中外科學家成功解析西瓜基因組
2012年11月26日,由北京市農林科學院、深圳華大基因研究院和康奈爾大學等多家單位合作完成的西瓜基因組相關研究成果在《自然?遺傳學》(Nature Genetics)雜志發表。這項研究為西瓜基礎生物學研究及其種質資源培育、抗病及遺傳改良提供了寶貴資源,同時,也為葫蘆科植物的進化和比較基因組學相關研究提供了重要的數據支持和線索。 西瓜(Citrullus lanatus)在植物分類學中屬于葫蘆科西瓜屬,原產于非洲,在五代時期引入中國。西瓜全球年產量大約為9000萬噸,為全球第五大水果消費品,同時也是中國重要的經濟水果之一。現代西瓜在形狀、大小、顏色、口味和營養成分等方面,都有很大差異。而且西瓜的近緣野生種、亞種和變種非常多,具有豐富的遺傳多樣性。但是,近幾十年來對其品質的定向選擇和培育,使得西瓜品種的遺傳基礎越來越窄,這已成為制約西瓜遺傳品質改良的重要瓶頸。 在本研究中,科研人員先對東亞西瓜培育品種971......閱讀全文
昆明動物所發布碧鳳蝶染色體水平基因組
蝴蝶因其豐富的形態多樣性,自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一,近幾年更被認為是研究形態遺傳、進化和發育的理想模型,已成為發育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態學等研究領域的重要模式生物之一。鳳蝶科是具有重要進化地位的蝴蝶支系,其豐富的色彩和形態等多樣性是昆蟲生態與進
抗病基因延長樹木壽命
近日,研究人員表示,樹木的壽命長可能由于其抗病基因的擴張。這一發現有助于解釋某些樹木(如櫟樹)為何長期暴露于各種威脅之下仍能存活幾百年。相關論文6月18日在線發表于 《自然—植物》。 櫟樹(俗稱橡樹)約有450個種,遍布亞洲、歐洲和美洲,它的無處不在和長壽已成為一種全球性的文化象征。自史前時代以
抗病基因延長樹木壽命
近日,研究人員表示,樹木的壽命長可能由于其抗病基因的擴張。這一發現有助于解釋某些樹木(如櫟樹)為何長期暴露于各種威脅之下仍能存活幾百年。相關論文6月18日在線發表于 《自然—植物》。 櫟樹(俗稱橡樹)約有450個種,遍布亞洲、歐洲和美洲,它的無處不在和長壽已成為一種全球性的文化象征。自史前時代
全基因組測序的竹亞科及生物學性狀的比較基因組學研究
禾本科(禾草)是被子植物最大科之一,約有12000種,是水稻、小麥、玉米等人類糧食和牲畜飼料的主要來源,也為人類提供了加工淀粉、制糖、釀酒、造紙、編織和建筑等方面的重要原料。同時,禾本科又是植物遺傳學和基因組學研究的模式類群。竹亞科(竹子)是禾本科的12個亞科之一,與早熟禾亞科、稻亞科組成BOP
《基因組生物學》:中外豬種骨骼肌研究
8月6日出版的英國《基因組生物學》(Genome Biology)期刊發表了中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所李奎教授課題組唐中林博士、李勇碩士等關于中外豬種骨骼肌生長發育生長差異分子機制的重要研究成果。?豬肉是人類動物蛋白的主要來源,我國是世界上生豬生產和豬肉消費的第一大國。我國種豬長期依賴進口,西
分子生物學篇之基因組DNA純化
2007年剛過,各種年終匯總琳瑯滿目,生物通也將于未來一個多月里大擺生物技術饕餮盛宴,為讀者帶來前沿技術和信息的思維享受和滿足--每日密集精選各廠家及經銷商過去一年在中國大陸地區著力推廣的重點產品文章或者上市的新產品新技術文章,將2007年當中生物通倍受矚目的產品和技術一一呈遞,打造精彩紛呈的生物技
基因組研究:揭示偏頭痛的生物學根源
在偏頭痛的研究中,研究人員第一次發現了新的5個遺傳區域與偏頭痛相關。這項研究為理解偏頭痛的原因和生物因素打開了新的研究大門。 研究人員發現了12個與偏頭痛相關的遺傳區域。其中8個區域在控制腦電路中發揮著重要的作用,其中2個區域的相關基因主要作用為維持健康腦組織。這些信號通路的調節對于遺傳易感性
研究從基因組水平揭示食肉目染色體進化規律
染色體進化是物種形成和演化的重要驅動因素。具有顯著核型差異的食肉目動物為染色體進化研究提供了很好的研究素材。雖然前人通過比較染色體涂色法建立了食肉目內許多物種的染色體比較圖譜,但這些研究的分辨率比較低,尚沒有深入到精細的核苷酸水平,也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物種間的共線性區塊、染色體重排以
用比較基因組雜交描述染色體結構異常實驗(一)
實驗方法原理 比較基因組雜交(CGH)是一種能夠在一步全基因組篩查程序,描述G帶不能發現的細胞遺傳物質增加或減少的分子細胞遺傳學技術。CGH優于進行全染色體涂染(wcp)的常規熒光原位雜交(FISH)和多色FISH之處,是它不僅能夠識別增加的未知片段的染色體來源,而且還可將該片段定位于特定的染色體區
鴨嘴獸基因組圖譜揭秘獨特的性染色體
鴨嘴獸可能是世界上長得最奇怪的動物。據說,當歐洲學者第一次見到這種鴨子嘴、海貍尾、水獺足的動物時,他們認為這是一場精心設計的騙局。它看上去既像爬行動物又像哺乳動物,還像鳥類。實際上,它屬于稀有的單孔類動物。 鴨嘴獸不僅有一些奇特的身體特征,其新的基因組版本也強調了它一些不尋常的遺傳特性。在上周
用比較基因組雜交描述染色體結構異常實驗(二)
二、正常男性中期染色體標本的制備1.準備一個封閉環境,其相對濕度約55%(可在50%?60%變化),溫度24?26.5℃。2.將巴斯德吸管置于玻璃載片上方2?4in處,讓一滴細胞懸液滴在玻片的左側。然后迅速將第二滴細胞懸液滴在玻片右側(見注釋7)3.在固定液全部蒸發前,將玻片浸入盛有新鮮固定液的染色
用比較基因組雜交描述染色體結構異常實驗(三)
六、中期染色體標本的變性1.在染色缸中加入大約50mL變性液,將染色缸放于75?76℃水浴中。預熱變性液使其溫度達到(73±2)℃。2.從-20℃冰箱中取出實驗所需的標本,室溫下系列乙醇脫水,各2min。3.室溫干燥片子(5min),或在實驗室抽風櫥中微風吹過標本使標本干燥。4.在37?40℃電熱板
“六谷”豐登?——首個染色體水平基因組組裝完成
中國菰? ? 中國農科院供圖? ? ? ??中國菰 (Zizania latifolia) 原產于中國,屬于禾本科稻族菰屬,主要分布于中國、韓國、日本和印度等國家。中國菰的穎果為菰米,在我國古代是重要的“六谷”之一。? ? 近日,中國農業科學院煙草研究所煙草功能成分與綜合利用創新團隊與中國水稻研
象腿蕉染色體級別基因組組裝研究獲進展
中國科學院華南植物園海外知名學者John Seymour Heslop Harrison教授領導的研究團隊,在象腿蕉染色體級別基因組組裝研究方面取得新進展。相關研究發表于Gigascience。王梓維為該文第一作者,John Seymour Heslop Harrison和劉青副研究員為通訊作者,華
象腿蕉染色體級別基因組組裝研究獲進展
象腿蕉(Ensete glaucum)是芭蕉科中耐寒的蕉類植物,原產于中國云南和東南亞地區,具有觀賞、飼用和藥用價值。中國科學院華南植物園教授John Seymour Heslop Harrison帶領的研究團隊,采用單分子納米孔、Illumina測序策略,結合染色體構像捕獲技術,發表了首個象腿蕉染
我國小麥基因組研究跨入世界先進行列
我國研究人員在國際上率先完成了小麥A基因組的供體(烏拉爾圖小麥和小麥D基因組供體種)粗山羊草基因組草圖的繪制,結束了小麥沒有全基因組序列的歷史,標志著我國小麥基因組研究跨入了世界先進行列。這是由中國農業大學承擔,中國科學院遺傳與發育生物學研究所、中國農業科學院作物科學研究所參與的“十二五”863
23家機構共同揭秘四倍體栽培種花生全基因組
花生是世界上重要的油料作物和第二大植物蛋白質來源。中國花生在單產、總產和消費量均居世界首位。花生栽培種為異源四倍體植物,基因組大、重復序列比例高,組裝難度大,全基因組測序一直未能突破,嚴重影響了花生研究和應用。 福建農林大學教授莊偉建,聯合印度國際半干旱熱帶作物研究所、華北理工大學等23個研究
我國科學家發布大黃魚全基因組圖譜
由浙江海洋學院、上海交通大學、復旦大學等高校研究機構聯合破譯的大黃魚全基因組圖譜,日前在世界權威期刊——《自然》周刊發表。這是繼半滑舌鰨之后,我國公布的第二個海水魚類的基因組圖譜,也是世界上第一個石首科魚類基因組圖譜,標志著我國海洋生物學的研究真正進入基因組時代。 自1985年大黃魚人工養殖
《基因組生物學》:慢性孤獨會降低人體免疫功能
美國科學家最近研究發現,孤獨可能會改變體內基因的表達,慢性孤獨(chronically lonely)的人體內免疫系統的防御功能會因此降低。這一研究一旦確證,將有助于醫生更好地防治那些會因孤獨而惡化的疾病,比如心臟病、感染、與年齡有關的癡呆以及某些種類的癌癥等。相關論文發表在《基因組生物學》上。?生
我國完成世界首張西瓜基因組序列圖譜
我國主導完成世界首張西瓜基因組序列圖譜的繪制與破譯,相關研究成果于北京時間11月26日凌晨在國際學術頂級刊物《自然·遺傳學》上在線發表。 西瓜是全球重要的經濟作物和夏季消暑水果,但就是這樣一種常見的水果,人們卻始終未能從內到外了解它。過去,各國科學家雖然知道栽培西瓜遺傳多樣性狹窄是制約西瓜
我國小麥基因組研究跨入世界先進行列
???????? 我研究人員在國際上率先完成了小麥A基因組的供體——烏拉爾圖小麥和小麥D基因組供體種——粗山羊草基因組草圖的繪制,結束了小麥沒有全基因組序列的歷史,標志著我國小麥基因組研究跨入了世界先進行列。 這是中國農業大學承擔,中國科學院遺傳與發育生物學研究所、中國農業科學
科學家為細菌重編基因組密碼-提高抗病毒能力
據物理學家組織網10月18日(北京時間)報道,最近,美國耶魯大學和哈佛大學的科學家合作,為一種細菌重新編寫了完整的基因組編碼,并提高了其抗病毒能力。相關論文發表在10月18日的《科學》雜志上。 “這是第一次從根本上改變了遺傳密碼。”論文共同高級作者、耶魯大學分子、細胞與發育生物學副教授法倫
首個豆科綠肥作物染色體水平基因組組裝完成
?紫云英? ? ? ?中國農科院供圖近日,中國農業科學院農業資源與農業區劃研究所肥料及施肥技術團隊完成了首個豆科綠肥作物——紫云英的染色體水平參考基因組組裝,并利用比較基因組學解析了紫云英共生結瘤的遺傳基礎。該研究填補了豆科綠肥作物基因組學研究的空白,為豆科植物與根瘤菌共生提供了新的見解。相關研究成
人類種了6000年的作物有了染色體級別基因組
大麻又名火麻、漢麻、線麻等,籽用大麻在食品、醫藥、紡織、造紙等多個領域被廣泛使用,是一種重要的工業原料。 9月15日,福建農林大學麻類研究室聯合該校基因組與生物技術中心在《植物通訊》(Plant Communications)上發表了首個染色體級別的籽用大麻參考基因組圖譜。他們在此基礎上解析了
破解染色體級別基因組密碼解析栽培菠菜的“前世今生”
上海師范大學16日發布消息稱,該校王全華研究團隊在菠菜基因組研究領域又取得一項重大標志性研究成果。團隊聯合康奈爾大學Boyce Thompson研究所(BTI)費章君教授課題組等多家科研機構完成了新一代菠菜基因組精細圖譜繪制、重要農藝性狀遺傳基礎和菠菜馴化歷史的解析。 該研究成果以“基因組解析
北京基因組所等揭示Y染色體表觀信息遺傳機制
表觀遺傳學是與傳統遺傳學相對應的概念。遺傳學以基于DNA序列的中心法則來傳遞遺傳信息,在人群中,遺傳信息在世代之間穩定遺傳,那么表觀遺傳信息是否像遺傳信息一樣可被子代繼承,尚缺少相關有力證據。DNA甲基化是非常重要的表觀遺傳信息,是表觀遺傳學研究的重要內容。目前,鮮少有DNA甲基化在人群中的繼承
轉基因細菌變身抗病“斗士”
埃希氏菌正被發展成人類基因療法的載體。圖片來源:Fernan Federici、Jim Haseloff 人們通常服用藥物清除難對付的細菌。如今,一種違反直覺的方法——將轉基因細菌轉變成藥物——正越來越受到認可。 若干公司正在測試工程菌能否治療影響大腦、肝臟和其他器官的疾病,甚至殺死有害細菌
轉基因細菌變身抗病“斗士”
? 埃希氏菌正被發展成人類基因療法的載體。圖片來源:Fernan Federici、Jim Haseloff 人們通常服用藥物清除難對付的細菌。如今,一種違反直覺的方法——將轉基因細菌轉變成藥物——正越來越受到認可。 若干公司正在測試工程菌能否治療影響大腦、肝臟和其他器官的疾病,甚
轉基因細菌變身抗病“斗士”
埃希氏菌正被發展成人類基因療法的載體。圖片來源:Fernan Federici、Jim Haseloff 人們通常服用藥物清除難對付的細菌。如今,一種違反直覺的方法——將轉基因細菌轉變成藥物——正越來越受到認可。 若干公司正在測試工程菌能否治療影響大腦、肝臟和其他器官的疾病,甚至殺死有害細菌
基因組學探究沙棘放線菌固氮生物學機制
沙棘是胡頹子科沙棘屬落葉性灌木,其根部與放線菌共生固氮,適應缺水少肥的華北及西北貧瘠地區,是防風固沙功臣;其果實富含維生素C及黃酮等活性物質,是健康飲品的原料供給者;具有重要的生態和經濟價值。 近日,《新植物學家》(New Phytologist)在線發表了來自中科院植物分子科學卓越創新中心