大連化物所樸海龍和許國旺團隊研究二甲雙胍分子機制
近日，中國科學院大連化學物理研究所生物技術研究部研究員樸海龍團隊與許國旺團隊合作，解釋了二甲雙胍（Metformin）繞開能量調控關鍵分子AMPKα的代謝通路分子機制。相關研究結果發表于《代謝-臨床與實驗》（Metabolism-Clinical and Experimental）雜志。大連化物所生物分子機制研究獲進展 二甲雙胍是廣泛應用于治療二型糖尿病的臨床一線藥物。近期研究發現，二甲雙胍治療的糖尿病人群中癌癥發病率明顯下降，因此其被認為是潛在的抗癌藥物。 AMPK（AMP蛋白激酶）是由α、β和γ三個亞基組成的三元復合物，在代謝、增殖、自噬和凋亡等生物學過程中發揮重要作用。然而，二甲雙胍是否通過AMPKα發揮作用至今仍存在爭議。針對這一科學問題，該研究利用二甲雙胍處理野生型、Ampkα1敲除型的小鼠胚胎成纖維（MEF）細胞后，對MEF細胞進行代謝組學分析，發現了二甲雙胍的新分子機制：其可繞開AMPKα促進糖酵解、抑制三......閱讀全文
與細胞代謝信號通路相關因子介紹GNAQ
GNAQ基因所編碼的蛋白屬于鳥嘌呤核苷酸結合蛋白（G蛋白）的家族，GNAQ與GNA11形成的復合物為G蛋白α亞基，這兩個基因調控細胞分裂，增強MEK（有絲分裂原活化蛋白激酶的激酶）蛋白活性，在80%的葡萄膜黑色素瘤病人中發現GNA11和GNAQ基因的突變，其機制為基因突變導致MEK的異常激活，目前正
廈大學者破解糖尿病“明星”藥物作用機制
糖尿病人對“二甲雙胍”并不陌生，這是目前全球治療糖尿病的“明星”藥物。但是，這種藥物降血糖的作用機理是如何發生的，卻一直是個科學之謎。 近日，廈門大學生命科學學院教授林圣彩課題組的研究破解了其中一個謎團，研究為II型糖尿病、脂肪肝、心血管疾病、癌癥等疾病的藥物研制提供了新的靶點和方向。10月1
糖尿病“明星”藥物作用機制破解
糖尿病人想必對“二甲雙胍”并不陌生,這是目前全球治療糖尿病的“明星”藥物。但是,這種藥物降血糖的作用機理是如何發生的,卻一直是個科學之謎。廈門大學生命科學學院林圣彩教授課題組的一項研究破解了其中的一個謎團,為Ⅱ型糖尿病、脂肪肝、心血管疾病、癌癥等疾病的藥物研制提供了新的靶點和方向。11日,該項研
PNAS揭示二甲雙胍抗癌新機制
近年來，科學家們在許多治療不同癌癥的臨床試驗中對糖尿病藥物二甲雙胍(metformin)開展了測試，一些研究指出其顯著激活了一種叫做AMPK的細胞代謝調控分子來抑制腫瘤生長。然而在發表于1月13日《美國科學院院刊》(PNAS)上的一項新研究中，來自辛辛那提兒童醫院醫學中心的研究人員建議，正在癌癥
Cancer－Cell：二甲雙胍/禁食協同抑制腫瘤的生長
研究發現，腫瘤細胞會出現不同于正常細胞的代謝變化，同時腫瘤細胞自身可通過糖酵解和氧化磷酸化（OXPHOS）之間的轉換來適應代謝環境的改變。近期，Cancer Cell最新刊登了一篇文章，研究人員發現在禁食狀態下使用二甲雙胍可以顯著抑制腫瘤生長，并提出PP2A-GSK3β-MCL-1通路可能是腫瘤
禁食狀態下使用二甲雙胍可以顯著抑制腫瘤生長！？
研究發現，腫瘤細胞會出現不同于正常細胞的代謝變化，同時腫瘤細胞自身可通過糖酵解和氧化磷酸化（OXPHOS）之間的轉換來適應代謝環境的改變。近期，Cancer Cell最新刊登了一篇文章，研究人員發現在禁食狀態下使用二甲雙胍可以顯著抑制腫瘤生長，并提出PP2A-GSK3β-MCL-1通路可能是腫瘤
細胞代謝信號通路相關的基因介紹RPTOR基因
該基因編碼一個信號通路的組成部分，該信號通路調節細胞生長以響應營養素和胰島素水平。編碼蛋白與mtor激酶形成化學計量復合物，并與真核起始因子4e結合蛋白-1和核糖體蛋白s6激酶相關。該蛋白正調控下游效應核糖體蛋白s6激酶，負調控mtor激酶。已發現該基因編碼不同亞型的多個轉錄變體。[由RefSeq提
細胞代謝信號通路相關的基因介紹FH基因
該基因編碼的蛋白質是三羧酸循環（tca）或krebs循環的酶組分，催化富馬酸鹽生成L-蘋果酸。它以胞質形式和n-末端延伸形式存在，僅在所使用的翻譯起始位點不同。n-末端延伸形式的靶向是線粒體，在線粒體中，延伸的移除產生與細胞質中相同的形式。它類似于一些耐高溫的Ⅱ類延胡索酸酶，具有四聚體的功能。該基因
細胞代謝信號通路相關的基因介紹SDHA基因
這個基因編碼琥珀酸泛醌氧化還原酶的一個主要催化亞單位，一個線粒體呼吸鏈的復合物。該復合物由四個核編碼亞單位組成，位于線粒體內膜。這種基因突變與一種線粒體呼吸鏈缺乏癥（leigh綜合征）有關。在染色體3q29上發現了一個假基因。另外，已經發現該基因編碼不同亞型的剪接轉錄變體。[由RefSeq提供，20
細胞代謝信號通路相關的基因介紹TYMS基因
胸苷酸合成酶利用5,10-亞甲基四氫葉酸（亞甲基四氫葉酸）作為輔因子催化脫氧尿苷酸甲基化為脫氧胸苷酸。此功能維持DNA復制和修復的關鍵DTMP（胸腺嘧啶-5-一磷酸素）池。這種酶作為腫瘤化療藥物的靶點一直備受關注。它被認為是5-氟尿嘧啶、5-氟尿嘧啶-2-原脫氧尿苷和一些葉酸類似物的主要作用部位。該
細胞代謝信號通路相關的基因介紹UMPS基因
這個基因編碼尿苷5'-單磷酸合酶。編碼的蛋白質是一種雙功能酶，對從頭嘧啶生物合成途徑的最后兩個步驟進行催化。第一個反應是由N-末端的酶-磷酸核糖基轉移酶進行的，該酶將乳清酸轉化為5'-單磷酸鹽。末端反應是由C末端酶OMP脫羧酶進行的，該酶能將5'-單磷酸列替丁轉化為單磷酸尿苷
細胞代謝信號通路相關的基因介紹SDHD基因
這個基因編碼呼吸鏈復合物ii的一個成員，負責琥珀酸的氧化。編碼蛋白是將復合物錨定在線粒體內膜基質側的兩個完整膜蛋白之一。該基因突變與腫瘤的形成有關，包括遺傳性副神經節瘤。疾病的傳播幾乎完全通過父系等位基因發生，這表明該位點可能是母系印記。這個基因在1號、2號、3號、7號和18號染色體上有假基因。選擇
細胞代謝信號通路相關的基因介紹DHFR基因
二氫葉酸還原酶將二氫葉酸轉化為四氫葉酸，這是嘌呤、胸苷酸和某些氨基酸從頭合成所需的甲基穿梭劑。功能性二氫葉酸還原酶基因已被定位到5號染色體上，多個無內含子處理的假基因或類似二氫葉酸還原酶的基因已被鑒定在不同的染色體上。二氫葉酸還原酶缺乏與巨幼細胞性貧血有關。已經發現了一些編碼不同亞型的轉錄變體。[由
細胞代謝信號通路相關的基因介紹SDHC基因
這個基因編碼四個核編碼亞單位之一，包括琥珀酸脫氫酶，也被稱為線粒體復合物ii，一個三羧酸循環和線粒體有氧呼吸鏈的關鍵酶復合物。編碼的蛋白質是兩個完整的膜蛋白之一，它們將復合物的其他亞單位（形成催化核心）固定在線粒體內膜上。這個基因在不同染色體上有幾個相關的假基因。這個基因的突變與副神經節瘤有關。另外
前列腺素的合成代謝通路介紹
前列腺素是二十碳不飽和脂肪酸花生四烯酸經酶促代謝產生的一類脂質介質。花生四烯酸在各種生理和病理刺激下經磷脂酶A2（phopholipaseA2，PLA2）催化經細胞膜膜磷脂釋放，在前列腺素H合成酶（prostaglandin Hsynthase，PGHS），又稱環氧化酶（cyclooxygenase
細胞代謝信號通路相關的基因介紹ATIC基因
該基因編碼一種雙功能蛋白，對從頭嘌呤生物合成途徑的最后兩個步驟進行催化。N-末端結構域具有磷酸核糖氨基咪唑甲酰胺甲酰轉移酶活性，C-末端結構域具有IMP環水解酶活性。該基因突變導致AICA核糖尿癥。[由RefSeq提供，2009年9月]This gene encodes a bifunctional
細胞代謝信號通路相關的基因介紹GNAS基因
GNAS作為一個重要的信號轉導蛋白，主要功能是在G蛋白偶聯受體信號轉導途徑中，激活腺苷酸環化酶，導致cAMP水平的升高，參與調控細胞生長和細胞分裂。
細胞代謝信號通路相關的基因介紹MYC基因
該基因編碼的蛋白質是一種多功能的核磷蛋白，在細胞周期進展、凋亡和細胞轉化中起到作用。作為調節特定靶基因轉錄的轉錄因子發揮作用。這種基因的突變、過度表達、重排和易位與多種造血腫瘤、白血病和淋巴瘤，包括伯基特淋巴瘤有關。有證據表明，來自上游、非aug（cug）幀和下游aug起始位點的選擇性翻譯起始導致兩
細胞代謝信號通路相關的基因介紹DPYD基因
該基因編碼的蛋白是嘧啶分解代謝酶，是尿嘧啶和胸腺嘧啶分解代謝途徑的起始和限速因子。該基因突變導致二氫嘧啶脫氫酶缺乏，嘧啶代謝錯誤與胸腺嘧啶尿嘧啶尿有關，癌癥患者接受5-氟尿嘧啶化療后毒性增加。兩個編碼不同亞型的轉錄變體已經被發現。The protein encoded by this gene is
細胞代謝信號通路相關的基因介紹TPMT基因
該基因編碼通過S-腺苷-L-蛋氨酸作為S-甲基供體和S-腺苷-L-同型半胱氨酸作為副產物代謝硫嘌呤藥物的酶。硫嘌呤類藥物如6-巰基嘌呤被用作化療藥物。影響這種酶活性的遺傳多態性與個體內對此類藥物的敏感性和毒性的變化相關，從而導致硫嘌呤s-甲基轉移酶缺乏。相關假基因已在第3、18和X染色體上鑒定。[由
細胞代謝信號通路相關的基因介紹CEBPA基因
這個無內含子基因編碼一個轉錄因子，該轉錄因子包含一個堿性亮氨酸拉鏈（bzip）結構域，并識別目標基因啟動子中的ccaat基序。編碼蛋白在具有CCAAT/增強子結合蛋白β和γ的同二聚體和異二聚體中起作用。這種蛋白的活性可以調節參與細胞周期調節和體重平衡的基因表達。該基因突變與急性髓系白血病有關。在非a
細胞代謝信號通路相關的基因介紹MTHFR基因
該基因編碼的蛋白質催化5,10-亞甲基四氫葉酸轉化為5-甲基四氫葉酸酯，這是同型半胱氨酸再甲基化為蛋氨酸的共基質。該基因的遺傳變異影響對閉塞性血管病、神經管缺陷、結腸癌和急性白血病的易感性，該基因的突變與亞甲基四氫葉酸還原酶缺乏有關。The protein encoded by this gene
細胞代謝信號通路相關的基因介紹MTOR基因
雷帕霉素（mTOR）的哺乳動物靶標，也稱為雷帕霉素和FK506結合蛋白12-雷帕霉素相關蛋白1（FRAP1）的機制靶標，是人類中由MTOR基因編碼的激酶。 mTOR是蛋白激酶的磷脂酰肌醇3-激酶相關激酶家族的成員。 mTOR與其他蛋白質結合，并作為兩種不同蛋白質復合物的核心成分，mTOR復合物1和m
細胞代謝信號通路相關的基因介紹SDHB基因
呼吸鏈的復合物II，特別參與琥珀酸的氧化，攜帶電子從FADH到COQ。復合物由四個核編碼亞單位組成，并定位于線粒體內膜。鐵硫亞單位高度保守，包含三個富含半胱氨酸的簇，這些簇可能包含酶的鐵硫中心。該基因的零星和家族性突變導致副神經節瘤和嗜鉻細胞瘤，并支持線粒體功能障礙和腫瘤發生之間的聯系。Comple
前列腺素的合成代謝通路介紹
前列腺素是二十碳不飽和脂肪酸花生四烯酸經酶促代謝產生的一類脂質介質。花生四烯酸在各種生理和病理刺激下經磷脂酶A2（phopholipaseA2，PLA2）催化經細胞膜膜磷脂釋放，在前列腺素H合成酶（prostaglandin Hsynthase，PGHS），又稱環氧化酶（cyclooxygena
細胞代謝信號通路相關的基因介紹POLE基因
該基因編碼DNA聚合酶epsilon的催化亞單位。這種酶參與DNA修復和染色體DNA復制。該基因突變與結直腸癌12和面部畸形、免疫缺陷、利維多和身材矮小有關。This gene encodes the catalytic subunit of DNA polymerase epsilon. The
細胞代謝信號通路相關的基因介紹GNAQ基因
GNAQ基因所編碼的蛋白屬于鳥嘌呤核苷酸結合蛋白（G蛋白）的家族，GNAQ與GNA11形成的復合物為G蛋白α亞基，這兩個基因調控細胞分裂，增強MEK（有絲分裂原活化蛋白激酶的激酶）蛋白活性，在80%的葡萄膜黑色素瘤病人中發現GNA11和GNAQ基因的突變，其機制為基因突變導致MEK的異常激活，目前正
非靶向代謝組學更適宜選用哪些代謝組學通路數據庫？
據相關介紹表明非靶向代謝組學的研究成果為眾多的藥物靶學、疾病機理研究以及疾病診斷提供有力依據。它還推動了免疫組化以及免疫熒光等技術的發展，事實上長期供應非靶向代謝組學更是由此迅速推進了研究步伐，現在就非靶向代謝組學更適宜選用哪些代謝組學通路數據庫作簡要闡述：1.HMDB非靶向代謝組學的代謝通路必須借
與細胞代謝信號通路相關因子介紹DNMT3A
CpG甲基化是一種表觀遺傳修飾，對胚胎發育、印記和X染色體失活具有重要意義。對小鼠的研究表明，DNA甲基化是哺乳動物發育所必需的。這個基因編碼一種DNA甲基轉移酶，被認為在從頭甲基化中起作用，而不是維持甲基化。該蛋白定位于細胞質和細胞核，其表達受發育調節。CpG methylation is an
與細胞代謝信號通路相關因子介紹TET2
該基因編碼的蛋白是一種催化甲基胞嘧啶轉化為5-羥甲基胞嘧啶的甲基胞嘧啶雙加氧酶。編碼蛋白參與骨髓生成，該基因的缺陷與數種骨髓增生性疾病有關。該基因有兩個編碼不同亞型的變體。The protein encoded by this gene is a methylcytosine dioxygenase