RSV感染的基因表達譜分析

　　發表在11月12日的PLOS Medicine雜志上的一項研究，采用全血基因表達譜分析估測了兒童RSV感染的發病機制和疾病嚴重程度，揭示了在兒童中由RSV感染引起的免疫反應的系統學調節異常，表明分子標記能夠用來預測疾病的嚴重程度。

　　呼吸道合胞體病毒(RSV，Respiratory syncytial virus)是兒童下呼吸道感染(LRTI)和住院治療的主要原因，引起世界上相當大一部分嚴重的兒童呼吸道感染和死亡。因為人們對這種疾病的發病機制缺乏完整的理解，目前還沒有獲得許可的疫苗，對該病的治療仍以癥狀治療為主。而且，僅以身體檢查和可用的診斷工具為基礎，我們不可能判斷出哪個感染RSV的兒童將會病情加重需要住院治療，哪個感染兒童是安全的可以留在家中照顧。

　　來自美國全國兒童醫院研究所和俄亥俄州立大學醫學院的 Asuncion Mejias和Octavio Ramilo兩位學者帶領的研究團隊，采用基因芯片分析了兒童嚴重RSV LRTI的總體宿主免疫應答，定義了RSV感染而非其它常見呼吸道病毒感染的基因表達模式，以鑒定能夠指示RSV感染嚴重程度的生物標記物。基因芯片分析使研究者能夠檢測例如全血中的基因表達譜(RNA轉錄譜)，一個生物標記物就是一個分子，它在體液或者組織中的水平表明一種疾病可能將如何發展，這有助于對患者進行分類。

　　研究者分別比較了因RSV感染、人類鼻病毒或者流感病毒感染(鼻病毒和流感病毒是LRTI的兩個另外的病毒起因)入院治療的2歲以下兒童和健康的對照兒童的全血RNA轉錄譜。利用“統計組比較”，他們鑒定了超過2000個轉錄本，這些轉錄本在來自45個RSV感染兒童和其他14個健康對照者的血液中出現了差異表達。在RSV感染的兒童中，干擾素功能相關基因和中性粒細胞相關基因，是最多的過表達基因。這個特殊的轉錄譜，也在其它三個兒童組中得到了驗證。而且RSV感染而生病的兒童具有的基因表達模式，不僅與健康兒童不同，而且與其它流感病毒或人類鼻病毒感染的兒童都不同。研究者稱這種模式為“RSV生物特征”，能夠精確地區別感染RSV和人類鼻病毒或者流感病毒的兒童。

　　據此他們得到一個基因組“嚴重指數”，這個指數與疾病嚴重程度的臨床指數、醫院治療的時間長短和補充氧氣的需要相關。RSV生物特征也使我們深刻理解患兒的免疫系統的狀態：RSV感染與一些炎癥基因的水平升高有關，也與非特異性的免疫系統基因的抑制和特定B和T細胞基因的表達減少有關，這在6個月以下的兒童中尤其明顯。

　　作者得出結論：RSV低呼吸道感染兒童的血液RNA譜，使得特異性診斷、疾病發病機制的更好理解和疾病嚴重度的評估成為可能。這項研究“為生物標記物的發現和潛在的治療或者預防的目標識別打開了一個新的方向，說明大的基因芯片數據集能夠被翻譯成生物學上有意義的信息，應用到臨床環境中。”

　　在同時出現的另外一個觀點中，Peter Openshaw贊成“這項研究，在轉錄組分析臨床應用于嚴重呼吸道感染兒童的預測和診斷中邁出了重要的幾步，”但是他也做出告誡，“僅有外周血可能不會告訴我們完整的信息，這需要補充呼吸道內的響應的詳細研究。”