植物根際微生物類群對植物的營養吸收和健康生長意義重大。玉米是一種重要的經濟作物,傳統的研究方法由于分辨率較低,使得我們很難真正了解根際細菌群落的結構及其動態變化。
中國科學院成都生物研究所應用與環境微生物中心的研究人員與美國伊利諾伊大學Mackie研究團隊合作,使用高通量測序方法分析了玉米不同生長階段的根際細菌群落的動態變化。高通量測序結果表明,與非根際土相比,玉米根際細菌群落的多樣性顯著下降;根際主要富集了變形菌門、擬桿菌門和放線菌門的成員,而這些細菌門的動態變化規律一般由其中一兩個主導類群所決定。根際占優勢的細菌屬主要有Massilia、Burkholderia、Ralstonia、Dyella、Chitinophaga和Sphingobium。在科以下的分類水平上,玉米不同生長階段的根際細菌群落發生了顯著演替:Massilia、Flavobacterium、Arenimonas和Ohtaekwangia屬在玉米生長前期占優勢,它們以易降解有機物質為底物,屬于生長速度較快的富營養菌;而Burkholderia、Ralstonia、Dyella、Chitinophaga、Sphingobium、Bradyrhizobium和 Variovorax在后期占優勢。該研究使我們對玉米根際細菌群落的結構和演替規律有了全面系統的認識。
該研究還比較了來源于美國和德國的玉米根際微生物結構的高通量測序數據,結果表明,盡管大多數優勢屬都存在于兩地的根際中,然而其中的優勢種是截然不同的,這種菌群上的差異意味著土壤性質可能是塑造根際細菌群落結構的重要因素。
該研究成果發表于Soil Biology & Biochemistry, 2014, 68: 392-401。
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