Nature子刊：長讀長DNA分析會導致錯誤
研究表明，讀取長串DNA的先進技術會產生有缺陷的數據，這些數據可能影響基因研究。 新方法可以讀取很長的“遺傳密碼”，準確率高達99.8%，然而，如果樣本是超過30億堿基的基因組，這相當于數百萬個錯誤。 這些錯誤可能錯誤地表明一個人的基因差異會增加某種疾病的風險。研究員說，這些技術產生的數據應該被謹慎解釋，因為它可能會給人類和動物的遺傳信息解析帶來問題。 以前的基因測序技術重點是讀取短串DNA，然后將這些序列拼湊在一起，耗時耗力。這種方法對讀取單基因很有用，但不適用于整個生命體研究。 愛丁堡大學的專家們研究了最近發表的三項人類基因組序列研究（都采用的長讀長技術）。他們發現，即使使用了修正軟件，這些數據仍然包含數千個錯誤。研究小組認為，如果將這些技術用于臨床研究或患者診斷，可能會產生重大影響。 文章發表在《Nature Biotechnology》雜志，愛丁堡大學Roslin研究所的Mick Watson教授說：“長讀......閱讀全文
Nature：用于蛋白質分析的單分子DNA技術
George Church 及同事開發出用于并行蛋白相互作用分析、借助用于蛋白功能分析的單分子DNA方法的一個“單分子相互作用測序”(SMI-seq)技術。 SMI-seq的工作原理是，通過核糖體顯示或酶結合將蛋白耦合到DNA識別符或“條碼”上。 這些條碼化的蛋白然后在水溶液中被一起分析，并
Nature子刊：長讀長DNA分析會導致錯誤
研究表明，讀取長串DNA的先進技術會產生有缺陷的數據，這些數據可能影響基因研究。 新方法可以讀取很長的“遺傳密碼”，準確率高達99.8%，然而，如果樣本是超過30億堿基的基因組，這相當于數百萬個錯誤。 這些錯誤可能錯誤地表明一個人的基因差異會增加某種疾病的風險。研究員說，這些技術產生的數據應
Nature：被丟失的“垃圾”DNA
在人類基因組中，基因只占據2%的序列，其余的均是由稱作非編碼DNA的遺傳物質構成。科學家們多年來一直試圖解開這一謎團：為何基因組中會存在如此龐大數量的這種遺傳物質？ 現在，一項新研究帶來了出乎意料的新發現：絕大多數的非編碼DNA也許確實并非復雜生命所需。這一研究發表在 5月12日的《自然》（N
Nature解析癌癥與“垃圾”DNA
癌癥是由多次遺傳改變（或突變）而引起的一類疾病。我們從父母那里繼承了或強或弱的形成某些癌癥類型的遺傳易感性；此外，在我們的一生中我們的細胞內也會不斷地累積新的突變。盡管已開展了很長一段時間的癌癥遺傳起源研究，直到現在研究人員仍無法估量基因組一些非編碼區域的作用。 來自日內瓦大學(UNIGE)的
Nature子刊：DNA“籠子”的妙用
來自麥吉爾大學的研究人員在最新一項研究中指出，DNA鏈制成的納米結構可以用于封裝小分子藥物，并在特定的刺激下釋放藥物，這一研究成果公布在9月1日的Nature Chemistry雜志上。 這項研究將有助于生物納米結構在藥物遞送方面的應用，也將為設計以DNA為基礎的納米材料開辟新的道路。
Nature：DNA復制過程的關鍵奧秘
最近，沙特國王科技大學（King Abdullah University of Science and Technology，KAUST）的研究人員，揭開了DNA復制過程中的一個關鍵奧秘。相關研究結果發表在最近的國際頂級學術刊物《Nature》。 在一個細菌分裂之前，它必須通過一個稱為DNA復
潘學文博士Nature解析DNA修復
生物通報道：來自貝勒醫學院的研究人員指出了一種核小體重構因子：Fun30在DNA雙鏈端粒末端切除過程中扮演的重要角色，為進一步解析DNA雙鏈斷裂修復過程提供了新思路，相關成果公布在Nature雜志上。 文章的通訊作者之一是華裔科學家潘學文博士(Xuewen Pan，生物通音譯)，其早年
Nature：撥慢人類DNA分子時鐘
人類祖先的故事一直只是寫在骨骼化石中，不過自上個世紀60年代DNA檢測介入其中，我們就了解的更加深入了，比如說一些研究結果表明，所有現代人類都源自10多萬年前生活在非洲人，但其中人類進化的一些關鍵事件與考古學相悖。 現在，考古學家和遺傳學家又開始重新解析這些事件，由于DNA突變率――基于遺
Nature－Methods發布首個DNA精確模擬平臺
模擬可以將實驗手段無法直接觀察到的活動呈現在人們眼前。科學家們日前開發了首個能夠精確模擬DNA的平臺，有助于研究DNA的結構改變，以及DNA與蛋白和藥物的互作。 分子動力學可以解析發生在不同時間尺度上的過程（從皮秒到分鐘），適用于不同規模的分析體系（從納米到米）。這一技術能用來模擬DNA的各種
Nature：從結構上揭示DNA解鏈機制
DNA是一本含有構建生命指令的分子手冊。與任何手冊一樣，如果DNA保持未打開且未讀取的狀態，那么它完全是沒有用的。為了讓DNA進行轉錄，RNA聚合酶（RNA polymerase, RNAP）必須撬開DNA的兩條鏈，這一過程稱為“解鏈”或“解旋”。圖片來自CC0 Public Domain。
Nature：從結構上揭示DNA解鏈機制
DNA是一本含有構建生命指令的分子手冊。與任何手冊一樣，如果DNA保持未打開且未讀取的狀態，那么它完全是沒有用的。為了讓DNA進行轉錄，RNA聚合酶（RNA polymerase, RNAP）必須撬開DNA的兩條鏈，這一過程稱為“解鏈”或“解旋”。 在一項新的研究中，來自美國洛克菲勒大學的研究
Nature子刊：DNA損傷應答又成禍首
密歇根大學研究發現了一個慢性腎臟病的一個新致病基因，研究指出慢性腎臟病的致病機制涉及了此前認為與之無關的DNA損傷應答，文章發表在7月8日的Nature Genetics雜志上。 “在發達國家，慢性腎臟病的發病率在持續上升，而人們還不了解這一現象的原因。慢性腎臟病已經成為影響健康的主要
Nature子刊：解密DNA的X檔案
DNA復制和DNA修復是所有生命的基本程序，也是生命科學領域的重要謎題。現在，Sheffield大學的研究團隊揭開了這個謎題的關鍵部分。他們捕捉到了前所未有的細節，闡明了細胞分裂之后從DNA雙鏈中去除分支DNA的分子機制。這項研究于六月六日發表在Nature Structural & Molec
交大Nature發文，DNA計算領域取得進展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508432.shtm上海交通大學化學化工學院/變革性分子前沿科學中心樊春海院士與王飛副教授近期發展了一種支持通用性數字計算的DNA可編程門陣列（DNA-based programmable gate ar
－Nature：DNA講述歷史－基因中發掘細節
英德研究人員在14日出版的美國《科學》雜志上報告說，絲綢之路的貿易、成吉思汗的西征乃至歐洲的殖民擴張等重大歷史事件的影響，都反映在現代人類的基因中。 研究人員利用世界各地95個民族近1500人的DNA(脫氧核糖核酸)數據，繪制出一幅過去4000年中的人類基因交流地圖，為人類通過基因分析的方
Nature子刊揭示DNA剪刀的秘密
科學家們通過低溫冰凍定格了差不多兩百個生物學結構，首次為人們展示了DNA雙鏈斷裂的整個過程。 西班牙國家癌癥研究所（CNIO）的研究團隊開發了一種特別的生物學晶體制造技術，首次觀察到了DNA雙鏈斷裂的全過程。他們通過計算機模擬，將這個微秒級的過程展現在人們眼前。這一成果發表在十二月八日的Nat
Nature：修復線粒體DNA損傷逆轉衰老
在醫療技術日趨完善的今天，健康不再是人們唯一所追求的，養生、保養等越來越成為人們津津樂道的話題，人人都想要永葆青春，而這其中最大的敵人便是“衰老”。之前《Science》雜志有報道稱衰老與線粒體DNA損傷相關，一直以來，科學家們將衰老歸因于遺傳及基因的損傷，卻并未深思過這種損傷是否可逆。而來自阿
Nature－Nanotechnology：DNA環狀分子的自主復制
生物系統中存在很多的自主復制的例子。然而，人工制造這樣的生物系統的自主復制系統卻是相當困難，這是因為生物系統很復雜。在其他領域，人類可以創造某些自我復制系統，比如磁場系統以及模塊化機器人等等。我們很少將這些人造的自我復制系統和生物系統中的自我復制系統進行比較。因而，如果能從理論上將人工的自主復制
Nature：缺乏Dna2會導致基因跳躍到DNA斷裂處
細胞具有許多保護基因組完整性的機制，包括修復在DNA復制過程中可能發生的錯誤的過程。酶Dna2參與DNA修復，但是人們對它的缺失對染色體不穩定性的影響知之甚少。在一項新的研究中，來自美國貝勒醫學院等多家研究機構的研究人員揭示出當Dna2缺失時，較小的DNA片段從整個基因組跳躍到染色體斷裂處。這種
Nature：新研究揭示DNA雙螺旋解鏈機制
在一項新的研究中，來自弗朗西斯-克里克研究所的研究人員發現了DNA的雙螺旋結構如何被打開以允許DNA復制。這一發現可能會導致進一步的研究，以更好地了解這一過程，包括它如何在諸如癌癥之類的疾病中出錯。相關研究結果于2022年6月15日在線發表在Nature期刊上，論文標題為“Mechanism o
Nature子刊：DNA堿基編輯新方法
10月，國際知名學術期刊《自然-方法（Nature Methods）》在線發表了中國科學院上海生命科學研究院/上海交通大學醫學院健康科學研究所常興研究組題為“Targeted AID -mediated mutagenesis (TAM) enablesefficient genomic diver
Nature：人類胚胎DNA編輯，NIH重申禁令了
4月22日Nature新聞首次報道，來自中國的科學家們使用CRISPR基因編輯技術將人類胚胎的致病基因移除。這一爆炸性新聞一經發布便受到了國內外科學界的廣泛關注，并引發了支持者和反對者激烈的辯論，該研究成果發表在4月18日的《Protein & Cell》雜志上。 NIH關注的是該技術的安全性
Nature子刊：DNA堿基編輯新方法
10月，國際知名學術期刊《自然-方法（Nature Methods）》在線發表了中國科學院上海生命科學研究院/上海交通大學醫學院健康科學研究所常興研究組題為“Targeted AID -mediated mutagenesis (TAM) enablesefficient genomic div
Nature遺傳學：生孩子由DNA決定？
什么時候生孩子、生幾個孩子，這些問題似乎純粹是個人選擇。牛津大學和格羅寧根大學的研究人員首次揭示了這些生殖行為的生物學基礎。他們十月三十一日在Nature Genetics雜志發表文章指出，人類生殖行為與12個DNA區域密切相關。研究人員對62個數據集進行了深入研究，分析了238,064名男女首次生
Nature子刊：組蛋白與DNA損傷修復
我們的機體是由億萬個細胞組成的，這些細胞就像是一個個繁忙的工廠，不斷有分子在其中生成、去除和修飾，這些過程不可避免的會出現錯誤。舉例來說，UV照射和許多其他因素都可能導致DNA鏈斷裂。 為了確保自己的生存和增殖，細胞采取了一些修復損傷的措施。雖然DNA修復一直是研究的熱點，但人們對這一基礎機制
Nature：DNA產前篩查擴容帶來的隱憂
報道：當22號染色體上與DiGeorge綜合癥有關的一小部分發生缺失時，會造成多種發育異常，例如語言發育遲緩、腭裂、免疫系統缺陷和心臟缺陷。不過出現這種問題的嬰兒，也有可能是健康的。 隨著非侵入性基因篩查技術的發展，各家公司正在爭先恐后的將更多染色體異常添加到自己的檢測列表中去，DiGeo
Nature：存儲細胞歷史的DNA工具包
如果你想追蹤一個人一天的活動，你可以每十分鐘給他打電話，問他在做什么。不過，更簡單的做法是為他們提供一個日志來記錄他們自己的行為。科學家們經常依靠類似于第一種方法的方法來跟蹤細胞是如何隨時間變化的;它們在設定的時間點從一組細胞中挑選細胞，并對它們的基因活動進行快照。現在，Gladstone研究所的研
Nature：DNA修復新模式解答轉錄爭議
紫外線和其他環境因素不多對我們的DNA造成破壞，可以說我們的健康在很大程度上依賴于細胞發現和修復DNA損傷的能力。紐約大學醫學院的一項新研究展示，RNA聚合酶負責在基因組中搜尋DNA損傷，并招募盟友對其進行修復。這一機制能夠有效減少突變，幫助人體控制癌癥和其他疾病。這項研究由Evgeny N
Nature子刊：組蛋白與DNA損傷修復
我們的機體是由億萬個細胞組成的，這些細胞就像是一個個繁忙的工廠，不斷有分子在其中生成、去除和修飾，這些過程不可避免的會出現錯誤。舉例來說，UV照射和許多其他因素都可能導致DNA鏈斷裂。 為了確保自己的生存和增殖，細胞采取了一些修復損傷的措施。雖然DNA修復一直是研究的熱點，但人們對這一基礎機制仍然知
Nature遺傳學：生孩子由DNA決定？
什么時候生孩子、生幾個孩子，這些問題似乎純粹是個人選擇。牛津大學和格羅寧根大學的研究人員首次揭示了這些生殖行為的生物學基礎。他們十月三十一日在Nature Genetics雜志發表文章指出，人類生殖行為與12個DNA區域密切相關。 研究人員對62個數據集進行了深入研究，分析了238,064名男