方向性,使鏈的延長經過環上的未知區而不是分開引

    PCR

    實驗概要protocal for PCR實驗步驟PCR?1) Add the following to a microfuge tube:? ? ? ? 10 ul reaction buffer? ? ? ? 1 ul 15 uM forward primer? ? ? ? 1 ul 15 uM

    PCR

    PCRPolymerase Chain Reaction1) Add the following to a microfuge tube:10 ul reaction buffer1 ul 15 uM forward primer1 ul 15 uM reverse primer1 ul templ

    實時熒光定量PCR(realtime-PCR)

    實驗材料 細胞樣品試劑、試劑盒 RNA提取試劑盒熒光定量PCR MixTRIZOLdNTP氯仿逆轉錄酶MMLV異丙醇Taq酶DEPC水ddH2OTEMgCl2瓊脂糖溴化乙錠MOPS甲醛乙酸鈉EDTAEB溴酚蘭儀器、耗材 離心管離心機風光光度計電泳槽凝膠板Realtime PCR儀實驗步驟 一、 樣品

    PCR技術-PCR技術的應用

    一滴殘留在裙子上的精液使得美國總統Bill?Clinton不得不坦承他與白宮實習生有不正當的關系。因為他知道現在的生物科技就連一個精子也能被用來做為證據。這種將極微量的生物標本化為可供鑒定的現代技術正是PCR(Polymerase?chain?reaction)--聚合酶鏈式反應具有的特色之一。這也

    PCR技術(一):PCR技術概論

     ?PCR技術概論PCR技術簡史PCR技術的基本原理PCR反應體系與反應條件PCR反應特點PCR擴增產物的分析  聚合酶鏈反應(Polymerase Chain Reaction ,PCR)是80年代中期發展起來的體外核酸擴增技術。 它具有特異、敏感、產率高、 快速、 簡便、重復性好、易自動化等突出

    PCR技術-PCR技術的應用

      一滴殘留在裙子上的精液使得美國總統Bill Clinton不得不坦承他與白宮實習生有不正當的關系。因為他知道現在的生物科技就連一個精子也能被用來做為證據。這種將極微量的生物標本化為可供鑒定的現代技術正是PCR(Polymerase chain reaction)--聚合酶鏈式反應具有的特色之一。

    實時熒光定量PCR(realtime-PCR)

    實驗步驟一、 樣品RNA的抽提?1. ?取凍存已裂解的細胞,室溫放置5分鐘使其完全溶解。2. ?兩相分離 每1 ml的TRIZOL試劑裂解的樣品中加入0.2 ml的氯仿,蓋緊管蓋。手動劇烈振蕩管體15秒后,15到30℃孵育2到3分鐘。4℃下12 000 rpm離心15分鐘。離心后混合液體將分為下層的

    原位PCR與PCR的區別

      PCR是提取細胞或組織中的DNA進行基因擴增反應,而原位PCR是保持細胞或組織的完整性,使PCR反應體系滲透到組織和細胞中,在細胞的靶DNA所在的位置上進行基因擴增,不但可以檢測到靶DNA,而且還可以了解靶DNA存在于何種細胞中,更有利于探討靶DNA與細胞之間的關系。  PCR所采用的反應體系能

    什么是反向PCR(inverse-PCR)

    反向PCR(inverse PCR)反向PCR是一種多聚合酶鏈式反應(PCR)應用的方法,可使已知序列的核心區邊側的未知 DNA成幾何級數擴增。用適當的限制性內切裂解含核心區的DNA,以產生適合于PCR擴增大小的片段,然后片段的末端再連接形成環狀分子。PCR的引物同 源于環上核心區的末端序列,但其方

    實時熒光定量PCR(realtime-PCR)

    ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 實時熒光定量PCR技術,是指在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監測整個PCR進程,最后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。 實驗材料

    PCR技術-PCR技術的應用

      一滴殘留在裙子上的精液使得美國總統Bill Clinton不得不坦承他與白宮實習生有不正當的關系。因為他知道現在的生物科技就連一個精子也能被用來做為證據。這種將極微量的生物標本化為可供鑒定的現代技術正是PCR(Polymerase chain reaction)--聚合酶鏈式反應具有的特色之一。

    降落PCR(Touchdown-PCR)的原理?

      Touchdown PCR是指每隔一個循環降低1°C反應退火溫度,直至達到“Touchdown”退火溫度,然后以此退火溫度進行10個左右的循環。該方法最初出現是為了避開確定最佳退火溫度而進行的復雜的反應優化過程。正確和非正確退火溫度之間的任何差異將造成每個循環PCR產物量的兩倍差異(每攝氏度造成

    免疫PCR技術(ImmunoPCR)

    免疫PCR技術(Immuno-PCR)?免疫PCR方法(Immuno-PCR)是Takeshi等1992年將免疫學反應和PCR技術相結合而創建的一種新的檢測技術,具有抗原、抗體反應的特異性和PCR技術的高效性。它運用PCR的高度敏感性來放大抗原抗體反應的特異性,使實驗中只需數百個抗原分子即可檢測,甚

    什么是反向PCR(inverse-PCR)

    反向PCR(inverse PCR)反向PCR是一種多聚合酶鏈式反應(PCR)應用的方法,可使已知序列的核心區邊側的未知 DNA成幾何級數擴增。用適當的限制性內切裂解含核心區的DNA,以產生適合于PCR擴增大小的片段,然后片段的末端再連接形成環狀分子。PCR的引物同 源于環上核心區的末端序列,但其方

    降落PCR(Touchdown-PCR)的原理

    Touchdown PCR是指每隔一個循環降低1°C反應退火溫度,直至達到“Touchdown”退火溫度,然后以此退火溫度進行10個左右的循環。該方法最初出現是為了避開確定最佳退火溫度而進行的復雜的反應優化過程。正確和非正確退火溫度之間的任何差異將造成每個循環PCR產物量的兩倍差異(每攝氏度造成4倍

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