Southern印跡法(Southern Blot)是將基因組 DNA經限制性內切酶酶解、瓊脂糖凝膠電泳分離,使DNA片段按分子量大小排列在瓊脂糖凝膠上。
經堿處理凝膠使DNA變性(使雙鏈DNA變成單鏈),通過具有一定鹽離子濃度溶液的毛細管作用,將凝膠中變性的單鏈DNA片段原位地吸印到硝酸纖維素濾膜或尼龍膜上,經過干燥或紫外線照射處理。單鏈DNA片段的極性基團與支持膜上的基團結合而使DNA分子牢牢地固定到轉移膜上,轉移后的單鏈DNA分子與32P或35S標記的DNA探針按互補原理進行雜交。
經放射自顯影對特定位置上顯現的特異DNA片段進行分析。