腸神經官能癥的癥狀輕重不一，病程多經年累月反復發作，常有腹痛或腹部不適、腹脹、腸鳴、腹瀉和便秘等主訴，并同時伴有神經官能性癥狀，如失眠、頭痛、健忘、注意力不集中、心悸、胸悶、憂慮、倦怠、盜汗、遺精、神經過敏等。腹痛較常出現于左下腹部或下腹部，痛不劇烈，多為脹痛或不適感，但亦可有短時絞痛；腹痛每于便前發生或加劇，進食亦可激發，便后或排氣后常能緩解。腹瀉多在清晨或餐后發生、常與便秘相交替。腹瀉每日幾次或十幾次，量不多，為水樣便，常同時排氣，可含有大量黏液。
