患兒出生時正常,在開始母乳或牛乳喂養后不久,通常在出生2~3天出現嚴重的腹瀉,大便呈水樣,長期腹瀉者的大便中含有大量的低分子量的有機酸,特別是乳酸和醋酸,pH降低,可伴有乳酸尿癥;患兒可出現脫水、代謝性酸中毒、營養不良及生長障礙,牛乳喂養者癥狀較輕。患兒因腹瀉導致大量的能量丟失,經常處于饑餓狀態,體重明顯下降。如停止含乳糖的飲食,癥狀一般在24小時內消失。