結合珠蛋白的主要功能是與 游離血紅蛋白結合成穩定的復合物，然后被單核—巨噬細胞系統處理掉。正常情況下，人的紅細胞在循環血中盡管不斷受到機械損傷，但仍可保持其完整性，這與紅細胞具有良好可塑性的細胞形態和血液微環境的相對穩定有關。當某種原因誘發紅細胞在血管內破壞時，大量血紅蛋白會釋放到血液循環中，血紅蛋白可以從人的腎臟濾過，造成腎臟損害，甚至造成不可逆轉的腎功能損傷。當結合珠蛋白與游離血紅蛋白結合成穩定的復合物后，由于其分子較大，不能從腎臟排出，這樣可以阻止血紅蛋白從腎小球濾過，避免游離血紅蛋白對腎小管的損害。結合珠蛋白與游離血紅蛋白結合成復合物后，呈現出新的抗原決定簇，可被單核細胞、巨噬細胞表面的血紅蛋白清除受體（CD163）所識別并結合，之后被吞噬降解，從而除去了血循環中游離的血紅蛋白。這種生理現象，為臨床檢驗學提供了一個十分有趣的參照指標。當醫生利用實驗儀器發現血清結合珠蛋白含量下降時，結合病人的臨床表現，可以確定是否發生了血管內溶血性疾病，如陣發性睡眠性血紅蛋白尿癥和蠶豆病，以及先天性無結合珠蛋白血癥等。還有一些其他類型的血管內溶血和部分血管外溶血時結合珠蛋白可降低，其降低的程度常與病性輕重相一致。
結合珠蛋白又是 一種急性期時相反應蛋白。當機體處在應激狀態時，血液中的結合珠蛋白明顯增多，如心肌梗塞、腫瘤、炎癥、創傷、感染等病理狀態時，以及應用某些激素，如皮質激素和雄性激素后，其血清含量常有顯著升高，并與嚴重程度和預后有關。一些科學家利用急性肺栓塞為研究對象，試圖找出支持這一觀點的證據。他們采用RT-PCR的方法檢測急性肺栓塞大鼠模型肺組織中結合珠蛋白和鐵蛋白mRNA水平的變化；結果發現，急性肺栓塞后大鼠肺組織中結合珠蛋白和鐵蛋白mRNA水平逐漸升高，血清中結合珠蛋白和鐵蛋白的蛋白水平也逐漸升高。這說明急性肺栓塞后肺組織細胞增加了結合珠蛋白和鐵蛋白的合成，導致這兩種蛋白的血清水平明顯升高。研究結論表明，血清結合珠蛋白和鐵蛋白含量的變化，對急性肺栓塞和深部靜脈血栓形成的病人具有一定的診斷價值。另外在進行 糖尿病 合并血管病變患者的基礎研究 中，也發現血清結合珠蛋白含量與疾病進展發生相關性變化，HP基因型有可能是糖尿病冠狀動脈病變的一個獨立的風險因素。因此認為，對結合珠蛋白含量的動態監測，有益于糖尿病血管病變患者的治療，尤其是在建立糖尿病患者血管病變預防策略時，具有十分重要的意義。 由于結合珠蛋白的合成與降 解均在肝臟，并且在結合珠蛋白與血紅蛋白的復合物形成與降解的過程中，結合珠蛋白不能重復利用，因此當肝臟功能出現問題時，體內的結合珠蛋白數量常發生明顯的變化。合成不足則其含量減少，降解不足則其含量增多。此時化驗檢查血液中的結合珠蛋白含量是否減少或增加，對診斷肝臟疾病，判斷疾病的預后，很有幫助。 目前我國自主研發的血清結 合珠蛋白試劑盒，已應用于臨床。
科研人員采用免疫比濁法，選擇特異性強的結合珠蛋白抗體，在反應體系中與患者血清中的結合珠蛋白結合，形成不溶性的免疫復合物，然后監測反應液的濁度變化，計算出血清結合珠蛋白的含量。這種方法的測試結果穩定可靠，準確性強，而且操作簡單，在臨床上非常實用。