? 細胞本身活力太差。實驗中發現未經誘導凋亡的對照細胞經染色后AnnexinV+/PI+雙陽性的細胞比例過高，造成這種結果的原因可能是細胞本身活力太差。建議用臺盼藍染色計算細胞的活力，臺盼藍拒染的細胞應大于95%。若活力偏低低，建議重新復蘇細胞，通常剛復蘇的細胞至少要傳代3 次以后才能進行實驗。
? 細胞操作不當。貼壁細胞消化過程中反復劇烈吹打導致細胞膜破壞，使得假陽性偏高。
? 凋亡誘導時間過長。一般情況下誘導幾個小時就可以出現早期凋亡，因此通常不需要處理大于48 小時以上，誘導時間過長會使營養物質耗盡，導致細胞狀態差，假陽性結果偏高。