食管自發性破裂一經確診應立即給予抗生素、搶救休克，應盡早手術治療、清除刺激性液體、縫合食管破裂。如破裂后不超過24小時，積極早期行開胸、局部食管修復手術，也有愈合的機會。如果胸腔沖洗干凈，胸腔術后引流通暢，肺膨脹良好，經過胃腸道外營養支持，或空腸造瘺營養支持，使破口愈合，則能縮短治療時間，避免復雜的治療措施。
食管自發性破裂一般為縱形破口，很少橫行，一般長度4～7cm。如破口小，病人立即來診，進入胸膜腔內的食物殘渣少，胸腔引流徹底，感染得以及時控制，可以不經手術修補，破口的愈口機會大。如破口大，進入胸膜腔內的胃內容物量多，食物殘渣未能引流干凈，病人來診較遲，肺膨脹不佳，或延誤診斷，形成膿胸、縱隔炎等，則單純引流、鼻飼或空腸造瘺往往形成慢性食管-胸膜-皮膚瘺，破口自行愈合的機會甚小。
一般認為迅速確診并進行手術修補是搶救成功的關鍵，手術時將食管裂口縫合，進行縱隔和胸腔引流。但是近年來也有應用內科保守治療獲得成功的病例，即在穿孔的早期應用自膨式金屬支架進行填塞，如已有胸腔積液或縱隔積液則在B超引導下穿刺置管引流，同時應用廣譜抗生素尤其是第三代頭孢菌素和新型喹諾酮類藥物，應用甲硝唑有助于治療合并厭氧菌感染者，加強支持治療特別是靜脈全營養療法的適當應用對加快食管穿孔的愈合有著積極的作用。一旦形成食管-胸膜-皮膚瘺則需延期修補，甚至需作部分食管切除，以腸管代替食管的手術。有時需作部分肋骨切除，以消滅膿腔及瘺道。