測序牛人發布蛋白單分子測序技術
人類生命的藍圖是三十億堿基對組成的人類基因組。而DNA編碼的蛋白質是幾乎所有生命過程的主要執行者。 現在，美國亞利桑納州立大學Biodesign研究所的Stuart Lindsay及其同事，在納米孔DNA測序技術的基礎上，開發了能夠精確鑒定氨基酸的蛋白單分子測序技術。這一技術不僅可以用來在臨床上測序蛋白質和檢測新生物指標，還有望給醫療領域帶來徹底的改變，在單分子水平上精確監控患者對治療的應答情況。 Lindsay及其團隊讓單鏈肽段穿過納米孔，納米孔兩邊的電極可記錄每個氨基酸通過時產生的電信號。他們使用一種機器學習算法，讓電腦能夠識別代表不同氨基酸的特征信號。這些信號可以作為可靠的指紋，幫助人們鑒別氨基酸的種類，以及氨基酸發生的微妙改變。 從基因組到蛋白組 蛋白對于細胞的生長、分化和修復至關重要，它們能夠催化化學反應，抵御疾病，具有各種各樣的重要功能。 與線蟲等簡單生物相比，人類的基因數相......閱讀全文
高通量測序技術研究進展介紹
第二代測序技術， 又稱新一代測序技術， 是相應于以Sanger 測序法為代表的第一代測序技術而得名。第二代測序中3種主流測序技術分別為依次出現的 Roche/454 焦磷酸測序(2005 年)、Illumina/Solexa 聚合酶合成測序(2006 年)和 ABI/SOLiD 連接酶測序(
蛋白上游研究之Sanger測序原理與方法
在分子生物學研究中，DNA的序列分析是進一步研究和改造目的基因的基礎。目前用于DNA測序的技術主要有Frederick Sanger發明的Sanger雙脫氧鏈終止法（Chain Termination Method）。快速DNA測序方法的出現極大地推動了生物學和醫學的研究和發現。 測序原理
最新DNA甲基化測序技術比較研究
在不同疾病中，DNA甲基化具有不同的模式。DNA甲基化的具體模式通常與諸如疾病亞型、疾病預后以及藥物反應等臨床信息具有一一對應的聯系。在多種癌癥的治療過程中，DNA甲基化生物標志物可以幫助臨床醫生選擇恰當的治療方式。 對于擁有成千上萬個樣本的大量病人來說，全基因組映射與DNA甲基化分析是非常合
蛋白上游研究之Sanger測序原理與方法
在分子生物學研究中，DNA的序列分析是進一步研究和改造目的基因的基礎。目前用于DNA測序的技術主要有Frederick Sanger發明的Sanger雙脫氧鏈終止法（Chain Termination Method）。快速DNA測序方法的出現極大地推動了生物學和醫學的研究和發現。測序原理利用一種DN
單細胞研究指南：測序方法大比拼
多細胞生物的每個細胞都攜帶著相同的遺傳學信息。不過，近年來蓬勃發展的單細胞研究告訴我們，每一個細胞都是獨一無二的。不同類型的細胞激活特定組合的機制，即使是同類型細胞，基因表達也會出現差異。 那么，細胞之間的哪些差異有生物學意義，哪些差異來自于技術偏好呢？要獲得可靠的結果又需要研究多少細胞呢？這
氨基酸的間接原子吸收法測定法研究
1 氨基酸的概述? 氨基酸（amino acids）：生物功能大分子蛋白質的基本組成單位，是構成動物營養所需蛋白質的基本物質。是含有一個堿性氨基和一個酸性羧基的有機化合物，氨基一般連在α-碳上。氨基酸都具有堿性二元氨基一元羧酸，例如賴氨酸（lysine）；酸性一元氨基二元羧酸，例如谷氨酸（Gl
什么是氨基酸？氨基酸的結構
氨基酸，是含有堿性氨基和酸性羧基的有機化合物。羧酸碳原子上的氫原子被氨基取代后形成的化合物。
氨基酸和必須氨基酸的定義
氨基酸是構成蛋白質的基本單位。人體營養角度,可將構成人體蛋白質的20種氨基酸分為必需氨基酸、條件必需氨基酸和非必需氨基酸。必需氨基酸是指人體需要但自己不能合成或合成速度不能滿足機體需要的氨基酸必需氨基酸共有9種,即賴氨酸、色氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸、蘇氨酸、異亮氨酸、亮氨酸、纈氨酸和組氨酸,其中組氨
DNA測序PCR測序反應
1. 取0.2 ml的PCR管，用記號筆編號，將管插在顆粒冰中，按下表加試劑： 所加試劑 測定模板管 標準對照管 BigDye Mix 1 μl 1 μl 待測的質粒DNA 1 μl － pGEM-3Zf (+) 雙鏈DNA － 1 μl 待測DNA的正向引物 1 μl － M13(
DNA測序的測序技術
高通量測序技術（High-throughput sequencing）又稱“下一代”測序技術（Next-generation sequencing technology），以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。根據發展歷史、影響力、測序原理和技術不同等，主要有以
DNA測序的測序原理
DNA測序的測序原理是：利用一種DNA聚合酶來延伸結合在待定序列模板上的引物。直到摻入一種鏈終止核苷酸為止。每一次序列測定由一套四個單獨的反應構成，每個反應含有所有四種脫氧核苷酸三磷酸(dNTP)，并混入限量的一種不同的雙脫氧核苷三磷酸。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基團，使延長的寡聚核苷酸
研究者完成馬鈴薯晚疫病病菌基因測序
新華網倫敦9月9日電 一個國際科研小組9日發布報告說，他們完成了對馬鈴薯晚疫病病菌的基因測序，這有助于找到對付這一病菌的新手段。晚疫病病菌曾導致歷史上著名的愛爾蘭大饑荒。 這項研究由美英等多國研究人員聯合完成。馬鈴薯晚疫病病菌基因測序結果顯示，與同類生物相比，該病菌有大得出奇的基因圖譜，其
多種測序技術或將深入推動癌癥領域研究
本文中小編整理了多篇文章，來解讀測序技術在闡明癌癥發生機制、癌癥診斷及療法開發等方面的巨大潛力，與各位一起學習！ 【1】JAMIA：新工具深入挖掘外顯子測序結果 幫助找到最佳癌癥治療藥物 doi：10.1093/jamia/ocw022 科羅拉多大學的研究人員最近在國際學術期刊JAMIA上
白血病最大測序項目研究數據已公開！
近日，美國圣裘德兒童醫院的科學家與合作者一同對數百名T細胞急性淋巴細胞性白血病（T-ALL）患者進行了前所未有的基因組測序分析。該研究展現了白血病患者最為宏觀細致的基因組圖景，為白血病臨床治療策略的制定和靶向藥物的開發提供了重要的信息。同時，大量的基因組信息也為白血病小鼠模型的設計打下了堅實的基
【盤點】單細胞測序研究進展一覽
細胞是生物學的基本單位，近年來研究人員正努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。而應用而生的就是單細胞測序技術，該技術是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。而隨著測序成本的大幅度下降，破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并對逐個細胞進行序列
國際研究小組完成團藻基因組測序
德國比勒費爾德大學9日報告說，一個有德國研究者參加的國際研究小組最近完成了對最簡單的多細胞生物團藻的基因組測序。科研人員希望以此幫助探尋單細胞生物向多細胞生物演變的奧秘。 單細胞生物怎么能演變為多細胞生物乃至人這樣高度復雜的生物，一直是生物研究的重要課題。一個由德國、美國、
教你輕松玩轉環狀RNA測序加機制研究（一）
從表達譜至海綿機制完美進階，教你輕松玩轉環狀RNA測序加機制研究文章導讀：禽白血病病毒J亞群(ALV-J)屬于逆轉錄病毒屬，慢病毒亞科的家族成員，可引起禽類多種腫瘤性疾病，如骨髓細胞瘤、肉瘤、血管瘤、腎腫瘤和成紅細胞增多癥，以及禽類骨髓白血病，導致受感染雞的高死亡很率。該分散的ALV-J菌株分布廣泛
【盤點】單細胞測序研究進展一覽
細胞是生物學的基本單位，近年來研究人員正努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。而應用而生的就是單細胞測序技術，該技術是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。而隨著測序成本的大幅度下降，破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并對逐個細胞進行序列比較已經開始
單細胞測序技術在細胞呼吸研究進展
單細胞測序技術在細胞呼吸研究中面臨以下一些挑戰：數據復雜性和分析難度：單細胞測序會產生大量復雜的數據，需要復雜的生物信息學分析方法和專業知識來解讀，從海量數據中準確識別與細胞呼吸相關的有意義信息并非易事。技術誤差和噪聲：包括樣本制備、細胞捕獲、核酸擴增等過程中可能引入技術偏差和噪聲，影響數據的準確性
454測序應用于花生種子敗育研究
?????? 花生為豆科作物，是我國優質食用油主要油料品種之一，又名“落花生”或“長生果”，在全國各地均有種植，主要分布于遼寧、山東、河北、河南、江蘇、福建、廣東、廣西、貴州、四川等地區。在花生種子的生長發育過程中，胚栓插入土壤，膨壓將種皮推開后露出胚軸是一個重要過程，因此，胚栓入土失敗、胚軸的膨壓
DNA測序儀市場遭遇冬天－削減研究經費所致
DNA測序儀目前主要供研究之用，是生物學家們所能購買的最昂貴儀器之一，然而，在美國政府削減研究經費且未來的經費前景也不容樂觀之際，許多研究機構正暫緩購置設備，儀器生產商受到重創。 據《自然》雜志在線新聞報道，在經歷了2011年第三季度市場銷售下滑后，許多測序儀制造商開始裁員和削減成本，同
雪貂基因組測序加深人類疾病研究
近日，一個國際研究團隊進行了雪貂基因組測序,他們認為這將鞏固雪貂作為研究人類呼吸道疾病如流感和囊性纖維化的生物模型。 研究人員檢查了雪貂感染大范圍流感病毒后基因隨著時間推移的不同表達，通過研究囊性纖維化雪貂模型反映了人類疾病的發展。 基因分析中心的合著人Federica Di Palm
測序研究發現狗起源于東南亞
狗被稱為“人類最忠實的朋友”。一項最新研究發現，這種最常見的人類寵物，最初起源于東南亞，而后才逐步擴散到全世界。這項研究描述了狗在被馴化后漫長的遷徙歷史，進一步加深了人們對狗的認識。 負責此項研究的中國科學院昆明動物所的張亞平、瑞典皇家理工學院的皮特·賽維雷恩和他們的研究團隊，對犬科家族的58
單細胞測序技術應用和發展現狀研究
一背景概況單細胞測序技術是指能夠在單個細胞的水平上，對基因組或轉錄組進行高通量測序分析的一項新技術。與傳統高通量測序相比，單細胞測序不僅能夠分析相同表型細胞的異質性，還能獲取難以培養微生物的遺傳信息以及珍貴的臨床樣本的信息，具有廣闊的應用前景。細胞是生命的單位，目前大部分的基因檢測均是從組織中抽提D
大規模測序研究：從遺傳變異到功能
隨著測序研究的深入，人們已不再滿足于了解遺傳變異，而是期待探究功能。在最近幾個星期，三個以“從遺傳變異到功能”為主題的大規模測序項目都發表了很有意思的論文。 Transcriptome and genome sequencing uncovers functional variation
教你輕松玩轉環狀RNA測序加機制研究（二）
3.gga-miR-373 通過與YAP1的3’UTR區結合負調控YAP1的表達，并且過表達gga-miR-375可減弱EMT生信預測揭示YAP1是gga-miR-375的潛在靶基因，進一步的雙熒光素酶報告基因證實了gga-miR-375可通過結合YAP1的3’UTR區抑制YAP1的表達；在體外細胞
單細胞測序技術在腫瘤研究中的應用
單細胞測序技術在腫瘤研究中有以下多方面的應用：腫瘤細胞異質性研究鑒定腫瘤內不同的細胞亞群，包括具有不同基因突變、轉錄組特征和表型的細胞。揭示腫瘤細胞之間的差異對腫瘤進展、轉移和治療反應的影響。腫瘤微環境分析解析腫瘤微環境中免疫細胞、基質細胞等的組成和功能狀態。研究腫瘤細胞與微環境中其他細胞的相互作用
多篇研究共同解讀近期單細胞測序重磅級研究成果
本文中，小編整理了近年來單細胞測序領域的重磅級研究成果，與大家一起學習！ 【1】Cell：開發出空間單細胞測序技術，有助揭示早期乳腺癌產生浸潤性之謎 doi：10.1016/j.cell.2017.12.007 在一項新的研究中，來自美國德州大學MD安德森癌癥中心的研究人員報道一種新的遺傳
復旦大學研究揭示氨基酸感知和信號傳導機制
復旦大學趙世民、徐薇、徐彥輝團隊通過近5年的持續研究發現，tRNA合成酶除了識別氨基酸和激活tRNA在蛋白質合成中扮演功能外，還具有修飾蛋白質賴氨酸的功能。相關研究成果日前在線發表于《細胞代謝》。 氨基酸除參與蛋白質合成外，眾多氨基酸還參與不同的重要信號通路調控。但氨基酸如何被感知、tRNA合
研究闡明苜蓿共生固氮的氨基酸交換機制
????豆科植物與根瘤菌形成的共生固氮體系是自然界最高效的生物固氮方式之一。在這一過程中，根瘤菌通過侵染線進入植物細胞，隨后被宿主的共生體膜包裹后形成可固氮的類菌體，這一功能單元被稱為共生體。經典模型認為，植物為類菌體提供二羧酸鹽作為碳源，類菌體則將固定的氮以氨態氮形式輸送給植物。但越來越多證據表明