基因編輯工具的開發
基因編輯已經被越來越廣泛的用于生物學的研究和應用當中,例如合成生物學,基因治療,藥物靶點發現,mRNA剪接,蛋白定向進化等等。我們在使用各種各樣的基因編輯工具時,不禁感嘆這些工具是多么的精巧絕倫。但科研人員發現基因編輯工具,改進這些工具的功能、效率并非易事。高效、精準、便捷的基因編輯工具,一直是人們夢寐以求的科研神器。我們熟知的CRISPR系統,最常聽到、見到的是Cas9蛋白,但Cas蛋白并不是只有Cas9,下圖中為Cas蛋白的分類。Cas蛋白功能分類圖[1]在如此多的Cas蛋白中,發現如Cas9、Cas12a、Cas13a等可以作為基因編輯工具的,可謂鳳毛麟角,少之又少。從1987年報道CRISPR重復序列,到2002年發現Cas4基因具有核酸外切酶功能,直到2012年發現Cas9可以通過RNA介導控制基因組編輯,歷經20余年。在CRISPR風靡全球后,對于該系統的開發并未停止,技術大牛們又開發出: 基于......閱讀全文
水稻基因組編輯工具盒再添新成員
近日,中國農業科學院植物保護研究所周煥斌課題組、周雪平課題組和四川大學生命科學學院林宏輝課題組合作開發了一系列基于Cas9-NG的各種水稻基因組定點編輯工具,并成功用于水稻單基因敲除、多基因敲除、單堿基編輯(堿基對G·C和A·T的互換)以及靶基因轉錄激活調控。相關研究成果在線發表于《分子植物》(
科學家構建基因編輯工具研究惡性瘧原蟲
分子水平的遺傳操作是研究惡性瘧原蟲病理學以及抗藥機制的重要工具。中科院上海巴斯德研究所江陸斌研究組利用CRISPR/dCas9系統,在惡性瘧原蟲中成功構建了基于表觀遺傳修飾的新型基因編輯工具。相關研究成果于12月24日在線發表于《美國國家科學院院刊》。 瘧原蟲是引起瘧疾的真核病原微生物,其中惡
研究人員拓展Cas12a基因編輯工具盒并優化其編輯效率
近年來CRISPR基因編輯工具的出現,依靠其簡單、快速、高效等優勢,極大地優化了基因工程的操作方法和手段,并且為基因治療等領域帶來了變革。 目前,科學家已經鑒定出6種類型、20余亞類的CRISPR系統。但是,只有Cas9、Cas12a和Cas12b三種系統被成功改造為基因組編輯工具。其中,Ca
基因編輯大牛張鋒開發出RESCUE技術,可擴大RNA編輯能力
基于CRISPR的工具徹底改變了我們靶向與疾病相關的基因突變的能力。CRISPR技術包括一系列不斷增長的能夠操縱基因及其表達的工具,包括利用酶Cas9和Cas12靶向DNA,利用酶Cas13靶向RNA。這一系列工具提供了處理突變的不同策略。鑒于RNA壽命相對較短,靶向RNA中與疾病相關的突變可避
最先進的基因編輯工具CRISPRCas成CNS大熱門
今年1月,世界上有四個科研團隊都對一種基因編輯工具——CRISPR-Cas系統進行了報告。越來越多的科學家開始對CRISPR-Cas系統進行研究。許多科研團隊利用它來刪除、添加、激活或抑制人體、老鼠、斑馬魚、細菌、果蠅、酵母、線蟲和農作物細胞中的目標基因,從而證明了這個技術的廣泛適用性。就在上個
加深癌癥了解!新基因工具可按時序編輯DNA序列
據物理學家組織網23日報道,美國研究人員在最新一期《分子細胞》雜志撰文指出,他們發明了一種新基因編輯技術,可按時間順序對切割點或編輯點進行編輯,有望促進癌癥研究等領域的發展。 基因編輯領域的“當紅炸子雞”CRISPR使科學家能改變細胞內DNA的序列,或添加所需序列或基因。CRISPR使用名為C
CRISPR新工具開辟更多可編輯基因組位點
據最新一期《科學進展》報道,美國麻省理工學院(MIT)研究人員發現了一種可靶向幾乎一半基因組位點的Cas9酶,從而極大地擴展了基因編輯工具的適用范圍。 盡管基因編輯工具近年來取得了相當大的成功,但CRISPR-Cas9在基因組上可訪問的位點數量仍然有限。這是因為CRISPR需要在基因組靶向位點
華人學者開發基因組分析新工具
最近,來自美國西奈山伊坎醫學院的科學家,開發和公布了兩種新的數據分析軟件,可以幫助研究人員以更高的效率和精確度,識別疾病的遺傳觸發因子。這些新的分析工具分別發表在11月30日的《PLoS Computational Biology》和11月25日的《Scientific Reports》。 M
遺傳發育所開發出植物基因驅動工具
面對雜草對農業生產帶來的威脅以及入侵植物導致的環境危機等挑戰,對野生植物進行群體水平上的基因控制已成為具有潛力的策略。然而,植物基因組存在著一類自私的基因或遺傳元件,使其以超越孟德爾定律的比例傳遞給后代,被稱為基因驅動元件。受天然基因驅動元件的啟發,開發人工基因驅動工具為改造野生植物群體提供了潛在的
遺傳發育所開發出植物基因驅動工具
面對雜草對農業生產帶來的威脅以及入侵植物導致的環境危機等挑戰,對野生植物進行群體水平上的基因控制已成為具有潛力的策略。然而,植物基因組存在著一類自私的基因或遺傳元件,使其以超越孟德爾定律的比例傳遞給后代,被稱為基因驅動元件。受天然基因驅動元件的啟發,開發人工基因驅動工具為改造野生植物群體提供了潛在的
利用基因編輯在小鼠中成功開發基因驅動系統-|-Nature論文
根據本周《自然》在線發表的一篇論文Super-Mendelian inheritance mediated by CRISPR–Cas9 in the female mouse germline,基因驅動作為一種用于增強特定基因變異(等位基因)在種群中遺傳性的策略,其可行性在實驗室小鼠身上得到了
媲美CRISPRCas9,-新CRISPR-工具探知90%的基因編輯領域
2類CRISPR–Cas系統,例如Cas9和Cas12,已被廣泛用于靶向真核基因組中的DNA序列。但是,代表自然界中所有CRISPR系統90%的1類CRISPR-Cas系統在基因組工程應用中仍未開發。杜克大學(Duke University)的生物醫學工程師利用此前未被探索的CRISPR技術,精
科學家開發新的宏基因組分析工具
對環境樣品(如海水、醫院表面和人類腸道)直接進行微生物測序,已經闡明了我們世界中存在的大量微生物。然而,一個微生物物種可能存在遺傳多樣性,而在宏基因組分析中往往捕獲不到這種多樣性。最近在《Genome Research》發表的一項研究中,科學家們開發了一種新的工具,來檢測細菌物種內的遺傳差異,并
Cell重磅:新型基因編輯工具誕生,吹散最后一片烏云
近日,韓國大田的基礎科學研究所( Institute for Basic Science,IBS)基因組工程中心的研究團隊開發了一種可編程工具,并在Cell發表了“Targeted A-to-G base editing in human mitochondrial DNA with progr
“通用型”基因編輯工具,可靶向多種突變和細胞類型
基因編輯技術為治療各種遺傳疾病帶來了希望。然而,許多類型的基因編輯工具都無法靶向DNA的關鍵區域,對于包含分裂或非分裂狀態的不同細胞類型的組織開發通用且有效的體內基因組編輯工具仍然是一個挑戰。 繼上周“CRISPR先驅”張鋒實驗室的博士后研究員Randall Platt教授帶來了CRISPR-
David-Liu團隊發表新型基因編輯工具,有效減少脫靶效應
目前,CRISPR–Cas9基因編輯工具雖然可以輕松地改變基因組,但其容易導致脫靶效應等意想不到的編輯后果。為更好地控制基因編輯的進行,科學家們在開發不同的替代方法方面進行了不懈的努力。 2019年10月21日,單堿基編輯技術開創者、Broad研究所David Liu教授研究團隊在頂級學術期刊
第一次,在成年猴子中使用基因編輯工具
Derek Lowe 在7月19日在《science》發文《Gene edited monkeys offer heart disease patients》(基因編輯猴子為心臟病患者帶來希望)。 第一次,在成年猴子中使用基因編輯工具 研究人員在成年猴子中使用基因編輯工具來阻斷大部分肝臟中的
CRISPR/Cas9設計工具,讓基因編輯不再高冷!
CRISPR/Cas9已經成為最常用的基因編輯系統。CRISPR/Cas9包括2部分:Cas9核酸內切酶和sgRNA(single guide RNA),sgRNA由天然的tracrRNA (transactivating crRNA)和crRNA (CRISPR RNA)融合而來。 使用
基因組所成功開發整合網絡工具iBIG
近日,中科院北京基因組研究所基因組科學與信息重點實驗室“百人計劃”研究員雷紅星,帶領其團隊成功開發網頁版整合網絡工具——iBIG (integrative BIoloGy),該研究成果iBIG: An Integrative Network Tool for Supporting Hum
異交植物基因高效定位新算法工具開發成功
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519329.shtm近日,中國農業科學院蔬菜花卉研究所蔬菜分子設計育種創新團隊聯合馬鈴薯遺傳育種與栽培創新團隊,通過解析異交(異花授粉)植物雜交1代分離群體的遺傳特點,開發了一套新算法工具OcBSA,該工
基因組系統解析工具開發研究取得重要進展
近日,中國工程院院士、南方海洋科學與工程廣東省實驗室(廣州)教授包振民團隊開發國際首個整合宏觀/微觀進化基因組和功能基因組的綜合分析工具(PanSyn,https://github.com/yhw320/PanSyn)。相關成果發表于《自然-實驗手冊》。該成果是包振民團隊長期積累的豐富基因組學分析方
基因編輯技術可以編輯所有基因嗎
即便當前不能,以后會能的。基因編輯技術指能夠讓人類對目標基因進行“編輯”,實現對特定DNA片段的敲除、加入等。在過去幾年中, 以ZFN (zinc-finger nucleases)和TALEN (transcription activator-like effector nucleases)為代表
流程化、更高效的基因編輯工具:打開腸道微生物組“窗口”
基因,就像是指揮官手里拿著的建筑總圖紙,調控著生物體的一切生命活動。這份施工的圖紙決定了整個建筑的所有呈現形式。那怎么才能對“圖紙”——基因進行編輯呢?CRISPR/Cas編輯系統被認為是最佳的一種工具。 1月6日,中國科學院深圳先進技術研究院合成生物學研究所、深圳合成生物學創新研究院戴磊課題
遺傳學大牛Nature子刊發布基因組編輯新工具
生物醫學研究和基因治療需要非常精確的基因組編輯技術。哈佛醫學院的研究人員為此開發了一種新的基因組編輯工具。這個重要成果十一月二日發表在Nature Communications雜志上,文章通訊作者是著名遺傳學George Church和Luhan Yang。近年來基于核酸酶的基因組編輯工具特別火,比
遺傳學大牛Nature子刊發布基因組編輯新工具
生物醫學研究和基因治療需要非常精確的基因組編輯技術。哈佛醫學院的研究人員為此開發了一種新的基因組編輯工具。這個重要成果十一月二日發表在Nature Communications雜志上,文章通訊作者是著名遺傳學George Church和Luhan Yang。 近年來基于核酸酶的基因組編輯工具特
eLIFE:艾滋病毒,人類基因組編輯新工具
丹麥奧胡斯大學開發出了一項新技術利用HIV病毒來作為對抗遺傳性疾病的一種工具。 研究人員首次成功地改造了HIV病毒顆粒,使得它們能夠通過一些生物學過程(可以說是)同時“剪切和粘貼”我們的基因組。由奧胡斯大學生物醫學系開發的這項新技術,使得以一種新的方式修復基因組變為可能(延伸閱讀:2014值得
我國科學家開發高效基因組序列分析工具
人類的疾病易感性和生理特征等常見性狀的差異,往往由DNA序列變化造成,這些DNA片段缺失、增加、異位等變化被統稱為遺傳變異。全基因組關聯研究(Genome-Wide Association Study,GWAS)是通過比對大量人群的遺傳信息,利用統計學檢測遺傳變異和性狀之間關聯性的方法。西湖大學
我國科學家開發高效基因組序列分析工具
類的疾病易感性和生理特征等常見性狀的差異,往往由DNA序列變化造成,這些DNA片段缺失、增加、異位等變化被統稱為遺傳變異。全基因組關聯研究(Genome-Wide Association Study,GWAS)是通過比對大量人群的遺傳信息,利用統計學檢測遺傳變異和性狀之間關聯性的方法。西湖大學的
體積是CRISPRCas9的一半的新型基因編輯工具CasΦ
基因編輯(gene editing),又稱基因組編輯(genome editing)或基因組工程(genome engineering),是一種新興的比較精確的能對生物體基因組特定目標基因進行修飾的一種基因工程技術。基因編輯技術指能夠讓人類對目標基因進行定點“編輯”,實現對特定DNA片段的修
體積是CRISPRCas9的一半的新型基因編輯工具CasΦ
基因編輯(gene editing),又稱基因組編輯(genome editing)或基因組工程(genome engineering),是一種新興的比較精確的能對生物體基因組特定目標基因進行修飾的一種基因工程技術。基因編輯技術指能夠讓人類對目標基因進行定點“編輯”,實現對特定DNA片段的修飾。