活性染色質是指具有轉錄活性的染色質。活性染色質的核小體發生構象改變，具有疏松的染色質結構，從而便于轉錄調控因子與順式調控元件結合和RNA 聚合酶在轉錄模板上滑動。
活性染色質主要特征活性：染色質具有DNase I超敏感位點（DNase I hypersensitive site）；活性染色質很少有組蛋白H1與其結合；活性染色質的組蛋白乙酰化程度高；活性染色質的核小體組蛋白H2B很少被磷酸化；活性染色質中核小體組蛋白H2A在許多物種很少有變異形式；HMG14和HMG17只存在于活性染色質。
