2024年,西湖大學施一公團隊合作再取進展
U2小核核糖核蛋白(snRNP)對pre-mRNA分支位點(BS)的選擇對于剪接前體 (A complex)的組裝至關重要。RNA解旋酶PRP5校對BS選擇,但其潛在機制尚不清楚。 2024年1月9日,西湖大學施一公及中國科學技術大學張曉峰共同通訊在Nature Structural & Molecular Biology 在線發表題為“Structural insights into branch site proofreading by human spliceosome”的研究論文,該研究報告了導致前質體組裝的兩個順序復合物的原子結構:人類17S U2 snRNP和跨外顯子pre-A復合物。 PRP5主要通過酸性環占領SF3B1的RNA通路錨定在17S U2 snRNP上;PRP5的解旋酶結構域與U2 snRNA結合;U2 snRNA與BS相互作用的莖環(BSL)被TAT-SF1屏蔽,無法與BS接合。在pr......閱讀全文
細胞化學詞匯引發體前體
中文名稱:引發體前體英文名稱:preprimosome定 義:形成引發體之前的蛋白質復合體。與引發酶和一些相關蛋白質和酶形成引發體參與DNA復制。應用學科:細胞生物學(一級學科),細胞遺傳(二級學科)
上海生科院發現mRNA剪接蛋白對肌肉分化和糖代謝的調控作用
11月11日,國際學術期刊Cell reports 在線發表了中國科學院上海生命科學研究院營養科學研究所馮英組的最新研究進展:SRSF10 plays a role in myoblast differentiation and glucose production via regulation
營養所揭示SRSF10調控mRNA選擇性剪接的新機制
1月18日,Nucleic Acids Research在線發表了中科院上海生命科學研究院營養科學研究所研究員馮英組的最新研究進展:Transcriptome analysis of alternative splicing events regulated by SRSF10 reve
上海生科院科研人員研發了-premRNA可變剪接分析軟件CASH
4 月 6 日,國際著名生物信息學期刊 Briefings in Bioinformatics 在線發表了中國科學院上海生命科學研究院(人口健康領域)馮英組和浙江農林大學吳文武博士,上海列冰生物科技有限公司宗杰博士的最新研究進展“CASH: a constructing comprehensiv
PNAS:RNA剪接調控研究方面新的進展
近日,PNAS在線發表了中科院上海生科院營養科學研究所馮英研究組的最新研究進展。該研究揭示了RNA二級結構在剪接調控中的新機制,并首次證明了MYC調控蛋白FUBP1同樣具有剪接調控活性。 RNA剪接是連接轉錄與翻譯的重要橋梁,也是生物體蛋白質多樣性的重要保證。在真核生物中,mRNA前體被剪
選擇性剪接
中文名選擇性剪接外文名alternative splicing別????名可變剪接作????用mRNA前體加工特????點表達水平的不同而導致不同的表型定義選擇性剪接(也叫可變剪接)是指從一個mRNA前體中通過不同的剪接方式(選擇不同的剪接位點組合)產生不同的mRNA剪接異構體的過程,使得最終的蛋白
中科院最新PNAS文章
近日,PNAS在線發表了中科院上海生科院營養科學研究所馮英研究組的最新研究進展:“Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing re
營養所在RNA剪接調控研究中取得新進展
近日,PNAS在線發表了中科院上海生科院營養科學研究所馮英研究組的最新研究進展:Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing rep
前核糖體RNA
中文名稱前核糖體RNA英文名稱pre-ribosomal RNA;precursor rRNA;pre-rRNA定 義真核細胞中rRNA基因轉錄的初級轉錄物。應用學科遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)
一文了解剪切體與疾病的關系
剪接體(Spliceosomes)是由RNA和蛋白分子組成,大小為60S的多組分復合物,這種機器能進行Pre-mRNA剪接,即把內含子去除并把外顯子序列連接成為成熟的mRNA,這是基因表達與調控的重要環節之一。從作用機制上來看,剪接體作為動態分子機器,需要由亞基從頭逐步組裝組合,來完成每個剪接事
異常剪接?
中文名異常剪接定????義指對序列庫中異常剪接mRNA的鑒定和分析隸屬領域生物領域主要功能處理多順反子性轉錄單元,調控轉錄效率和mRNA的穩定性,同時可以增加產物蛋白的多樣性
RNA-剪接
中文名稱RNA 剪接英文名稱RNA splicing定 義在真核細胞核中從RNA初始轉錄物切除內含子,連接外顯子形成成熟的mRNA的過程。應用學科細胞生物學(一級學科),細胞遺傳(二級學科)
自剪接
自剪接(self-splicing)出現在稀少的內含子組成核酸酶,核酸酶在只有RNA的情況下代替了剪接體的功能。自剪接的內含子有兩種,稱為I型及Ⅱ型。I型及Ⅱ型內含子以與剪接體類似的方式進行剪接,但不需要任何蛋白質。這種相似性使人相信這些內含子與剪接體在演化過程上有著關連。自剪接亦可能是非常古老,且
我科學家揭示剪接體組裝及激活機制
日前,清華大學生命科學學院施一公研究組就剪接體的組裝機理與結構研究于《科學》期刊發表題為《完全組裝的釀酒酵母剪接體激活前結構》的論文,報道了釀酒酵母剪接體處于被激活前階段的兩個完全組裝的關鍵構象——預催化剪接體前體和預催化剪接體。 這兩個高分辨率三維結構首次展示了在剪接體組裝過程中剪接位點和分支點
催化活化酵母剪接體的結構揭示了分枝機理
在1977年,Phillip Sharp和Richard Roberts倆個研究組獨立發現了剪切這一過程,緊接著,1979年, Steitz研究組發現五種稱為U1,U2,U4,U5和U6 snRNA的富含尿苷的小核RNA(snRNA)和7種12-35kDa的蛋白質(snRNPs)。之后,
Science:科學家成功解析人類剪接體關鍵結構
看看任何一個真核細胞基因組內的蛋白編碼基因,不管是動物,植物,真菌還是原生生物,我們都會發現由于內含子的存在,編碼基因被隔斷成幾個片段。當一個基因發生轉錄,這些內含子會在蛋白質合成之前從mRNA前體中被移除,雖然關于這些內含子的移除過程已經得到了幾十年的深入研究,但是在一些三維動態結構研究技術出
研究揭示LARP7在生精細胞mRNA精準剪接和精子發生中的功能
2月3日,國際學術期刊Molecular Cell 在線發表了中國科學院分子細胞科學卓越創新中心/生物化學與細胞生物學研究所劉默芳研究組的最新研究成果“LARP7-Mediated U6 snRNA Modification Ensures Splicing Fidelity and Sperm
哺乳動物細胞體外剪接分析實驗
實驗方法原理 剪接反應的典型做法是使用核提取物,即 S100 提取物補充 SR 蛋白或粗提取物的部分純化組分,最常使用的是 HeLa 細胞的提取物。前體 mRNA 底物通常采用噬菌體聚合酶體外轉錄的方法來制備。實驗材料 前體 mRNA 底物試劑、試劑盒 ATP CP 混合物HEPES-KOH聚乙烯醇
哺乳動物細胞體外剪接分析實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 剪接反應的典型做法是使用核提取物,即 S100 提取物補充 SR 蛋白或粗提取物的部分純化組分,最常使用的是 HeLa 細胞的提取物。前體 mRNA 底物通常采用噬菌體聚合酶體外轉錄的方法來制備。
哺乳動物細胞體外剪接分析實驗
剪接反應的典型做法是使用核提取物,即 S100 提取物補充 SR 蛋白或粗提取物的部分純化組分,最常使用的是 HeLa 細胞的提取物。前體 mRNA 底物通常采用噬菌體聚合酶體外轉錄的方法來制備。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編:鄭曉飛。實驗方法原理剪接反應的典型做法是使用核提取物,即 S10
2024年,西湖大學施一公團隊合作再取進展
U2小核核糖核蛋白(snRNP)對pre-mRNA分支位點(BS)的選擇對于剪接前體 (A complex)的組裝至關重要。RNA解旋酶PRP5校對BS選擇,但其潛在機制尚不清楚。 2024年1月9日,西湖大學施一公及中國科學技術大學張曉峰共同通訊在Nature Structural & Mo
Nature新文章:生命起源于“RNA世界”
來自芝加哥大學的科學家們在《自然》(Nature)雜志上報告稱,RNA是控制基因表達的分子機器——剪接體的重要功能元件。這一研究發現確立了是RNA,而非蛋白質,負責催化了這一基礎生物學過程,豐富了地球上的生命起源于僅以RNA為基礎的世界這一假說。 研究的共同通訊作者、芝加哥大學分子遺傳學和
ZRSR2基因編碼的功能和結構描述
這個基因編碼一個重要的剪接因子。編碼的蛋白與U2輔助因子異源二聚體相關,這是識別前體mRNA剪接中功能性3’剪接位點所必需的,并且可能在剪接體組裝過程中起到網絡相互作用的作用。This gene encodes an essential splicing factor. The encoded pr
ZRSR2基因突變因子與藥物介紹
這個基因編碼一個重要的剪接因子。編碼的蛋白與U2輔助因子異源二聚體相關,這是識別前體mRNA剪接中功能性3’剪接位點所必需的,并且可能在剪接體組裝過程中起到網絡相互作用的作用。[由RefSeq提供,2008年7月]This gene encodes an essential splicing fac
細胞化學詞匯tRNA前體
中文名稱:tRNA前體英文名稱:tRNA precursor定 義:轉移核糖核酸(tRNA)基因轉錄的初始產物,需經過多步加工才能產生成熟的、有功能的tRNA分子。應用學科:生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
前體脂質體的制備
前體脂質體多采用先制備脂質體,再進行特殊處理,目前較成熟的方法有凍融法、重建法、噴霧法、噴霧干燥法、旋轉蒸發法,所制得均為干燥粉末。 前體脂質體的體內性質的研究 以各種方法制得的前體脂質體,要對其再分散性質進行深入研究。如粒徑及粒度分布、包封率、考察不同制備方法中具體的影響因素,以期提高包封
tRNA前體的結構特點
中文名稱tRNA前體英文名稱tRNA precursor定 義轉移核糖核酸(tRNA)基因轉錄的初始產物,需經過多步加工才能產生成熟的、有功能的tRNA分子。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
如何查找microrna的前體
在NCBI主頁輸入要查找的miRNA的名稱,all database中選擇GENE;在搜索結果中選擇目的miRNA,在NCBI reference sequences(RefSeq)欄中點擊目的miRNA的ID號即轉到序列,還可以通過鏈接到UCSC、miRBase查找。
施一公:克服提純問題,發布最新酵母剪接體結構
2018年5月25日,清華大學生命學院施一公教授研究組就剪接體的組裝機理與結構研究于《科學》(Science)雜志以長文形式再次發表重大研究成果。這篇題為《完全組裝的釀酒酵母剪接體激活前結構》(Structures of the Fully Assembled Saccharomyces cer
首次發現!西湖大學施一公團隊合作最新Nature子刊
剪接體通過四個連續的階段進行pre-mRNA剪接:組裝、激活、催化和拆卸。剪接體的活化,即催化前剪接體(B復合體)重塑為活化剪接體(Bact復合體)和催化活化剪接體(B*復合體),涉及蛋白質組分的主要通量和結構重排。 2024年7月27日,西湖大學施一公團隊在Nature Communicat