華人科學家Nature公布核小體分布圖
來自美國西北大學分子生物學系，統計系等處的研究人員發表了題為“A map of nucleosome positions in yeast at base-pair resolution”的文章，通過建立了一種新方法，在全基因組范圍內分析核小體分布的位置，這將有助于揭示體內與轉錄相關的核小體作用機制。相關成果公布在6月28日Nature雜志上。 文章的通訊作者是西北大學統計系王吉平(Ji-Ping Wang，音譯)博士，王博士2003年畢業于賓州州立大學，主要研究方向包括生物信息學，基因組學等方面。 真核基因組在活體中不以裸露DNA形式存在，但在被稱為染色質的蛋白-DNA復合物中是以裸露DNA形式存在的。其中的核小體能幫助扭曲或者封閉基因組DNA，影響DNA片段與DNA結合蛋白的接觸，而且核小體的精確位置也會影響染色質纖維的結構。核小體中即使是單個堿基對位置的變化，都會改變染色質構象，以及蛋白結合動力......閱讀全文
染色質蛋白非組蛋白的介紹
非組蛋白主要是指與特異DNA序列相結合的蛋白質,所以又稱序列特異性DNA結合蛋白（sequence specific DNA binding protein)。利用凝膠延滯實驗（gel retardation assay）,可以在細胞抽提物中進行檢測。首先制備一段帶有放射性標記的已知特異序列的D
染色質非組蛋白鋅指模式簡介
負責 5S RNA、tRNA 和部分 snRNA 基因轉錄的RNA聚合酶Ⅲ所必須的轉錄因子。TFⅢ A 是首先被發現的鋅指蛋白,由344個氨基酸組成。TFⅢ A 含有9個有規律的鋅指重復單位,每個單位30個氨基酸殘基,其中一對半胱氨酸和一對組氨酸與Zn2+形成配位鍵。每個鋅指單位是一個DNA結合
染色質蛋白組蛋白的相關介紹
組蛋白是構成真核生物染色體的基本結構蛋白,富含帶正電荷的Arg和Lys等堿性氨基酸,等電點一般在pH10.0以上,屬堿性蛋白質,可以和酸性的DNA緊密結合,而且一般不要求特殊的核苷酸序列。 用聚丙烯酰胺凝膠電泳可以區分5種不同的組蛋白：H1、H2A、H2B、H3和H4。幾乎所有真核細胞都含有這
簡述染色質蛋白非組蛋白的特性
①酸堿性：組蛋白是堿性的,而非組蛋白則大多是酸性的。 ②多樣性：非組蛋白占染色質蛋白的60%~70%,不同組織細胞中其種類和數量都不相同,代謝周轉快。包括多種參與核酸代謝與修飾的酶類如DNA聚合酶和RNA聚合酶、HGM蛋白（high mobility group protein）、染色體支架蛋
染色質非組蛋白HMG框結構模式
在發現一組豐富的高速泳動族蛋白（high mobility group protein）以后,首先命名HMG框結構模式。該結構由3個α螺旋組成 boomerang-shaped 結構模式,具有彎曲DNA的能力。因此,具有HMG框結構的轉錄因子又稱為“構件因子（architectural fact
華人科學家Nature公布核小體分布圖
來自美國西北大學分子生物學系，統計系等處的研究人員發表了題為“A map of nucleosome positions in yeast at base-pair resolution”的文章，通過建立了一種新方法，在全基因組范圍內分析核小體分布的位置，這將有助于揭示體內與轉錄相關的核
染色質非組蛋白亮氨酸拉鏈模式
在構建轉錄復合物過程中,普遍涉及蛋白與蛋白之間的相互作用,形成二聚體是識別特異DNA序列蛋白的相互作用的共同原則,亮氨酸拉鏈就是富含Leu殘基的一段氨基酸序列所組成的二聚化結構。這類序列特異性DNA結合蛋白家族,包括酵母的轉錄激活因子（GCN4）、癌蛋白Jun、Fos、Myc以及增強子結合蛋白（
染色質蛋白非組蛋白α螺旋轉角α螺旋模式介紹
這是最早在原核基因的激活蛋白和阻抑物中發現的。迄今已經在百種以上原核細胞和真核生物中發現這種最簡單、最普遍的DNA結合蛋白的結構模式。這種蛋白與DNA結合時,形成對稱的同型二聚體（symmetric homodimer）結構模式。構成同型二聚體的每個單體由20個氨基酸的小肽組成α螺旋-轉角-α螺
染色質非組蛋白螺旋環螺旋結構模式
HLH這一結構模式廣泛存在于動、植物DNA結合蛋白中。HLH由40~50個氨基酸組成兩個兩性α螺旋,兩個α螺旋中間被一個或幾個β轉角組成的環區所分開。每個α螺旋由15~16個氨基酸殘基組成,并含有幾個保守的氨基酸殘基。具有疏水面和親水面的兩性α螺旋有助于二聚體的形成。α螺旋鄰近的肽鏈 N 端也有
抗組蛋白抗體的基本信息介紹
組蛋白是核內最豐富的蛋白質，它與DNA構成的復合物稱為染色質。染色質最基本的亞單位結構是核小體(nucleosome)，它由146個堿基對組成的DNA鏈纏繞8個組蛋白分子(2個H2A-H2B雜二聚體之間夾著2個雜二聚體H2-H4)2圈構成的核心和核心外的組蛋白H1與連結DNA(約60個堿基對)組
單分子力譜定量解析泛素修飾對基因調控研究獲進展
人類基因組包含大約31.6億個DNA堿基對，線性DNA分子作為龐大遺傳信息的載體一般都比較長（人類一條染色體的DNA長度約為2米），生命通過組蛋白將DNA分子有序組織壓縮形成微米級別的染色質存儲到細胞核中。核小體是染色質的結構和功能的最基本單元，其中DNA纏繞在組蛋白巴聚體周圍約兩圈，完成對DN
Polycomb組蛋白與染色質相互作用的關鍵機制
2021年6月，Genome Research雜志在線發表了法國巴黎薩克雷大學植物科學研究所Moussa Benhamed教授為通訊作者題為“Polycomb-dependent differential chromatin compartmentalization determines gen
NatureCell兩大頂級雜志獲表觀遺傳研究突破
來自美國賓州大學與西北大學的兩個研究組，近期分別在Nature和Cell這兩大頂級期刊上發表文章，分別取得了表觀遺傳學核小體研究方面的突破性進展，這兩項的關鍵點都來自其重要的研究新技術――賓州大學的研究人員發展了超高分辨率ChIP-exo技術，而西北大學的研究人員則研發了一種基于改造后組蛋白的化
什么是堿基對？
堿基對，是一對相互匹配的堿基（即A—T， G—C，A—U相互作用）被氫鍵連接起來。它常被用來衡量DNA和RNA的長度（盡管RNA是單鏈）。它還與核苷酸互換使用，盡管后者是由一個五碳糖、磷酸和一個堿基組成。 堿基對是形成DNA、RNA單體以及編碼遺傳信息的化學結構。組成堿基對的堿基包括A、G、T
常染色質的結構簡介
常染色質的結構類似于未折疊的一串珠子中間被一根細繩穿過，這其中的珠子代表核小體結構。每個核小體由八個蛋白質單體組成，這些蛋白質叫做組蛋白，每個組蛋白單體周圍有147個堿基對長度的雙鏈DNA環繞；在常染色質中，DNA在組蛋白上的包裹是較為松散的，從而其上的原始DNA序列是暴露在外可被讀取的。每一個
常染色質的結構介紹
常染色質的結構類似于未折疊的一串珠子中間被一根細繩穿過，這其中的珠子代表核小體結構。每個核小體由八個蛋白質單體組成，這些蛋白質叫做組蛋白，每個組蛋白單體周圍有147個堿基對長度的雙鏈DNA環繞；在常染色質中，DNA在組蛋白上的包裹是較為松散的，從而其上的原始DNA序列是暴露在外可被讀取的。每一個處于
常染色質的結構特點
常染色質的結構類似于未折疊的一串珠子中間被一根細繩穿過，這其中的珠子代表核小體結構。每個核小體由八個蛋白質單體組成，這些蛋白質叫做組蛋白，每個組蛋白單體周圍有147個堿基對長度的雙鏈DNA環繞；在常染色質中，DNA在組蛋白上的包裹是較為松散的，從而其上的原始DNA序列是暴露在外可被讀取的。每一個處于
物理所SM1組基于單分子力譜技術解析泛素修飾對基因調控
人類基因組包含大約31.6億個DNA堿基對，線性DNA分子作為龐大遺傳信息的載體一般都比較長（人類一條染色體的DNA長度約為2米），生命通過組蛋白將DNA分子有序組織壓縮形成微米級別的染色質存儲到細胞核中。核小體是染色質的結構和功能的最基本單元，其中DNA纏繞在組蛋白巴聚體周圍約兩圈，完成對DN
單分子力譜定量解析泛素修飾對基因調控研究的新進展
人類基因組包含大約31.6億個DNA堿基對，線性DNA分子作為龐大遺傳信息的載體一般都比較長（人類一條染色體的DNA長度約為2米），生命通過組蛋白將DNA分子有序組織壓縮形成微米級別的染色質存儲到細胞核中。核小體是染色質的結構和功能的最基本單元，其中DNA纏繞在組蛋白巴聚體周圍約兩圈，完成對DN
基因沉寂的作用
這個“原則”就是目前尚沒有真正完全清楚的“組蛋白密碼”（Histone Code)。能夠與甲基化組蛋白結合的蛋白質有sir1/2/3/4，這是一組被稱為"Silencing Informative Repressor"的蛋白，其中，Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶，而Sir1/3/4則負責與甲基化
關于基因沉寂的作用介紹
這個“原則”就是目前尚沒有真正完全清楚的“組蛋白密碼”（Histone Code)。能夠與甲基化組蛋白結合的蛋白質有sir1/2/3/4，這是一組被稱為"Silencing Informative Repressor"的蛋白，其中，Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶，而Sir1/3/4則負責與甲
基因沉寂的作用
這個“原則”就是目前尚沒有真正完全清楚的“組蛋白密碼”(Histone Code)。能夠與甲基化組蛋白結合的蛋白質有sir1/2/3/4,這是一組被稱為"Silencing Informative Repressor"的蛋白,其中,Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶,而Sir1/3/4則負責與甲基化
基因沉寂的作用
這個“原則”就是目前尚沒有真正完全清楚的“組蛋白密碼”（Histone Code)。能夠與甲基化組蛋白結合的蛋白質有sir1/2/3/4，這是一組被稱為"Silencing Informative Repressor"的蛋白，其中，Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶，而Sir1/3/4則負責與甲基化
關于組蛋白八聚體的特點介紹
這種集合是將DNA的166對堿基對以1.75左手超螺旋形圍在這個蛋白質線軸。連接組蛋白H1將核小體核心顆粒與DNA的進入位點及E位點結合,因而可以將DNA緊扣在位,并且能容許形成更高層次的結構。最基本的形狀為一個10納米的纖維或一連串的珠子。這涉及將在每一個核小體之間約50對的DNA堿基對圍在這
染色體的類型介紹
原核生物細菌和古細菌通常具有單個環狀染色體，但染色體大小存在顯著變異。大多數細菌染色體的大小從13萬個堿基對到 1400 萬個堿基對不等? 。疏螺旋體屬的螺旋體是個例外，僅含有單一線性染色體 。序列結構與真核生物相比，原核染色體含有更少的基于序列的結構。細菌通常具有一個復制起點，而一些古菌含有多個復
千堿基對的結構
千堿基對為kbp，或簡寫作kb（對于雙鏈核酸、單鏈核酸，kb指千堿基）。是DNA片段的長度單位，一千個堿基對相當于兩千個核苷酸。
千堿基對的定義
千堿基對kilobase (kb)定義：DNA片段的長度單位，一個千堿基對相當于2000個核苷酸。
細胞化學基礎堿基對
堿基對是形成DNA、RNA單體以及編碼遺傳信息的化學結構。組成堿基對的堿基包括A、G、T、C、U。嚴格地說，堿基對是一對相互匹配的堿基(即A：T，G：C，A：U相互作用)被氫鍵連接起來。然而，它常被用來衡量DNA和RNA的長度(盡管RNA是單鏈)。它還與核苷酸互換使用，盡管后者是由一個五碳糖、磷酸和
堿基對的組成結構
堿基對，是一對相互匹配的堿基（即A—T， G—C，A—U相互作用）被氫鍵連接起來。它常被用來衡量DNA和RNA的長度（盡管RNA是單鏈）。它還與核苷酸互換使用，盡管后者是由一個五碳糖、磷酸和一個堿基組成。
組蛋白分子伴侶DAXX和染色質重塑蛋白ATRX相互作用模式
近日，中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所陳勇研究組的最新研究成果，以Structural basis for DAXX interaction with ATRX為題，發表在Protein & Cell上，該成果揭示了組蛋白分子伴侶DAXX蛋白與染色質重塑蛋白ATRX相互作用