過氧基團反應
青蒿素與三苯基磷反應可以證明青蒿素含有一個當量的過氧基，其做法是青蒿素在三苯基磷和二甲苯溶液中通氮氣回流，再加甲醛及水攪拌，水洗有機層，合并水層及酸性溶液，加堿后，用無過氧化物乙醚提取，無水硫酸鈉干燥，除去乙醚，測得三苯基磷重量，結果證明消耗三苯基磷克分子數與青蒿素相近。
顯色反應
顯色反應是用以鑒定青蒿素簡單可行的方法，報道較多，主要有以下幾種：
（1）對二甲氨基苯甲醛縮合反應：取實驗產品青蒿素約10mg，加乙醇2mL溶解，加對二甲氨基苯甲醛試劑1mL置水浴上加熱，溶液呈藍紫色反應。
（2）異羥肟酸鐵反應：取樣同（1），溶于1mL甲醇中，加入φ=7%鹽酸羥胺甲醇溶液4～5滴，在水浴上加熱至沸，冷卻后加稀鹽酸調至酸性，再加入φ=1%FeCl3，乙醇溶液1～2滴，溶液呈紫紅色反應。
（3）2,4-二硝基苯肼反應：取樣同（1），溶于1mL氯仿后，滴于濾紙片上，以2,4-二硝基肼試液噴灑，在80℃烘箱中烘10min，產生黃色斑點。
（4）堿性間二硝基苯反應：取樣同（1），溶于2mL乙醇中，加入φ=2%間二硝基苯的乙醇液和飽和的KOH乙醇液各數滴，水浴微熱，溶液呈紅色反應。
氫解反應
青蒿素在含有鈀-碳酸鈣的甲醇溶液中，在常溫、常壓下催化氫化，過氧化物被還原成化合物Ⅲ（圖1中的Ⅲ）。在此反應過程中，反應最初所得為油狀物，若將其溶于有少量丙酮的正己烷中，需放置4～5d，變為化合物Ⅲ的晶體，而在重氮甲烷中則甲酯化得到甲酯化合物Ⅳ（圖1中的Ⅳ）。 [1]
還原反應
青蒿素溶于甲醇，在冰浴中（0～5℃）攪拌分次慢慢加入固體硼氫化鈉，加完后繼續攪拌半小時。反應液用冰醋酸中和，減壓除去溶媒，即得到化合物Ⅴ（圖1中的Ⅴ）的粗結晶產物，它是用硼氫化鈉還原青蒿素而得到的半縮醛化合物。如用鈀-碳酸鈣在常溫常壓下進行催化氫化，則會失去氧而得到環氧化合物。
與堿反應
青蒿素加甲醇溶解，另取碳酸鉀溶于水，將此碳酸鉀溶液在攪拌下緩緩加入青蒿素甲醇溶液，使成均勻混和成澄清液，在20～22℃恒溫1h，加入水，用乙醚提取兩次，醚層用少量水洗2次，水層用φ=10%鹽酸酸化至pH=2，再用乙醚提取3次。乙醚層用水洗至中性，經無水硫酸鈉干燥2～3h，乙醚層減壓抽干，所得殘余物放冰箱過液，有半固體析出，加少許甲醇，冷卻，析出針狀結晶，即為化合物Ⅵ（圖1中的Ⅵ），過濾再結晶一次，則得到更精制的結晶。
與酸反應
青蒿素加入到冰醋酸-濃H2SO4混合液中搖勻，使溶解，25℃放置16～17h，溶液呈淺棕黃色微帶熒光，將反應液倒入等體積冰水中，攪勻，用氯仿提取3次，氯仿層用水沖洗至中性，無水硫酸鈉干燥，減壓除去有機溶劑，得粗結晶，重結晶2次，即得化合物Ⅶ（圖1中的Ⅶ）的片狀結晶，熔點144～146℃，（C=.2.1氯仿）。