Science采用改進CRISPR技術發現近500個新的lncRNAs
長鏈非編碼RNA (lncRNAs)是一類長度大約為200個核苷酸,但不編碼任何蛋白的神秘分子,一直以來科學家們都想知道基因組中這類分子到底是起什么作用的。 12月15日Science雜志公布了一項最新研究發現:來自加州大學舊金山分校的研究人員識別出了499個新lncRNAs,這為理解這些小分子的功能奠定了基礎。同時研究人員也發現lncRNAs與大多數編碼基因不同,后者能作用于多種細胞系,但令人驚訝的是,90%已發現的lncRNAs只會影響一種細胞類型的生長。 “大多數細胞中都具有大量的lncRNAs這種神秘分子,但我們不知道它們具體有多少,哪些對基本生物功能具有重要意義。這項最新成果讓我們驚訝的是,大多數lncRNAs只在一種細胞類型內發揮功能,這種RNA功能的極度特異性是之前未曾發現過的,”文章作者,加州大學舊金山分校神經學家和臨床醫師 Daniel Lim說。 之前的研究表明,某些lncRNAs 在細胞生長和功能......閱讀全文
簡述非編碼RNA的成熟
多數生物體中的非編碼基因(ncRNA)被轉錄為需要進一步加工的前體。核糖體RNA(rRNA)通常被轉錄為含有一個或多個rRNA的前體rRNA,前體rRNA后來在特定位點被大約150種不同的snoRNA切割和修飾。轉移RNA(tRNA)的5'和3'端序列分別被RNase P和tRN
Cell驚人發現:誰說非編碼RNA不編碼?
來自德克薩斯大學西南醫學中心的Eric Olson和同事們在分析梳理肌肉特異性的長鏈非編碼RNAs(lncRNAs)以了解它們的功能時,發現了一種在骨骼肌中特異性表達的lncRNA。盡管這一RNA以往被歸類為是非編碼RNA,它的序列中包含的一小段卻看上去好像一個編碼區域。這一研究發現發布在《細胞
Nature解析癌癥與非編碼RNA
人類基因組可生成1萬多種長鏈非編碼RNA(lncRNA) 分子,但人們至今卻只知道其中幾十種轉錄物的功能。在發表在8月14日《自然》(Nature)雜志上的一篇新研究中,來自加州大學的楊柳青(Liuqing Yang,音譯)等研究人員揭示,兩種lncRNAs結合并控制了雄激素受體的功能。
長非編碼RNA與肺癌轉移
我們體內的大多數DNA(約80%)并沒有編碼蛋白,不過它們會轉錄為RNA。這些非編碼的RNA分子負責在細胞中實現多種功能。microRNA等小RNA已經被研究得很多了,近年來人們又發現了一類長非編碼RNA,這些RNA擁有兩百個以上的核苷酸。 長非編碼RNA對細胞周期、細胞生長和細胞死亡等細
細胞化學詞匯非編碼小RNA
中文名稱:非編碼小RNA英文名稱:small non-messenger RNA;snmRNA定 義:細胞中一大類由幾十核苷酸到幾百核苷酸組成的、不編碼蛋白質的RNA。本身或與蛋白質結合形成的復合體有生物學功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干擾小RNA、時序小RNA等。應用學科:生物化學
Nature重要發現:獨特的非編碼RNA
我們的皮膚表皮是由許多不同細胞類型構成的混合體,每種細胞類型都有非常明確的職責。這樣復雜的組織,其生成或分化在細胞水平上需要進行大量的協調,這一過程發生故障可以導致災難性的后果。現在,來自斯坦福大學醫學院的研究人員確定了這一分化過程的一個主要調控因子。研究成果發表在12月2日的《自然》(Natu
長鏈非編碼-RNA-測序案例分析
背景:人類壽命的延長伴隨著神經退行性疾病的發病幾率的增加,因而價格不貴的血液診斷的發展迫在眉睫。通過 RNA-seq 分析血液細胞的轉錄本是發現新的生物標志物的非常高效的途徑。 目的:利用 Illumina 測序平臺對帕金森病人白血球中 lncRNAs 進行分析,探討其對 mRNA 選擇性剪接的
非編碼小RNA的結構和功能
中文名稱非編碼小RNA英文名稱small non-messenger RNA;snmRNA定 義細胞中一大類由幾十核苷酸到幾百核苷酸組成的、不編碼蛋白質的RNA。本身或與蛋白質結合形成的復合體有生物學功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干擾小RNA、時序小RNA等。應用學科生物化學與分子生
非編碼小RNA的基本信息
中文名稱非編碼小RNA英文名稱small non-messenger RNA;snmRNA定 義細胞中一大類由幾十核苷酸到幾百核苷酸組成的、不編碼蛋白質的RNA。本身或與蛋白質結合形成的復合體有生物學功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干擾小RNA、時序小RNA等。應用學科生物化學與分子生
長鏈非編碼-RNA(lncRNA)研究策略
長鏈非編碼 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)指的是轉錄本長度在 200-100000 nt 之間的 RNA 分子,它們不編碼蛋白,位于細胞核或胞質內,具有保守的二級結構。研究顯示,lncRNA 并非以前所認識的那樣沒有功能,它可與蛋白質、DNA 和 RNA 相互作
長鏈非編碼RNA調控腫瘤生長
人類基因組能夠產生10000多種長鏈非編碼RNA(lncRNA),但是至今為止,人們只知道幾十種lncRNA分子的功能。 加州大學圣地亞哥分校的Liuqing Yang等人發表在Nature上的一項研究成果表明,兩種lncRNAs可以與雄激素受體結合并控制其功能。雄激素受體是一種轉錄因
帶你認識RNA軍團中“非正規軍”——非編碼RNA
人類的每一個細胞隨時都像在進行著一場無止盡的戰爭,細胞核是司令部,細胞質是戰場。六十年前,弗朗西斯·克里克(Francis Crick)的“中心法則”( DNA轉錄成RNA,再翻譯成蛋白質)現在一直是細胞作戰的絕對軍規,軍事機密(遺傳信息)必須從司令DNA先到RNA軍團,再到“武器彈藥”蛋白質。司令
長期被誤解-非編碼RNA存在“認知黑洞”
在人類基因組中95%的基因并不編碼蛋白質,其他物種也有大量的非編碼基因。這些DNA不會被編碼成蛋白質,卻又會轉錄出非編碼RNA,它們對生命活動起什么作用?是進化的冗余還是神秘的緩存? 《細胞》雜志近日刊登中國工程院院士曹雪濤團隊的研究論文,他們發現一種全新非編碼RNA分子。該分子能夠調控免
非編碼RNA的功能引發國際研究熱潮
由1962年諾貝爾生理學或醫學獎獲得者英國科學家克里克和美國科學家沃森提出的分子生物學中心法則認為,遺傳信息是從DNA(脫氧核糖核酸)傳遞給mRNA(信使核糖核酸),再從mRNA傳遞給功能蛋白質,由此來完成遺傳信息的轉錄和翻譯過程的。 根據這一中心法則,mRNA似乎只有唯一的
非編碼RNA為癌癥研究提供新思路
澳大利亞紐卡斯爾大學和中國科技大學等機構合作完成的兩項最新研究表明,非編碼RNA(核糖核酸)在癌癥治療方面存在巨大潛力,有助于開發出新型的癌癥靶向治療方法。 非編碼RNA是指不編碼蛋白質的RNA。長期以來,全球各地開展的癌癥研究主要針對能編碼蛋白質的基因,這些基因只占人類基因組的2%。 發表
如何揭開長非編碼RNA的神秘面紗
長非編碼RNA(lncRNA)長達兩百個核苷酸以上的轉錄本,但并不編碼任何蛋白質。盡管如此,長非編碼RNA在不同組織和發育階段的表達依然具有特異性,說明lncRNA的調控具有重要的生物學意義。細胞中絕大多數lncRNA(也稱lincRNA)位于細胞核,它們對應的DNA區域有的與蛋白編碼基因重疊,
深入研究非編碼RNA的新工具
最近,加拿大多倫多大學Donnelly中心的一個研究小組,開發出了一種方法,可使科學家們能夠深入探索“ncRNAs在人類細胞內做了什么”。 這項研究發表在5月19日的《Molecular Cell》雜志,同一天,來自新加坡基因組研究所的Yue Wan研究組與斯坦福大學的Howard Chang
帶你走進神秘的長鏈非編碼RNA
長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類轉錄本長度超過200nt的RNA分子,它們并不編碼蛋白,而是以RNA的形式在多種層面上(表觀遺傳調控、轉錄調控以及轉錄后調控等)調控基因的表達水平。lncRNA起初被認為是基因組轉錄的“噪音”,是RNA聚合酶II轉錄的副產物,不具有生物學功能。然而,近年來的研究
中國科大發現新型非編碼RNA
最近,中國科學技術大學單革教授實驗室在國際知名雜志《自然-結構和分子生物學》(Nature Structural & Molecular Biology)發表研究性論文,報導了其實驗室發現的一類新型非編碼RNA以及此類非編碼RNA的功能和功能機理。 非編碼RNA是一大類不編碼蛋白質而在細胞中起
長期被誤解-非編碼RNA存在“認知黑洞”
在人類基因組中95%的基因并不編碼蛋白質,其他物種也有大量的非編碼基因。這些DNA不會被編碼成蛋白質,卻又會轉錄出非編碼RNA,它們對生命活動起什么作用?是進化的冗余還是神秘的緩存? 《細胞》雜志近日刊登中國工程院院士曹雪濤團隊的研究論文,他們發現一種全新非編碼RNA分子。該分子能夠調控免疫
長鏈非編碼RNA與淋巴瘤
類基因組中僅有1.5%~2.0%編碼蛋白的基因得以穩定轉錄,而剩余的絕大多數RNA無編碼蛋白的功能。長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類異質性的非編碼RNA,根據lncRNA的功能,可將其分為信號分子、誘餌分子、引導分子和骨架分子4類。人們以往僅將這些不具編碼功能的RNA視為進化過程中產生的廢
單革:非編碼RNA的探索者
日前,國際知名雜志《自然·結構和分子生物學》刊發了中國科學技術大學單革教授的一篇文章,他的實驗室發現了一類新型環狀非編碼RNA,并揭示了其功能和功能機理,相關成果得到了新華社、中科院官網等媒體關注。 記者了解到,在2012年9月,《自然·通訊》也在線發表了單革的研究成果,那次他發現了曾被認為是
Cell封面故事:抗癌向著非編碼RNA開炮
一種常見兒童血癌中對觸動及推動腫瘤生長和進展的因子開展大型遺傳分析,來自紐約大學Langone醫學中心的研究人員報告稱,他們鑒別出了一個可能的、治療這種疾病的新藥物靶點。 T細胞急性淋巴母細胞性白血病(T-cell acute lymphoblastic leukemia)是一種最常見且具有侵
可以促進癌細胞生長的非編碼RNA
國際著名學術期刊《美國國家科學院院刊》發表西奈山伊坎醫學院教授Benjamin Greenbaum的一篇研究文章。研究人員在癌細胞中發現了一組可以激發免疫反應的非編碼RNA分子,它們具有與病原體相似的一些特征。由于這些分子在癌細胞中表達并擴增,它們造成的免疫反應有可能影響癌細胞的生長。 研究
長鏈非編碼RNA:-從科研到臨床
長鏈非編碼RNA (LncRNA)是一類真核生物中長度大于200 nt的非編碼RNA分子;根據其與鄰近基因的位置可以分為反義lncRNA、增強子lncRNA、基因間lncRNA、雙向lncRNA、和內含子lncRNA;它具有多種作用機制,比如在細胞核中作為分子支架、協助可變剪接、調節染色體結構
出人意料的非編碼RNA調控
為了將六英尺多的DNA塞進細胞核里,細胞將基因組緊緊纏繞在組蛋白核心上形成核小體,并最終將其包裝成緊密的染色質。DNA轉錄的時候需要打開核小體,而胚胎干細胞的染色質重塑復合體esBAF可以做到這一點。它不僅會打開需要轉錄的DNA,還暴露了促進轉錄的啟動子和增強子。 基因組測序研究最近顯示,增強
m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點,也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature,cell級別高分文章領域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼,之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究(詳細見云序課堂之前往期回顧)。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RNA在
北京生科院發表環形非編碼RNA識別新技術
2月28日,國際學術期刊Briefings in Bioinformatics 發表了中國科學院北京生命科學研究院趙方慶團隊題為Circular RNA identification based on multiple seed matching 的最新研究成果。因為目前在環形RNA識別方面存
Nature:像海綿一樣的非編碼RNA
一種稱為RsmZ的小分子RNA具有特殊的功能:屏蔽細菌中抑制翻譯的蛋白的作用,最新一項研究揭示了這種RNA如何能完成其功能的分子機制,指出RsmZ像海綿一樣能吸收多種阻遏蛋白(repressor proteins)。 小 RNA(small RNAs 或 sRNAs)是一類長度為40-400個
非編碼RNA的調控作用研究計劃項目指南
基因信息傳遞過程中非編碼RNA的調控作用機制重大研究計劃2016年度項目指南 非編碼RNA是由基因組轉錄產生的一類不同于mRNA的遺傳信息分子。對真核細胞中非編碼RNA及其基因的發掘和功能研究,有可能揭示一個由非編碼RNA介導的遺傳信息傳遞方式和表達調控網絡,從不同于蛋白質編碼基因的角度注釋和