如何選擇技術方法來進行單細胞多組學研究
現階段，科學家們已經開始以單細胞分辨率組合多層信息。這些“多組學”技術可以更仔細地觀察細胞之間的可變性，更清楚地識別特定細胞及其功能。分析基因組DNA揭示了單細胞基因組，甲基化組織或染色質，而分析RNA和蛋白質則能分別產生轉錄組和蛋白質組數據。如何做出選擇有了這么多種的檢測方法可供選擇，研究人員還需要根據他們提出的生物學問題，特定技術的成本，勞動密集程度和技術要求來決定使用哪些檢測方法。“通常這需要技術專家團隊，計算人員和了解實驗系統的生物學家合作才能很好地完成這些類型項目的研究，”Bock說。如何制定技術方案，選擇方法取決于很多因素，各種技術的實驗指南存在的一大差異是如何從組織中分離單個細胞，口腔移液和連續稀釋是相對快速，簡便和低成本的方法，可以最大限度地降低RNA或蛋白質降解的風險，但它們通量也相對較低。FACS，機器人操作和微流體是高通量的，但它們很昂貴并且可能在細胞分離上沒有那么精細。成本是另一個因素。基于指南和試劑的體......閱讀全文
單細胞多組學高通量測序平臺（一）
一單細胞多組學高通量測序技術簡介通過測序手段檢測細胞多層次信息，如基因組、表觀組、轉錄組甚至蛋白組已經成為生物學研究的重要手段。幾乎一切生命體的活動都圍繞著DNA->RNA->蛋白質的過程，而現有的組學技術也圍繞這一過程獲取信息（如DNA層面的基因序列），從而解讀生物體運行機制，應用于疾病的診斷和治
單細胞多組學高通量測序平臺（二）
雖然single-cell sequencing的方法仍在不斷推出，但是目前使用最為廣泛、商業化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系統。1.2以RNA-seq為例介紹高通量單細胞測序技術單細胞測序的最主要難點是如何在短時間內分離得到最可能多的單個細胞，早期的技術代表F
單細胞多組學整合技術有了新突破
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516674.shtm近日，軍事科學院軍事醫學研究院應曉敏團隊在國際著名學術期刊《自然·生物技術》以Article類長文形式在線發表重大原創研究成果。該團隊自主研發的用于單細胞多組學數據馬賽克整合的人工智能
單細胞多組學整合技術有了新突破
近日，軍事科學院軍事醫學研究院應曉敏團隊在國際著名學術期刊《自然·生物技術》以Article類長文形式在線發表重大原創研究成果。該團隊自主研發的用于單細胞多組學數據馬賽克整合的人工智能算法取得新突破。細胞是生物體內發揮功能的基本結構單元。單細胞測序技術是近年來生命科學領域的突破性技術，能夠檢測單個細
如何選擇技術方法來進行單細胞多組學研究
現階段，科學家們已經開始以單細胞分辨率組合多層信息。這些“多組學”技術可以更仔細地觀察細胞之間的可變性，更清楚地識別特定細胞及其功能。分析基因組DNA揭示了單細胞基因組，甲基化組織或染色質，而分析RNA和蛋白質則能分別產生轉錄組和蛋白質組數據。如何做出選擇有了這么多種的檢測方法可供選擇，研究人員還需
碧迪醫療與NanoString戰略合作，推動單細胞空間多組學
2022年12月1日，上海——今日，全球領先的醫療技術公司碧迪醫療與全球空間生物學的先鋒NanoString聯合宣布，將在單細胞空間多組學領域開啟戰略合作，結合雙方優勢，為國內基礎科研、臨床研究和生物醫藥研發提供一站式的技術工具和服務。此次合作將把國際領先的單細胞多組學和空間組學技術相結合，著眼于面
Cell－Res重點論文：單細胞表觀多組學測序技術最新突破
2017年6月16日，北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
Cell－Res重點論文：單細胞表觀多組學測序技術最新突破
2017年6月16日，北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
大咖云集，共襄單細胞多組學及空間組學線上峰會
2009年，第一篇單細胞mRNA測序的文章的發表，標志著單細胞轉錄組測序的時代正式來臨。2013年，單細胞測序技術被《Nature Methods》評為年度技術。同年，《Science》將單細胞測序列為年度最值得關注的六大領域榜首，認為該技術將改變生物界和醫學界的許多領域。 目前，基于單細胞技
大咖云集，共襄單細胞多組學及空間組學線上峰會
2009年，第一篇單細胞mRNA測序的文章的發表，標志著單細胞轉錄組測序的時代正式來臨。2013年，單細胞測序技術被《Nature Methods》評為年度技術。同年，《Science》將單細胞測序列為年度最值得關注的六大領域榜首，認為該技術將改變生物界和醫學界的許多領域。 目前，基于單細胞技
聚焦單細胞多組學－布魯克宣布以1億美元現金收購Phenomex
馬薩諸塞州比勒里卡和加利福尼亞州埃默里維爾--（美國商業資訊）--布魯克公司（納斯達克股票代碼：BRKR）和PhenomeX Inc.（納斯達克股票代碼：CELL）今天宣布，他們已簽署最終協議，布魯克將以每股1.00美元的價格以全現金交易收購PhenomeX。擬議的收購對PhenomeX的總股權
2023（第六屆）單細胞多組學研究與臨床應用峰會
為響應我國加大發展前沿生物技術創新發展的政策號召，生物谷、梅斯醫學聯合有關單位將于2023年9月14-15日舉辦“2023（第六屆）單細胞多組學研究與臨床應用峰會”。 本次大會誠邀臨床應用科學家、科研人員及企業研究人員共同探索單細胞多組學的技術發展前景，助力單細胞多組學技術快速進入臨床應用，推
北京基因組所開發新型高通量單細胞多組學新技術
單細胞測序已成為生物醫學領域的關鍵共性技術。然而，由于缺乏高效的手段降低“假單細胞率”，主流微流控平臺的單通道細胞通量通常在1萬細胞以下，空載率達到90%以上，且成本高昂，限制了對數百萬個細胞或上千例樣本的人群隊列進行大規模研究。 近日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）蔣嵐研究組
單細胞多組學測序公司Mission－Bio獲7千萬美元C輪融資
總部位于加州的美國基因診斷初創公司Mission Bio宣布已經獲得了新一輪7000萬美元的C輪融資，由Novo Growth領投，Soleus Capital和現有投資者Mayfield、Cota和Agilent跟投。歷經三次融資，目前該公司共融得1.2億美元。Mission Bio成立于2012
我國科學家自主研發，單細胞多組學整合技術有了新突破
近日，軍事科學院軍事醫學研究院應曉敏團隊在國際著名學術期刊《自然·生物技術》以Article類長文形式在線發表重大原創研究成果。該團隊自主研發的用于單細胞多組學數據馬賽克整合的人工智能算法取得新突破。 細胞是生物體內發揮功能的基本結構單元。單細胞測序技術是近年來生命科學領域的突破性技術，能夠檢
Webinar單細胞和空間多組學微流控樣品制備和質譜分析
2022年CASMS系列網絡研討會——推進單細胞和空間多組學微流控樣品制備和質譜分析美國東部時間2022年8月18日12：00-13：00北京時間2022年8月19日0：00-1：00注冊鏈接:https://casms.org/index.php/webinar演講者? ? ? 單細胞蛋白
北大湯富酬課題組發表單細胞表觀多組學測序技術新成果
2017年6月16日，北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
測序技術再現新進展，已開發基于單分子測序平臺的單細胞多組學測序技術
單細胞多組學測序技術是指對一個單細胞同時檢測多個組學層面（例如基因組、表觀基因組和轉錄組）的測序技術。這類技術可以更系統、全面地探索細胞異質性以及同一個細胞內的不同組學層面之間的互動關系，有利于更深入地解析復雜的生理、病理過程中細胞類型特異性的分子調控機制1, 2。2019年，Nature Me
中藥多組學研究取得重大突破
中藥材基因資源是國家戰略資源，其挖掘、保護和利用是中藥資源可持續發展的首要關鍵。近期，中國中醫科學院中藥研究所團隊基于多組學技術成功揭示了紫蘇、黃連、大青葉等藥用植物的基因遺傳背景，相關研究成果以三篇研究論文形式連續發表在國際著名權威學術期刊《自然通訊》上，引起了國際學術界對我國中藥應用基礎性研
中藥多組學研究取得重大突破
中藥材基因資源是國家戰略資源，其挖掘、保護和利用是中藥資源可持續發展的首要關鍵。近期，中國中醫科學院中藥研究所團隊基于多組學技術成功揭示了紫蘇、黃連、大青葉等藥用植物的基因遺傳背景，相關研究成果以三篇研究論文形式連續發表在國際著名權威學術期刊《自然通訊》上，引起了國際學術界對我國中藥應用基礎性研
首個菊科多組學數據平臺AMIR發布
10月8日，華中農業大學果蔬園藝作物種質創新與利用全國重點實驗室、藥用植物資源可持續利用團隊梅之南教授和楊慶勇教授課題組，發布了首個專門面向菊科植物的多組學數據庫平臺——Asteraceae Multi-omics Information Resource（AMIR）。該平臺涵蓋了74種菊科植物的多
基于生成式人工智能的新算法MIDAS，實現單細胞多組學數據的馬賽克整合
目前，單細胞多組學技術日益成熟，測序數據也在不斷增長。然而，不同組學組合、不同測序技術、不同測序樣本的“馬賽克”式單細胞數據的整合是該領域的巨大挑戰。 2024年1月23日，軍事醫學研究院應曉敏團隊和伯曉晨團隊在 Nature Biotechnology 期刊發表了題為：Mosaic inte
植物多組學比較和進化研究平臺發布
近日，西北農林科技大學生命科學學院馬闖教授團隊發布了植物多組學數據跨物種比較和進化研究的在線分析平臺，相關成果發表在Molecular Biology and Evolution上。進化是植物性狀遺傳多樣性和適應生存環境的基礎，而基因變異是物種進化的源動力。隨著后基因組時代高通量技術的發展和應用，在
CASMS分論壇：多組學整合與大數據
分析測試百科網訊 美國東部時間2021年8月9日-13日，首屆美國華人質譜學會（CASMS）學術研討會暨展覽會在Gather.Town隆重舉行。在13日“Multi-omics Integration and Big Data”分論壇中，哈沃德醫學院Steven Gygi博士、太平洋西北國家實驗
首個免疫衰老多組學數據庫設立
記者12月17日從中國科學院基因組所（國家生物信息中心）了解到，該所研究員張維綺團隊、鮑一明團隊與中國科學院動物研究所研究員劉光慧、曲靜研究組合作，建立了免疫衰老領域首個多組學數據庫Immunosenescence Inventory，旨在為整合和分析與免疫衰老相關數據提供一體化平臺。隨著全球人口老
解析腫瘤HiC多組學研究策略
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象，利用高通量測序技術，結合生物信息分析方法，研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系，獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-S
多組學研究助力玉米種質資源創新利用
近日，中國農業大學農學院、國家玉米改良中心王向峰教授在《科學通報》（英文版）（Science Bulletin）上發表了方法學研究論文。 農作物種質資源精準鑒定與基因挖掘是從源頭上實現種業創新、保障糧食安全的根本路徑，是生物育種重點攻關的關鍵技術之一。全基因組關聯
多組學研究助力玉米種質資源創新利用
近日，中國農業大學農學院、國家玉米改良中心王向峰教授在《科學通報》（英文版）（Science Bulletin）上發表了方法學研究論文。 農作物種質資源精準鑒定與基因挖掘是從源頭上實現種業創新、保障糧食安全的根本路徑，是生物育種重點攻關的關鍵技術之一。全基因組關聯分析（GWAS）是通過推斷
多組學手段揭示苦蕎“不怕冷”的奧秘
苦蕎 ? ? ? 董玉梅攝低溫脅迫是影響植物生化、分子、代謝調控的主要環境因素之一。長期在暴露于低溫而引導植物脅迫耐受性的提高，即耐寒性或冷馴化。闡明植物對低溫響應的分子機制對育種和基因發掘至關重要。有研究表明苦蕎可以通過增加花色苷和原花青素的積累增強其耐寒性。苦蕎的每個器官幾乎都含有蘆丁，包括種子
空間多組學質譜技術研討會（2023）
空間多組學技術結合了組學技術（如基因組學、轉錄組學、蛋白質組學、金屬組學等）和組織學技術，有助于更好地理解生物體內各種生物分子與金屬元素在空間上的分布、相互作用及其對生理功能和疾病發生發展的影響。 質譜成像技術是近年來快速發展的空間多組學技術之一，可以在組織的空間層面上同時測定多種生物分子（如