北大科學家解析小鼠著床前胚胎中的單堿基分辨率5fC譜圖
2017年3月23日，北京大學BIOPIC中心湯富酬課題組與生命科學學院伊成器課題組合作在《Cell Stem Cell》雜志上發表了題為“Single-Cell 5-Formylcytosine Landscapes of Mammalian Early Embryos and ESCs at Single-Base Resolution”的研究論文，在國際上首次實現了單細胞水平的5-醛基胞嘧啶全基因組測序，并解析了小鼠著床前胚胎中的單堿基分辨率5-醛基胞嘧啶（5fC）譜圖。 哺乳動物早期胚胎發育過程中會發生劇烈的表觀遺傳重編程。在5-甲基胞嘧啶的主動去甲基化過程中會產生一種新穎的表觀遺傳學修飾5fC。湯富酬課題組與伊成器課題組緊密合作，開發了一種基于特異性化學標記的單細胞、單堿基分辨率的5fC測序技術（CLEVER-seq），并將其應用于小鼠著床前胚胎以及哺乳動物多能干細胞的5fC檢測。研究發現，在小鼠早期胚胎發育過程......閱讀全文
北大科學家解析小鼠著床前胚胎中的單堿基分辨率5fC譜圖
2017年3月23日，北京大學BIOPIC中心湯富酬課題組與生命科學學院伊成器課題組合作在《Cell Stem Cell》雜志上發表了題為“Single-Cell 5-Formylcytosine Landscapes of Mammalian Early Embryos and ESCs at
方興未艾：單堿基基因編輯技術
近一年多來，全世界范圍內多個實驗室圍繞“單堿基基因編輯技術”發表了大量的研究成果，而我國科學在此領域也取得了一系列重要進展。特別是近日，來自中山大學松陽洲和黃軍就實驗室在Protein & Cell雜志上發表了題為“Effective gene editing by high-fidelity
利用單堿基編輯器實現多位點單堿基編輯DMD及HGPS豬模型
6月28日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院賴良學課題組在國際學術期刊Nature Communications(《自然-通訊》)發表了題為Efficient base editing for multiple genes and loci in pigs using base editors
Nature－Methods發表論文報道5醛基胞嘧啶測序新技術
2015年9月7日，北京大學生命科學學院伊成器研究組在《Nature Methods》雜志在線發表題為“Bisulfite-free, base-resolution analysis of 5-formylcytosine at the genome scale”的研究論文（DOI: 10.1
單堿基基因編輯技術之工具篇
前言今年5月，David R. Liu教授與張鋒教授等人聯合創立Beam Therapeutics公司，再一次將“單堿基編輯技術”送上了熱搜榜，趁著熱度還未散去，我們繼上一期“單堿基編輯技術淺談”后，又為大家準備了一篇超級實用性的深度分析，帶你一起看看單堿基編輯的前世今生及如何一步步發展壯大的歷程！
單堿基基因編輯技術之工具篇
今年5月，David R. Liu教授與張鋒教授等人聯合創立Beam Therapeutics公司，再一次將“單堿基編輯技術”送上了熱搜榜，趁著熱度還未散去，我們繼上一期“單堿基編輯技術淺談”后，又為大家準備了一篇超級實用性的深度分析，帶你一起看看單堿基編輯的前世今生及如何一步步發展壯大的歷程！
單堿基基因編輯技術之工具篇
前言 今年5月，David R. Liu教授與張鋒教授等人聯合創立Beam Therapeutics公司，再一次將“單堿基編輯技術”送上了熱搜榜，趁著熱度還未散去，我們繼上一期“單堿基編輯技術淺談”后，又為大家準備了一篇超級實用性的深度分析，帶你一起看看單堿基編輯的前世今生及如何一步步發展
“Helicase－AID”實現多位點單堿基突變
近日，大連理工大學、中科院天津工業生物技術研究所研究團隊在《Metabolic Engineering》上發表題為“Helicase-AID: A novel molecular device for base editing at randomgenomic loci”的研究論文，將DNA解旋
基因檢測新突破:－單堿基突變檢測
DNA序列中稍有變異就會對身體產生深遠的影響。現代基因組學研究已經表明，只要一個突變就占領了決定是否成功治愈一種疾病還是使該病猖獗地蔓延到全身各部位的制高點。 研究人員通過一種新的方法檢測特定DNA片段，找出單一突變位點，從而幫助疾病(如癌癥、肺結核)的診斷和治療。DNA序列中這
單堿基基因編輯研究進展速覽
本文中，小編整理了近年來科學家們在單堿基基因編輯研究領域取得的新進展，分享給大家！ 【1】Nat Commun：科學家首次在豬身上實現多位點單堿基編輯 doi：10.1038/s41467-019-10421-8 近日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院賴良學課題組利用單堿基編輯器首次在豬
CRISPR技術再升級——單堿基的精準編輯
CRISPR/Cas9基因組編輯系統來源于簡單的細菌免疫系統組分，經過改造后可在真核細胞中實現高度靈活且特異的基因組編輯。該系統是單RNA(single-guide RNA, sgRNA) 介導的核酸酶系統，通過靶點特異的CRISPR RNA (crRNA)序列與靶序列進行堿基配對從而引導Cas
中國科學家9月參與發表多篇Nature文章
9月中國學者參與的多項研究在Nature雜志及其重要子刊上發表，其中包括NIBS邵鋒研究組解析細胞炎性壞死的關鍵分子機制，還有北京大學在Nature Methods上發表的5-醛基胞嘧啶測序新技術等。 NIBS邵鋒研究員近年來發表了多項重要成果，最新這一項利用最新的CRISPR/Cas9基因組
單堿基編輯首次應用于非人靈長類模型
? ?5月20日美國遺傳學家團隊近日首次在非人靈長類模型中，實現了對一種名為PCSK9基因剪接位點的高效精準編輯。這一成功意味著，只需單次注射，便可持久抑制肝臟中PCSK9基因的表達，其為心血管疾病的預防提供了全新的思路，并極大地推動了單堿基編輯技術的臨床轉化應用。研究報告19日公開于英國《自然》雜
天津工生所實現單窗口堿基編輯
堿基編輯器主要有3種類型：胞嘧啶堿基編輯器(cytosine base editor, CBE)、腺嘌呤堿基編輯器(adenine base editor, ABE)和糖基化酶堿基編輯器（Glycosylase base editor，GBE），它們在不需要DNA雙鏈斷裂和編輯模板的情況下可分別
作物基因組單堿基編輯方法研究取得進展
單核苷酸點突變是作物許多重要農藝性狀發生變異的遺傳基礎。單堿基的變異會導致氨基酸替換或蛋白質翻譯終止，使基因功能發生改變，從而有可能產生優良的等位基因與優異性狀。傳統誘變及單堿基突變篩選技術（如TILLING）需要進行基因組規模的篩選，耗時、耗力且鑒定到的點突變數目和種類有限。基因組編輯技術，特
單堿基基因編輯系統，基因治療又一利器
TaC9-ABE單堿基編輯技術原理。黃博純 供圖近日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員賴良學與五邑大學副教授鄒慶劍團隊合作首次將腺苷脫氨酶與轉錄激活因子樣效應子（TALE）融合，開發了一種不會產生Cas9依賴性脫靶的新型堿基編輯系統TaC9-ABE。相關研究3月24日在線發表于《細胞發現》（
世界首次證實單堿基基因編輯存在脫靶效應
基因編輯技術越來越火，然而針對基因編輯工具最大的風險——脫靶效應，一直以來缺乏良好的檢測工具。記者從中科院神經科學研究所獲悉，其團隊與多家機構合作完成的研究，建立了一種在精度、廣度和準確性上遠超越之前的基因編輯脫靶檢測技術，這一技術首次證實：近年來興起的單堿基編輯技術有可能導致大量無法預測的脫靶
科學家開發新型RNA單堿基編輯工具AMBER
中國科學院上海藥物研究所研究員郝沛團隊和中國科學院分子植物科學卓越創新中心研究員李軒團隊合作，開發了一種新型RNA單堿基（C>U）編輯工具AMBER，并在細胞和小鼠動物模型體內實現對多個靶標基因RNA轉錄本的精準編輯，為基于RNA編輯的遺傳病治療策略開拓了新技術路徑，同時進一步豐富了RNA編輯工具庫
徐彥輝等《自然》揭示TET蛋白底物偏好性機制
今天，國際頂級學術期刊《自然》（Nature）在線發表了復旦大學生物醫學研究院徐彥輝教授課題組的論文。該項研究成果揭示了TET蛋白底物偏好性機制，對研究多種疾病的發病機制，尤其對血液腫瘤（如髓系白血病）治療性藥物開發有重大意義。 這 篇題為“晶體結構揭示TET蛋白介導的氧化反應底物偏好性機制”
基因編輯大牛Nature子刊發文：CRISPR單堿基編輯準確！
來自韓國基礎科學研究所IBS的研究人員發表了題為“Genome-wide target specificities of CRISPR RNA-guided programmable deaminases”的文章，證實了最近研發的基因編輯方法的準確性。這一研究成果公布在4月10日的Nature
復旦大學、中科院Nature發布表觀遺傳新成果
來自復旦大學、中科院上海藥物研究所等機構的研究人員，揭示出了TET在介導DNA氧化去甲基化作用時的底物偏好及結構基礎。研究成果發布在10月28日的《自然》（Nature）雜志上。 復旦大學上海醫學院的徐彥輝(Yanhui Xu)教授和中科院上海藥物研究所的羅成（Cheng Luo）研究員是這篇
遺傳發育所－個體水平發現單堿基編輯系統存在脫靶效應
人類遺傳疾病和農作物農藝性狀很多情況下是由基因組中的單個或少數核苷酸的突變引起的。因此，基因組中關鍵核苷酸變異的鑒定與定向修正是人類遺傳疾病治療及動植物育種的重要方向。基因組編輯工具單堿基編輯器的開發，為定向編輯和修正基因組中的關鍵核苷酸變異提供了重要工具，展現了其在遺傳疾病治療與動植物新品種培
《Nature》子刊：新CRISPR技術－輕松實現單堿基精確基因敲除
CRISPR-Cas9系統為研究者提供了精準編輯DNA的技術手段，如今，研究人員又利用它開發出了靶向釀酒酵母（S. cerevisiae）單基因的技術，研究人員通過刪除DNA序列中1個堿基即可關閉基因。這種基因組級別的生物工程與傳統的靶向單個基因或有限數量基因的策略相比，未來將更方便研究者獨立研
人分裂期胚胎介導高效的單堿基編輯研究獲進展
5月23日，Genome Biology 發表了一篇題為《人分裂期胚胎介導高效的單堿基編輯》的研究論文，該研究由中國科學院神經科學研究所（中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心）、上海腦科學與類腦研究中心、神經科學國家重點實驗室、中國科學院靈長類神經生物學重點實驗室楊輝研究組與上海交通大學仁濟醫
單堿基修復基因編輯公司Beam獲8700萬美元A輪支持
新聞事件 今天幾位華人基因編輯科學家創建的單堿基修復基因編輯公司Beam獲得8700萬美元A輪支持。Editas的三位創始人MIT的張鋒、哈佛的David Liu、和Mass General的Keith Young聯手創立了Beam，CEO為Agios的原高管John Evans。本輪投
單堿基編輯系統在植物中建立mRNA剪接操控新方法
mRNA前體的剪接是高等生物體內基因轉錄后加工的重要過程，傳統mRNA的剪接遵循“GU-AG”法則，即主要剪接體包含三個保守的剪接位點，即位于內含子5’端的“GU”、3’端的“AG”和靠近3’端的分支點“A”。剪接體通過選擇一種或多種剪接位點可將mRNA前體加工為一種或多種成熟的mRNA，即組成
科學家發明單堿基分辨率測序技術：CeUSeq
2015年6月15日，北京大學生命科學學院伊成器研究組在《Nature Chemical Biology》雜志在線發表題為“Chemical pulldown reveals dynamic pseudouridylation of the mammalian transcriptome
新培育：單堿基突變的遺傳性疾病動物模型
近日吉林大學動物醫學學院賴良學團隊利用新型單堿基編輯系統成功對家兔實現單堿基精確突變，培育出具有白化病、早衰癥等遺傳性疾病模型兔，這代表人類距離基因治療時代更近一步。 團隊成員、吉林大學動物醫學學院博士李占軍介紹，白化病、早衰癥等遺傳性疾病都是由于基因組發生單堿基突變所致。由于遺傳性疾病產生的
我國科學家開發更高精度的單堿基基因編輯工具
單堿基編輯技術是一種是自2012年CRISPR/Cas9技術被發現以來最寄予厚望的高精度基因編輯技術，其中一種單堿基編輯技術BE3可以在不切斷DNA雙鏈的情況下精確地引入由C/G到T/A的點突變，另外一項單堿基編輯技術ABE7.10可以由T/A突變成C/G的技術，對于基因突變導致的遺傳疾病的治療
清華、中大Cell子刊發表表觀遺傳學重要成果
種系特異性基因（lineage-specific gene）的表觀遺傳學調控對于T細胞的分化和功能非常重要。DNA甲基化是一種常見的表觀遺傳學修飾，廣泛參與了細胞對基因表達的控制。 近幾年，科學家們的研究重心逐漸從4種基本堿基轉移到其他經過修飾的堿基，從5-甲基胞嘧啶（5mC）、5-羥甲基胞嘧