科學家繪制褐牙鲆全基因組精細圖譜
近日，中國水產研究院黃海水產研究所研究員陳松林領導的研究組與上海海洋大學、德國維爾茨堡大學、葡萄牙阿爾加夫大學、深圳華大基因研究院等單位合作，破譯了褐牙鲆全基因組序列，通過與半滑舌鰨全基因組比較分析，初步揭示了比目魚變態發育的分子機制。該研究成果發表于《自然—遺傳學》。 通過與半滑舌鰨全基因組比較，研究發現褐牙鲆和半滑舌鰨兩者的基因組存在高達85%的相似性。比較其基因組學后，篩選到153個比目魚類特異的基因家族以及12個比目魚擴張的基因家族與細胞分裂和凋亡、眼睛大小調控、視網膜神經遞質、軟骨重構等比目魚變態過程中的生物學現象密切相關。 值得一提的是，hipk基因家族的擴張可能參與了比目魚變態過程中眼睛的移動。此外，研究還鑒定出106個比目魚的正選擇基因，這些基因與體軸發育、神經模式、骨骼肌重建、甲狀腺激素、視黃酸信號通路等密切相關。 研究揭示的甲狀腺激素和視黃酸信號通路在比目魚變態中的協同調控作用與昆蟲變態發育過程中的蛻......閱讀全文
科學家繪制褐牙鲆全基因組精細圖譜
近日，中國水產研究院黃海水產研究所研究員陳松林領導的研究組與上海海洋大學、德國維爾茨堡大學、葡萄牙阿爾加夫大學、深圳華大基因研究院等單位合作，破譯了褐牙鲆全基因組序列，通過與半滑舌鰨全基因組比較分析，初步揭示了比目魚變態發育的分子機制。該研究成果發表于《自然—遺傳學》。 通過與半滑舌鰨全基因組
科學家繪制褐牙鲆全基因組精細圖譜
近日，中國水產研究院黃海水產研究所研究員陳松林領導的研究組與上海海洋大學、德國維爾茨堡大學、葡萄牙阿爾加夫大學、深圳華大基因研究院等單位合作，破譯了褐牙鲆全基因組序列，通過與半滑舌鰨全基因組比較分析，初步揭示了比目魚變態發育的分子機制。該研究成果發表于《自然—遺傳學》。 通過與半滑舌鰨全基因組
解開花鱸的基因密碼
“破譯魚類基因組序列，完成其基因組精細圖譜的繪制意義重大，可以為開展魚類重要經濟性狀的遺傳解析、基因組選擇育種以及良種培育提供基因組資源和技術支撐，使魚類遺傳育種研究進入一個全新的階段。”中國水產科學研究院黃海水產研究所（以下簡稱黃海所）研究員陳松林在接受采訪時表示。花鱸基因家族分析 陳松林供圖
OPGEN全基因組圖譜應用系列——鞭蟲全基因組測序
鞭蟲是一種常見的土壤傳播寄生蟲，地理分布廣，感染率高，寄生于人體盲腸，導致人體慢性感染，對人類危害巨大。鞭蟲的全基因組測序研究由著名的桑格研究院（Wellcome Trust Sanger Institute）完成，發表在世界頂級期刊《Nature Genetics》上。該研究通過對2種不同
基因組育種技術翻開海水魚類育種新篇章
目前，解決好漁業發展和生態環境保護之間的矛盾是當務之急，國家大力控制海洋捕撈的同時，促進了海洋魚類養殖業的快速發展，這個產業在未來相當一段時間內有著廣闊的發展空間和前景。 瞄準產業需求、用科技造福人類是中國水產科學研究院水產生物技術領域首席科學家、黃海水產研究所（以下簡稱：黃海所）研究員陳松林
人類全基因組測序計劃
全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。 1986年， Renato Dulbecco是Z早提出人類基因組測序的科學家之一。他認為如果能夠知道所有人類基因的序列，對癌癥的研究將會很有幫助。美國能源部（DOE）與美國國家衛生研究院（NIH），分別在1986年與1987年加入人類基
虎尾海馬全基因組破譯
中科院南海海洋研究所、德國康斯坦茨大學、華大基因和新加坡A*STAR研究院聯合破譯了虎尾海馬的全基因組。有關研究成果日前以封面文章的形式發表在《自然》雜志上。 海馬隸屬于海龍科。與其他硬骨魚不同，海馬呈現高度特殊的形態，例如頭部前方具有管狀長嘴，無腹鰭和尾鰭，尾端卷曲，全身覆蓋硬骨骼，沒有鱗片
全基因組擴增技術介紹
研究人員通常會在下游分析中遭遇DNA樣本量有限或不足的問題。QIAGEN的全基因組擴增技術通過以包括單細胞在內的小量樣本或珍貴樣本擴增獲得基因組DNA，解決此類難題。REPLI-g?Kit能夠準確地復制原始DNA樣本，不會造成偏差，擴增后的DNA可以直接應用于廣泛的遺傳學分析。什么是全基因組擴增(w
全基因組的比較基因組雜交技術介紹
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
多國實施全基因組分析計劃
由于基因測序可以探查與特定疾病相關的基因，該療法正在成為日益受歡迎的診斷方法。 英國計劃到2017年對10萬人進行基因組測序。 美國加州一對龍鳳胎出生后，他們的父母非常憂慮：兩個嬰兒不僅發育緩慢，而且肌肉松軟無力。大腦掃描結果顯示，男嬰或存在大腦性麻痹；然而醫生對造成女嬰震顫和癲癇的原因卻不
全基因組測序各步驟工具
全基因組測序（WGS）是下一代測序技術，用于快速，低成本地確定生物體的完整基因組序列。基因組的深度測序對于臨床研究的意義重大，解讀WGS數據并了解基因組突變在健康和疾病中的重要性是精準醫療的基石。WGS分析流程能分為三大塊，數據處理、檢測變異和綜合分析，具體如下圖所示：由于WGS現在已經非常成熟了，
全基因組研究解碼口吃根源
口吃跨越不同語言和血統，影響著全球約7000萬人。過去，許多人認為口吃能夠通過自主控制來改善。但數十年來的研究表明，口吃實際上是一種高度遺傳的不可控疾病，其原因復雜且模糊。而一項7月28日發表于《自然-遺傳學》上的研究讓口吃的部分原因變得清晰。 研究人員利用基因檢測服務公司23andMe的龐大
昆蟲全基因組DNA的提取
實驗概要利用改進的CTAB 法提取昆蟲全基因組DNA。主要試劑1. 蛋白酶K[美國Merck公司]2. 三羥甲基氨基甲烷(Tris)[美國Amresco公司]3. Taq DNA聚合酶及dNTP[NEB公司]4. 瓊脂糖及溴化乙錠(EB)[美國Amresco公司生產]5. 乙二胺四乙酸鈉(Na2ED
全基因組測序的診斷價值
根據《Nature Genetics》上發表的一項新成果，全基因組測序有望用于臨床上的遺傳病診斷。這項研究評估了影響全基因組測序在臨床診斷中取得成功的因素。 這個國際研究小組由英國的研究人員領導，對156個病例或家庭開展了臨床基因組測序。這些病例有著遺傳疾病的特征，但無法通過之前的篩查檢測來解
全血基因組提取操作步驟
操作步驟（（２００ul全血））* 第一次使用前請先在15ml漂洗液WB中加入60ml無水乙醇! 1. 取200ul新鮮、冷凍或加入各種抗凝劑的血液，放入1.5ml離心管。對如果全血起始量小于200μl，則用緩沖液BB補足到200μl。如果起始量介于200μl-300μl之間，則后續操作需要按照比例增
脂褐質色素定義
實質細胞胞漿內出現的一種棕褐色色素顆粒。它是細胞器碎片中不飽和脂肪過氧化的產物。
食品的褐變作用
1 褐變 褐變指食品在加工、貯藏過程中顏色發生變化而趨向加深的現象。根據褐變的原因，可分為非酶褐變和酶促褐變。 2 非酶褐變： ① Maillard 反應 Maillard 反應又稱為羰氨反應，指食品體系中含有氨基的化合物與含有羰基的化合物之間
什么是脂褐素？
脂褐素（lipofuscin）又稱老年素。沉積于神經、心肌、肝臟等組織衰老細胞中的黃褐色不規則小體，內容物為電子密度不等的物質、脂滴、小泡等，是溶酶體作用后剩下不再能被消化的物質而形成的殘余體。 其積累隨年齡增長而增多，是衰老的重要指征之一。見于淺表皮膚者俗稱“老年斑”。能用蘇丹黑染色，西夫氏
脂褐素的簡介
脂褐素的命名由來是具有顆粒狀的褐黃色色素，由含有脂肪的殘存物與 溶酶體消化物所組成。被認為是一種隨著年紀增長或細胞操勞而增加的色素，可見于肝臟、腎臟、心肌、 腎上腺、神經細胞與 神經節細胞。主要分布在細胞核周圍，是脂色素的一種。 是蓄積于 胞漿內的黃褐色的微細顆粒，電鏡下顯示為 自噬溶酶體內未
食品的褐變作用
1 褐變 褐變指食品在加工、貯藏過程中顏色發生變化而趨向加深的現象。根據褐變的原因，可分為非酶褐變和酶促褐變。 2 非酶褐變： ① Maillard 反應 Maillard 反應又稱為羰氨反應，指食品體系中含有氨基的化合物與含有羰基的化合物之間發生反映而使食品顏色加深的反應。羰氨反應的過
食品的褐變作用
1 褐變 褐變指食品在加工、貯藏過程中顏色發生變化而趨向加深的現象。根據褐變的原因，可分為非酶褐變和酶促褐變。 2 非酶褐變： ① Maillard 反應 Maillard 反應又稱為羰氨反應，指食品體系中含有氨基的化合物與含有羰基的化合物之間發生反映而使食品顏色加深的反
中國種茶樹全基因組密碼破解
記者從安徽農業大學獲悉，該校茶樹生物學與資源利用國家重點實驗室宛曉春教授研究團隊，聯合深圳華大基因等單位，破解了世界上分布最廣的中國種茶樹的全基因組信息，成果日前在線發表于《美國科學院院刊》上。 世界主栽茶樹分屬兩個變種：即中國種和阿薩姆種，前者葉小，分布廣泛，適制綠茶等六大茶類；后者葉大，主
研究發現全新全基因組組裝方法
十年前，Illumina基因組測序技術進入市場時，前所未有的龐大數據量淘汰了較早開發的測序分析工具。 歷史總是重演。如今，第三代測序技術已經達到低成本群體測序規模的臨界點。 英國時間12月9日，《自然—方法學》在線發表了第一個能夠跟上基因組測序產生速度的組裝算法。 這篇論文只有兩位作者，
小須鯨全基因組圖譜獲破譯
11月25日，韓國海洋科學技術研究所、深圳華大基因研究院等宣布成功破譯了小須鯨全基因組圖譜，并對鯨類獨特生理習性的遺傳學機制進行了分析。相關成果在線發表于《自然—遺傳學》雜志。 人們一直癡迷于海洋生物是如何演化為陸生生物的。鯨類的進化卻反其道而行之，由陸生向水生演化，和陸生偶蹄動物如牛、豬等
我國率先完成菊花全基因組測序
中國中醫科學院中藥研究所和安利植物研發中心對外發布消息稱，由他們共同發起的科研團隊，在菊花全基因組計劃獲重大進展的同時，還完成了重要的藥用菊花品種——杭白菊的全長轉錄組遺傳信息發掘。此舉使我國成為世界上首次完成菊屬植物菊花全基因組測序的國家。 據了解，菊屬植物染色體結構復雜，包含從2n=18到
中國樹鼩全基因組解析完成
中科院昆明動物研究所張云研究員課題組與深圳華大基因研究院合作，解析了新型實驗動物中國樹鼩的全基因組，系統評估了樹鼩作為藥物研發實驗動物的特征和優勢。研究近日發表于《公共科學圖書館·綜合》。 研究不僅為中國樹鼩用于新藥研發的藥效學、藥理學和毒理學評價提供了系統的基礎信息數據和科學依據，而且揭示了
關于全基因組測序的應用介紹
全基因組測序的應用：通過生物信息手段，分析不同個體基因組間的結構差異，同時完成SNP及基因組結構注釋。 DNA突變可誘發癌癥。吸煙過程中所釋放的>60種致癌化學物質可與DNA結合并對DNA鏈上的鳥嘌呤和腺嘌呤進行化學修飾從而產生大的加合物，該加合物改變了DNA雙螺旋的結構，如果不被核苷酸剪切修復
關于全基因組測序的內容介紹
1998年，克萊格·凡特的塞雷拉基因組公司成立，而且宣布將在2001年完成測序工作。隨后國際團隊也將完成工作的期限提前。2000年6月26日，塞雷拉公司的代表凡特，以及國際合作團隊的代表弗朗西斯·柯林斯（Francis Collins），在美國總統柯林頓的陪同下發表演說，宣布人類基因組的概要已經
“863”腫瘤全基因組研究獲進展
7月14日，“十一五”國家“863”重大專項“食管癌全基因組關聯分析和藥物基因組學研究”和“肺癌全基因組關聯分析和藥物基因組學研究”成果匯報會在京召開。 日前，遺傳學權威期刊《自然—遺傳學》刊登了我國科學家食道癌和肺癌研究的重要進展。由中國醫學科學院腫瘤研究所分子腫瘤學國家重點實驗室教授林東昕
我國率先完成棗樹全基因組測序
在科技部“十一五”和“十二五”科技支撐計劃項目的持續資助下，河北農業大學劉孟軍教授研究團隊在世界上率先完成了棗樹的高質量全基因組測序，組裝出總長4.38億個堿基的棗基因組序列，達估測基因組的98.6%，使棗樹成為世界鼠李科植物（近千種）和我國干果樹種中第一個完成基因組測序的物種。 相關論文