細胞凋亡（英語：apoptosis，源自希臘語：απ?πτωσι?，有“墮落、死亡”之意），為一種細胞程序性死亡。相對于細胞壞死（necrosis），細胞凋亡是細胞主動實施的。細胞凋亡一般由生理或病理性因素引起。而細胞壞死則主要為缺氧造成，兩者可以很容易通過觀察區分開來。在細胞凋亡過程中，細胞縮小，DNA被核酸內切酶降解成180bp-200bp片段屬于有層次之斷裂，（可以通過凝膠電泳證明），而細胞壞死時，細胞腫脹，細胞膜被破壞，通透性改變。細胞器散落到細胞間質，需要巨噬細胞去清除，結果是該局部組織發炎。相比起細胞壞死，細胞凋亡是更常見的細胞死亡形式。
細胞凋亡受到抑凋亡因子和促凋亡因子的調控。