方法三
(1)收集細胞懸液(106細胞),低速離心(1000r/min,離心5min)。
(2)去上清,沉淀加0.4ml低滲緩沖液作用1h。
(3)13 000r/min,離心10min,將上清轉移至另一Eppendorf管中,加等量50%異丙醇和0.5mol/L NaCl混勻,置液氮5min。
(4)12 000r/min,離心10min,棄上清,沉淀真空抽干。
(5)加TE 100μl,65℃加熱10min,取20μl,加1~2μl上樣緩沖液,電泳觀察。
方法四
(1)收集細胞,1000r/min離心5min,去上清。
(2)用冰預冷的70%乙醇固定,可長期保存于-20℃冰箱。
(3)1000r/min離心5min,去除固定液,用約0.5ml的PBS重懸細胞。
(4)轉入Eppendorf管中,同法離心,去上清。
(5)細胞用40μl PC緩沖液重懸,室溫30~60min。
(6)1000r/min離心5min,吸上清于新的Eppendorf管中,真空濃縮15min。
(7)加入0.25% NP-40溶液3μl,1mg/ml RNase A溶液3μl,37℃,30min。
(8)加入3μl蛋白酶K,37℃,30min。
(9)加入12μl樣品稀釋液,含溴化乙錠的1.5%瓊脂糖電泳,觀察
2、瓊脂糖凝膠電泳的定量檢測
方法一:簡易末端標記法
(1)按常規提取細胞DNA。
(2)在0.5ml的EP管中加入細胞DNA,反應體系如下:細胞DNA 0.5~1.0μg,10×緩沖液2μl,32P-dATP(或-dCTP)0.5μCi,Klenow聚合酶5U,雙蒸水加至20μl。
(3)混勻后稍加離心,室溫反應30min。
(4)加1μl 0.5mol EDTA終止反應。
(5)常規酚/氯仿/異戊醇抽提1次,無水乙醇沉淀DNA,真空抽干。
(6)溶于20μl的TE緩沖液中。
(7)取標記DNA在1.8%瓊脂糖凝膠上點樣,50V電泳約2h。
(8)電泳后的凝集置濾紙上烘干,進行放射自顯影。
方法二:5’末端32P標記法
細胞DNA的提取
(1)細胞懸液離心后,沉淀加消化緩沖液0.5ml,50℃ 3~5h,或37℃過夜。
(2)用等體積的酚:氯仿:異戊醇抽提細胞裂解液。
(3)將水相轉移至新的試管,加入150mmol/L乙酸鈉和10mmol/L氯化鎂。
(4)加入2倍體積的預冷無水乙醇,置液氮5min或-20℃ 12h。
(5)12 000r/min離心沉淀DNA,70%乙醇洗1次后,真空抽干。
(6)溶于20μl的TE緩沖液中。
(7)加入終濃度為10μg/ml RNase,37℃,30min。
(8)同法用等體積酚:氯仿:異戊醇抽提,乙醇沉淀,真空抽干。
(9)溶液20μl的TE緩沖液中,-20℃保存備用。DNA含量測定:用260nm波長紫外分光光度計:吸光單位為20時約為1mg/ml DNA。
3、DNA 5’末端脫磷酸
(1)取純化的細胞DNA 10μg,然后加入:10×CIP 2μl(1U),雙蒸水加至50μl。
(2)37℃水浴2h。
(3)90℃水浴5min以滅活CIP。
(4)用等體積酚:氯仿:異戊醇抽提,乙醇沉淀,真空抽干。
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