NatureMethods：全面檢測CRISPR脫靶效應的新策略
CRISPR/Cas9基因組編輯目前正應用得如火如荼，但若要轉化到臨床應用，準確檢測脫靶效應則是必不可少的。近日，麻省總醫院的研究人員開發出一種新策略，能夠鑒定全基因組范圍的CRISPR/Cas9脫靶突變。 之前，在全基因組范圍鑒定脫靶效應的細胞方法也時有報道，但這些方法可能錯過低頻率的脫靶突變，而且高效轉染的要求也限制了其應用。相比之下，體外篩查策略則具有一定的優勢。它不需要高效轉染，避免了細胞適應性的影響。此外，活性核酸酶的濃度可以盡可能高，將低頻率突變一網打盡。 在這篇周一發表于《Nature Methods》的文章中，麻省總醫院和哈佛大學的研究人員介紹了一種新的體外篩查方法CIRCLE-seq。他們認為，這種方法在鑒定全基因組的CRISPR/Cas9脫靶突變上，比現有的細胞或生化方法表現更佳。 “與之前的體外方法相比，我們表明CIRCLE-seq可使用廣泛普及的新一代測序技術，且不需要參考基因組序列，”作者在文......閱讀全文
基因測序技術升級檢測CRISPR脫靶效應
政府主導致效率低 2014年末，習近平總書記前往鎮江視察時發表過如下言論：“一些大醫院始終處于‘戰時狀態’的狀況需要改觀。”新醫改啟動至今已是第七年，但因患者在大醫院高度擁堵造成的看病難、看病貴卻絲毫不見緩解，反而有所加劇，習總書記所指出的，正是這一輪醫療衛生體制改革最亟需解決的問題。 相關
全基因組測序揭示CRISPR－/－Cas9在葡萄上的脫靶效應
近日，Horticulture Research在線發表了西北農林科技大學葡萄種質資源與育種團隊王西平課題組題為“Whole genome sequencing reveals rare off-target mutations in CRISPR/Cas9-edited grapevine”的
盤點全基因組檢測CRISPR脫靶位點的幾種重要技術
在2013年，來自麻省總醫院的研究人員發現使用CRISPR-Cas RNA引導性核酸酶的一個重要局限：會在預期靶點以外的位點上生成多余的DNA突變。此后陸續有研究直接說明了CRISPR/Cas9存在嚴重的脫靶性，即該技術可以發生非特異性切割，引起基因組非靶向位點的突變，這樣會造成研究結果的不確定
Nature－Methods：全面檢測CRISPR脫靶效應的新策略
CRISPR/Cas9基因組編輯目前正應用得如火如荼，但若要轉化到臨床應用，準確檢測脫靶效應則是必不可少的。近日，麻省總醫院的研究人員開發出一種新策略，能夠鑒定全基因組范圍的CRISPR/Cas9脫靶突變。 之前，在全基因組范圍鑒定脫靶效應的細胞方法也時有報道，但這些方法可能錯過低頻率的脫靶突
CRISPR實驗指南：如何檢測CRISPR脫靶突變（一）
張鋒實驗室的一位研究生：Winston Yan的項目就是利用CRISPR-Cas9基因組編輯系統的一個突變來敲除調控小鼠膽固醇的基因。“最終的目的是為治療應用鋪平道路，”Yan說，他最近完成了他的研究生工作，同時也第一次遇到CRISPR脫靶效應的問題。 CRISPR能幫助研究人員快速有效地對基
DISCOVERSeq檢測CRISPR脫靶效應的新方法
自從CRISPR基因組編輯技術于2012年發明以來，它已經顯示出治療許多難治性疾病的巨大希望。然而，科學家們一直在努力在治療相關的細胞類型中鑒定潛在的脫靶效應，這仍然是將治療方法轉移到臨床應用的主要障礙。如今，在一項新的研究中，來自美國加州大學伯克利分校、加州大學舊金山分校、格拉德斯通研究所和瑞
CRISPR技術脫靶效應有了解決之道
CRISPR基因編輯技術廣受爭議的最大副作用——脫靶效應有了解決辦法。據物理學家組織網12日報道，CRISPR-Cas9技術發明人之一詹妮弗·杜德納參與的研究團隊證實，抗CRISPR蛋白能將CRISPR導致的脫靶效應降低四分之一，其中一種名叫“AcrllA4”的蛋白甚至能將脫靶效應發生率減少4倍
證實CRISPR/Cpf1基因組編輯幾乎沒有脫靶效應
作為CRISPR基因組編輯的新工具，Cpf1因其不同于Cas9的性質而引起人們的廣泛關注。它只需要單個RNA，即crRNA（CRISPR RNA），因而組裝更加簡單；它的交錯切割模式可能促進利用所需的序列替換現有的DNA序列；它識別富含胸腺嘧啶的DNA序列，而且相對于Cas9識別的富含鳥嘌呤的序
CRISPR女王最新發現：一種抗CRISPR蛋白能減少脫靶效應
去年12月，兩組科學家發表了幾種可以阻斷CRISPR-Cas9活性蛋白質的重要發現，而7月12日，研究人員又再次指出，利用其中的一種抗CRISPR蛋白能減少Cas9介導的人類細胞基因組編輯中的脫靶效應。 這一研究成果公布在Science Advances雜志上，由美國加州大學伯克利分校Jenn
CRISPR女王最新發現：一種抗CRISPR蛋白能減少脫靶效應
去年12月，兩組科學家發表了幾種可以阻斷CRISPR-Cas9活性蛋白質的重要發現，而7月12日，研究人員又再次指出，利用其中的一種抗CRISPR蛋白能減少Cas9介導的人類細胞基因組編輯中的脫靶效應。 這一研究成果公布在Science Advances雜志上，由美國加州大學伯克利分校Je
三篇Nature子刊：如何克服CRISPR的脫靶效應
規律成簇的間隔短回文重復CRISPR與內切酶Cas9的組合，原本是細菌抵御病毒的重要武器，現在這一組合已經成為了一個通用工具，被用于在真核生物中進行位點特異性的基因組修飾。 最近Nature Biotechnology雜志上發表了三個研究團隊的研究成果，研究人員深入分析了CRISPR的脫靶效應
DISCOVERSeq，一種檢測CRISPR脫靶效應的新方法
自從CRISPR基因組編輯技術問世以來，它已經顯示出了治療許多棘手疾病的巨大希望。然而，科學家們一直在努力確定與治療有關的細胞類型的潛在非靶向效應，這仍然是臨床轉化的主要障礙。現在，Gladstone研究所和創新基因組學研究所（IGI）的一組科學家與AstraZeneca合作開發了一種可靠的方法
Nature?Methods：兩種新型?CRISPR?脫靶效應的分析方法
昨日，在 Nature Methods 同時刊登的兩篇研究中，發表了兩種分析 CRISPR/Cas -9 基因組編輯脫靶效應的新方法。其中一種方法可以鑒定細胞類型特異性 SNP 相關的脫靶突變，另一種則可以檢測潛在脫靶切割位點。 第一項研究中，來自麻省綜合醫院（MGH）和哈弗大學的研究人員開發
本周Science期刊發布－檢測CRISPR脫靶效應新方法DISCOVERSeq
本周又有一期新的Science期刊（2019年4月19日）發布，它有哪些精彩研究呢？讓小編一一道來。圖片來自Science期刊。 1.Science：開發出一種檢測CRISPR脫靶效應的新方法---DISCOVER-Seq doi:10.1126/science.aav9023； doi:1
CRISPR導致突變－從而大范圍“脫靶”？
CRISPR基因編輯會導致數以百計意想不到的突變？5月30日，《自然-方法》刊登的一篇通信文章顯示，來自美國哥倫比亞大學等研究機構的科學家確認通過CRISPR基因編輯技術成功修復了導致兩只小鼠失明的基因后，經全基因組測序發現小鼠體內有超過1500個單核苷酸發生突變，并有百個以上的位點發生發生了大片段
Editas創始人再破“脫靶效應”，向精準CRISPR時代邁進！
在CRISPR系列的基因編輯系統中，Cas9酶是一個非常關鍵的組成部分，更是“元老級”的成員，但是CRISPR/Cas9的脫靶效應是一直急需攻克的難題。在CRISPR技術向醫學臨床不斷轉化的過程中，科學家們正想法設法的解決這一重大技術難題，希望形成更精準的基因編輯系統。 1月6日，發表在《自然
Nat－Meth:－新方法終結CRISPRCAS9爭論
基因編輯是近年來發展起來的可以對基因組完成精確修飾的一種技術，可完成基因定點InDel突變、敲入、多位點同時突變和小片段的刪失等。這項革命性的技術可讓研究人員精確地改變基因組，從而有著廣泛應用，包括基礎研究、生物技術和人類基因療法。 自從基因組編輯技術引爆科學界熱潮以來，就有許多研究小組發現具
“基因魔剪”有了脫靶突變檢測系統
據英國《自然》雜志9月12日在線發表的一項基因編輯學研究，歐洲與美國科學家團隊報告稱：針對CRISPR-Cas9基因組編輯的全基因組脫靶效應的高效檢測系統，在小鼠身上完成了測試。該研究成果將促進基因組編輯從研究到臨床的轉化。 CRISPR-Cas9基因組編輯技術有“基因魔剪”之稱，被認為是人類
應用慢病毒載體檢測CRISPRCAS9和TALEN脫靶
近日，國際生物學期刊nature biotechnology在線刊登了美國科學家的一項最新研究成果，他們應用整合酶缺陷的慢病毒載體（IDLV）檢測CRISPR-CAS9和TALEN對基因組造成的脫靶效應，最低可檢測1%的脫靶頻率。這項研究或對推廣CRISPR-CAS9和TALEN技術，保證基因操
先進科學：基因編輯如何擺脫“脫靶”困擾
基因組編輯技術是當前生命科學研究的前沿領域。在多種不同的基因組編輯方法，以CRISPR/Cas9系統最為便捷、高效，應用也最廣泛。 但CRISPR技術存在的脫靶效應依舊是影響其能否廣泛應用的主要限制因素，如何正確評估、檢測脫靶效應，并提出相應的策略降低脫靶效應，是當前基因編輯研究領域的重要研究
Science：張鋒再發重大突破，新成果“劍指”CRISPR脫靶效應！
2015年，基因編輯這個詞可謂是最活躍的科技詞匯之一；CRISPR作為最受歡迎的基因編輯神器更是突破不斷。雖然今年它最終沒能摘得諾獎，但是技術的一次次更新和突破讓科學界根本無法忽視這一技術的巨大實力和無限潛力。 Cas9酶是基因編輯系統中一個非常關鍵的組成部分，而脫靶效應一直是CRISPR技術
基因編輯新進展:－關鍵酶消除CRISPRCas技術脫靶效應
近來全球興起的CRISPR-Cas編輯技術是基于細菌和古細菌天然防御機制的一項技術。與真核生物體內的RNA干擾過程極為相似，CRISPR-Cas 技術能夠特異性切割核酸片段，不過該技術也有可能發生非特異性切割，引起基因組非靶向位點的突變，這一問題越來越受到科研人員的關注。 CRISPR
完美基因編輯:－新方法可消除CRISPRCas的脫靶效應
前段時間，麻省理工的研究人員發現基因編輯工具CRISPR-Cas系統具有脫靶效應。近日，這個研究小組的負責人張峰教授表示，他們已經找到了影響CRISPR-Cas系統精確度的關鍵因素，這一發現將使該系統在人類細胞中的應用更安全。目前，這一研究發表在Nature Biotechnology上。
Nature子刊“大發現”：CRISPR可引發數百種“意外突變”！
問世短短幾年的CRISPR儼然已成為生命科學領域最耀眼的“明星”之一。除了作為常規的科研工具，這一被稱為“魔剪”的基因編輯工具還被寄予了用于疾病治療的厚望。目前，來自全球各國的科學家們正在開展CRISPR用于多種疾病治療的研究，包括癌癥、艾滋病、失明、免疫缺陷病癥、杜氏肌營養不良癥、鐮狀細胞病等
CRISPR遭遇迄今最大安全性質疑
據《新科學家》雜志網站5月30日報道，美國科學家通過全基因組測序發現，CRISPR基因編輯技術能引起基因組內大量非靶標區內的基因發生突變，包括1500多種單核苷酸突變和100多種大片段序列的敲入和敲除。發表在《自然·方法學》雜志上的這一論文表明，CRISPR的脫靶效應可能遠超人們此前的估計。
研究發現CRISPRCas9在非人靈長類中不會導致明顯脫靶效應
CRISPR-Cas9基因編輯系統已被廣泛應用于生物和醫學研究，研究人員正在嘗試利用它進行人類疾病的基因治療，然而，它在臨床前的安全性方面還缺少全面評估。記者從中科院昆明動物研究所了解到，近期該所多個課題組合作，發現這一基因編輯系統在非人靈長類中不會導致明顯脫靶效應，因而有較高安全性。研究成果發
CRISPRCas9基因編輯系統在靈長類中不會導致明顯脫靶效應
CRISPR-Cas9基因編輯系統已被廣泛應用于生物和醫學研究，研究人員正在嘗試利用這一系統進行人類疾病的基因治療。然而，CRISPR-Cas9系統在臨床前的安全性卻缺少全面的評估。之前有研究表明，CRISPR-Cas9系統在小鼠中會造成大量脫靶突變。此外，對細胞系的研究發現，Cas9編輯細胞的
哈佛大學實驗室發現CRISPR/Cas9存在嚴重脫靶效應
哈佛大學David R Liu實驗室利用體外篩選和高通量測序檢測CRISPR/Cas9的脫靶，針對CLTA基因的四個不同靶位點共設計了八條不同序列的gRNA，即每個靶位點有兩條gRNA，結果發現，四個靶位點均存在脫靶現象，脫靶效率最高可達 84%，同時CRISPR/Cas9的特異性僅與g
西北農大張涌團隊利用CRISPR技術培育出抵抗結核病的奶牛
在一項新的研究中，來自中國西北農林科技大學動物醫學院的研究人員首次利用CRISPR/Cas9基因編輯技術成功地培育出具有增加抵抗牛結核病能力的奶牛。相關研究結果于2017年2月1日發表在Genome Biology期刊上，論文標題為“Single Cas9 nickase induced gen
科學家建立“GOTI”新型脫靶檢測技術
3月1日，《科學》（Science）雜志發表了一篇名為《胞嘧啶單堿基編輯會導致大量單核苷酸突變的脫靶》的研究論文，該研究由中國科學院神經科學研究所（中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心）、上海腦科學與類腦研究中心、神經科學國家重點實驗室、中國科學院靈長類神經生物學重點實驗室楊輝研究組與中國科學