1.視力損害 是顱咽管瘤全切或次全切除最主要的神經障礙。決定其能否恢復的主要因素是手術前視力損害的程度及持續時間的長短。一般手術前視力全部喪失超過1周者，即使手術未加重視路神經組織的損傷，也不易恢復。術前尚保留部分視力且為時不長者，如手術未加重，則術后視力視野損害多可逐漸恢復。
2.尿崩癥 顱咽管瘤切除手術中，垂體柄及漏斗損傷或中斷的發生率較高，尿崩癥的發生、治療與替代療法已成為術后處理的重要課題。手術后臨床觀察及動物實驗證實，垂體柄切斷后可出現3個時期：①即刻性多尿：在手術后數分鐘至數小時后出現，可持續數小時至數天，為神經垂體創傷性休克所致的抗利尿激素（ADH）釋放障礙的結果。②間歇期：術后第1～3天內尿量排出正常，可能由于下丘腦-垂體神經束壞死及退行性變，使貯存于神經組織內的ADH釋放，血ADH水平重新升高所致。此期用垂體后葉素進行替代治療需減量，以免造成體內ADH水平過高，引起反彈性水中毒，出現體內水分貯留、低滲血癥、稀釋性低血鈉，造成嚴重的下丘腦與額葉水腫。因此，需結合血、尿滲透壓、尿比重與尿排出量，及時調節輸液量與ADH的替代治療。③永久性尿崩癥：在手術后數日出現，由神經原退行性變達到神經核，使ADH分泌減少所致。
尿崩癥的治療，主要使病人排尿量控制在每日3000ml以內。輕者可補充輸液，并給予噻嗪類藥物（如雙氫克尿塞等）。此藥為利尿劑而治療尿崩癥，其原理尚不清楚，給藥后尿量可減少一半。此外尚可給予卡馬西平、氯磺丙尿（是一種降血糖藥，有抗利尿作用）等。如損傷較重則需給予垂體后葉素（天然加壓素）作為激素替代療法，效果較為確切，同時注意水、電解質平衡，防止鈉潴留，限制鈉鹽入量，補充鉀鹽。癥狀持續較久者，可給予長效尿崩停。近年還有經過改良的人工合成的加壓素類似物DDAVP（desamino-8-D-arginine vasopressin，簡稱彌凝），其作用較天然垂體后葉素作用大而持久，且無血壓升高等不良反應，早期可給予其靜脈滴注劑，一次給藥后效用可持續18h。病人清醒后可改為口服或鼻腔內噴霧，其藥量相當于靜滴的10倍。10%～15%的病人，垂體柄切斷后3年內可恢復，這可能與下丘腦視上核、室旁核內巨細胞又形成新的神經血管單位有關（Antunes，1979）。
3.垂體功能減退 嚴重者出現垂體功能低下危象，需根據病情，采取緊急的搶救措施。其中最主要的是腎上腺皮質功能減退，與手術密切相關。一般術前探查已有腎上腺皮質功能低下者，術前給予激素進行準備，術中給予補充。一般腦部手術后早期給予大劑量可的松作為手術應激療法，繼續3～4天，然后減至維持量且改為口服。這時給予大劑量激素，還可起到抗腦水腫的作用，可給予地塞米松或甲潑尼龍（methylprednisolone）。后者起效更迅速，15min即達血漿濃度高峰，且鹽皮質激素樣作用弱，短期使用時下丘腦-垂體-腎上腺軸無影響，較前者更適宜大劑量沖擊治療，待病情平穩后逐漸減量，且在腦水腫消退后不再為此繼續給藥。但對于垂體柄損傷或切斷的病人，則需持續給予適當維持量（相當每日氫化可的松10～30mg）作為替代治療，并在某些誘因（感染、疲乏等）侵襲時適當增加藥量，以免病勢加重。60%～80%垂體柄切斷的病人可發生甲狀腺功能低下，需用甲狀腺素替代治療。此外，年輕婦女及青春期男性還需給予促性腺激素的替代治療，以免其FSH、LH分泌不足而產生癥狀（如婦女閉經、男子性功能低下等）。
4.下丘腦損害癥狀 可表現多種多樣，如嗜睡、熱量代謝調節失常等。此外，對于經終板入路手術的病人，尤其在兒童及青年中，常于術后1～6個月出現中樞性食欲失常，表現為貪食等，可行激素及對癥治療。