終止子可分為兩類。一類不依賴于蛋白質輔因子就能實現終止作用。
另一類則依賴蛋白輔因子才能實現終止作用。這種蛋白質輔因子稱為終止因子,通常又稱ρ因子。
兩類終止子有共同的序列特征。在轉錄終止點前有一段回文序列。回文序列的兩個重復部分(每個7~20bp)由幾個不重復的bp節段隔開。回文序列的對稱軸一般距轉錄終止點16~24bp。