RNA干擾回復實驗,主要是為了說明Off-target效應。
Off-target效應
Off-target effects(脫靶效應)最早由Dharmacon科學家Jackson和他的同事們提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce Toxic Phenotype." RNA Accepted (2006).)他們給細胞轉染特定基因的單條siRNA后運用全基因組芯片檢測技術鑒定表達上調/下調1.5到3倍的靶基因數量。研究人員發現在這種情況下有大量的基因被非特異性的調控著。siRNA正義鏈和反義鏈與脫靶基因的互補水平有高有低,并且每條siRNA所引發的脫靶基因表達譜也不盡相同,反映了序列依靠性的脫靶效應。
簡單來說,Off-target效應就是指干擾shRNA序列進入了microRNA途徑,通過microRNA途徑,其可以不受完全互補的限制而調控大量靶基因的表達。原本需要19~23nt的RNA序列完全互補才能發生干擾作用,而如果進入microRNA途徑,只需要11~15nt互補就可以產生干擾效果,這使得siRNA可能與非靶基因結合而導致非靶基因沉默,造成脫靶。